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文档简介

1、一、名词解释:转录:是指以为模板,在依赖于的聚和酶催化下,以4中(、和)为原料,合成的过程。转录单位():从启动子到终止子的序列(转录起始点)。模板链():又称反义链,指与转录物互补的链(极性方向3-5)。编码链:又称有义链,指不作模板的单链(极性方向5-3)。:核内不均一,是存在于真核细胞核中的不稳定,大小不均一的一组高分子的总称。转录的极性:转录的效率与转录单位的位置有关。转录起始:聚合酶与转录启动子结合形成有功能的转录起始复合物的过程。启动子():指分子上被聚合酶、转录调节因子等识别并结合形成转录起始复合物的区域。核心启动子:聚合酶能够直接识别并结合的启动子。聚合酶:是催化以为模板()、

2、三磷酸核糖核甘为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成的酶。C端结构域():II的大亚基中有C末端结构域。中含一保守氨基酸序列的多个重复C端重复七肽。沉默子():沉默子能够同反式因子结合从而阻断增强子及反式激活因子作用并最终抑制该基因的转录活性的真核基因中的一种特殊的序列。增强子():是一类正调控元件,能够从转录起始位点的上游或下游数千个碱基处来激活转录。绝缘子():阻断增强子或沉默子的序列。上游:转录起点上游的序列,是调控区,与转录的方向相反。下游:转录起点下游的区域,是编码区,与转录的方向一致。转录起点:+1位点,聚合酶的转录起始位点,起始多为或。转录泡:在转录时聚合酶r(n)与模板结合,会形成

3、一个泡状结构,成为转录泡。转录压制:指转录因子的过度表达,抑制受特异性调节基因的基本转录装置,引起转录抑制。上游激活序列():框上游的保守序列称为上游启动子元件或上游激活序列。锌指结构:在蛋白质中,一小段保守的氨基酸序列(约23个氨基酸残基)结合一个锌离子而形成的一个相对独立的功能域。终止子():在转录的过程中,提供转录终止信号的序列。抗终止子:有的蛋白因子能作用于终止序列,减弱或取消终止子的作用,称为抗终止作用,这种蛋白因子就称为抗终止因子。/引起抗终止作用的蛋白质。加工:指新合成的前体分子所经历的结构和化学方面的修饰与成熟的过程。帽子结构:在链长度超过20-30之前,其5端经化学修饰被加上

4、了一个7-甲基鸟昔残基,这种5末端的修饰称为帽子结构(A)尾巴:核内不均一和在其3-末端的一个独特的结构,由残基组成的长链。多聚腺甘化():添加(A)到分子上的过程。序列:原核生物起始密码子上游7-12个核甘酸处一段可以与16的3端反向互补保守区。选择性剪接:一个()转录本,通过外显子的剪接、重组,产生多个成熟的的机制。组成性剪接:一个基因的转录产物通过剪接只能产生一种成熟的.它和选择型剪接的区别是后者可以产生多种成熟。剪接体:在剪接过程中形成的剪接复合物称为剪接体,剪接体的主要组成是蛋白质和小分子的核()。复合物的沉降系数约为5060S,它是在剪接过程的各个阶段随着的加入而形成的。编辑:指由

5、水平的核甘酸改变所引起的密码子发生变化的一种预定修饰,一种编辑是以另一为模板来修饰前体。内含子:断裂基因的非编码区,可被转录,但在加工过程中被剪切掉。外显子:断裂基因中的编码序列,在剪接后仍保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。断裂基因:真核生物结构基因,由若干个编码序列和非编码序列互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码序列再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋启动子的清理:当开放的启动子复合物足够稳定是,聚合酶离开启动子,释放出(T亚基,核心酶空出启动子位点以进行下一次转录起始。指导:一类小分子,其部分序列可与被编辑的序列互补。3类特异性转录因子:酸性功能域、富含功能域、富

