CDISC编码标准和21CFR Part11在医学研究系统中的应用

1、 Zhou Hong数据采集和处理系统提供商 Data acquisition and processing system provider CDISC编码标准和编码标准和21CFR Part11在医学研究系统中的应用在医学研究系统中的应用The application of CDISC and 21CFR Part11 in clinical research标准让数据互相认识标准让数据互相认识Standardized data can communicate seamlessly全球全球PM2.5最高的地区在北非和中国的华北、最高的地区在北非和中国的华北、华东、华中全部。世界卫生组织华东、

2、华中全部。世界卫生组织(WHO)认认为，为，PM2.5小于小于10是安全值，中国的这些是安全值，中国的这些地区全部高于地区全部高于50接近接近80。（南方都市报）。（南方都市报）PM2.5监测网监测网 http:/举例：举例：PM2.5事件事件-美国大使馆公布PM2.5-政府认可并同样公布临床研究数据是否需要标准化？Does Clinical data need standardization ?新药新药研发到研发到上市的上市的路线图路线图Pathway from Compound to New DrugR&D (研发)Preclinical (临床前期)PH I (一期临床)PH II (二

3、期临床)PH III (三期临床)Submission ( 申报审批)Year (年年)Every step generates dataEvery step needs data managementProcess(流程流程)药物药物上市上市后后的的研究研究Post-marketing clinical reserachEvery step generates dataEvery step needs data management新药研究和上市后研究新药研究和上市后研究的的区别区别pre & post marketing researchEvery step generates dataE

4、very step needs data management采集采集Collection运输Transportation收样Receipt分离Process入库Storage分析分析Assays转运Shipment出库Retrieving新药研究Trial有生物标本的采集有生物标本的采集 Sample collectionEvery step generates dataEvery step needs data management上市后研究 Post maketing clinical research采集Collection存储数据Storage分析Assays一般没有生物标本的采集一

5、般没有生物标本的采集Without sample collection临床数据采集的目的临床数据采集的目的Objective of clinical research datap 数据标准化的目的 Objective药物临床研究 Clinical trial 提交FDA评审 FDA data submission与国际同行交换数据 Data exchange eg: STS EACTS临床数据的应用流程临床数据的应用流程Operational Process for Clinical Data EDC电子病历电子病历EMR源数据源数据Source DataRemote backup统计师统计师

6、Statistics心电图心电图ECG实验室实验室Labs研究者研究者InvestigatorDatabaseEDC 和临床数据的现状和临床数据的现状Current Status for EDC and Clinical DataEDC是目前最流行的数据采集方法Electronic Data Capture (EDC) is the commonly used method to collect clinical data有很多EDC系统，每个的数据结构都不一样There are so many EDC vendors now, each of them has different datab

7、ase structure, setup, different variable naming convention and labeling and data attributes 有的界面和CRF一致some have the data entry interface similar to the CRFs 有的不一致， 完全是列表式 Some have a listing-form of data entry screen EDCRemote backupDatabaseEDCEDC 和临床数据的现状和临床数据的现状Current Status for EDC and Clinical

8、Data提供给统计师的数据各不一样Data delivered to statistician are very different! 数据呈递给FDA也各不一样Data submitted to FDA are very different! 由于这种非标准化情况，FDA很难横向的比较不同厂家，同类药的疗效和安全性Because of non-standard and non-exchangeable, there was no way for FDA to evaluate drug applications cross different sponsors EDCRemote backu

9、pDatabaseEDC样本数据示例样本数据示例SampleGrace研究项目暴露出的问题暴露出的问题The Problemsp 大部分临床医学研究 Most clinical trials 没有采用数据标准化 dont employ a standard for data exchange 没有使用标准化的工具和技术 dont use standardized analytic tools or techniques p 后果Result其结果是造成了临床数据分析中效率和系统化的困难，特别是对多个临床试验Analyzing clinical trial data efficiently an

10、d systematically is difficult and time consuming, especially across many trials 不如这样一个简单的问题：有多少女性参与了GRACE的临床试验？e.g. How many women participate in clinical trials with GRACE? 如何自动统计女性数量如何自动统计女性数量How do you automate counting women? 面对这样的一个简单的问题，我们往往会感到无能为力 Facing on such a simple question, we often fe

