分子生物学合并完成

1、分子生物学复习题第三章1. 基因的三种主要功能是什么？储存信息(转录，翻译);复制;突变第四章1. cDNA、基因克隆与核酸内切酶的概念（概念）（1） cDNA指与RNA链互补的单链DNA，以其RNA为模板，在适当引物的存在下，由RNA与DNA进行一定条件下合成的DNA。（2）基因克隆一般指将外源基因导入宿主细胞中，分离含有外源基因的单细胞，然后由一个单细胞生长起来的都是含有外源基因的相同的细胞系。 （3）核酸内切酶是在核酸水解酶中，水解DNA分子链内部磷酸二酯键生成寡聚核苷酸的酶。2. 载体至少需要几个筛选标记各起什么作用？答：载体至少需要3个筛选标记。作用分别为：1：指示自主复制的起点。2

2、：指示载体进入宿主细胞。3：指示目的基因进入宿主细胞。3. cosmid、质粒与噬菌体载体的区别？Cosmid噬菌体质粒宿主Bacteria大肠杆菌BacteriaBacteria插入片段的大小Up to 50kb 12-20 kb 1-8 kb进入细胞的方式Transfection转染Infection感染Transformation转化转入效率高效高效一般第五章1. 杂交的概念，Northern blot与Southern blot 的异同点（简答）答：一条核酸单链在适宜条件下与另一条与之互补的核酸单链在适宜的条件下形成双链螺旋的现象叫做杂交。异同点：Southern blot 是分析DN

3、A的杂交技术，Northern blot是分析RNA的 Southern 和Northern原理基本相同，都是利用DNA或RNA的复性过程，但过程上也有区别，主要是： Southern是先电泳后变性，而Northern是先变性后电泳； Southern是碱变性，而Northern采用甲醛、乙二醛、二甲基亚砜等变性，因为采用碱变性会导致RNA水解。第六章1. 转录、启动子、下降突变、上升突变？(概念 选择)答：（1）转录是指拷贝出一条与DNA链序列完全相同（除了TU之外）的RNA单链的过程，是基因表达的核心步骤。（2）启动子（promoter）：一段RNA聚合酶转录起始时结合的DNA序列。（3）

4、下降突变：破坏与保守序列的匹配率，使启动子的转录活性减弱的突变。（4）上升突变：使启动子的序列更接近保守序列而使启动子功能增强的突变。2. 原核生物启动子的基本结构？郑炜鹏答：原核生物启动子在转录起始位点上游存在-10和-35两个区域中心。大写字母仅指在给定的位置该碱基的出现有较高的概率。小写字母相应的碱基在所给定的位置出现的频率较大写字母在其位置上的概率要低。3. E.coli RNA聚合酶核心酶与全酶的区别？郑炜鹏答：大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由5个亚基组成（2，），没有基的酶叫核心酶。核心酶只能使已开始合成的RNA链延长，但不具有起始合成RNA的能力，必须加入基才表现出全部聚合酶的活性。

5、4. E.coli终止子的类型、结构特点与作用机制。郑炜鹏答：大肠杆菌细胞内含有两种终止子。一种是没有其它蛋白帮助下的内在终止子。第二种是依赖辅助因子的终止子，叫做依赖型终止子。 <1>内在的终止子结构 ： 大肠杆菌色氨酸（trp）操纵子含有一个导致提前转录终止的衰减序列。trp 衰减子具有两个元件（1）反向重复序列（2）非模板链富含一连串T的序列 <2> 因子非依赖型终止子：因子非依赖型或内在的终止依赖于终止子的两个元件：（1）富含GC的反向重复序列（2）基因非模板链紧随的富含T的序列。因子非依赖型终止子允许在转录末端形成发夹结构的反向重复序列；非模板链一连串的T使得

6、rU-dA碱基对作用很弱。第七章1. 操纵元、结构基因、操纵子、调控基因、终止子、效应物 正/负调控、弱化子（衰减子）郑炜鹏答：操纵元：结构基因：负责编码细胞代谢途径中组成型蛋白质的基因。其所编码的蛋白质一般不作为调节因子。操纵子：操纵子是指能被调控蛋白特异性结合的一段DNA序列，常与启动子邻近或与启动子序列重叠，当调控蛋白结合在操纵子序列上，会影响其下游基因转录的强弱。调控基因：调控基因是编码能与操纵序列结合的调控蛋白的基因。终止子：终止子是给予RNA聚合酶转录终止信号的DNA序列。效应物：所谓效应物是指直接产生效应的物质,通常是酶,如腺苷酸环化酶、磷酸脂酶等,它们是信号转导途径中的催化单位