6、含功能域以3种方式发挥作用:改变构象影响基本转录起始复合体装置影响其他调节因子的活性转录3个过程(起始、延伸、终止)真核生物中有三种不同的聚合酶,因此也有三种不同的启动子:I启动子、n启动子、田启动子。说明全酶各个亚基的主要功能。(2)6亚基:转录起始时与核心酶结合成全酶,使全酶能识别启动子的(-35区,R位点)、(-10区,B位点),选择并紧密与模板链发生特异性结合。不同的(7因子与核心酶结合,可识别不同的启动子。全酶完成转录发动后,(7亚基离开全酶。可重复使用。a亚基:核心酶的组建因子,促使与模板链结合前端a因子-使模板双链解链为单链尾端a因子-使解链的单链重新聚合为双链B亚基:模板链结合

7、位点,包含杂交链结合位点?完成之间的磷酸酯键的连接?编辑功能(排斥与模板链不互补的碱基)?与(p)因子竞争3?构成全酶后,B因子含有两个位点:起始位点1(.):对利福平敏感,该位点专一性地结合或者(需要高浓度的或)延伸位点E():对利福平不敏感,对没有专一性的选择,从而保证了链的延伸(2) B亚基:促进聚合酶与非模板链结合。聚合酶核心酶4个功能位点:非模板链结合位点、模板链结合位点、双链解旋位点、双链重绕位点原核生物启动子结构及各部分功能。答:启动子由两个部分组成:上游部分:上游控制因子():的结合位点:降解物基因活化蛋白:环腺甘酸()的受体蛋白下游部分:核心启动子():-35区(识别位点,R

8、)、一10区(结合位点,B)、转录起点(+1位点,I)盒:-35区序列(),位于复制起点上游35区处的6核甘酸序列,能直接被聚合酶全酶中的6因子识别并结合。盒:-10区序列(),位于-10区处的6核甘酸序列,能使聚合酶识别双链中的模板链,确保转录的链和方向无误。真核生物启动子I:负责转录顺式作用元件:(上游启动子元件)、(核心启动子元件)反式作用因子:(上游启动子元件结合因子)、1(选择性因子)H:负责转录(前体,核不均一)、部分(核内小分子)顺式作用元件:+1区、-30区、-70区、-90区(、)反式作用因子:HA、HB、HDHE、HF、UH田:负责转录5S、的前体、序列和部分顺式作用元件:

9、内部启动子I(A、B)内部启动子H(A、B)反式作用因子:内部启动子I(mcinB)内部启动子n(mA、me、mB)(mC:辅助mbmB:定位因子,结合到上游)在与结合后,1方可结合上来,它类似原核生物聚合酶中的6因子,确保聚合酶正确定位在起始点上。与聚合酶I相互作用可识别不同来源的模板,但1具有种属特异性。mA:mA在一行上有9个锌指,他们会插入到5S基因内部启动子的每一面的大沟中,这就使特异的氨基酸能够与特异的碱基接触并相互作用,形成致密的复合物。启动子上游元件():岛():严格控制的转录启动盒(T):决定启动子起始转录的效率,增强启动子的强度试比较原核和真核细胞的的异同.原核生物原核生物

10、的半衰期短。许多原核生物以多顺反子形式存在。其5端无帽子结构,3端没有或只有较短的(A)o原核细胞(包括病毒)有时可以编码几个多肽。原核生物常以(有时,甚至)作为起始密码子真核生物:其5端存在帽子结构。绝大多数真核生物具有(A)尾巴。其最多只能编码一个多肽。真核生物几乎永远以为起始密码子。剪接分支位点核甘酸是腺喋吟核糖核甘酸链合成的特点:1是按5-3方向合成.以双链中的反义链(模板链)为模板.以4种三磷酸核甘()为原料.根据碱基配对原则.各核甘酸间通过形成磷酸二酯键相连.不需要引物.合成的带有于编码链相同的序列真核生物聚合酶n转录起始HD因子对盒的识别,nA与HD和其中的结合,增强并稳定HD与

