老师教你查文献李晓霞

1、如何利用如何利用Internet化学化工资源化学化工资源李晓霞李晓霞中国科学院过程工程研究所（原化工冶金所）如何利用网络化学化工资源？如何利用网络化学化工资源？ (How to find Internet chemical information?)n对象：信息资源对象：信息资源n学科：化学相关学科：化学相关n平台：平台：Internet获取的方法、获取的方法、工具工具40个学时个学时内容提要内容提要n为什么？为什么？n网络平台化学信息检索步骤网络平台化学信息检索步骤l检索策略检索策略、文献管理工具、文献管理工具EndNoten主要检索工具主要检索工具l主流工具及其主流工具及其工作原理工作原理

2、、功能特点功能特点n全文获取及其发展全文获取及其发展趋势趋势l主流期刊全文数据库、全文传递主流期刊全文数据库、全文传递lRepository、Open accessl其他全文：专利、学位论文、科技报告其他全文：专利、学位论文、科技报告n小结小结为什么为什么？n信息获取贯穿科研工作的各个环节信息获取贯穿科研工作的各个环节n信息缺失的代价信息缺失的代价n信息时代信息时代 信息获取方式的改变信息获取方式的改变nInternet 信息检索的机遇与挑战信息检索的机遇与挑战为什么？为什么？n获取信息获取信息: R&D不可或缺不可或缺、贯穿整个过程贯穿整个过程n选题选题 及方案制定及方案制定 方向如

3、何、可行否？方向如何、可行否？ n做实验做实验 (计算计算) 如何做？如何做？n数据处理数据处理 如何处理？如何处理？n总结规律总结规律 结果如何？结果如何？信息获取和利用信息获取和利用为什么为什么?n信息获取信息获取/ /分析分析是终身需要的基本技能是终身需要的基本技能 n职业素养的培养职业素养的培养n整体水平的差距整体水平的差距 有有n可利用资源的差距可利用资源的差距 有有n交流渠道的差距交流渠道的差距 有有n美国美国 经常性讲座经常性讲座n获取信息的习惯与意识的差距获取信息的习惯与意识的差距 ？n日本日本, , 澳大利亚澳大利亚为什么？为什么？ - 信息缺失的代价信息缺失的代价n重复性研

4、究重复性研究 低水平低水平n1960s, 美国，调研计算机用于信息检索美国，调研计算机用于信息检索, Lockheed Missiles and Space Companyn“ A common statement around Lockheed at the time was that it is usually easier, cheaper, and faster to redo scientific research than to determine whether it has been done previously”n灾难后果灾难后果Roger Summit, Reflecti

5、ons on Beginning of Dialog (1972-2002) The Birth of Online Information Access, June, 2002n信息灾难信息灾难 2001 2001年年n2001年夏一位参加年夏一位参加John Hopkins大学医疗哮喘大学医疗哮喘研究项目的志愿者因吸入研究项目的志愿者因吸入hexamethonium死亡死亡.n文献数据库文献数据库Pubmed: 1966 -nWebnHexamethonium副作用报道副作用报道 - 1950sn可检索文献数据库可检索文献数据库ToxlineSusan Feldman, The high

6、cost of not finding information, KMWorld, Vol 13 (3), Mar. 2004六甲铵六甲铵降血压降血压为什么？为什么？ - 信息缺失的代价信息缺失的代价 /robert/internet/timeline/为什么？为什么？ - Internet的影响的影响 (1969 - ) /robert/internet/timeline/为什么？为什么？ - Web的影响的影响 (1990 目前可用工具的基础目前可用工具的基础)Chemistry on the Internet:

7、The Library on Your ComputerChemical Engineering为什么？为什么？- 网络对专业信息获取的影响网络对专业信息获取的影响 n Gary Wiggins, 1998 文章文章n 我国我国1994正式接入互联网正式接入互联网n 我们开始建立我们开始建立ChIN, 1997为什么？为什么？- 网络对科研方式的影响网络对科研方式的影响 n JACS, 2003 社论社论n 出版专著出版专著Internet化学化工资源化学化工资源, 2000n 我开课我开课: 2001 -2003(所里所里), 2004 (研究生院研究生院)“电子化、互联网已经改变了电子化、