7、。效应物通常也是跨膜糖蛋白。正/负调控：负调控保证了乳糖操纵子在乳糖不存在时，处于关闭状态，而正调控保证了乳糖操纵子在葡萄糖存在时处于关闭状态，甚至在乳糖和葡萄糖一起存在时也处于关闭状态。 弱化子（衰减子）：RNA合成终止时，起终止转录信号作用的那段DNA序列。2. （1）根据图示请写出乳糖操纵子各部分的名称和功能。并简述乳糖操纵子的正、负调节机制。（论述题，详细过程）许玉庆、丁俊祥1、结构图：I：阻遏蛋白基因序列。C:CAP binding site 代谢激活蛋白结合位点。P:启动子。O：操纵子。结构基因包括：Z. Y A 经过翻译以后分别是-半乳糖苷酶，半乳糖苷透过酶，b-半乳糖苷乙酰转移

8、酶。2、负调控机制：由于阻遏蛋白阻止RNA聚合酶对3个lac基因的转录，所以当阻遏蛋白结合到操纵子上时。操纵子即被关闭。当供应的葡萄糖被消耗殆尽且有乳糖可被利用时，少数的酶分子将乳糖转化为异乳糖，异乳糖作为诱导剂与阻遏蛋白结合，引起阻遏蛋白变构，从操纵子上脱落下来，RNA聚合酶与启动子结合而起始3个lac基因的转录，形成相应的酶分解利用乳糖。正调控机制：由代谢激活蛋白介导，CAP 与cAMP协同促进操纵子的转录。由于葡萄糖的存在会引起cAMP浓度的降低，所以葡萄糖存在可以阻止操纵子的正调控。只有当葡萄糖浓度较低且需要消耗另一种糖原时，lac操纵子被激活，CAP、cAMP通过结合在邻近启动子的激

9、活位点而促进lac操纵子的转录。第十章1（2）真核生物RNA聚合酶的种类、功能及定位。（详细叙述）RNA聚合酶种类定位功能核仁合成大的rRNA前体核质催化合成mRNA前体hnRNA核质催化合成5srRNA tRNA及其他小分子RNA和病毒RNA.2hnRNAs, snRNAs的定义、概念，它们如何起作用？郑炜鹏答：hnRNAs：不均一核RNA ，真核生物mRNA的前体，为存在于真核生物细胞核中的不稳定、大小不均的一组高分子RNA之总称。占细胞全部RNA之百分之几，在核内主要存在于核仁的外侧。snRNAs：核小RNA，真核生物细胞核中的小分子RNA，链长为几十到一百多核苷酸，它参与真核生物细胞核

10、中RNA的加工。作用：snRNAs和许多蛋白质结合在一起成为小核核糖核蛋白参与信使RNA前体（hnRNAs）的剪接，使后者成为成熟mRNA。3（3）RNA聚合酶II 的亚基组成，最大亚基（CTD）的磷酸化有那些作用（11章promoter clearance from initiation to elongation;14章CTD stimulate splicing in vitro; 15章 binding of the CTD of Rpb1 to mRNA-processing proteins）？（论述）许玉庆、丁俊祥答：聚合酶II原先的12个亚基归为三组：核心亚基，它们与细菌RNA

11、聚合酶核心亚基的结构和功能相似；聚合酶II中的三种多肽，Rpb1,Rpb2和Rpb3对酶的活性是必需的。它们与大肠杆菌RNA聚合酶中的，及亚基同源。 通用亚基，至少在酵母中它们同时存在于三种聚合酶中；Rpb5,Rpb6,Rpb8,Rpb10,和Rpb12在酵母三种核聚合酶中都存在。它们在转录过程中起着最基本的作用。 非必须亚基，它们对酶的活性是可以被替换的。有两个亚基Rpb4,Rpb9,在聚合酶活性中并非绝对需要。Rpb7和Rpb11不属于以上三类中的任何一种。然而，它们是聚合酶活性所必需的，研究发现Rpb7和Rpb11的突变体没有活性。 最大亚基（ CTD）的磷酸化有那些作用IIa亚基可以通

