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文档简介
1、p肌动蛋白的克隆与鉴定王鹏邓志康石绮峰刘允刘准刘斌摘要:肌动蛋白是在真核生物中普遍存在的一种古老的蛋內质之一。p肌动蛋白是肌动蛋白家族的一员,广泛表达于真核生物非肌细胞中,是构成细胞骨架的维持、细胞运动、细胞 分裂等。作为一种细胞质肌动蛋a, e肌动蛋g在所有组织屮相对持续稳定表达,因此e肌 动蛋白基因常用作定量研究的对照基因。由管家基闵的旮份决定,p肌动蛋內基因的启动子 为强启动了,对于提高转®因表达具冇显著的效果,其表达不受组织的限制。关键词:p肌动蛋白克隆分析一材料与方法1.1组织dna的提取1.1.1材料细胞裂解缓冲液蛋白酶k te缓冲液酚:氯仿:异戊位(25:24:1)1.
2、 1.2过程1. 取新鲜或冰冻动物组织块0. lg,尽量剪碎,置于玻璃匀浆器中, 加入iml的细胞裂解缓冲液匀浆至不见组织块,转入1. 5ml离心管中, 加入蛋白酶k20ml,混均,在65° c恒温水浴锅中水浴20min,间歇振 荡离心管数次,于台式离心机以12000rpm离心5min,取上淸液入另 一个离心管中。2. 加2倍体积异丙醇,倒转混均后,可以看到丝状物,用100ml吸头 挑出,晾干,用200mlte重新溶解。3. 加等量的酚:氯仿;异戊醇振荡混均离心12000rpm, 5分钟4. 取上层溶液至另一试管加入1/2体积的7. 5mol/l乙酸铵,加入2倍体积的无水乙醇,混均后
3、室温沉淀2分钟,离心12000rpm, 10分 钟。5. 小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上将附于管壁上的残余液滴除掉。6. 用lml70%乙醇洗涤沉淀物离心12000rpm, 5分钟。7. 小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上将附于管壁上的残余液 滴除掉。8. 加200mlte重新溶解沉淀物,然后置于4° c或20° c保存备用。1.2 pcr1.2.1过程配制25毫升反应体系在pcr板屮依次加入模板dnalul下游引物,pcr预混液12.5 ul ddh2o 9.5ul设置pcr反应体系程序 94 °c 532个循环94°c 30s 55
4、176;c 30$ 72°c is72 °c 10s上样,启动反应程序, 扩增产物的产物检测1. 3电泳1.3.1材料50xtae缓冲液lxtae缓冲液溴化乙啶欵存液6x上样缓冲液dna样品dnaladder掠 脂糖1.3. 2过程制备1%琼脂糖凝胶:称取1. 5g琼脂糖置于锥形瓶中,假如150mltae, 瓶!倒扣小烧杯100°c加热煮沸3次,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶。 胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽洗干净,晾干,放入制胶玻璃 板,取透明胶带将玻璃与内槽两端边缘封好,形成模子将冷却到65°c 左冇的琼脂糖凝胶混匀小心倒入内槽,形成均匀胶层。加样
5、:在点样板伤感混合dna样品和上样缓冲液。电泳:加样后的凝胶立即通电进行电泳,加压110v,样品由负极向 正极方向移动。观察照相:在紫外灯t观察,dna存在则显绿色荧光带,拍照保存。1.4连接1.4. 1过程与t载体连接(pud-18t)pud-18t取0. 5-l.ou,冋收纯化的dna2u (或3_4u)看具体浓度加水互补至5 u 1再加入5 u 1 solution i (冰上助融)共10 u 1在16qc放置30min之后4°c过液转化:大肠杆菌(dh5a )1. 从-70°c冰箱屮去除感受态细胞,放入冰水屮融化,放置大约lomin2. 用冷却后无菌吸头将连接好的i
6、)na混合液加入到感受态细胞中(没 100p 1感受态细胞加连接产物5 pl)轻旋转,混匀内容物,在冰 上放置30min3. 再将离心管放到42°c的水浴锅中热激90s切勿摇动试管4. 迅速转移到冰浴屮,使细胞冷却l_2min5. 每管加400 u 1的lb液体培养基,转移到37°c摇床上,温浴45min 转速不超过125转,使细胞复苏(一般得4-5h菌液xl*能浑浊)摇 完后4000rpm离心2-3min,弃去上清200 ul,使菌液浓度增加, 用枪吹打后,再涂平板(此步可在4°c保存)6. 涂平板,尽量迅速至菌液被吸收,如吸收不完全正放30min之后倒放在37