11、el lack of power 没有标准的数据集名 No standard 怎么可能自动地用计算机找出包含要找数据的数据集How does a computer find the contains the data ? 没有标准的变量名 No standard variable names 怎么可能自动地用计算机找出包含性别的数据名How does a computer find the column that contains sex information 没有标准的数据编码 No standard terminology 怎么可能自动地用计算机告知1还是2代表女性How does a

12、computer know which code represents which sex ? 临床数据标准化非常关键和重要！ Clinical data Standardization is very important and critical! 数据的可交换性数据的可交换性Data Exchangeability 定义定义Definition 数据的可交换性是它具有的属性，它使得数据可以以各种方式传送和使用而不会失去它的内容和意义Data exchangeability is the attributes of data that enable the data to be commun

13、icated and used in many ways without loss or alter the information content or meaning assigned to the data. 只有标准化的数据才具有可交换性只有标准化的数据才具有可交换性Only standardized data are exchangeableCDISC是什么是什么? CDISC:临床数据交换标准协会Clinical Data Interexchange Standards Consortium, started with small group of volunteers in 19

14、97 是一个全球的、开放的、多学科的、非营利的组织，创建了支持临床研究数据和元数据采集、交换、提交和存档的标准It is a global, open, multidisciplinary, non-profit organization that has established standards to support the acquisition, exchange, submission and archive of clinical research data and metadata. 主要的模型 There are two major models in CDISC: SDTM:

15、针对临床数据 Standard Data Tabulation Model for clinical trial data ADaM:针对分析数据Analysis Data Model 其他正在建立的标准Other still-developing standard CDASH:针对CRF表 Clinical Data Acquisition Standards Harmonization for CRF standardsSDTM的基本模型的基本模型SDTMs fundamental model for operational dataObservation观察Generic structu

16、re（衍伸结构）（衍伸结构）Unique identifiersTopic variable or parameterTiming Variables Qualifiers.Interventions干预Findings发现Events事件General classes （一般（一般分类）分类）SubjectCMEXEGIELBPEAEDSSDTM Domains （SDTM域）域）(dataset structures)The patient/subject focused information model of the clinical reality (general classes

17、of observations on subjects: interventions, findings, events). This model has been developed by CDISC/SDS team.Interventions干预Events事件ConMedsExposureAEMedHistDispositionFindings结果ECGPhysExamLabsVitalsDemogOther其他Subj Char*Substance UseIncl Excl*RELATESSUPPQUALStudy SumStudy DesignQS*, MB*CommentsCP*

18、, DV*CDISC SDTM 域域 DomainsCDISC SDTM 域注解域注解 Domains comments分类解释EX试验用药记录CM伴随用药记录和其它物理治疗SU 物质使用（烟、酒、咖啡等）干预干预Interventions事件事件EventsAE不良反应事件DS试验完成、中止、脱落报告MH病史（试验药物相关疾病病史及其它病史）结果结果Findings分类解释EG心电图IE入选、排除标准LB实验室检查QS调查问卷（HAMILTON DEPRESSION SCLAE, SF36, ADAS.）PE体格检查SC个体特征（比如患者姓名、眼睛颜色、生育状态、过敏状态）VS生命体征注：

19、HAMILTON DEPRESSION SCLAE 指 汉密顿抑郁量表 SF36 简明健康状况问卷 ADAS 阿尔茨海默病评分其他其他OtherDM受试者人口学资料CO非异常描述、其它注释FDA对数据标准化的态度对数据标准化的态度FDAs Stands on Clinical Data StandardizationFDA药品审评中心于2004年7月就接纳CDISC CDER adopted CDISC SDTM 7/04今年二月， FDA发布了关于数据标准化的指导原则草案FDA released a draft guidance in Feb. 2012 on study data stan

20、dardizationFDA鼓励申办方采用标准化数据，越早越好FDA is encouraging manufacturers to adopt these new data submission standards early in the product development cycle FDA认可CDISC作为标准之一 CDISC is one of standard FDA endorsed越来越多的药厂已开始采用CDISC标准The more and more companies are submitting data FDA in CDISC standard再过2-3年，CDI

21、SC可能成为FDA的正式标准It could be an official requirement of CDISC standard by FDA in 2-3 yearsFDA申报标准数据包申报标准数据包Submission Data Package FDA申报标准数据包以下The submission data package to FDA usually include the following SDTM datasets in SAS transport format (.xpt) SDTM annotated CRFs Define.xml for SDTM ADaM (in .

