医学信息检索和利用讲义

1、医学信息检索和利用讲义一、学习医学信息检索课一、学习医学信息检索课的目的和意义的目的和意义 （一）（一） 提高信息素质与信息检索提高信息素质与信息检索 （二）（二） 科技创新与信息检索科技创新与信息检索（一）信息素质教育与信息检索（一）信息素质教育与信息检索信息素质信息素质( (Information Literacy)Information Literacy) 人们在工作中运用信息、学人们在工作中运用信息、学习信息技术、利用信息解决问题的习信息技术、利用信息解决问题的能力。能力。 信息素质的构成要素：信息素质的构成要素： （1 1）信息意识信息意识 （2 2）信息能力信息能力 信息检索力信息

2、检索力: :指熟悉各种信息源，掌指熟悉各种信息源，掌握信息检索的基础理论和基本技术，熟握信息检索的基础理论和基本技术，熟练地利用各种手工检索工具和计算机检练地利用各种手工检索工具和计算机检索系统查找所需信息的能力索系统查找所需信息的能力 （3 3）信息道德信息道德 信息素质能力的评价标准信息素质能力的评价标准“美国高等教育中学生信息素质能力标准美国高等教育中学生信息素质能力标准”：能确定信息资源的特点和范围；能确定信息资源的特点和范围；能有效地获取所需信息；能有效地获取所需信息；能评价信息及其来源，利用其知识基础和能评价信息及其来源，利用其知识基础和价值系统选择适当的信息；价值系统选择适当的信

3、息；能有效利用所获得的信息实现特定的目标；能有效利用所获得的信息实现特定的目标；在信息获取和利用时自觉遵守道德规范和在信息获取和利用时自觉遵守道德规范和有关的法律。有关的法律。（二）科技创新与信息检索（二）科技创新与信息检索科技信息是知识创新的源泉：科技信息是知识创新的源泉： 世界上任何一项科研成果或创新都世界上任何一项科研成果或创新都是在吸取和借鉴前人或他人研究成果是在吸取和借鉴前人或他人研究成果的基础上，再加上自己的钻研和创新的基础上，再加上自己的钻研和创新所获得的。所获得的。科技信息是科研的先决条件。科技信息是科研的先决条件。 科研选题与信息检索科研选题与信息检索 科研选题就是形成、选择

4、和确定科研选题就是形成、选择和确定所要研究和解决的课题。所要研究和解决的课题。 科研选题是科学研究的起始步骤。科研选题是科学研究的起始步骤。它关系到科学研究的方向、目标和内它关系到科学研究的方向、目标和内容，直接影响科研的途径和方法，决容，直接影响科研的途径和方法，决定着科研成果的水平，价值和发展前定着科研成果的水平，价值和发展前途。途。1 1、科研选题的步骤一般是：、科研选题的步骤一般是： 文献调研和实际考察文献调研和实际考察提出选提出选题题初步论证初步论证评议和确定课题。评议和确定课题。 2 2、选题的过程是一个不断反馈调整的、选题的过程是一个不断反馈调整的过程，常常需要反复文献调研和多次

5、过程，常常需要反复文献调研和多次论证，要继承已有的研究成果，并防论证，要继承已有的研究成果，并防止低水平重复。止低水平重复。3 3、科研选题应遵循的基本原则、科研选题应遵循的基本原则 科学性原则科学性原则 创造性原则创造性原则 需要性原则需要性原则 可行性原则可行性原则（1 1）科学性原则：）科学性原则： 科研选题既要尊重所依据的科学科研选题既要尊重所依据的科学理论和科学事实，同时还要随着基础理论和科学事实，同时还要随着基础事实和背景理论的改变而对选择的课事实和背景理论的改变而对选择的课题进行调整。题进行调整。（2 2）创造性原则：）创造性原则： 概念、理论、方法、或应用上的概念、理论、方法、