12、过CTD的磷酸化转换成IIoCTD的磷酸化打破在启动子区聚合酶与TBP的结合，开始进入转录延伸。CTD呈现了协助招募剪接底物以激活剪接体的作用加帽、剪接和多聚腺苷酸化的酶都直接结合到CTD上，CTD为这三个加工事件提供了一个平台。4Enhancer and Silencer 的概念，特点及作用。答：1、增强子：无方向和位置依赖的，能够增强基因转录的DNA元件。沉默子：无方向和位置依赖的，能够抑制相关基因转录的DNA元件。特点：它们在基因转录过程中，对转录效率的影响无位置和方向依赖；增强子与沉默子具有组织特异性，其活性有赖于组织特异性DNA结合蛋白。第十一章1 （4）什么是TBP因子的多功能性？

13、答:分子生物学充满了神奇 ，其中之一就是TATA结合蛋白（TBP）的多功能性。a) TBP不仅能够与聚合酶II共同作用于含有TATA框的启动子，而且在不含TATA框的由聚合酶II识别的启动子上也起作用。b) 更神奇的是，它还对不含TATA框的聚合酶I和III识别的启动子起作用。TBP对所有聚合酶和启动子类型都起作用，它是一种通用真核转录因子。2 （5）什么是组装因子？哪些因子含有TBP? 它们的功能？（详细叙述）郭进宝1）组装因子：结合于转录起始位点的上游区，识别启动子内特定的结合位点，组装前起始复合物的因子。2）类因子，类因子，类因子均含有TBP。3） TBP不仅能够与聚合酶II共同作用于含

14、有TATA框的启动子，而且在不含TATA框的由聚合酶II识别的启动子上也起作用，它还对不含TATA框的聚合酶I和III识别的启动子起作用。TBP对所有聚合酶和启动子类型都起作用，它是一种通用真核转录因子。 （1）TBP在I类转录中是必需的，除了酵母外，所有类核心结合因子都是TBP。聚合酶和聚合酶的转录依赖于TBP和几种TAFs组成的转录因子 （2）TAFIIs的特别受关注的两个功能是：助于TBP对带有起始子和DPEs的启动子的转录。TAFIIs还具有酶活性，并且TBP结合在TATA框上并把TFIIIB锚定在上游的结合位点。（3）TBP的突变不仅影响聚合酶II的转录，TBP也参与到I类和III类

15、基因的转录，并且分别与I类和III类起始前复合物中的不同TAFs（TAFIs和TAFIIIs）结合。 有TATA框的II类启动子（也可能是第三类），这个因子是TBP，但其它类型的启动子有它们自己的组装因子。在特定的启动子中，即便TBP不是首先结合的组装因子，但它在大多数已知的启动子中作为起始前复合物组装的一部分并在组建复合体的过程中发挥其组织装配的优势。第十二章1 转录激活子的结构及相应功能？翁骏超答：转录激活因子可以激活也可抑制RNA聚合酶II的转录过程。 它们至少都有两个基本的功能域组成 ：1、DNA结合结构域（DNA-binding domain）2、转录激活结构域（transcript

16、ion-activating domain功能：1、细胞中的转录激活因子通过所谓的召集作用来提高转录水平； 2、真核生物的转录激活因子也介导RNA聚合酶全酶与启动子结合，但不像原核生物转录激活因子那样直接，真核转录激活因子通过刺激通用转录因子及RNA聚合酶全酶与启动子结合。2 DNA-binding Domain 有几种类型？是什么？激活结构域有几种？翁骏超答：大多数DNA结合基序可归为如下几类：1.含锌组件（Zinc-containing module） § 这类含锌组件包括：Ø a. TFIIIA和Sp1两种转录激活子中发现的锌指结构（Zinc fingers）。

17、16; b.糖皮质激素受体和其他细胞核受体成员中发现的锌组件。Ø c.酵母转录激活子GAL4和其家族成员中发现的包含两个锌分子和六个半胱氨酸的组件。2.同源域（Homeodomain, HD）。 § 螺旋-转角-螺旋的DNA结合域在结构和功能上类似。3.bZIP和bHLH基序。 § 亮氨酸拉链（leucine zipper）和螺旋-环-螺旋结构（helix-loop-helix, HLH）二聚化域中的一个或两个相连接。迄今为止，大多数的转录激活域可归为如下三种类型：1 酸性域（acidic domain）。a) 酵母转录激活子GAL4是典型代表。它具有一个由49个