8、互联网已经改变了科学研究的方式科学研究的方式、研、研究究成果传播方式成果传播方式、学生、学生学习的方式学习的方式”Editorial, J. AM. CHEM. SOC. 2003, 125, p1-8化学化工文献检索方式化学化工文献检索方式的改变的改变检索工具检索工具CA, EI原始文献 (纸介质)期刊文章、专利、专著、期刊文章、专利、专著、报告、会议文集等报告、会议文集等其他其他原始文献 (纸介质 + 电子化电子化)期刊文章、专利、专著、期刊文章、专利、专著、报告、会议文集等报告、会议文集等其他各类其他各类WebWeb信息信息检索工具检索工具CA, EI门户门户搜索引擎搜索引擎数据库引擎数

9、据库引擎图书馆图书馆图书馆图书馆Internet(实验室实验室)为什么：机遇与为什么：机遇与挑战挑战n(网络网络)信息资源的特点信息资源的特点 nScattered nNo one knows what exists or where it isnNo single unified access pointn信息检索的要求信息检索的要求nThoroughly (信息完整性信息完整性 Internet, Yes, but)nCritically (信息的仔细评估信息的仔细评估 ?)nTimely (信息的及时性信息的及时性 Internet )n如何获取如何获取 非常重要非常重要2010: 网络

10、化行为模式网络化行为模式 碎片化的时代？碎片化的时代？注意力转移快？注意力转移快？如何利用如何利用Internet化学化工资源化学化工资源？n目标目标n掌握掌握信息源基本知识信息源基本知识 What information is accessible?n信息检索方法与策略信息检索方法与策略 How to retrieve it?n更多信息或求助来源更多信息或求助来源 Ask for more infon运用运用Internet已有工具已有工具n传统文献源传统文献源+网络检索网络检索 (完整性要求完整性要求)n获取信息意识获取信息意识n观念观念 - 理性的态度理性的态度 (facts)网络化学信

11、息检索的基本步骤网络化学信息检索的基本步骤n明确信息需求明确信息需求 找什么？找什么？l问题问题 模型化模型化(主题主题/关键词、关键词、同行同行)n整理检索起点整理检索起点 已知什么？已知什么？l直接、简介直接、简介n选择检索工具选择检索工具 信息源知识信息源知识n设计设计检索策略检索策略 如何检索？如何检索？l结合结合(问题描述问题描述 + 工具功能工具功能)n评价检索结果评价检索结果 (个性化个性化 复杂复杂)l结果满意吗？结果满意吗？l新的线索新的线索循环循环 满意！满意！检索检索 - - 没有标准答案没有标准答案检索结果检索结果 自我评价自我评价信息检索的基本步骤信息检索的基本步骤n

12、明确信息需求明确信息需求/整理检索起点整理检索起点 举例举例n音乐之声音乐之声插曲插曲 - - 雪绒花的歌词雪绒花的歌词 ( (英语英语) )n工具：工具：GoogleGoogle， 可能的策略？可能的策略？( (不讨论不讨论baiduMP3)baiduMP3)n已知：音乐之声已知：音乐之声n模型化：雪绒花模型化：雪绒花 + + 歌词歌词 + +英语英语 找不到找不到! !n挖掘线索挖掘线索：歌词：歌词 “small and white”“small and white”或者歌名或者歌名/ /歌词原文歌词原文“EdelweissEdelweiss”n注意注意：EdelweissEdelweis

13、s仅为一种植物，应该加限制条件，仅为一种植物，应该加限制条件，如如EdelweissEdelweiss + + musicmusic ( (电影名称原文的一部分电影名称原文的一部分) )n注意注意：早期例子，由于：早期例子，由于GoogleGoogle索引覆盖面扩大，结索引覆盖面扩大，结果不同了，思路供参考果不同了，思路供参考为什么？为什么？为什么？为什么？Google是全文检索是全文检索Google是通用搜索是通用搜索增加限制条件可锁定目标增加限制条件可锁定目标信息检索的基本步骤信息检索的基本步骤n明确信息需求明确信息需求/整理检索起点整理检索起点 举例举例n一个站点杂志及创办人一个站点杂志

