ncbi中查找基因序列的方法和三个号码

1、ncbi中查找基因序列的方法和三个号码一例子：查找酿酒酵母（saccharomyces cerevisiae）里的海藻糖合成酶基因（tps1） 即可出现很多条目，找到saccharomyces cerevisiae的就是nc_001134了，点击后就进入该基因所在染色体的界面了，再在“编辑”中“查找” tps1就可以看该基因所在的位置，再点击cds或者geneid:852423都可以出现相关链接！当然，如果你在文献查到目的蛋白的序列号如np_009684.1或者geneid:852423，那分别在search后选择protein或者gene也可以出现相关链接！二基因cds区界面的3个号码htt

2、p://entrez/viewer.fcgi?val=50593115&from=488899&to=490386&view=gbwithparts找到后，我发现该界面有3个标记，一个是nc_001134 ，其次是gi:50593115，最后是features中的gene中的 /db_xref= “geneid:852423”，他们分别是什么号码，用在什么地方呢？尝试中，终于发现，在search“nucleotide”或者“core nucleotide”时，for后面是nc_001134，最终go到该基因所在染色体全长序列的信息，所以nc_001134

3、应该是该染色体的登录号吧？在search“nucleotide”或者“core nucleotide”时，for后面是50593115，最终go到该基因所在染色体全长序列的信息，所以50593115应该是该染色体的号吧？在search“gene”时，for后面是852423，最终go到该基因的信息，所以852423应该是该基因的登录号吧？所以我们如果要记住目的基因在ncbi中的位置就记住这个geneid！其他像np_009684当然是基因编码的蛋白质的登录号啦，不说了。我们在文献中查到的基因往往给的是gene id三引物设计第一步-找编码序列的方法 在search“gene”时，for后面是8

4、52423，最终go到目的基因的信息 点击中的fasta,获得的就是mrna的非模板链（其实就是mrna里的u换成了t），也可以说是cdna的互补片段，因为与编码的蛋白质一一对应，所以也就是引物设计真正的模板！引物设计后面的pcr要克隆的就是这段序列！所以千万不要搞错了！点击genbank，获得的是cds区的序列和相关信息，这个cds区包括cdna，也包括其他不编码的序列，所以pcr没必要把cds区全部克隆出来！其实在cds界面（或者说点击genbank后出现的界面里），把display里的genbank（full）改成fasta也可以！其实在该界面中我们还可以了解到其他信息1. 点击reference sequence details，可以看到np_009684.1，点击他，可以看到目的蛋白质的信息2. 点击获得的是目的基因的图谱，然后点击tps1后面的sv，也可以看到编码序列了，当然这里的dna序列和蛋白质一一对应，更说明是设计引物的模板（这个图谱界面也可以在2的点击genbank后获得的cds区中点击852423链接获得，或者说条条链接通罗马！）四关于cds和cdna的关系ncbi中的cds就是编码序列，包括cdna全部，也含有其他序列，毕竟cdna是人为根据mrna反转录得到的，而cds区生物本身的，有些不编