18、氨基酸组成的结构域，其中11个氨基酸是酸性氨基酸。2 富含谷氨酰胺的结构域。Sp1转录激活子有两个这样的结构域，谷氨酰胺占该区氨基酸总数 的25%左右。其中的一个结构域中，在143个氨基酸长度的肽段中含有39个谷氨酰胺。此外，Sp1还有两个转录激活结构域不能列入这三类的任何一种。3 富含脯氨酸的结构如转录激活子CTF，在84个氨基酸组成的结构域中19个氨基酸是脯氨酸。3 什么是multiple enhancers? 这对细胞的调控有什么意义？翁骏超答： 复合增强子：是指对基因进行调控时，有不止一个增强子行使功能，这些增强子称作复合增强子。 对于细胞而言复合增强子能使一个特定基因对各种激活因子的

19、不同组合产生应答，不同激活因子的组合对不同细胞中的给定基因产生不同的水平表达，同时这种布局使得细胞能够对生物的基因在不同组织或不同的发育阶段产生精细的调控。4 什么是insulator? 它的主要功能？比较enhancer, activator, insulator的本质和作用？翁骏答：绝缘子(insulator)：屏蔽一个基因的增强子的正效应或沉默子负效应的DNA元件。激活因子（activator）：于增强子（或激活因子结合区）结合的蛋白质并激活附近启动子的转录。在真核生物中，它激发转录前起始复合体的形成。增强子（enhancer）：促进一个或多个基因转录的DNA元件。增强子一般存在于其调控

20、基因的上游，但他们也可以点到或在间距几百甚至上千对碱基之外对基因起调控作用。绝缘子与增强子的本质都是DNA元件，而激活因子的本质是蛋白质。5 （6）对激活因子的调节有哪些方式？（详述）纪苏婷答：对激活因子的调节方式有（1）细胞核受体传统分类法将核受体归为三类：I型受体（type I receptors）包括类固醇激素受体，代表物是糖皮质激素受体。当激素的配体缺乏时，受体蛋白和其他蛋白偶联存在于细胞质中；当激素配体与I型受体蛋白相结合时，释放偶联蛋白，以同源二聚体形式进入细胞核，结合在激素应答元件上。II类激素受体，甲状腺激素受体是典型的II类受体，存在于细胞核中。对于型受体，由于其配体有待鉴定

21、，因此也被称为“孤儿受体”。（2）GAL4蛋白GAL4蛋白是调控酵母半乳糖代谢基因的转录激活因子。每种GAL4应答元件包括一个GAL4靶位点，每个GAL4单体是包含六个半胱氨酸及两个锌离子的双金属巯基簇。GAL4单体包含一个螺旋二聚体基序，能在与其它GAL4单体相互作用时形成平行的缠绕螺旋。（3） 聚合酶全酶的召集全酶是包含一组通用转录因子和其他多肽的复合体。 事实上有证据表明，的确存在对全酶的召集作用。 实验结果显示激活因子是通过召集完整的聚合酶全酶到启动子上，而不是在启动子上一次一个地组装。聚合酶全酶可做为一前体单元被召集，或以其中的一部分形式被召集到前起始复合物上。 （4）复合增强子通过

22、DNA环化，使结合在增强子上的每种转录激活子能与启动子上的起始复合物相互作用。当增强子处于基因附近时，基因处于开放状态；反之，则处于关闭状态。多增强子具有协同作用的能力，多增强子能应答不同的转录激活子的组合单元。（5）转录激活子的泛素化RLIM蛋白通过在CLIM蛋白的赖氨酸残基上附加多拷贝的泛素小分子蛋白，从而形成所谓的泛素化蛋白。一旦附加的泛素分子链足够长时，此蛋白将被送达细胞质内的一个蛋白酶体结构内。它含有的蛋白酶可使任何被带入蛋白酶体的泛素化蛋白降解。 泛素化对激活因子也有正效应。 （6）转录激活因子的SUMO修饰SUMO修饰是在目标蛋白的赖氨酸残基上，附加一至多个101个氨基酸的SUM