14、及创办人 间接线索间接线索n线索线索: : 访谈杂志，曾访谈访谈杂志，曾访谈“Wendy Warr”nGoogle “wendy warr“Google “wendy warr“得到访谈文章得到访谈文章n从文章链接从文章链接 ReportsReactive Reports”n利用利用Google/ChINGoogle/ChIN检索检索“”“”或或 直接利用域名到杂志站点得知期刊创办人直接利用域名到杂志站点得知期刊创办人为为”David Bradley”David Bradley”为什么？为什么？Google是是全文检索全文检索信息检索的基本步骤信息检索的基本步骤n明确信息需求明确信息需求/整理

15、检索起点整理检索起点 举例举例n院士张春霆研究组的网页院士张春霆研究组的网页n线索：天津大学、线索：天津大学、生物信息学、张春霆生物信息学、张春霆n线索：线索：Zcurve方法方法nGoogle “张春霆”、“生物信息学” “天津大学” NonGoogle “Zcurve” 学生网页学生网页Link to 张张groupn注意注意：早期例子，由于：早期例子，由于GoogleGoogle索引覆盖面扩大，结果索引覆盖面扩大，结果不同了，思路供参考不同了，思路供参考信息检索的基本步骤信息检索的基本步骤n科研项目信息检索的起点科研项目信息检索的起点 建议建议 n课题组原有的积累课题组原有的积累 ( (

16、工作工作+ +文献文献) )nReviewReview文章文章n近期的文章近期的文章n经典文章经典文章 引用引用l相关术语相关术语 检索关键词检索关键词l同行及课题组同行及课题组l学术会议、论坛学术会议、论坛检索步骤：选择检索工具检索步骤：选择检索工具 - 信息源知识的重信息源知识的重要性要性 n一公司合成出某化学品、欲知其分析方法及物一公司合成出某化学品、欲知其分析方法及物性性 (2010)(2010)n网络：找到一部分，无法得出严谨的结论网络：找到一部分，无法得出严谨的结论l所里可用的信息源受限制所里可用的信息源受限制n线索：清华线索：清华有有SciFinder (美国化学文摘美国化学文摘

17、CA)lSciFinder上不去上不去 - busyl意外发现另一个工具可用意外发现另一个工具可用 CrossFire (Beilstein有有机合成手册、机合成手册、Gmelin手册手册)n结果：结果：CrossFire给出了系统的结果给出了系统的结果n信息源知识的重要性信息源知识的重要性 需要积累需要积累n了解科学院、研究所订阅情况了解科学院、研究所订阅情况l方法：检索方法：检索CSDLCSDL、“查看具体研究所查看具体研究所”n了解各种可能的来源了解各种可能的来源 图书馆图书馆/ ChINl免费资源免费资源l馆际互借馆际互借 文献传递文献传递l互相帮忙互相帮忙 论坛、其他求助论坛、其他求

18、助检索步骤检索步骤 设计检索策略的重要性设计检索策略的重要性 举例举例n从从NSFC检索与检索与Internet有关的资助项目有关的资助项目l检索输入：检索输入：“Internet”检索步骤检索步骤 设计检索策略的重要性设计检索策略的重要性 举例举例n从从NSFC检索与检索与Internet有关的资助项目有关的资助项目l检索输入：检索输入：“Internet” (猜测检索字段：项目名称猜测检索字段：项目名称)检索步骤检索步骤 设计检索策略的重要性设计检索策略的重要性 举例举例n从从NSFC检索与检索与Internet有关的资助项目有关的资助项目l检索输入：检索输入：“互联网互联网”检索步骤检索

19、步骤 设计检索策略的重要性设计检索策略的重要性 举例举例n从从NSFC检索与检索与Internet有关的资助项目有关的资助项目n术语规范化术语规范化 影响检索准确性的基本问题影响检索准确性的基本问题lSynonymy (一义多词、多形态一义多词、多形态)lPolysemy (一词多义一词多义)文献数据库文献数据库 信息加工水平的标志信息加工水平的标志l 是否有可控词库是否有可控词库( (主题词表主题词表) )？l 是否有叙词表？是否有叙词表？李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10检索步骤检索步骤 设计检索策略的重要性设计检索策略的重要性 举例举例李晓霞 中国科学院过程工程研究所 20

