ch3医学文献信息检索基础

1、医学文献检索第三章第三章 医学文献信息检索基础医学文献信息检索基础 内容提要第一节第一节 文献数据库文献数据库 一、数据库的类型一、数据库的类型 二、数据库的结构二、数据库的结构 三、文献数据库的检索途径三、文献数据库的检索途径 第二节第二节 检索语言检索语言 一、信息组织方法一、信息组织方法 二、检索语言的概念二、检索语言的概念 三、检索语言的类型三、检索语言的类型 四、常用的医学文献检索语言四、常用的医学文献检索语言内容提要第三节第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术 一、文献检索方法一、文献检索方法 二、文献检索技术二、文献检索技术 第四节第四节 文献检索策略文献检索策略 一、文献

2、检索步骤一、文献检索步骤 二、检索效果的评价二、检索效果的评价 三、检索策略的调整三、检索策略的调整 教学基本要求能够叙述检索语言基本知识、文献检索策略构建步骤、检索方法与技术。熟悉数据库的类型和结构，文献检索途径，MeSH、中图法的使用。了解检索语言等方面的基本知识，检索效果评价。第一节 文献数据库文献数据库 一、数据库的类型数据库的类型（一）按对信息收录的（一）按对信息收录的学科范围学科范围划分划分1.综合性数据库 Web of Science、CNKI、万方2.专业性数据库 PubMed、BIOSIS、CBM3.专题性数据库 GenBank、中国药物专利数据库第一节 文献数据库文献数据库

3、 （二）按收录（二）按收录信息内容信息内容的类型不同划分的类型不同划分1.文献型数据库(书目型和全文型)literature database2.数值型数据库 numerical database3.事实型数据库 fact database4.图像数据库 image database5.多媒体数据库 multimedia databaseThe Visible Human Project第一节 文献数据库文献数据库 二、数据库的结构数据库的结构 从用户的角度看，数据库主要由文档、记录和字段三个层次构成。 数据库通常由若干个文档（file）组成，每个文档又由若干条记录（record）组成，每条记

4、录则包含若干字段（field）。 文献数据库中：文献数据库中：一篇文献一篇文献 即即 一条记录，篇名、一条记录，篇名、作者、刊名、主题词等作者、刊名、主题词等 即即 字段字段 第一节 文献数据库文献数据库 三、文献数据库的检索途径三、文献数据库的检索途径 检索系统主要依信息的各项特征来编排，形成不同的检索途径。 检索途径是检索系统提供的检索入口。 常用的检索途径：主题词途径、关键词途径、分类途径、题名途径、著者途径等。 第二节 检索语言一、信息组织方法一、信息组织方法信息组织方法是指将信息按一定规律进行有序排列的方法。 1.形式信息组织法：号码法、物名法、引证关系法、时序法、地序法、专用代码法

5、等。 2.内容信息组织法：分类法、主题法。 3.效用信息组织法：权值组织法、特色组织法、重要性递减组织法、概率组织法。 第二节 检索语言二、检索语言的概念二、检索语言的概念 检索语言（retrieval language）又称文献存储与检索语言、标引语言等，是信息检索系统存储与检索过程中共同使用的一种专用语言，是在文献检索领域中用来描述文献特征和表达信息检索提问的一种专用语言。 三、检索基本原理三、检索基本原理经选择经选择的信息的信息主题主题分析分析标引标引语言语言表达表达文献文献特征特征标识标识经确立经确立的课题的课题主题主题分析分析检索检索语言语言表达表达文献文献需求需求标识标识信息信息集

6、合集合词表词表存储存储检索检索检索检索结果结果匹配匹配第二节 检索语言三、检索语言的类型三、检索语言的类型 非规范化语言规范化语言第二节 检索语言检索语言可按照是否规范来分类：l 规范化语言：对文献检索用语的概念加以人工控制和规范，对同义词、近义词、多义词等进行规范化处理，一个概念仅用一个词表达。如主题词、分类号艾滋病AIDS获得性免疫缺陷综合征 l 非规范化语言（自然语言）：关键词 keyword、 文本词 textword第二节 检索语言四、常用的医学文献检索语言四、常用的医学文献检索语言 （一）中国图书馆分类法 中国图书馆分类法简称中图法，是目前国内最常用的一种等级体系分类法。以科学分类

7、和知识分类为基础，结合文献内容特点及形式特征进行分门别类、逐层深入的逻辑划分和系统排列的分类法。 将学科划分为5个基本部类、22个基本大类 。 第二节 检索语言（二）医学主题词 医学主题词（Medical Subject Headings，简称MeSH）是NLM编制的世界医学领域最权威、最常用的一部规范化的、可扩充的动态叙词表。主要用途： PubMed数据库（Medline；IM） 中国生物医学文献数据库（CBM） 其他部分数据库、搜索引擎第二节 检索语言（二）医学主题词1. MeSH词的种类（1）叙词（descriptor）：又称主题词(subject heading) （2）款目词（ent

8、ry term）：又称入口词 （3）限定词（qualifier）：又称副主题词(subheading)（4）特征词（check tag）主题词树形结构（类目）：大类 Anatomy A Organisms B Diseases C Chemicals and Drugs D Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment E Psychiatry and Psychology F Phenomena and Processes G Disciplines and Occupations H Anthropology

9、, Education, Sociology and Social Phenomena I Technology, Industry, Agriculture J Humanities K Information Science L Named Groups M Health Care N Publication Characteristics V Geographicals Z 主题词：能代表文献内容实质的经过严格规范化的专业名词术语或词组 特点：规范性、唯一性、动态性 高血压高血压/ /治疗治疗 关键词：从文献中抽出来的、有实质内容的、未经或略经规范化了的名词术语以及增添的相关概念词，属于

