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文档简介
1、生物芯片技术张建亮基础医学院神经生物学系基础医学院神经生物学系 生物芯片的概念及发展渊源生物芯片的概念及发展渊源 生物芯片的分类及应用生物芯片的分类及应用 应用前景分析应用前景分析 Fodor displays a graph of coded messages emitted by so-called dark regions of the human genome. RNA蛋白质转录翻译细胞表型生物表型复制逆转录 (病毒中)Oligo 芯片, CpG-岛芯片, CGHcDNA芯片Oligo芯片蛋白芯片 组织芯片? ? ? ?1. SNPs 2. 拷贝数 3. DNA修饰1.开 / 闭 2.
2、拷贝数 3.剪接分析1. 酶分析 2. 拷贝数 3. 蛋白修饰1. 细胞形态 2. 细胞功能 3. 细胞生长PCR-测序Southern blot FISHNorthern blot RT-PCR RNase保护Western blot ELISA 质谱分析组织培养 组织学 免疫组织学DNAFood testingLivestock diagnosticsor gradingAgricultural biotechHuman diagnosticsEnvironmental testingBasic ResearchIdentity testingPersonalized medicine 生
3、物芯片的概念及发展渊源生物芯片的概念及发展渊源 生物芯片的分类及应用生物芯片的分类及应用 应用前景分析应用前景分析生物芯片种类概述生物芯片种类概述最早实现商品化,原理在于DNA变性杂交;极有挖掘潜力的一种芯片;最理想的芯片,“全功能”实验室;一次性完成芯片制备、样品处理、靶分子和探针分子杂交/亲和,以及信号检测、分析;视频图象扫描/结果分析杂交/洗涤芯片标记好的样品点样(针点或喷点)探针标准化Oligo探针合成Oligo探针序列确定基因组序列分析组织样品目的细胞总RNA提取cDNAmRNA基因文库构建目的基因扩增PCR产物纯化根据样品来源、基因含量、检测方法和分析目的不同,采用的标记方法各异;
4、标记方法:荧光标记法、生物素标记法、同位素标记法等;RNA样品一般要先逆转录成cDNA并进行标记才可进行检测;多数方法需要在标记和分析前对样品进行适当的扩增,以提高检测灵敏度;方法盖玻片杂交盒全自动杂交洗涤工作站VIDEO第二军医大学沈锋教授团队首先对8名肝癌手术后患者的样品进行了表达谱cDNA芯片杂交实验,发现肝癌AAH高表达预示肝脏切除术预后更差,且极易引发复发。文章发表在Hepatology.安徽医科大学第一附属医院张学军发现5个与汉族人群红斑狼疮病密切相关的易感基因,同时验证了在欧洲人中发现的7个易感基因在汉族人中同样存在. 蛋白蛋白AAAAARNARNA抗体抗体DNADNATissue arrayHuman M
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