20、07.10检索步骤检索步骤 设计检索策略的重要性设计检索策略的重要性 举例举例观察检索结果标题观察检索结果标题 “分析分析”相关术语：相关术语：l “ “测定测定”l “显色反应显色反应”l 李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10检索步骤检索步骤 设计检索策略的重要性设计检索策略的重要性 举例举例检索步骤检索步骤 检索策略优化检索策略优化l合适的检索工具合适的检索工具l利用检索工具的主题词表、索引利用检索工具的主题词表、索引n例如例如EI browse indexesl关键词关键词(术语术语)的优化的优化l检索字段调整、优化检索字段调整、优化n扩大检索范围：扩大检索范围： 标题标题(

21、TI) 主题词主题词 (subject/keywords/CV)李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.9化学化工文献检索流程化学化工文献检索流程 (3步步)原始文献 (纸介质 + 电子化电子化)期刊文章、专利、专著、期刊文章、专利、专著、报告、会议文集等报告、会议文集等其他各类其他各类WebWeb信息信息(Web)检索工具检索工具摘要库摘要库 ( (CA, EI)门户门户搜索引擎搜索引擎数据库引擎数据库引擎Internet检索结果保存检索结果保存复印、打印复印、打印文献管理工具文献管理工具文献管理工具文献管理工具李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.9文献管理工具文献管理工具 nE

22、ndNote (中科院统一订阅中科院统一订阅)nReference ManagernProCitenThomson ResearchSoftn1000种文献格式种文献格式Niles SoftwareResearch Information Systems (RIS)李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.9文献管理工具文献管理工具 建立自己的文献数据库建立自己的文献数据库 n导入导入 参考文献信息参考文献信息n手工手工n检索结果文件检索结果文件 - 自动导入自动导入n在线在线检索检索 - 直接自动导入直接自动导入n导出导出 论文参考文献插入与格式自动生成论文参考文献插入与格式自动生成nEn

23、dNote - WORD (论文写作论文写作)投国际期刊、论文修改投国际期刊、论文修改 EndNote内置其文献格式内置其文献格式李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2013.4EndNote 建立自己的文献数据库建立自己的文献数据库 信息检索结果评价信息检索结果评价 估计估计n相关文档相关文档 (Rel) 应该得到的应该得到的n检索结果检索结果 (Retr) 所得到的所得到的n查全率查全率 (Recall) n查准率查准率 (Precision)RetrRel李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.9主要主要检索工具检索工具 - 类型类型 (Index)n文献数据库文献数据库(Web)n摘

24、要库摘要库n学科资源导航学科资源导航(信息源知识信息源知识)lChIN: http:/ n资源搜索引擎资源搜索引擎l通用：通用：Google, 百度百度l科技搜索：科技搜索：SciRus, Google Scholarl化学专业：化学专业：Pubchem, （我（我们）们）期刊文章、专利、专著、期刊文章、专利、专著、学位论文、报告等学位论文、报告等WebWeb信息信息系统系统部分部分李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.9主要检索工具：主要检索工具：文献摘要库文献摘要库 平台平台n在线系统在线系统STN、Dialog、Questel Orbitn联机系统联机系统(online servi

25、ce, 1972 - )n磁带磁带 (1967 ) 光盘光盘 (正在消亡正在消亡)nInternet：基于：基于Web的摘要数据库的摘要数据库 ( 1995 -)文献摘要数据库文献摘要数据库 bibliographic database李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.9n文摘数据库文摘数据库 (各有特色、互有重叠各有特色、互有重叠)nCA (Chemical Abstracts, SciFinder) 化学化学nEI (Engineering Village 2) 化学化工化学化工 15%nCurrent Contents - ISI Web of Knowledgeu多学科、全文