11、盒的结合,形成“前转录起始复合体()”(nD因子盒结合蛋白、至少8个辅助因子)随后RB作为RD和聚合酶的桥梁因子,富集高浓度聚合酶到启动子周围,nF和RH使解螺旋后有助于聚合酶的转录与移动。形成“基本转录起始复合体()”HH的激酶活性使HA型的发生高频的磷酸化,转换为HO型的高转录活性的聚合酶。形成“完全的转录起始复合体()”聚合酶在启动转录前清理转录起始复合体后,仅与nF因子一起完成转录的延伸(nD:对增强子和沉默子作出反应)原核生物与真核生物启动子的主要差别?原核生物起始位点-35-10真核生物增强子一5一起始位点-110-70-25增强子的组织和细胞学表达特性:(1)远距离作用(2)增强

12、子的位置无需固定,可在受其调控基因的上游、下游、或内部。(3) 一个增强子可以包含一个以上能够被转录激活子识别的元件。 沉默子:可以在远距离调控转录(至少1以外)。可以使染色质卷曲成浓缩的难以接近的非活性的形式。与组蛋白的去乙酰化有沉默子是一种通过延伸的异染色质化而影响染色质结构,形成高密度的异染色质,从而关闭转录的元件。 绝缘子:是一段具有特化染色质结构的区域,能够阻断增强子和沉默子对靶基因的作用效应。当绝缘子位于增强子和启动子之间时,可以阻断增强子上的激活子与下游基本转录复合物的结合,从而阻止增强子对启动子的表达效应。当绝缘子位于沉默子和启动子之间时,可以提供一道屏障墙,阻止沉默子的异染色

13、质化区域的延伸,从而阻断沉默子对下游靶基因的失活效应。 终止子:1)一种是依赖p因子(p)的转录终止子2)一种是不依赖p因子的转录终止子帽子结构的功能保护,防止降解。将转运出细胞核。增强的可译性。帽子结构是正确剪切所必需。与某些病毒的正链的合成有关,抢夺宿主的帽子5端完整的帽子结构将有利于第一个内含子的剪切(A)尾巴的作用:稳定,防止降解。促进的翻译。在拼接和向核外运输的过程中发挥作用。多腺甘酸化的意义:参与新生从聚合酶n三联体复合物中的释放与转录偶联既能促进转录终止,也能防止“早熟”参与前体的3端内含子的去除稳定影响翻译效率的降解:作为合成蛋白质的模板,在完成任务后,就到达细胞的一定部位死亡

14、。细胞对于的命运具有空间控制作用。过程:真核细胞中降解的前奏是先去掉尾,然后触发了5帽子的去除,最后导致被一种外切酶从5一3降解。4P是一种去掉的尾巴的酶,而去帽酶则位于P小体内第一类内含子剪接的机制:剪接活性由35s自身催化()完成,剪接过程不需任何酶类与能量的参与。剪接反应只要求鸟甘酸的3。一处的磷酸酯键转化为另一处新的磷酸酯键,不需以分解高能前体物()为代价而形成新的磷酸酯键,破坏的磷酸酯键与形成的磷酸酯键总是相等。这类内含子的剪接包括三次转酯反应第一次转酯反应由游离的G发动,G的3攻击内含子的5末端,产生内含子和外显子游离的3末端。第二次转酯反应由上一个外显子的3攻击另一个外显子,并与

15、之相连,同时释放线状的内含子。游离的线状内含子发生第三次转酯反应而形成环状。编辑()的生物学意义形成/删除,改变信息扩大编码的遗传信息量较大程度地改变了的遗传信息,使该基因的序列仅是一串简略意义模糊的序列()或称为隐秘基因、模糊基因真核生物5端帽子结构与3尾巴结构的主要功能5端“帽子”结构的功能:稳定的一级结构,防止被5-核酸外切酶所水解;为识别核糖体提供信号,使较快地与核糖体结合,以提高对蛋白质的合成效率。3端尾巴结构的功能:有助于从细胞核向细胞质转移;与保护的稳定性和维持的二级结构有关;对蛋白质的合成速度有影响。1、转录是以一条链为模板的的酶促合成。我们把模板链称为有意链。2、数个生化反应