23、O。SUMO修饰的激活因子蛋白不会导致降解，相反会被特异且稳定区隔在细胞核中，使其不能与靶基因序列互作。 （7）转录激活子的乙酰化组蛋白的赖氨酸残基能被组蛋白乙酰转移酶（HATs）乙酰化，从而减弱组蛋白的阻抑活性。乙酰转移酶（HATs）可以使非组蛋白激活因子和阻抑物发生乙酰化，并对乙酰化的蛋白活性产生正向或负向调控。 （8）信号转导途径蛋白质的磷酸化与去磷酸化过程是生物体内普遍存在的信息传导调节方式。信号转导途径通常由信号分子与细胞膜受体相互作用而激活，多引起基因表达的改变。多数信号转导途径，包括Ras-Raf途径，依赖蛋白质磷酸化来传递信号分子，并且此信号会逐级扩大。第十四章1 什么是编码区

24、，m RNA的组成？纪苏婷编码区指从起始密码子AUG开始经一连串编码氨基酸的密码子直至终止密码子的结构。mRNA是以DNA的一条链为模板，以碱基互补配对原则，转录而形成的一条单链。5端的结构称为帽子结构，3端的是一串AMP称做poly(A)2 什么是mRNA的前体？纪苏婷定位于细胞核内的较大RNA分子被认为是mRNA前体。3 核mRNA剪接的机理。索套结构指什么？纪苏婷从未成熟的mRNA中切除内含子，将外显子连接在一起形成最后产物的过程叫做RNA的剪接。hnRNA的大小（比mRNA大）和定位（细胞核）与未经剪接的 mRNA前体完全一致，而且，hnRNA很快会转化为比较稳定的小RNA，这暗示hn

25、RNA仅仅是形成稳定RNA的中间体。索套两步模型（two-step lariat model）。第一步，索套状中间产物的形成。当位于内含子中间的腺苷酸的2-OH攻击第一个外显子和该内含子开始处G之间的磷酸二酯键时，形成索套状环，同时将第一个外显子与内含子分开。第二步，完成剪接过程：第一个外显子末端留下的3端-OH攻击内含子与第二个外显子之间的磷酸二酯键。形成外显子-外显子磷酸二酯键，同时释放索套状的内含子。 可变剪接能够决定一个基因的蛋白质产物的性质，成为基因表达转录后水平的调控方式之一。 4 什么是可变剪接（alternative splicing）?纪苏同一前体mRNA分子，可以在不同的剪

26、接位点发生剪接反应，生成不同的mRNA分子，最终产生不同的蛋白质分子的一种RNA剪切方式。5 什么是RNA的自我剪接？group I和group II introns 的自我剪接方式由何不同？纪苏婷具有自我催化能力,将自身的某些部位切除的现象称为自我剪接。根据特定的保守序列，真菌线粒体基因最初被划分为两类：类和类。类内含子的自剪接反应由游离的鸟嘌呤核苷酸启动；类内含子的自剪接反应由内含子内部的腺苷酸启动，并形成套索结构。第十五章1 什么是mRNA的帽子结构？什么是capping?苏芳芳从真核生物到病毒来源的大多数mRNA都被甲基化了。而且，大部分甲基化都集中在mRNA的5端，在结构上称之为帽子

27、（cap）结构。 2 帽子的功能有哪些？（详述）苏芳芳（1）防止mRNA的降解； （2）增强mRNA的翻译能力；（3）增强mRNA从核内向细胞质中的转运；（4）增强mRNA的剪接效率。3 什么是Poly(A)? 什么是polyadenylation? Poly(A)的长度和功能？苏芳芳Poly(A)：在核内不均一RNA（hnRNA）和mRNA的3端共享一个独特的结构，即一个被称为poly(A)的AMP残基长链。Podenylation：给RNA添加poly(A)的过程称为多聚腺苷酸化。Poly(A)的长度是200个碱基。Poly(A)的功能:poly(A)具有保护mRNA免受降解的功能，pol

28、y(A)对它所连结的mRNA的翻译有促进作用，还有证据表明poly(A)在mRNA的剪接及转运出核时起一定的作用。4 RNA聚合酶II最大亚基上CTD的作用（延伸、剪接、加帽、加尾等各方面）。(详述)丁俊祥第十六章1 什么是cis-splicing 和trans-splicing? 反式剪接的机理。王欢顺式剪接：去分支酶只打开套锁结构使之成为线形反式剪接：100nt的半个内含子在3端是开放的而不是套锁结构的，所以去分支酶可以将它作为独立的RNA而释放它。2 什么是编辑？王欢是指转录后的RNA在编码区发生碱基的加入，丢失或转换等现象。它导致了DNA所编码的遗传信息的改变，因为经过编辑的mRNA序