26、链接多学科、全文链接 *nCSA (剑桥科学文摘剑桥科学文摘) 材料材料nBIOSISnPubMed 医学医学(免费免费)n重庆维普重庆维普中文科技期刊中文科技期刊全文数据库全文数据库, CNKI, NSTL (面向全国面向全国)n其他其他主要检索工具：主要检索工具：文献摘要库文献摘要库 李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.9n文摘数据库文摘数据库n会议录会议录ISTP - ISI Web of Knowledge nPQDT.B学位论文学位论文数据库数据库nDewent世界世界专利专利索引索引 - ISI Web of Knowledgen免费免费专利专利检索检索 (USPTO、世界

27、各国世界各国专利专利espcenet等等)n美国科技报告检索美国科技报告检索 (NTIS等等)n其他其他主要检索工具：主要检索工具：文献摘要库文献摘要库 趋势：文献摘要数据库趋势：文献摘要数据库 对应的全文链接对应的全文链接 并不意味着并不意味着：摘要库与全文库是同一个库：摘要库与全文库是同一个库文献摘要数据库文献摘要数据库 工作原理及检索功能工作原理及检索功能n文献数据库检索文献数据库检索n文献著录信息文献著录信息 - 数据库数据库 (类似图书馆卡片类似图书馆卡片)n经过人加工、格式规范经过人加工、格式规范n可检索字段可检索字段 Title, Author, Keywords n原理：检索式

28、原理：检索式 = (匹配匹配) 被检索字段值被检索字段值 检索结果检索结果n组合检索组合检索 布尔代数布尔代数n检索结果子集检索结果子集 逻辑运算逻辑运算n运算符：运算符：AND, OR, NOTnAND (intersection) 交集交集nOR (union) 并集并集nNOT (complement) 补集补集推荐：推荐：高级检索高级检索索引索引 - - 关系数据库关系数据库检索策略比较：检索策略比较：l检索检索式式：“EI”? OK, 结果较多结果较多l检索检索式式：“Village”? better!l检索检索式式：“工程索引工程索引” ? No!文献摘要数据库检索文献摘要数据库检

29、索n组合检索组合检索 布尔代数布尔代数 举例举例n检索结果子集检索结果子集 逻辑运算逻辑运算n运算符：运算符：AND, OR, NOTn例如：例如：我们组的化合物搜索引擎我们组的化合物搜索引擎的组合检索功的组合检索功能能 ()n逐步增加检索条件逐步增加检索条件 - 供应商供应商(中文名称中文名称 )n检索：苏州生物制药方面的公司检索：苏州生物制药方面的公司高级检索高级检索细化细化文献摘要数据库检索文献摘要数据库检索n组合检索组合检索 布尔代数布尔代数 举例举例n检索结果子集检索结果子集 逻辑运算逻辑运算n运算符：运算符：AND, OR, NOTn例如：我们组的化合物搜索引擎的组合检索功例如：我

30、们组的化合物搜索引擎的组合检索功能能 ()n逐步增加检索条件逐步增加检索条件 - 产品产品(中文名称中文名称 +分子式分子式)文献摘要数据库检索文献摘要数据库检索n组合检索组合检索 布尔代数布尔代数 为什么能够检索？为什么能够检索？n经过人的组织、加工经过人的组织、加工n数据库管理数据库管理文献摘要数据库检索文献摘要数据库检索n组合检索组合检索 主流数据库基本功能主流数据库基本功能信息检索基本问题信息检索基本问题n有效交流有效交流 - 相同的语言相同的语言n检索检索 (匹配匹配) 一致表达一致表达nPolysemy (一词多义一词多义)n同一个词有不同的含义同一个词有不同的含义, e.g. “

31、扩散扩散”n社会学里：社会学里：“内部传达，不要扩散内部传达，不要扩散” - 传播、流传传播、流传n健康领域：癌症：健康领域：癌症：“扩散扩散”- 转移转移n化学：分子化学：分子/离子在一相分散的过程，从浓度高向低离子在一相分散的过程，从浓度高向低nSynonymy (一义多词一义多词)n同一个概念用不同的同一个概念用不同的 词表达词表达 (习惯习惯)文献数据库加工、格式规范文献数据库加工、格式规范n文章索引标准化文章索引标准化 - standardized terminologyn受控词表受控词表 文献数据库文献数据库规范化术语索引规范化术语索引 (防漏检防漏检)nControlled Vo