22、xpt) Define.xml for ADaM Review guide 审阅指导申报数据进入申报数据进入FDA的流程的流程 Flow for Submission Data within FDAJanus System审办方审办方SponsorSDTMADaM统计评审员统计评审员FDA Statistical Reviewer医学评审员医学评审员FDA Medical Reviewer电子申报接口电子申报接口Electronic Submission Gateway (ESG)常用创建常用创建SDTM和和ADaM流程流程Commonly Used Procedure for Creatin

23、g SDTM and ADaM几乎是通过SAS在数据库外的后期制作Created via SAS转换为转换为SDTM和和ADaM存在的问题存在的问题Issues in Mapping SDTM and ADaM from Raw目前的SDTM转换是单向的，没法溯源It is an one-way mapping (i.e. RawSDTM) without traceability. E.g. age was calculated variable. From the mapped SDTM, it didnt tell how age was calculated太多的数据库外的手工程序，非

24、常容易出错! Too much outside database programming，easy to make mistakes in the conversion processes增加了大量的质控和验证工作Increased a lot of validation and QC work不能保证申报数据的质量和溯源性Lack of insurance of quality and traceability for submitted data package没有有用的软件或工具No powerful tools for automatic SDTM mapping理想的步骤理想的步骤T

25、he Should-be Procedure无系统外转换无系统外转换No outside-system mapping目前还没有这样的系统目前还没有这样的系统No system available yetShould be xml format, not SASSAS datasets are two dimensional, i.e. it is “flat” Xml is multi-dimensional, i.e. it is stereoFDA is thinking to request for xml format in the future部分的解决方案部分的解决方案Parti

26、al Solutions 对一个新study，数据标准化应从数据库的设计开始For new study, data standardization can be started with the database design 利用CDASH的标准表建库 Use CDASH standard forms 用SDTM给变量命名和标识，但不是所有的变量都能这样做Use SDTM to name and label variables (not all variables can be directly named in SDTM, e.g. date field 用SDTM域来分类 Group d

27、ata using SDTM domain 即使这样，一个完全的SDTM标准库也会面临挑战Even you setup database in CDASH, it is still not possible to have a100% SDTM database. However, it is a SDTM-like database 对以前的历史遗留研究，用SAS转换仍然是唯一的办法For legacy studies, mapping through SAS is still the only wayCDISC 总结总结SummaryCDISC是用于数据申报的一个趋势CDISC stand

28、ard is the current trend for regulatory submission数据标准化对申办方和FDA都非常重要和关键It is very important and critical for both sponsors and FDA to have a quality and efficient regulatory review但是，我们还面临很多挑战However, there are a lot of challenges in 对CDISC指导原则的理解understanding the CDISC guidance 如何具体实施 Implementing

29、the modules 需要研发有效的可直接转换和溯源的软件或工具Developing some powerful tools or software for direct mapping from ODM to SDTM and being able to trace back the source 如何保证电子数据的有效和安全?Ensures security and data administration are effectively managed21CFR Part11 是什么是什么?l 21 CFR Part 11 是联邦法规21章第11款 主要规定内容涉及电子记录和电子签名 l

30、 食品、医药制造行业多遵照此标准，此法规确保了电子数据的有效性和可靠性 l 遵照此标准而保留的数据才可以作为通过检验或者今后追溯的有效数据来源l 现在很多大型自动化控制系统已经符合此标准规定21CFR Part11的重点的重点Keyponits我们DAP在做什么?What we are doing in this field？DAP的医学研究系统的医学研究系统Clinical research system developed by DAP临床研究管理系统CRT systemCRF问卷编辑问卷编辑EDC在线在线/离线录入离线录入Online/Offline input中央随机分配中央随机分配Randmization数据分析管理数据分析管理Data management生物样本冻存管理系统Biobank System自动自动/手动入库手动入库Inventory定位查询定位查询Sample Locating可视化容器管理可视化容器管理Freezers生命周期管理