29、列发生了不同于模板DNA的变化。编辑是转录后在mRNA的Poly（A）尾巴处发生的。编辑是按照3-5方向进行。3 什么是RNAi? 它的作用机理?王欢1、在这些生物中转入的转基因不是表达了，而是被该生物关闭了，被关闭的基因不仅仅是转入的基因还包括该基因在细胞中的正常拷贝。2、 dsRNA导致胚胎中产生RNA干涉。而且，在正进行RNA干涉的胚胎中检测到了相应的靶RNA的减少这种dsRNA必须包括外显子区，dsRNA相应的内含子和启动子序列不能引起RNA干涉。Dicer在RNAi 中对RNA进行切割。编码Dicer的基因Dicer表达产生一个可将dsRNA切成22nt的小片段的蛋白质。由它制备的抗

30、体可与果蝇提取物中的一个酶结合，该酶能将dsRNA切割成小的片段。将dicer相应的dsRNA 导入到果蝇细胞中，它能部分阻断RNAi的进行。Dicer也有RNA螺旋酶活性，因此它能将其构建的siRNA的双连解开。但不能对靶信使RNA进行切割，由酶slicer完成此项工作，蛋白质ArgonauteRNAi的第二步（Slicer）反应中是必需的，可以作为siRNA的停泊位点，但对于切割酶的切割活性它不是必需的。第十七章1 什么是30S起始复合体？30S起始复合体是如何形成的？IF因子在其中的作用。王欢（1）核糖体解离为50s和30s亚基后，细胞就在30s亚基上建立一个复合物，包括mRNA、氨酰t

31、-RNA和几个起始因子。（2）核糖体解离后形成50s和30s亚基IF因子紧密的结合在30s亚基上靠近16SRNA3-末端的一个位点上，一旦三个起始因子结合在一起，它们就将另外两个关键的参与者mRNA和初始氨酰-tRNA吸引到复合物上，后两者的结合顺序是随机的。（3）IF1激发核糖体的解离，IF3结合到游离的30s亚基上阻止它们与50s亚基重新结合再形成核糖体，IF2能够结合到30s亚基上。2 真核生物中翻译的起始有什么特点？与原核生物有什么异同点？（认真写）王欢 第一，真核生物的起始从甲硫氨酸，而不是N-甲酰甲硫氨酸开始。但起始tRNA与将甲硫氨酸加到多肽链内部的tRNA是不同的（tRNAmM

32、et）。起始tRNA携带的是非甲酰化甲硫氨酸，不适合叫tRNAfMet，而常被称做tRNAiMet 或者 tRNAi。第二个主要区别是，真核生物的mRNA没有Shine-Dalgarno序列来指示核糖体从哪儿开始翻译，大多数真核生物mRNA的5'-末端具有帽子结构（15章），以此指示起始因子结合并开始搜索起始密码子。3 什么是SD sequence? Kozak sequence?（概念）朱燕（1）SD序列是mRNA中用于结合原核生物核糖体的序列。（2）Kozak 序列存在于真核生物mRNA的一段序列，其在翻译的起始中有重要作用。核糖 体能够识别mRNA上的这段序列，并把它作为翻译起始

33、位点。第十八章1 mRNA的阅读方向？多肽的合成方向？朱燕答：已知蛋白质的合成方向是从氨基端至羧基端，那么很容易证明mRNA是按532 什么是genetic code? 标准遗传代码有多少个？遗传代码有什么特点？朱燕答：遗传密码：核酸中的核苷酸残疾序列与蛋白质中的氨基酸残基序列之间的对应关系。标准遗传代码有64个。遗传代码的特点：§ 每个密码子三联体决定一种氨基酸。§ 两种密码子之间无任何核苷酸或其他成分加以分离，即密码子无逗号。§ 密码子具有方向性。§ 密码子有简并性，一种氨基酸的现象称为密码子的简并性。§ 共有64个密码子。§ 密