6、或应用上的创新创新 创造性原则实质上是要求做到：创造性原则实质上是要求做到：在选题时熟悉别人已经进行过的工作，在选题时熟悉别人已经进行过的工作，避免重复劳动；课题论证时恰当估计课避免重复劳动；课题论证时恰当估计课题的意义和可能包含创造性成份。题的意义和可能包含创造性成份。 二、医学信息检索的基本概念二、医学信息检索的基本概念（一）信息（一）信息知识知识文献文献 信息：信息： 对现实世界事物的反映对现实世界事物的反映。 在自然界、人类社会以及人类思维活在自然界、人类社会以及人类思维活动中普遍存在，是物质存在方式及其运动动中普遍存在，是物质存在方式及其运动的规律、特点的外在表现。的规律、特点的外在

7、表现。 知识：人们通过信息对世界的认识与掌握，知识：人们通过信息对世界的认识与掌握，是人的大脑通过思维重新组合的系统化信是人的大脑通过思维重新组合的系统化信息的集合。息的集合。 文献：记录有知识的一切载体。文献：记录有知识的一切载体。（二）信息检索与文献检索二）信息检索与文献检索 信息资源：信息资源： 可供人类开发利用的各类信息的可供人类开发利用的各类信息的集合。分为非文献信息资源和文献信集合。分为非文献信息资源和文献信息资源两大类。息资源两大类。信息检索：信息检索： 收集、组织、存储一定范畴的信息，并可收集、组织、存储一定范畴的信息，并可供用户按需要查询信息的技术和过程。供用户按需要查询信息

8、的技术和过程。 信息组织的方法即信息加工、标引等（主信息组织的方法即信息加工、标引等（主题词、分类题词、分类. .） 信息检索可分为三类信息检索可分为三类 ： 事实型信息检索事实型信息检索 数据型信息检索数据型信息检索 文献型信息检索文献型信息检索 文献检索：文献检索： 以某些特定的文献信息资源为检以某些特定的文献信息资源为检索对象，以获取文献信息为目的的信索对象，以获取文献信息为目的的信息检索。息检索。 检索结果是切题文献或相关文献检索结果是切题文献或相关文献的文献线索或具体的文献。的文献线索或具体的文献。 根据检出内容的祥略，文献检索根据检出内容的祥略，文献检索又可以分为书目检索和全文检索

9、。又可以分为书目检索和全文检索。 （三）文献信息资源的分类（三）文献信息资源的分类1、按文献的出版形式分、按文献的出版形式分 图书图书 期刊期刊 报纸报纸 特种文献特种文献：科技报告、会议文献、专利文科技报告、会议文献、专利文献、学位论文、档案资料、产品资料等。献、学位论文、档案资料、产品资料等。期期 刊刊核心期刊：刊载某学科文献密度大、载文核心期刊：刊载某学科文献密度大、载文率、被引用率及利用率较高，深受本学率、被引用率及利用率较高，深受本学科专家和读者关注的期刊中的精华。科专家和读者关注的期刊中的精华。评价期刊的常用工具：评价期刊的常用工具： 医学核心期刊指南医学核心期刊指南 中文核心期刊

10、要目总览中文核心期刊要目总览 JCR（Journal Cition Report，期刊，期刊引用报告）。引用报告）。确定核心期刊和评价期刊质量的常用方确定核心期刊和评价期刊质量的常用方法：载文率法和引文法。法：载文率法和引文法。IF（影响因子）（影响因子）= 某年内某年内SCI来源刊引来源刊引用该刊前二年发表论文总次数用该刊前二年发表论文总次数 / 该刊该刊前二年发表论文篇数前二年发表论文篇数II（当年被引率）（当年被引率）=某刊当年发表的论某刊当年发表的论文被文被SCI来源刊引用的次数来源刊引用的次数 / 该刊当年该刊当年发表论文篇数发表论文篇数 2、按文献的载体形式按文献的载体形式 印刷型

