基因芯片筛查外周血中胃癌转移相关基因-文档资料

1、基因芯片筛查外周血中胃癌转移相关基因胃癌；外周血；转移；基因芯片；基因表达谱Screening of metastasis associated genes in peripheral blood of gastric carcer patients by gene chipsHUANGSu-ying, TIAN Jun, YING Min-gang,et al.School of Public Health,Fujian Medical University， Fuzhou350004,China【】 ObjectiveTo screen the differentially express

2、ion genes related to metastasis of gastric carcer by gene chips, in order to identify marker gene candidates of gastric carcer metastasis in peripheral blood.Results The gene chips of Whole HumanGenomeMicroarray (32050 humangenes, phalanx) were used to detect the differential gene expression profile

3、s in peripheral blood between gastric carcer patients with metastasis and with not. The results were analyzed by bioinformatics methods. Results 157 differentially expression genes in peripheral blood were identified,including 92 up-regulated genes and 65 down-regulated genes. They were genes associ

4、ated with cell adhesion and motility, genes associated with protiendegradation,etc. Conclusion Gastric carcer metastasis process is very complicated, involved many genes with different function. The metastasis related genes in peripheral blood of gastric cancer patients can be selected preliminarily

5、 by gene chips.?Gastric cancer ；Peripheral blood ；Metastasis ；Genechip;Gene expression profile?基金项目：福建省教育厅科技项目 （ 项目编号： JB06224）; 福建医科大学教授基金 （ 项目编号： JS060018）?通讯作者：陈华 E-mail:gwyb2mail.fjmu. 省略 胃癌患者出现复发和 （ 或） 转移是影响胃癌患者生存期的重 要因素。 从分子水平探索胃癌转移机制， 寻找理想的胃癌转移相 关分子标志物，预测患者的预后情况，制定个体化治疗方案，是 进一步提高胃癌患者生存率的有效途径。

6、 本文采用全基因组表达 谱芯片技术， 分析出现转移与未出现转移的胃癌患者以及健康者 之间外周血基因表达谱的差异， 筛选与胃癌转移相关的差异表达 基因，并探讨其生物学意义。 ?1 资料与方法 ?1.1 样本收集 选择经临床和组织病理检查确诊为胃癌，未 化疗且排除其他原发性肿瘤的胃癌患者10 例，其中胃癌转移组5 例 （ 转移至肝脏 ） ，胃癌未转移组 5 例；另选择健康体检自愿者5 例为对照组。 经知情同意后， 采集外周血 5 ml ，分离有核细胞， 送上海康成生物工程 XX 公司进行 phalanx 人全基因组表达谱芯 片（人 32050个基因）检测。 ?1.2 胃癌转移相关基因筛选筛选全基因

7、组表达谱芯片获取的基因差异表达水平 2,且经 T-test 统计分析显著差异表达的基因 （PTGFa （转化生长因子-a ）为EGFR配体，是生长因子自分泌系统 的基本组成部分，它在调节细胞分化、增殖、维持上皮完整性中 起重要的作用。有报道指出，TGFa 在恶性实体瘤中呈显著性高表达，尤其与胃肠道肿瘤关系密切 3 。本研究发现，胃癌转移 组TGFA基因明显高表达。？CTNNB基因编码B -连环蛋白（B -catenin）,是Wnt信号通 路发挥促进肿瘤发生发展的直接原因。B -catenin异常表达可见于人类多种恶性肿瘤，如胃癌、直结肠癌、乳腺癌、肺癌、白 血病等。黄悦等发现 B -caten

8、in 表达的下调与胃癌的发生发展 具有相关性，本实验也显示 CTNNB基因明显低表达。？在阳性基因中，属于ADAh家族的ADAM23ADAM1、ADAM33 ADAM1、ADAM、ADAM等多个基因出现异常表达。目前， ADAMs 与肿瘤的关系已成为肿瘤研究的热点之一。新近研究表明 ADAM 家族基因参与了 EGFF信号转导、肿瘤转移和肿瘤血管新生等过 程，在肿瘤发展中起到重要的作用。ADAM通过去整合素和富半胱氨酸区与整合素3 硫酸乙酰肝素蛋白聚糖相互作用， 其金属蛋 白酶区能够降解黏附分子和细胞外基质， 调节细胞和细胞、 细胞 和细胞外基质相互作用来影响肿瘤转移 5 。ADAM、ADAMS ADAM1等基因的异常表达在肺癌、子宫内膜癌等肿瘤侵袭和转 移中的作用有文献报道， 但其在胃肠道肿瘤转移中的表达情况报 道较少， 因此值得将其作为新的胃