34、码子有通用性，即无论是病毒、原核生物还是真核生物密码子的含义都是相同的。3 密码子和反义密码子的不寻常碱基配对指什么？通常发生在什么位置？陈凯答：一种方式可能是对同一个氨基酸具有多个tRNA（同工tRNA），每个都专一性地对应不同的密码子。确定的生物体中含有约60种tRNA。但理论上，比这个简单假设所预计的要少得多的tRNA就可以解决问题。 他假设密码子的前两位碱基必须按照Watson-Crick 碱基配对原则与反密码子严格配对，但是最后一位碱基则会从其正常位置发生“摆动”与反密码子形成反常的碱基配对。这个假说被称之为摆动假说。4 （7）什么是G protein? 有什么特点？哪些因子属于G

35、proteins？（选择 概念 填空）曹靖答：G蛋白是具有GTP酶活性，在细胞信号通路中起信号转换器或分子开关作用的蛋白质大多数G蛋白都具有以下特点 ：(1)G蛋白是GDP-和GTP-结合蛋白。G蛋白的“G”来自于“鸟嘌呤核苷酸”。(2)G蛋白在三种构象之间循环，取决于是否结合GDP、GTP，或不结合核苷酸，并且这些构象状态决定它们的活性。(3)G蛋白与GTP结合后才被活化执行功能。(4)G蛋白具有内在的GTP酶活性。(5)G蛋白的GTP酶活性被GTP酶活化蛋白激发。(6)当GAP激发G蛋白的GTP酶活性时，G蛋白将自己所结合的GTP降解成GDP，并使自身失活。（7）G蛋白被鸟嘌呤核苷酸交换蛋

36、白重新激活，该因子从失活的G蛋白上除去GDP，允许另一分子GTP结合。 属于G proteins因子有RF3、起始因子EF-G、延伸因子EF-Tu5 （8）什么是翻译的终止？有哪些终止密码？（选择。）陈凯答：延伸循环不断重复，每次就会在多肽链上加入一个新的氨基酸。最后，核糖体遇到终止密码子，获得信号，该是翻译终止。mRNA分子中的琥珀、赭石和蛋白石突变分别产生UAG、 UAA和UGA三个终止密码子，因此造成肽链翻译的提前终止。这三个密码子也是mRNAs编码区末端的正常终止信号。6 有哪些释放因子？它们是如何分工的？陈凯答：原核细胞的释放因子：a) 释放因子（RF1）与终止密码子UAA和UAG合

37、作，引起fMet的释放，而另一个释放因子（RF2）与UAA和UGA合作。 b) 第三个释放因子（RF3）是一个核糖体依赖的GTPase，结合GTP并帮助其它两个释放因子结合到核糖体上。 那么真核生物的释放因子又是怎样的呢？a) 1971年通过与Nirenberg相同的方法，发现了第一个真核释放因子（eRF）。 b) eRF能识别全部3个终止密码子，而不像原核细胞的两种释放因子都只能识别2个。 c) eRF也像原核细胞RF1和RF2一样，与G蛋白协作d) 真核细胞中包含两种释放因子，eRF（重命名为eRF1）和eRF3。e) eRF1具有与RF1和RF2相同的作用，eRF3与细菌RF3的作用相同

38、。 第十九章1 核糖体的主要活性位点有哪些？陈凯答：根据核糖体的位点和功能，我们可以区分出核糖体的几种活性。30S亚基结合mRNA和起始-tRNA起始因子复合体。然后它们结合50S亚基。70S核糖体可能具有供tRNA结合的两个功能位点：A位点和P位点。肽转移酶的中心在50S亚基上，EF-G结合位点以及负责移位的位点都在50S大亚基上。2 （9）tRNA三叶草结构名称及功能。（简答）曹靖答：tRNA的二级结构为三叶草结构。其结构特征为：tRNA的二级结构由四臂、四环组成。已配对的片断称为臂，未配对的片断称为环。(1)叶柄是氨基酸臂。其上含有CCA-OH3，此结构是接受氨基酸的位置。(2)氨基酸臂

39、对面是反密码子环。在它的中部含有三个相邻碱基组成的反密码子，可与mRNA上的密码子相互识别。(3)左环是二氢尿嘧啶环(D环)，它与氨基酰-tRNA合成酶的结合有关。(4)右环是假尿嘧啶环(TC环)，它与核糖体的结合有关。(5)在反密码子与假尿嘧啶环之间的是可变环，它的大小决定着tRNA分子大小tRNA的二级结构为三叶草结构。具五臂四环结构1.受体臂： 此臂负责携带特异的氨基酸。2.反密码子臂：负责对密码子的识别与配对。3. D臂：负责和氨基酰tRNA合成酶结合;4. TC臂：此臂负责和核糖体上的rRNA识别结合；5.额外环：其功能是在tRNA的L型三维结构中负责连接两个区域。第二十章1. 什么

