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文档简介
1、 寻找能调控自噬autophagy的microRNAs Pipeline: 快速查询基因与各种疾病表型的相 关性，判断其临床重要性 应用情景： （1）课题设计阶段：通过小规模的差异表达分析、RNAi、文献分 析，初步筛选了一组基因/microRNAs/lncRNAs作为研究对象，希 望进一步从临床重要性的角度选定后续研究对象 （2）论文准备阶段：已完成了某基因/microRNAs/lncRNAs的功能 实验，如果能demo该基因与各种疾病表型（如疾病发生、预后、药 物敏感性）的相关性，将极大提升论文的临床重要性，提升其引起 “general interests”的潜在影响 已集成、处理了大量已
2、发表的基因表达谱数据： breast cancer(>2000/ovarian cancer (>500/ lung cancer (>600 预后（生存期）信息 药物响应信息(pCR/RD） Kaplan-meier plot (KM图 Significance test (Log-rank test Hazard ratio / Odds ratio Cox regression 多变量Cox regression测试其独立性（相对经典指标如tumor size， age等） 技术支持数据库： 输出： 案例：通过 cell lines/RNAi 实验中筛选到与Ras基因有协同 致死关系的基因，利用公共库中肿瘤预后相关的基因表达谱 数据，进一步展示这些基因的临床相关性，并demo出个体 化治疗的策略 201
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