10、自然语言 高血压高血压 AND AND （治疗（治疗 OR OR 处理）处理） 举例：阿司匹林引起的消化性溃疡的治疗主题词途径与关键词途径第二节 检索语言（二）其他医学文献检索语言 1. 国际疾病分类法 ICD 2. 国际系统医学术语集 SNOMED第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术 一、文献检索方法 1.检索工具法 2.浏览法 3.引文追踪法 4.综合法 第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术二、文献检索技术 1布尔逻辑检索（boolean logical searching） 2截词检索(truncation searching) 3限定检索（limit searching

11、） 4词组检索（phrase searching） 5扩展检索（expanded searching） 6位置检索（position searching） 7 加权检索（weighting searching) 8 相关信息检索（related information searching） 1布尔逻辑检索 与（AND）、或（OR）、非（NOT） A or B A and B A not BA or B A and B A not B第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术例如，查找例如，查找“动物的乙肝病毒（不要人的）动物的乙肝病毒（不要人的）”的文献的文献 查找查找“胰岛素治疗糖尿病胰岛

12、素治疗糖尿病”的文献的文献 查找查找所有关于所有关于“肺肺肿瘤肿瘤”的文献的文献 布尔逻辑运算符的运算布尔逻辑运算符的运算顺序顺序一般为：一般为： （）NOTANDOR 但有些数据库不按照这个次序，如PubMed第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术例：维生素例：维生素C C或维生素或维生素E E对糖尿病患者肾脏的对糖尿病患者肾脏的保护作用保护作用（维生素C or 维生素E）and 糖尿病 and 肾 2截词检索、通配符检索l无限截词 * ：代表有或无若干个字符，可以检索词根相同但词尾不同的检索词。 例：gene*l有限截词 ? ：代表有或无一个字符，可以检索单复数、英美不同拼写方式等检

13、索词 。 例：wom?n 乙？肝第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术 3限定检索可以将检索词限制在特定的字段中，限制符多为 in、=、 等。 例：张学 in AU AU=张学 zhang xau第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术4. 词组检索（精确检索） 精确检索精确检索（exact searching）：检索结果必须含：检索结果必须含有与检索提问式完全相同（包括次序）的字串，即有与检索提问式完全相同（包括次序）的字串，即完全匹配。完全匹配。在许多系统中用在许多系统中用引号引号来表示，如检索来表示，如检索“Acute Pancreatitis”； 模糊检索模糊检索（fuzzy

14、 searching）：可能是将检索词拆：可能是将检索词拆分后进行检索，也可能检索到与检索词意义相近的分后进行检索，也可能检索到与检索词意义相近的同义词的结果同义词的结果。如检索。如检索Acute Pancreatitis，可检，可检索出索出Acute necrotizing Pancreatitis、Acute gallstone Pancreatitis等。等。第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术5. 扩展检索：检索系统向查询中加入与检索词词义相关的词，如同义词、下位词等。扩大检索范围，提高查全率。 如：输入如：输入 “ “甲流甲流”，扩展检索，系统可同时，扩展检索，系统可同时检索

15、检索 猪流感、甲型猪流感、甲型H1N1H1N1流感、流感、A A型流感型流感第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术6. 位置检索（邻近检索） 记录级：记录级： andand 字段级：字段级： withwith 子字段或自然句：子字段或自然句：samesame 词位置：词位置：near3near3第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术加权检索加权检索7. 加权检索（weighing searching）不仅检索提问词是否存在，而且计算提问词的权值，权值之和超过阈值的 记录 才能在数据库中被检出来。在某些数据库中表现为仅检索主要概念主题词，如MEDLINE；而有些数据库表现为词频检索，

16、如中国学术期刊全文数据库。8.相关信息检索： related articles related records similar pages cited paper citing paper第三节 文献检索方法与技术文献检索方法与技术相关信息反馈检索第四节 文献检索策略文献检索策略 一、一、文献检索步骤文献检索步骤1分析检索课题，明确检索要求2选择检索工具，确定检索方法 3. 选定检索途径、检索词，制订检索策略式4. 评价检索结果，优化检索策略 5. 文献筛选，获取原始文献 如何获取原始文献？ 网络下载从数据库检索结果从数据库检索结果直接下载直接下载从免费全文库下载从免费全文库下载 本馆馆藏 联

17、合目录/馆际互借 医知网 外地朋友帮助下载 向原文作者索取第四节 文献检索策略文献检索策略 二、检索效果的评价二、检索效果的评价1.信息检索评价 一般包括检索系统评价和检索效果评价。 2.查全率与查准率 是评价检索效果的两个重要指标。 两者之间存在着相反的相互依赖关系。 应依具体课题需求，合理调节查全率和查准率。查全率 recall sensitive查准率 precision specific 查全率查全率R=R=检出的相关信息量检出的相关信息量/ /信息库中相关信信息库中相关信息总量息总量 100% 100% 查准率查准率P P = = 检出的相关信息量检出的相关信息量/ /检出信息总检出信息总量量 100%100%如：如：60/10060/100，60/12060/120文献检索效果评价文献检索效果评价第四节 文献检索策略文献检索策略 三、检索策略的调整三、检索策略的调整1.扩大检索范围，提高查全率可以采用的方法：(1)增加各种形式的自由词（如同义词、全称简称等相关词）进行检索，使用OR算符；(2)减少AND（如减少次要概念）或NOT的使用次数；(3)由词组检索变模糊检索；(4)用截词检索；(5)调整限定的字段；(6)适当放宽限定条件；(7)使用其他检索系统进行检索；(8)使用更多的检索途径进