32、cabularies / Controlled Termsn如：主题词表如：主题词表(subject headings) n叙词表叙词表 (Thesauri) 以自己熟悉的词为起点以自己熟悉的词为起点n词之间的关系词之间的关系n缩小、扩大概念范围缩小、扩大概念范围n相关词汇相关词汇文献摘要数据库加工文献摘要数据库加工 - 受控词表受控词表n受控词表受控词表nControlled Vocabularies / Controlled Terms文献摘要数据库加工文献摘要数据库加工 - Stemmingn术语规范化术语规范化l不同词性不同词性/形式形式 词根词根(stem)l检索工具：检索工具：打开

33、或关闭打开或关闭stemming李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2012nISI Current Contents Connect检索检索n检索结果分析检索结果分析n例：例：Data mining + 化学领域化学领域n如果如果TI/TS=(data mining), 按领域分析按领域分析 (结果页右结果页右侧上方图标侧上方图标)nCC CLASSIC SEARCHnTI=(data mining)nDIS=(chem*)n结果分析结果分析 (国家国家, 2010无此字段选项，无此字段选项，2011有有)文献摘要数据库文献摘要数据库 分析功能分析功能 (策略优化依据策略优化依据)ISICur

34、rent Contents Connect 检索结果分析检索结果分析时间限制：时间限制：2009 ISICurrent Contents Connect 检索结果分析检索结果分析引文报告引文报告(2013)检索步骤检索步骤 检索策略优化检索策略优化l合适的检索工具合适的检索工具l推荐检索模式：推荐检索模式：高级检索高级检索 (更好地描述检索策略更好地描述检索策略)l利用检索工具的主题词表、索引利用检索工具的主题词表、索引n例如例如EI browse indexesl关键词关键词(术语术语)的优化的优化l检索字段调整、优化检索字段调整、优化n扩大检索范围：扩大检索范围： 标题标题(TI) 主题词

35、主题词 (subject/keywords/CV)l容易重名的字段容易重名的字段(缩写加重这一问题，例：缩写加重这一问题，例：Web of Knowledge)n作者名作者名n作者单位名作者单位名李晓霞,中国科学院过程工程所 2013n通用资源搜索引擎通用资源搜索引擎nGoogle、百度百度(中文杂项中文杂项)n科学搜索引擎科学搜索引擎nScirus, Google Scholar, Google Booksn百科全书百科全书(科技科技)：wikin化学化工专业搜索引擎化学化工专业搜索引擎n文本搜索：文本搜索：Cn化合物数据搜索：化合物数据搜索： nPubChem, eMolecule (Ch

36、moogle), ChemSpidernChemDB Portal (我们：我们：)主要检索工具：主要检索工具：搜索引擎搜索引擎 n可检索词可检索词 文档中的所有词文档中的所有词 (every word)n文档文档未经过人工加工未经过人工加工 (文献数据库文献数据库 人加工人加工)n计算机计算机 文本规范性处理文本规范性处理建索引建索引n停用词过滤停用词过滤 (a, the, we, chemistry?)n词干归一化词干归一化(stemming)n检索结果的打分、排序检索结果的打分、排序n例如：词频统计例如：词频统计n检索结果检索结果 太多太多n高级检索高级检索 检索策略检索策略Google

37、是通用搜索是通用搜索增加限制条件可锁定目标增加限制条件可锁定目标例：例：Edelweiss + music主要检索工具：搜索引擎主要检索工具：搜索引擎 检索检索 全文检索全文检索李晓霞,中国科学院过程工程所 2013nChIN 国内权威、国际承认国内权威、国际承认 (since 1997)l化学信息源知识化学信息源知识 帮助选择不同类型工具帮助选择不同类型工具l本身也是一个精选资源检索工具本身也是一个精选资源检索工具主要检索工具：主要检索工具：导航导航 系统系统(门户门户)61日本同行建立了日本同行建立了ChIN的日文版的日文版(2008 -)化学化学信息检索工作原理及功能信息检索工作原理及功