40、是Semiconservative Replication、conservative replication、dispersive replication？魏珍珍答：半保留复制(Semiconservative Replication) ，是由于每一个子代双链都是由一条母链和一条新链组成，换言之，在每一个子代双链中“保留”其中一条母链。 保留复制(conservative replication)，按这种复制机制，两条母链始终在一起，然后以某种方式产生另一个由两条全新链组成的子代DNA双链。 弥散复制（或称散乱复制，dispersive replication），按这种复制机制， DNA先片段

41、化，复制后，新合成的和原有的DNA共存于同一条链中。2. 什么是Semidiscontinuous Replication？魏珍珍答：自然界中所有复制机器的DNA合成部件（DNA 聚合酶）只能沿53一个方向合成DNA，当复制叉打开，露出一段新的DNA区域待复制时，滞后链沿却沿“错误的”方向伸长，离开了复制叉。复制这一新暴露区域的唯一办法是在已经复制的DNA片段后面，从复制叉处重新启始DNA合成。这种DNA合成的启始和再启始一遍一遍地反复进行，所产生的DNA片段必须以某种方式连接到一起形成连续的链，成为DNA复制的最终产物。这样的复制机制叫半不连续复制3. 什么是Okazaki fragment

42、s？魏珍珍DNA复制的最初产物，被称为冈崎片段（Okazaki fragments）4. （10）什么是复制子（replicon）？真核与原核replicon的数目有何不同？原因？曹靖答：复制子：在一个复制原点控制下的DNA被称为复制子，尽管它可能有两个复制叉。原核生物一般来说只有一个复制起点，整个DNA都由这个起点开始的复制叉完成，所以它们的DNA是“单复制子”的。真核细胞是多个复制起点，每个起点开始各自完成一个片段最终相连完成整体复制，所以是“多复制子”的。原核生物的染色体和质粒、真核生物的细胞器DNA都是环状双链分子，它们都是单复制子，都在一个固定的起点开始复制，复制方向大多数是双向的，

43、少数是单向复制。多数是对称复制，少数是不对称复制（一条链复制后才进行另一条链的复制）。原核基因组中只含有一个复制子，所以复制的单位就是分离的单位。5. 复制的方向6. 什么是解链酶（Helicase）有什么作用？杨春答：复制子：在一个复制原点控制下的DNA被称为复制子，尽管它可能有两个复制叉。原核生物一般来说只有一个复制起点，整个DNA都由这个起点开始的复制叉完成，所以它们的DNA是“单复制子”的。真核细胞是多个复制起点，每个起点开始各自完成一个片段最终相连完成整体复制，所以是“多复制子”的。原核生物的染色体和质粒、真核生物的细胞器DNA都是环状双链分子，它们都是单复制子，都在一个固定的起点开

44、始复制，复制方向大多数是双向的，少数是单向复制。多数是对称复制，少数是不对称复制（一条链复制后才进行另一条链的复制）。原核基因组中只含有一个复制子，所以复制的单位就是分离的单位。7. 什么是单链DNA结合蛋白（SSBs）有什么作用？杨春答：在DNA复制时参与解离DNA链的蛋白称为单链DNA结合蛋白（SSBsDNA结合蛋白SSB可增强解链酶活性。DnaG 和SSB单独或两者一起均没有任何DNA解链酶活性。 单链DNA结合蛋白（SSBs），这些蛋白并不能象解旋酶那样催化DNA链解离，而是一旦单链DNA形成，这些蛋白就选择性地与之结合，包裹在单链DNA上使其不能退火重新形成双螺旋。单链DNA结合蛋白使DNA保持单链状态，还能增强同源DNA聚合酶的活性。在真核生物中并没有发现具有相似重要性的SSB。病毒基因编码的SSB在某些真核生物病毒DNA复制过程中发挥主要作用，包括腺病毒和疱疹病毒的DNA复制。8. 三种E.coli DNA Polymerases的功能有何差异？杨春答：Pol I修复有关的酶并非真正的 DNA复制酶