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文档简介

1、标准文档表达载体的构建方法及步骤一、载体的选择及如何阅读质粒图谱目前,载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA 是一种新的非病毒转基因载体。一个合格质粒的组成要素:( 1)复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA 分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA 分子有多个复制起始位点。( 2)抗生素抗性基因可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+( 3)多克隆位点MCS 克隆携带外源基因片段( 4) P/E 启动子 /增强子( 5) Terms 终止信号(6)力口 poly (A)信号可以起到稳定 mRNA作用选择载体主要依据构建的目的,同时要考虑载体中应有合适的限制酶切位点。

2、如果构建的目的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。载体选择主要考虑下述3 点:【 1】构建DNA 重组体的目的,克隆扩增/基因表达,选择合适的克隆载体/表达载体。【 2】 .载体的类型:( 1)克隆载体的克隆能力据克隆片段大小(大选大,小选小)。如10kb 选 质粒。( 2) 表达载体据受体细胞类型原核/真核/穿梭,E.coli/ 哺乳类细胞表达载体。( 3)对原核表达载体应该注意:选择合适的启动子及相应的受体菌,用于表达真核蛋白质时注意克服4 个困难和阅读框错位;表达天然蛋白质或融合蛋白作为相应载体的参考。【 3】载体 MCS 中的酶切位点数与组成方向因载体不同而异,适应目的基因

3、与载体易于链接,不能产生阅读框架错位。综上所述,选用质粒(最常用)做载体的5 点要求:(1)选分子量小的质粒,即小载体(11.5kb)-不易损坏,在细菌里面拷贝数也多(也有大载体);( 2)一般使用松弛型质粒在细菌里扩增不受约束,一般10 个以上的拷贝,而严谨型质粒10 个。( 3)必需具备一个以上的酶切位点,有选择的余地;( 4)必需有易检测的标记,多是抗生素的抗性基因,不特指多位Ampr (试一试)。( 5)满足自己的实验需求,是否需要包装病毒,是否需要加入荧光标记,是否需要加入标签蛋白,是否需要真核抗性(如 Puro、G418)等等。无论选用哪种载体,首先都要获得载体分子,然后采用适当的

4、限制酶将载体DNA 进行切割,获得线性载体分子,以便于与目的基因片段进行连接。如何阅读质粒图谱第一步:首先看Ori 的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒)第二步:再看筛选标记,如抗性,决定使用什么筛选标记。(1) Ampr水解B内酰胺环,解除氨苇的毒性。( 2) tetr 可以阻止四环素进入细胞。( 3) camr 生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。( 4) neor ( kanr )氨基糖苷磷酸转移酶使G418 (长那霉素衍生物)失活( 5) hygr使潮霉素B失活。第三步:看多克隆位点(MCS)。它具有多个限制酶的单一切点。便于外源基因的插入。如果在这些酶切位点以外有外源基因

5、的插入,会导致某种标志基因的失活,而便于筛选。决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。第四步:再看外源DNA 插入片段大小。质粒一般只能容纳小于10Kb 的外源DNA 片段。一般来说,外源DNA 片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。第五步: 是否含有表达系统元件,即启动子核糖体结合位点克隆位点转录终止信号。这是用来区别克隆载体与表达载体。克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。第六步:启动子核糖体结合位点克隆位点转录终止信号( 1)启动子促进DNA 转录的 DNA 序列,这个DNA 区域常在基因或操纵子编码序列的上游,是 DNA 分

6、子上可以与RNApol 特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。( 2) 增强子 /沉默子为真核基因组(包括真核病毒基因组)中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。其作用与增强子所在的位置或方向无关。即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。/沉默子负增强子,负调控序列。( 3)核糖体结合位点/起始密码/SD 序列( Rbs/AGU/SDs ): mRNA 有核糖体的两个结合位点,对于原核而言是 AUG (起始密码)和SD序列。( 4)转录终止序列(终止子)/翻译终止密码子:结构基因的最后一个外显子中有一个 AATAAA 的保守序列,此位点down stream 有一段 GT 或

7、 T 富丰区,这2部分共同构成poly (A)加尾信号。结构基因的最后一个外显子中有一个 AATAAA 的保守序列,此位点 down stream 有一段 GT 或 T 富丰区,这2部分共同构成poly (A)加尾信号。质粒图谱上有的箭头顺时针有的箭头逆时针,那其实是代表两条DNA 链,即质粒是环状双链DNA ,它的启动子等在其中一条链上,而它的抗性基因在另一条链上 . 根据表达宿主不同,构建时所选择的载体也会不同。二、目的基因的获得一般来说,目的基因的获得有三种途径:调取基因:根据目的基因的序列,设计引物从含有目的基因的cDNA 中通过 PCR的方法调取目的基因,链接到克隆载体挑取单克隆进行

8、测序,以获得想要的基因片段, 这种方法相对成本较低,但是调取到的基因往往含有突变,还有不同基因的表达丰度不同,转录本比较复杂,或是基因片段很长,这些情况都很难调取到目的基因。全基因合成:根据目的基因的DNA 序列,直接设计合成目的基因。此方法准确性高,相对成本会高一些,个人操作比较困难,需要专业的合成公司完成。优点是可以合成难调取及人工改造的任何基因序列,同时可以进行密码子优化,提高目的基因在宿主内的表达量。三、克隆构建目前, 克隆构建的方法多种多样,除了应用广泛的酶切链接以外,现在还有很多不依赖酶切位点的克隆构建方式。下面具体说一下双酶切方法构建载体的步骤。实验材料实验试剂试剂名称生产厂家载

9、体pCDNA3.1Transheep大肠杆菌菌株DH5 aTiangen限制性内切酶FermentasT4 连接酶Fermentas质粒DNA 小 ,大量抽提试剂盒Axygen凝胶回收试剂盒Axygen琼脂糖BiowestDNA ladderFermentas( 2) X 基因慢病毒载体的构建X 基因基因由Transheep 全基因合成,构建于载体PUC57 中。PUC57-X 基因 EcoRI/BamHI 酶切结果:实用文案标准文档酶切完成后进行胶回收2.载体用pCDNA3.1双酶切,酶切体系如下20ul酶切体系37度3小时4ul pCDNA3.1 载体(500 ng/ul )1ul BamHI1ul EcoRI2ul 10 xbuffer12 ul H2O酶切完成后胶回收(见附录)处理好的目的片段与载体连接反应体系:6ul PCR 酶切回收片段(约 50ng/ul )1ul酶切好的载体(约 50ng仙)2ul ligase buffer1ul T4ligase10ul H2O以上连接液在16 c过夜。转化(感受态细胞:

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