11、文献印刷型文献 缩微型文献缩微型文献 声像资料声像资料 机读型电子出版物机读型电子出版物 电子期刊电子期刊 电子期刊的定义：电子期刊的定义： 指从投稿、编辑、出版、发行、订指从投稿、编辑、出版、发行、订购、阅读乃至读者意见反馈的全过程都购、阅读乃至读者意见反馈的全过程都是在网上进行，任何阶段都不需用纸的是在网上进行，任何阶段都不需用纸的新型出版物，称网络电子期刊。新型出版物，称网络电子期刊。 电子期刊的特点：电子期刊的特点： 信息速发性高、信息量大、信息共信息速发性高、信息量大、信息共享性强、交互性强、可读性强、易检索、享性强、交互性强、可读性强、易检索、良好的信息扩展性、内容、形式多样良好的

12、信息扩展性、内容、形式多样 从网络获取电子期刊的方式：从网络获取电子期刊的方式： 出版商、代理商、搜索引擎、出版商、代理商、搜索引擎、其它网站的友好链接、专门收集期其它网站的友好链接、专门收集期刊的站点刊的站点 3、按文献的内容加工级次、按文献的内容加工级次 一次文献：原始文献一次文献：原始文献 二次文献：对一次文献进行加工整二次文献：对一次文献进行加工整序后衍生得到的文献。主要是揭示和报序后衍生得到的文献。主要是揭示和报道一次文献，提供查找一次文献的线索。道一次文献，提供查找一次文献的线索。 三次文献：包括综述、评论、进展三次文献：包括综述、评论、进展等。等。 零次文献：未经发表或进入社会交

13、零次文献：未经发表或进入社会交流、未经系统加工整理的原始文献记录。流、未经系统加工整理的原始文献记录。 三、文献信息检索语言三、文献信息检索语言 文献信息检索语言：文献信息检索语言： 根据文献信息检索的需要而创根据文献信息检索的需要而创制的人工语言。制的人工语言。 检索语言分为描述文献外表特征的检索语言分为描述文献外表特征的语言和描述文献内容特征的检索语语言和描述文献内容特征的检索语言两大类。言两大类。描述文献外表特征的检索语言：描述文献外表特征的检索语言： 题名索引、著者索引、引文索引、序号索引等。题名索引、著者索引、引文索引、序号索引等。描述文献内容特征的检索语言：描述文献内容特征的检索语

14、言： 分类检索语言分类检索语言 主题检索语言主题检索语言 代码检索语言：用代表事物的代码作为标识系统代码检索语言：用代表事物的代码作为标识系统的索引语言。（化合物分子式索引、环状化合物环系的索引语言。（化合物分子式索引、环状化合物环系索引、化学物质号索引等）索引、化学物质号索引等） 。（一）分类语言及中图法（一）分类语言及中图法分类语言：分类语言： 一种用分类号表达文献中的各种概一种用分类号表达文献中的各种概念，按学科、专业对各种概念加以分类念，按学科、专业对各种概念加以分类和系统排列的文献信息检索语言。和系统排列的文献信息检索语言。 （美国国会图书馆图书分类法、杜威（美国国会图书馆图书分类法

15、、杜威十进分类法、国际十进分类法、中国图十进分类法、国际十进分类法、中国图书馆分类法、国际疾病分类等）书馆分类法、国际疾病分类等） 我国文献分类的主要依据是我国文献分类的主要依据是中国中国图书馆分类法图书馆分类法（简称（简称中图法中图法）。）。 中图法中图法 定义：定义： 依一定的思想观点，以学科分类依一定的思想观点，以学科分类为基础，综合图书资料的内容、特点，为基础，综合图书资料的内容、特点，分门别类组成的分类表。分门别类组成的分类表。 以等级制为标记制度，依照从总以等级制为标记制度，依照从总分、一般分、一般特殊、低级特殊、低级高级、高级、简单简单复杂的逻辑次序，逐层展开各复杂的逻辑次序，逐