38、能n工具类型：工具类型：化学数据库化学数据库 化学结构检索化学结构检索n化学结构化学结构 (1D, 2D, 3D) n1D SMILES, InChI (New): 检索途径检索途径n2D MOL, RDF, : 检索途径检索途径n3D MOL, PDB, CIF (几何优化几何优化)n应用：应用：3D构象搜索、优化构象搜索、优化 - 药物设计、分子模拟药物设计、分子模拟n目前国际化学数据库发展趋势：目前国际化学数据库发展趋势：2D结构的检索结构的检索n全结构全结构(exact match) 唯一唯一n子结构子结构 (substructure)n相似性检索相似性检索 基于基于fingerpri

39、nt n举例：我们的化合物搜索引擎举例：我们的化合物搜索引擎n举例：举例：Web of Knowledge的化学模块的化学模块1D 2D结构结构可互相转化可互相转化化学结构化学结构的组合检索的组合检索数值型数据库NIST：Chemistry WebBook李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.1070Internet化学化工数据库化学化工数据库n举例：举例：n从从NIST Chemistry WebBook检索苯的数据检索苯的数据n数据全数据全 (物化性质、谱图、基元反应等物化性质、谱图、基元反应等)李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10全文获取及趋势全文获取及趋势n一次文献类

40、型及其所占比例一次文献类型及其所占比例李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10Internet化学化工电子期刊进展化学化工电子期刊进展n电子期刊全文电子期刊全文 ( (文本文本 No Eqs., Graphs) )nJournal of Medicinal Chemistry, 1000篇文章篇文章, 试用试用, 1980n16种种ACS期刊全文通过期刊全文通过BRS在线在线, 1982nACS期刊全文上线期刊全文上线STN, 1983 1986nRSC, Elsevier, John Wiley , 1983 1986STN - 1995美国化学会美国化学会ACS: 19种种英国化学

41、会英国化学会RSC: 10种种 Elsevier: 4种种Wiley: 5种种Before Internet李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2012.10基于基于Web电子期刊全文电子期刊全文nScience AAAS, HighWiren1995 - nScienceDirect Elseviern1997 n1100 journals 1800 journalsnSTM (科学、技术、医学科学、技术、医学)nACS journals - - 美国化学会美国化学会n1997 免费试用免费试用n1998 收费服务收费服务nInterScience John Wiley (400)nSprin

42、gerLink (1600)1994我国加入我国加入InternetNetscape beta 版版李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10Internet化学化工电子期刊进展化学化工电子期刊进展n基于基于W Webeb的的期刊电子化期刊电子化nSciencen1995 - n整个刊物的电子化整个刊物的电子化 ( (backfiles) )n美国物理学会美国物理学会n美国化学会美国化学会 - 2002 (2000 - 2002 (2000秋季宣布秋季宣布) )n1879 - 1997n英国皇家化学会英国皇家化学会 - (2003 - (2003春季宣布春季宣布) )n1841 - 19

43、96 nElsevier - (200- (2004.74.7宣布宣布完成完成, 3, 3年年) )nJohn Wiley (2004.11, 完成完成11种期刊种期刊)83%科技期刊已上网科技期刊已上网Accounts of Chemical Research, 37(3), 2004李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2012.10CSDL订阅的订阅的电子期刊全文库电子期刊全文库nScienceDirect Elsevier (1800)nWiley-Balckwell online library (2011- )nWiley InterScience John Wiley (400)nB

44、lackwell SynergynSpringerLink Springer (1600)nACS journals - - 美国化学会美国化学会 (30) (30)nRSC journals 英英国皇家化学会国皇家化学会 (30) (30)nNature, SciencenCNKI 国内中文科技期刊国内中文科技期刊 (8000)n重庆维普重庆维普 中文科技期刊中文科技期刊 (7953)nMore?查看查看CSDLl 摘要检索工具摘要检索工具(EI, Web of Knowledge)检索摘要的范围囊括了这些全文库检索摘要的范围囊括了这些全文库+其他出版商的期刊其他出版商的期刊l 出版商的全文