7、qc培养箱过液1.5转化1.5. 1过程从-70°c冰箱屮取出感受态细胞,放入冰水屮融化,大概放置lomin; 用冷却的无菌吸头将连接好的dna混合液加入到感受态细胞中(没 100 pl感受态细胞加连接产物5 pl)轻轻旋转,混匀内容物,在冰 上放置30min;再将离心管放到42°c的水浴锅中热激90s,切勿摇动 离心管;迅速转移到冰浴中,使细胞冷却l_2min;每管加400ul的 lb液体培养基,转移到37°c摇床上125转,使细胞复苏,摇完后 4000rpm离心3min,弃去上清液200 u l,然后用枪吹打后涂平板, 37°c培养箱中过夜;用枪头挑
8、单菌落接于5ml液体lb培养基中,摇 12h后提取质粒。用ecor i和hindlll进行质粒双酶切或pcr鉴定 1.6质粒dna的提取1.6.1材料1. x-gal(5-溴-4-氯-3卩引啜-3-d半乳糖)x-gal溶于n, n'-二甲基 甲酰胺中配20mg/ml原液。-2(tc避光保存2. iptg (异丙基-p -d半乳糖苷)0. 2g/ml分装贮存于_20°c3. 氨t青霉素(ampiaillin) lg ampiaillin溶于5ml灭菌水中。配成母液保存于_20°c1.6.2方法平板准备:在40微升x-gal (中加入4微升iptg充分混合,在 无菌条件
9、下涂布于含amp (浓度50微升每毫升)的lb平板上将平 板至于37°c恒温箱屮2-3h,意识培养基充分吸收色素底物x-gal涂板:将转化菌在无菌条件下涂布于含抗生素和x-gal iptg的平 板上正面朝上放置30分钟,待菌液完全被吸收后倒置平板。37°c培养12-18h1.7验证pcr扩增实验实验材料:1. 仪器:吸头,pcr仪器,移液枪2. 材料pcr预混液12.5微升,水9.5微升,上游引物1微升,下游 引物1微升,组织dna1微升实验内容及步骤:1配制25微升反应体系,在pcr板中依次加入卜*列溶液中 模板rna 1微升上游1微升下游引物1微升,pcr预混液12.5
10、微 升,ddh2o0.95 微升。2. 设置pcr反应程序强变性94摄氏度5分钟变性94摄氏度30秒退火58摄氏度30秒延伸72摄氏度1分钟最后延伸72摄氏度8分钟共32个循环3. 上样启动反应程序4. 扩增产物的电泳检测(取5毫;t) 项目:电泳实验所用设备:水电泳槽,电泳仪,凝胶成像分析系统,微波炉,微量移液器,透明 胶带,点样板,锥形瓶,量筒,吸头。50xtae, tris溶液,edta溶液,去离子水,1xtae缓冲液琼脂糖溴化 乙叮贮存液,溴化乙啶,溴酚蓝,甘汕,其他,dna样品。实验内容及步骤:1. 琼脂糖凝胶电泳的制备:称取1. 5克琼脂糖置于锥形瓶中,加入150毫升1xtae瓶口
11、倒扣小 烧杯100摄氏度加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成百分之1琼脂糖凝胶液。2. 胶板制备:取电泳槽内有机玻璃内槽洗干净晾干,放入制胶玻璃板,取透明胶带 将玻璃板与槽两端边缘封好形成模子。将内槽置于水平位置,并固定 位置放好梳子,将冷却到65摄氏度左右的琼脂糖凝胶完全凝固垂直 轻拔梳子,取不胶带,将凝胶剂内槽放入电泳槽中,添加1xtae电泳 缓冲液至没过胶板为止。3. 加样:在点样版上混合dna样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数 应不小于lx,用1微升微量移液管枪分别将样品加入胶板的样品小 槽内,每加完一个样品应更换一个加样头,以防止污染,加样时五碰 坏样品周围的凝胶面。4. 电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,电压60100伏特,样品由负极 向正极方向移动,电压升高,琼脂糖凝胶的有效分离,范围降低,当 溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处吋,停止电泳。5. 观察照相:在紫外灯下观察,dna存在则显示出红色荧光条带采 用凝胶成像系统拍照保存。二结果分析实验成功提取出目的基因,进行pcr扩増,然后进行电泳,电泳表现出荧光带并 且两条荧光带都处在10(t200bp之间,证明pcr扩增成功。再进行蓝白斑验证时,由于没冇立即涂匀氨苄青霉素导致培养基屮心青霉素浓度 过高,没有生氏菌落。从没有加入x-gal
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