16、层展开各门学科知识的类目等级体系，系统地组门学科知识的类目等级体系，系统地组织文献。织文献。 中图法第四版将文献知识分为中图法第四版将文献知识分为5 5大部类，即马、列、毛泽东思想；哲大部类，即马、列、毛泽东思想；哲学；社会科学；自然科学；综合性图学；社会科学；自然科学；综合性图书。下分书。下分2222个基本大类。个基本大类。 例如例如 O：数理科学、化学：数理科学、化学 Q：生物科学：生物科学 R：医药卫生：医药卫生 每个类目采用拉丁字母和阿拉伯数字每个类目采用拉丁字母和阿拉伯数字相结合的混合号码相结合的混合号码R 医药、卫生（医药、卫生（17个二级类目）个二级类目） 1 预防医学、卫生学预

17、防医学、卫生学 2 中国医学中国医学 3 基础医学基础医学 4 临床医学临床医学 5 内科学内科学 6 外科学外科学 71 妇产科学妇产科学 72 儿科学儿科学 73 肿瘤学肿瘤学 74 神经病学与精神病学神经病学与精神病学 75 皮肤病学与性病学皮肤病学与性病学 76 耳鼻咽喉科学耳鼻咽喉科学 77 眼科学眼科学 78 口腔科学口腔科学 79 外国民族医学外国民族医学 8 特种医学特种医学 9 药学药学 每个类目还可细分至六、七级类目，如每个类目还可细分至六、七级类目，如 ： R6 外科学外科学 R65 外科学各论外科学各论 R655 胸部外科学胸部外科学 R655.1 胸壁胸壁 R655.

18、2 胸膜胸膜 R656 腹部外科学腹部外科学 R656.1 急腹症急腹症 R656.2 腹部疝腹部疝 R656.3 腹壁腹壁 R656.31 腹壁炎症腹壁炎症 R656.32 腹壁损伤腹壁损伤（二）文献标识码（二）文献标识码 文献标识码与中图法分类号不是一回事文献标识码与中图法分类号不是一回事 根据中国学术期刊检索与评价数据规根据中国学术期刊检索与评价数据规范的规定，对文献标识码规定如下：范的规定，对文献标识码规定如下： A理论与应用研究学术论文理论与应用研究学术论文（含综述）（含综述） B实用性技术成果报告实用性技术成果报告 C业务指导与技术管理性文章业务指导与技术管理性文章 D一般动态性信

19、息（通讯、报一般动态性信息（通讯、报导、会议活动、专访等）导、会议活动、专访等） E文件、资料文件、资料 （三）主题语言（三）主题语言 主题检索语言：主题检索语言：一种采用描述文献主题一种采用描述文献主题内容的词语标识并按照字顺排检文献的内容的词语标识并按照字顺排检文献的检索语言。主要包括主题词和关键词两检索语言。主要包括主题词和关键词两种。种。 叙词法：严格规范化、可进行概念组配、叙词法：严格规范化、可进行概念组配、具有完善参照系统、具有范畴索引等。具有完善参照系统、具有范畴索引等。 关键词法：以出现在文献的标题、摘要关键词法：以出现在文献的标题、摘要或全文中能表达文献实质内容的词或关或全文

20、中能表达文献实质内容的词或关键性专业名词术语作为检索标识。键性专业名词术语作为检索标识。1 1、主题语言、主题语言主题词主题词 主题词：主题词： 又称叙词，是以规范化的词汇来表又称叙词，是以规范化的词汇来表达文献内容的主题。达文献内容的主题。 规范化也就是对文献中的同义词、规范化也就是对文献中的同义词、近义词、多义词等加以规范，同一主题近义词、多义词等加以规范，同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下。概念的文献相对集中在一个主题词下。 采用参照系统间接反映主题概念之间的采用参照系统间接反映主题概念之间的关系关系 如：如：“肾功能衰竭肾功能衰竭” renal failure 或或 Kidney