45、库出版商的全文库 均有自己的检索引擎均有自己的检索引擎李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10Internet化学化工电子期刊化学化工电子期刊 附加数据附加数据n举例：举例：E. J. Corey发表发表2002年年在在JACS上的上的一篇论文附带的数据一篇论文附带的数据nRef: JACS, 124(27), 7904- 7905n步骤步骤n从从ChIN定位到定位到ACS期刊检索页期刊检索页n直接定位文章直接定位文章 / 通过检索定位文章通过检索定位文章n下载附带数据下载附带数据: 点击、另存点击、另存 (.cif) n下载下载Viewer: Rasmol (课件课件)n观看数据观看

46、数据李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10 详细的实验过程详细的实验过程 更完整的数据更完整的数据ACS期刊期刊: : 附带数据附带数据课件：课件：ACS-corey-supporting-info-2002.cifRasMol: raswin-272.exe李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2012.10nOpen Access (开放获取开放获取)“journals that use a funding model that does not charge readers or their institutions for access. - DOAJ.ORG网络期刊网络期刊的影

47、响的影响 出版商出版商李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10nOpen Access BioMed CentralnPublication is the last phase of Research processn作者交出版费作者交出版费 ( (科研经费的一部分科研经费的一部分) )n同行评审同行评审 标准标准n130130种期刊种期刊 (2005.11) (2005.11)nISI, Scopus, Google Scholarn免费全文免费全文网络期刊网络期刊的影响的影响 出版商出版商李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10nOpen Access BioMed Cen

48、tral李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10nOpen Access BioMed Central李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2013.nOpen Access 美国美国2013 (文章发表文章发表1年后免费年后免费)李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10nOpen Access Chemistry Central李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10nRepository PubMed CentralnNCBI, NLM, NIHn永久保藏永久保藏n213213种期刊种期刊 (2005.11) (2005.11)n版权仍属于原出版者版权仍属于原出版者nN

49、IHNIH资助项目：作者提交文章资助项目：作者提交文章n免费全文免费全文网络期刊网络期刊的影响的影响 信息服务者信息服务者李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10nRepository PubMed Central李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10nRepository PubMed Central李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2012.10网络期刊网络期刊的影响的影响 读者读者n获取一篇文章的全文获取一篇文章的全文n过去过去n检索工具检索工具, ,图书馆书架图书馆书架( (字母序字母序) )、全文传递服务、全文传递服务n现在现在( (1995 -1995 -) )n

50、摘要摘要检索工具检索工具(Web of Knowledge)(Web of Knowledge) - - 期刊出版者网期刊出版者网站站 检索检索 全文全文 ( (无缝无缝) )n出版商出版商摘要检索工具摘要检索工具 全文全文 ( (无缝无缝) () (Scirus, SciVerse) )n图书馆图书馆摘要检索工具摘要检索工具( (图书馆收藏目录图书馆收藏目录) ) 全文全文 ( (NSTLNSTL、CSDLCSDL全文传递全文传递) )n搜索引擎搜索引擎 全文全文 ( (无缝无缝, , 作者网页作者网页) )n搜索引擎搜索引擎 全文全文 ( (无缝无缝, , 作者单位网页作者单位网页) )n

51、检索工具检索工具 全文全文 ( (无缝无缝, , Repository) )李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10期刊文章全文获取期刊文章全文获取n中国科学院订阅的期刊全文中国科学院订阅的期刊全文 CSDLn是否全院订阅、是否所里订阅是否全院订阅、是否所里订阅?n文章是否在订阅库的覆盖范围？文章是否在订阅库的覆盖范围？n是否已经电子化？是否已经电子化？n免费途径免费途径n全文传递全文传递 ( - 1995, 早期文献早期文献)n全国期刊联合目录全国期刊联合目录nN NSTLSTLn其他其他n向作者索要向作者索要李晓霞 中国科学院过程工程研究所 2007.10引用与研究者影响引用与研究者影响科学家访谈：科学家访谈：2008年之后在年之后在sciencewatch李晓霞 中国科学院过程工程研究所 20