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文档简介
1、克隆载体:大多是高拷贝的载体,一般是原核细菌,将需要克隆的基因与克隆载体的质粒相连接,再导入原核细菌内,质粒会在原核细菌内大量复制,形成大量的基因克隆,被克隆的基因不一定会表达,但一定被大量复制。克隆载体只是为了保存基因片段,这样细胞内不会有很多表达的蛋白质而影响别的工作。克隆载体(Cloningvector):携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋白质产物。(这是为携带”感兴趣的外源DNA、实现外源DNA的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。)其中,为使插入的外源DNA序列可转录、进而翻译成多肽链而设计的克隆载体又称表达载体。是否含有表达系统元件,即启动子-核糖
2、体结合位点-克隆位点-转录终止信号,这是用来区别克隆载体和表达载体的标志。表达载体:有的是高拷贝的,有的是低拷贝的,各有各的用处,是一些用于工程生产的细菌,被导入的目标基因会在此类细菌中得到表达,生产出我们需要的产物,导入的基因是由克隆载体产出的。表达载体具有较高的蛋白质表达效率,一般因为具有强的启动子。表达载体(Expressionvectors)就是在克隆载体基本骨架的基础上增加表达元件(如启动子、RBS、终止子等),是目的基因能够表达的载体。如表达载体pKK223-3是一个具有典型表达结构的大肠杆菌表达载体。其基本骨架为来自pBR322和pUC的质粒复制起点和氨苇青霉素抗性基因。在表达元
3、件中,有一个杂合tac强启动子和终止子,在启动子下游有RBS位点(如果利用这个位点,要求与ATG之间间隔5-13bp),其后的多克隆位点可装载要表达的目标基因。(RBS位点:1974年Shine和Dalgarno首先发现,原核生物,在mRNA上有核糖体的结合位点,它们是起始密码子AUG和一段位于AUG上游310bp处的由39bp组成的序列。这段序列富含嗯吟核昔酸,刚好与16SrRNA3,末端的富含嗑咤的序列互补,是核糖体RNA的识别与结合位点。根据发现者的名字,命名为Shine-Dalgarno序歹U,简称S-D序列。由于它正好与30S小亚基中的16srRNA3端一部分序列互补,因此S-D序列
4、也叫做核糖体结合序列。真核生物存在于真核生物mRNA的一段序列,其在翻译的起始中有重要作用。加Kozarksequence(GCCACC),Kozaksequence是用来增强真核基因的翻译效率的。是最优化的ATG环境,避免ribosome出现leakyscan)克隆载体目的在于复制足够多的目标质粒,所以常带有较强的自我复制元件,如复制起始位点等,往往在菌体内存在多拷贝,所以抽质粒会抽出一大堆。但不具备表达元件。而表达质粒有复杂的构成,为的是控制目标蛋白的表达,如各种启动子(T7),调节子(LacZ)等,而且以pET为代表的表达载体在菌体内都是低拷贝的,防止渗漏表达。克隆载体只是把你要的基因片
5、段拿到就可以了,不管读码框什么的,但是表达载体是不但要你的目的基因连在上面,而且要表达蛋白,所以就要求你的读码框不能乱了,否则就不能得到你想到的表达产物。1.载体即要把一个有用的基因(目的基因一一研究或应用基因)通过基因工程手段送到生物细胞(受体细胞),需要运载工具(交通工具)携带外源基因进入受体细胞,这种运载工具就叫做载体(vector)。2.载体的分类按功能分成:(1)克隆载体:都有一个松弛的复制子,能带动外源基因,在宿主细胞中复制扩增。它是用来克隆和扩增DNA片段(基因)的载体。(2)表达载体:具有克隆载体的基本元件(ori,Ampr,Mcs等)还具有转录/翻译所必需的DNA顺序的载体。