21、 failureMESH: renal failure see Kidney failure 采用主题词检索，能实现较高的查全率采用主题词检索，能实现较高的查全率和查准率。和查准率。 2 2、主题语言、主题语言关键词关键词 关键词关键词： 非规范化（未经严格规范化处理）检非规范化（未经严格规范化处理）检索语言，属于自然语言范畴。能够及时索语言，属于自然语言范畴。能够及时反映文献的最新信息，用法简便。反映文献的最新信息，用法简便。 如：如：Apoptosis 但对同义词、近义词未经严格规范，但对同义词、近义词未经严格规范，因此同一主题概念的文献标引相对分散，因此同一主题概念的文献标引相对分散，容

22、易导致漏检和误检。容易导致漏检和误检。3 3、医学主题词词表、医学主题词词表MeSHMeSH Medical Subject Headings（MeSH） 美国国立医学图书馆编制的权威性主美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表。题词表。 规范化的可扩充的动态性叙词表。规范化的可扩充的动态性叙词表。 汇集约汇集约18,00018,000多个医学主题词。多个医学主题词。 MeSH 附有各种参照和注释，它是对生附有各种参照和注释，它是对生物医学文献进行标引和检索的依据。物医学文献进行标引和检索的依据。 MeSH引入范畴表引入范畴表(树形结构树形结构,Tree Structure)，将主题词按其学科性

23、质、，将主题词按其学科性质、词义范围的上下类属及派生关系，分别词义范围的上下类属及派生关系，分别划为划为15大类，其中有大类，其中有9类又分若干子类类又分若干子类目，子类目下面又分若干更小的类目。目，子类目下面又分若干更小的类目。18,000多个主题词按其学科概念的性质多个主题词按其学科概念的性质分别列入各自所属的类目之下。分别列入各自所属的类目之下。 GASTROIN TESTINAL NEOPLASMS胃肠肿瘤胃肠肿瘤 INTESTIINAL NEOPLASMS 肠肿瘤肠肿瘤 CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤盲肠肿瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤阑尾肿瘤 C

24、OLONIC NEOPLASMS 结肠肿瘤结肠肿瘤 COLONIC POLYPS 结肠息肉结肠息肉 . . . . DUODENAL NEOPLASMS 十二指肠肿瘤十二指肠肿瘤 ILEAL NEOPLASMS 回肠肿瘤回肠肿瘤 . . . . 副主题词副主题词(Subheadings)又称限定词，与又称限定词，与主题词进行组配，对某一主题词的概念主题词进行组配，对某一主题词的概念进行限定或复分，使主题词具有更高的进行限定或复分，使主题词具有更高的专指性。专指性。 如：诊断（如：诊断（Diagnosis，DI）、药物治疗）、药物治疗（Drug Theray，DT）。）。 MeSH有副主题词有副

25、主题词92个个 在检索中，主题词与副主题词的组配在检索中，主题词与副主题词的组配（主题词（主题词/副主题词）须有逻辑关系。副主题词）须有逻辑关系。 如：阿司匹林治疗感冒如：阿司匹林治疗感冒 阿司匹林阿司匹林/治疗应用；感冒治疗应用；感冒/药物疗法。药物疗法。 四、医学信息检索的方法、途径四、医学信息检索的方法、途径 检索途径检索途径 常用检索方法常用检索方法 检索步骤及检索策略检索步骤及检索策略 检索效果评价指标检索效果评价指标 提高机检查全率、查准率的方法提高机检查全率、查准率的方法 1 1、常用的检索途径、常用的检索途径（1 1）主题途径）主题途径（2 2）著者途径）著者途径（3 3）代码

