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文档简介
1、实验原理 利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓, 以保证得到较长的DNA。一般来说,构建基因组文库, 初始DNA长度必须在100kb以上,否则酶切后两边都带合适末端的有效片段很少。而进行RFLP和PCR分析, DNA长度可短至50kb,在该长度以上,可保证酶
2、切后产生RFLP片段(20kb以下),并可保证包含PCR所扩增的片段(一般2kb以下)。 不同生物(植物、动物、微生物)的基因组DNA的提取方法有所不同; 不同种类或同一种类的不同组织因其细胞结构及所含的成分不同,分离方法也有差异。在提取某种特殊组织的DNA时必须参照文献和经验建立相应的提取方法,以获得可用的DNA大分子,尤其是组织中的多糖和酶类物质对随后的酶切、PCR反应等有较强的抑制作用,因此用富含这类物质的材料提取基因组DNA时,应考虑除去多糖和酚类物质。 第1页/共18页实验材料和试剂实验材料:植物幼嫩叶子。实验所需试剂:1. 提取缓冲液提取缓冲液:100 mmol/L TrisCl
3、(pH8.0), 20mmol/L EDTA, 500 mmol/L NaCl, 1.5% SDS2. 80:4:16/氯仿氯仿:戊醇戊醇:乙醇乙醇 3. RnaseA母液母液 4. 其它试剂:液氮、异丙醇、其它试剂:液氮、异丙醇、TE缓冲液,无水乙醇、缓冲液,无水乙醇、70% 乙醇、乙醇、3mol/L NaAc。第2页/共18页实验仪器第3页/共18页离心机第4页/共18页各种型号的微量移液枪第5页/共18页研钵不同型号的eppendorf管第6页/共18页实验实验步骤步骤:1. 水稻幼苗或叶水稻幼苗或叶片片0.1-0.2g, 剪碎剪碎, 置研钵中,加入置研钵中,加入1mL提取缓冲液,提取缓
4、冲液, 研磨成浆;研磨成浆;2. 吸入吸入1.5mL EP管中,剧烈摇动混匀;管中,剧烈摇动混匀;3. 60水浴保温水浴保温30-60min,不时不时颠倒混匀;颠倒混匀; 4. 室温下室温下10000rpm离心离心5min;5. 小心吸上清于新的离心管中,加入等体积氯仿,剧烈震动;小心吸上清于新的离心管中,加入等体积氯仿,剧烈震动;6. 室温下室温下10000rpm离心离心5min; 7. 小心小心将将上清吸入新的离心管中;上清吸入新的离心管中; 8. 加入加入1倍体积异丙醇,室温下放置片刻即出现絮状倍体积异丙醇,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。沉淀。 9. 8000rpm离心离心5min
5、 ,弃掉上清;,弃掉上清;10.75酒精洗一次,酒精洗一次,晾干沉淀;晾干沉淀;10. 加入加入5L RNaseA(10g/L), 37 10min, 除去除去RNA。11. 加加50-100l水融解水融解,-20贮存。贮存。 第7页/共18页1. 植物叶子0.1- 0.2g, 剪碎置预冷研钵中 加入1mL提取缓冲液,研磨成浆 第8页/共18页2. 吸入1.5mLeppendorf 管中,摇动混匀 第9页/共18页3. 3. 60水浴保温30-60min第10页/共18页4. 10000rpm离心5min第11页/共18页5. 吸上清于新的离心管中,加入等体积氯仿,颠倒混匀第12页/共18页6
6、. 6. 再次10000rpm离心5min; 将上清小心吸入新的离心管中; 第13页/共18页7. 加入1倍体积异丙醇,-20 放置10min,出现絮状DNA沉淀; 随后8000rpm离心5min ,弃掉上清;75酒精洗沉淀一次晾干沉淀;加5L RNaseA (10g/L), 37 10min, 除去RNA; 加50-100L的TE Buffer ,取1-5L电泳检测;其余-20 贮存备用。第14页/共18页DNA样品在0.7% Agarose胶上电泳(例图) 第15页/共18页实验注意事项1.微量移液枪的使用一定要规范,吸取氯仿等有机试剂要注意不要将试剂吸入枪中;2.提取过程中的机械力可能使大分子DNA断裂成小片段,所以为保证DNA的完整性,各步操作均应较温和,避免剧烈震荡。第16页/共18页思考题思考题:
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