6、按进入受体细胞类型分:(1)原核载体(2)真核载体(3)穿梭载体(sbuttlevector)指在两种宿主生物体内复制的载体分子,因而可以运载目的基因(穿梭往返两种生物之间)克隆载体顾名思义就是质粒拷贝数比较高,在做上游克隆时比较方便,其重点在于质粒的复制.问题:基因工程中有克隆载体和表达载体,克隆载体可以在受体菌中大量复制,表达载体用于表达目的蛋白,那么实际应用中,我们的最终目的是要得到目的蛋白,克隆载体不能完成表达,有何用呢?还是说利用克隆载体实现目的基因的大量复制后,再将其转移到表达载体中实现表达?它是否有何缺陷不能整合克隆载体的功能?构建兼有克隆和表达双重功能的载体有何困难?1 .克隆
7、的目的比较单一,就是将你感兴趣的DNAt段,重组进入载体,然后于宿主细胞中大量繁殖,主要用于各种文库的建立,比如人类基因组计划;同时由于载体所能容纳的目的片段的长度是有限的,而克隆载体没有表达所需的各种片段,所以可以容纳更长的目的片段,即可以克隆足够长的基因,效率更高。2 .重组DNAS要使用限制性内切酶,因此待克隆的目的片段两端必需有其识别位点,现在的T/A克隆载体可以直接克隆PCFT物,省去了两端加装识别位点的设计,PCRt率就更高。3 .表达载体的目的是多样化的,为了实现实际工作中的需要,不同的目的就要设计不同的载体,用表达载体克隆基因不是不可以,实际工作中要考虑更多,因此更复杂。4 .
8、细菌摄取能量的能力是一定的,如果用来合成大量蛋白质,合成核酸就会少。5 .细菌承受的工作负荷也是有限的,给它的工作太多,效率必然低下,这和我们日常生活是一个道理。原因很简单,不是不能,是完全可以,但是效率会低很多。所以我们一般的策略是,将目的片段克隆于非常简单的克隆载体上,按照需要再亚克隆于可以满足各种要求的表达载体上。回答的不是很系统,如有问题可以继续来信讨论,希望对你有所帮助。1)“T/A克隆载体可以直接克隆PCRT物,省去了两端加装识别位点的设计,PC徵率就更高。”是什么意思?T/A克隆载体是PUC载体的线性化后两端加了T,而Taq酶有在PCR产物后随机加A的特性,所以PCRT物直接可以
9、接入T载体。而经典的克隆PCRT物需要限制性内切酶切割后接入载体,所以在设计PCR引物时两端要加酶的识别位点,而加装的序列与模板不配对,因此PCR率会低很多。2)克隆载体只是为了得到大量的目的基因,而现在多用PCR1可以达到这个目的。那这个目的基因的主要用途是什么?只用来测序吗?表达载体应该兼有克隆与表达的功能的吧?嗯,基本是这个意思。就测序不克隆也可以进行,克隆到载体的CM计就在基因两端有了可供你选择的很多限制性酶切位点,方便亚克隆到各种表达载体上。当然表达载体可以克隆,但是效率低于克隆载体。一是因为表达载体不能直接克隆PCFT物,必须加装限制性酶切识别序列,上面已经讲过。二是表达载体的选择
10、相对克隆载体是更加严谨型的质粒,就是每个细菌里的拷贝数较低,能量守恒,细菌摄取能量的能力是一定的,用来合成蛋白质,核酸的合成必然受一定得限制。3)我要构建一个基因的载体,1 .我可以将目的基因(1.3kb左右)和表达载体分别作酶切后连接吗?这几天将目的基因做了一个T载体连接,可是不知道下一步怎么利用?2 .设计引物的时候用了sacl和hindlll,做pcr的时候可以用pfu酶吗?pfu酶是必须的吗?3 .我选择的表达载体上sacl和hindlll的酶切位点只是相差两个碱基,做双酶切的时候能切开吗?1 .如果你的目的基因已经在T载体上,当然可以分别酶切后连接,但是要注意方向。2 .如果是T载体连接PCR的引物可以不设at酶切位点。T载体可以直接连接PCRT物源于其末端错加的A,所以不能使用高
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