26、途径）代码途径（4 4）题名途径）题名途径（5）分类途径分类途径 2 2、常用的检索方法、常用的检索方法 顺查法顺查法 倒查法倒查法 抽查法抽查法 追溯法追溯法 3 3、医学信息检索的一般步骤、医学信息检索的一般步骤 检索准备阶段检索准备阶段 检索实施阶段检索实施阶段 检索准备阶段检索准备阶段分析课题，明确检索目的及要求（课题所分析课题，明确检索目的及要求（课题所属的学科范围、要求的文献类型、年限、属的学科范围、要求的文献类型、年限、语种、需要的文献量等）；语种、需要的文献量等）；选择检索系统（包括检索工具或数据库）；选择检索系统（包括检索工具或数据库）；确定检索方法；确定检索方法；选择检索用

27、词及检索途径。选择检索用词及检索途径。 检索实施阶段检索实施阶段 包括实际检索操作，检索策略优化与包括实际检索操作，检索策略优化与反馈，检索结果的筛选和整理，获取原始反馈，检索结果的筛选和整理，获取原始文献等。文献等。 4 4、检索效果评价指标、检索效果评价指标 被检出相关文献量被检出相关文献量查全率：查全率：R =R = 相关文献总量相关文献总量 被检出相关文献量被检出相关文献量查准率：查准率：P =P = 被检出文献总量被检出文献总量 未检出相关文献量未检出相关文献量漏检率：漏检率：M =M = 相关文献总量相关文献总量 被检出非相关文献量被检出非相关文献量误检率：误检率：N =N = 被

28、检出文献总量被检出文献总量 5 5、提高查全率、查准率的方法、提高查全率、查准率的方法 提高查全率的方法：提高查全率的方法： 用主题词检索；用主题词检索； 主题词、关键词、同义词间用主题词、关键词、同义词间用or or 组配；组配； 用上位词（扩展下位词）检索；用上位词（扩展下位词）检索； 截词检索；截词检索； 少用副主题词组配。少用副主题词组配。 提高查准率的方法：提高查准率的方法： 用主题词检索；用主题词检索； 用下位词（专指度）检索用下位词（专指度）检索 ； 检索词的字段限定检索词的字段限定 ； 副主题词组配限制副主题词组配限制 。五、计算机检索基础五、计算机检索基础 文献检索的技术手段

29、文献检索的技术手段 手工检索：利用各种印刷型检索工手工检索：利用各种印刷型检索工具，人工查找所需的文献信息。具，人工查找所需的文献信息。 计算机检索：根据信息特定的需求，计算机检索：根据信息特定的需求，利用计算机从相关数据库中检索所需要利用计算机从相关数据库中检索所需要的文献信息。的文献信息。 网络信息检索：通过互联网上提供网络信息检索：通过互联网上提供的网络信息查询工具，从网上获取文献的网络信息查询工具，从网上获取文献信息。信息。 计算机检索系统包括文献存储和文献检计算机检索系统包括文献存储和文献检索两部分，分别对应数据库的建立和利索两部分，分别对应数据库的建立和利用。用。 计算机检索是目前

30、广大医学临床与科研计算机检索是目前广大医学临床与科研工作者获取医学文献信息最常用的方法工作者获取医学文献信息最常用的方法和手段，具有信息量大、操作技能容易和手段，具有信息量大、操作技能容易掌握、方便快捷等特点。掌握、方便快捷等特点。 （一）数据库基本概念（一）数据库基本概念 数据库的定义：数据库的定义： 计算机把大量的数据项有机地集中起来计算机把大量的数据项有机地集中起来存放在数据文件中，构成一个存放数据的整存放在数据文件中，构成一个存放数据的整体，即数据库。体，即数据库。 数据库文件：数据库文件： 各项数据以二维表格形式存放于数据文各项数据以二维表格形式存放于数据文件中，一个以二维表格形式存放在磁盘上的件中，一个以二维表格形式存放在磁盘上的数据文件称为数据库文件（库文件）。数据文件称为数据库文件（库文件）。 数