16、可由核酶催化,这种具有催化功能的可以剪切自身或其它的分子,或者完成连接或自身剪接反应。3与之间的差别主要有两点大小、翻译功能。4在转录开始后不久就与核糖体结合,形成颗粒这种颗粒排列于分子上,呈申珠状,就像核小体一样。5、原始转录物的一些序列被修饰,叫做编辑。6,真核生物的5-帽子结构是m7具3末端有结构7.原核生物指导的聚合酶的核心酶的组成是a亚基、a亚基、B亚基、B亚基。8,真核生物聚合酶负责转录、5S、序列和部分。9 .在转录过程中聚合酶全酶的因子负责识别启动子的(一35区),并通过(7与模板链结合,核心酶负责转录起始和延伸。10 .将区上游的保守序列称为盒。11 .真核生物的加工过程中,

17、5端加上帽子结构,在3端加上多腺甘酸尾巴,后者由末端腺昔转移酶催化。如果转录的基因不连续,那么,一定要被切除,并通过剪接,将外显子连在一起。12 .每个锌指的末端形成一个a-螺旋,在大沟的转折处与结合。有锌参与时才具备转录调控活性。134蛋白是参与半乳糖代谢的一套基因表达的正调节因子。4能够识别这些基因上游激活序列。13 蛋白是原核生物的阻遏物,在大肠杆菌细胞中,结合在操纵子上,能够阻止下游基因的表达。蛋白无转录激活域,因为蛋白无转录激活功能。14 ,激活域的功能是将聚合酶募集到启动子处,让结构基因开始表达。16.未甲基化帽子的底物在剪切时,可以被腺甘酸-同型半胱氨酸抑制,此物质也是帽子甲基化

18、过程的抑制剂。17基序在多腺昔化位点上游20处。多聚腺甘化的能力取决于一致序列的保守性。18 .多聚腺甘酸化涉及前体的切割和在切割位点的多聚腺甘酸化两个过程。19 .16S的3端即非常保守,又高度自我互补,能形成发卡式结构。这正好说明了序列配对是动态的,可变的。20 .L19是剪切下来的内含子,L19可以促进重排,作为异构酶;具有酶的基本共性21 .在的5-末端,锚定序列能够引导到达将被编辑的区域。四、简述转录的基本过程?答:模板识别:聚合酶与双链启动子相互作用并与之相结合。转录起始转录延伸:聚合酶释放因子离开启动子,核心酶沿模板链移动并使新生链不断伸长。(nS刺激延伸;nS负责转录产物的矫正

19、)转录终止:当链延伸到转录终止位点时,聚合酶不再形成新的磷酸二酯键,杂合物分离,转录泡瓦解,恢复成双链状态,而聚合酶和链都被从模板上释放出来。说明(A)在分子生物学实验中的应用价值。a)可将()与载体相连,从总体中分离纯化b)用寡聚()为引物,反转录合成帽子的种类。帽子0(0)m7(共有)m7GN7一甲基鸟昔帽子1(1)m7第一个核甘酸的2位上产生甲基化(AN6位甲基化)帽子2(2)m7第二个核甘酸的2位上产生甲基化(A、GC、U)真核生物前体内含子剪接的信号序列特征是什么?前体中内含子的两端边界存在共同的序列,这些序列可能是产生前体剪接的信号。多数细胞核前体中内含子的5边界序列为,3边界为。

20、 I型内含子发生改变后,可以产生其他酶的活性吗?如果可以,是哪些活性?这意味着I型内含子的催化中心有什么特点?答:可以。这些活性包括:聚合酶、内切核酸酶、磷酸酶、连接酶的活性。将I型内含子转变成这些酶的能力表明它能结合于的糖一磷酸骨架并能催化在它前后的几个不同反应。 转录涉及模板链和编码链的分离,解释在转录中单链是怎样被保护的。答:转录过程中控板与编码链分离时,聚合酶覆盖了整个转录泡一一从解旋位点到螺旋重新形成位点,因此单链的被保护起来。 哪三个序列对原核生物的精确转录是必不可少的? 答:-35(聚合酶结合位点)、-10(聚合酶起始位点)启动子序列和终止子;试证明一个基因中只有一条链作为模板被转录。答:若基因两条链均被转录,而聚合酶只能以5-3方向合成,所以两条链会以相反方向转录。两信使携带着彼此互补的反向核甘酸序列,编码不同的多肽。信使只可以与一条链(重链)互补,因而双链中只有一条链作为转录的模

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