WesternBlot试验详细步骤_第1页
WesternBlot试验详细步骤_第2页
WesternBlot试验详细步骤_第3页
WesternBlot试验详细步骤_第4页
WesternBlot试验详细步骤_第5页
已阅读5页,还剩8页未读 继续免费阅读

下载本文档

版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领

文档简介

1、WesternBlot实验技术SDS-PAGE浓缩胶(5%Acrylamide)配方表杏曲虫也名相看朴用皎整和吊力位的步却里出的取才?1ml2El3mH4mlSml&01)Bmi10mlHtOCBSL41a.7344J5.5E.S3F0Ab,1立即id0IT03305H7H31013171.0MTiisHO|pHC.13C.Z50.3E0.5n630.751.01.2aId%SD6aoiCLOfln.ft3004C朋白配CC.1熔脸转o.aic.oeO.M03口第00G。说0.1TCMGDO.DQIia.nsQ.MQ.QQ4Q.0Q3Q.OQ&13.W8CLCHSDS-PAG

2、盼离胶配方表喜笄震K偌箱所时思的吝静组等的曲*5mlWmi15ml20ni25nil30ml4QmlfrDml6%GelH1025537.9I0.61321SS21.22fl.5MPu心ynrrim-1003040S.Q6。SC10d15MTriHCI加HBH)IS2538506.375100125廿SDS00501015020.251oa04051/。记设飘故0,05010150.20.2S0304asTEMEO8%GB)aGMoooa0012GDISgQC24口032OJ34HtO23466S33115130232SQPfllb|曲Ei加13274。53e,7BO10713315MTrE-

3、HD|iHEB132538506.37510012510?uSDS0.G5Q.10.150.2。比0.30.40.510、1_折理小00501oie030.2B03040.5TEMED00030006000&00120015ambQ必0031QF%QvlH;O191.7405573991191591SB3y*oMcr,auiicte3350e78.3100133W-7I.AMTris-HSIB1.32Sae50E.37S1CL0I.SIODSDS0.050.10150.20s250.3040.5IF,匕航的隹0050101502OK03u*05TEMED、丸GelQ.coeOOQ400

4、06Q390,010.0120.015Q.Q2HiC16534-gC5白之9S13210.5SOnHer)E鬲品22ato白心10,0uos6.a15MTrb-HGI(pHBa)132536503751001253第0.05DI01601a.2G3Q40.5】见诘砒酸族CkCfi0101S口曰O.-K03。身OSTEMEDa.ace口cm000ocae0,(M0Qt200160X1215%Gd修。233日5.792ILS304Acryiamidte25507S101?5陋。汽ID?501后MTrLhIGgHB同1.325385.06.3751Q01Z51(Tn$DS0050101520.250

5、304051FU忆付IE城a,c5010150.2Q2S030405TEMED0CD20004oooe0MB0010012001A0.02用坦日的殂口的分子量大小选择合造的;旗技浓应,再按照下面的长喑配制 iO8-PAOE 的分阈胺酬口 I、官腰八不同 I浓度的 SDSPAGC 分曲般刖晶 4 工妇,3 位函SUS-PAGit 分阿胺浓度最佳方网转国E 笑月交EiO-ISOKD蜂股3O-OOKDHOHS2O-BOKD12%胶1.2-GOICD1S阵脆1O-4OkQ1 1、检查制胶器是否漏水,吸干玻璃中水分2 2、配置分离胶,加入玻璃板中(注意:不能有气泡和杂物),距离玻璃上口 1.5mL1.5

6、mL停止加胶。3 3、再加 ddH2OddH2O 或异丁醇水封除去气泡,凝胶后倒掉水,吸干水到浓缩胶插梳。二、上样1 1、先在内槽加满电泳液才可以拔梳子。2 2、拔梳子时垂直向上拔出,不可左右摇晃梳子。3 3、拔完梳子后观察梳子孔,是否有缺口和歪,用针头拨正。4 4、上样时从左到右依次上样。5 5、若上样组不多时,左右第一孔不加样。6 6、要预留 MarkerMarker 的上样孔。配置电泳液5xDS-PAGE携冲液tris15.1g800mlddHQ溶解Glycine94g定容至1LSDS5g室温保存使用时稀释成心为了节约成本,电泳液可回收通电:恒压调节电压a。“,当、在浓缩胶与分离胶分界线

7、处压成一条直线时,调节电压120,直到蓝色带跑到底部,结束修实际操作时可以1HOV,但电泳槽要放在冰水里.日寸I旬:1h-L5h四、转膜质印迹法中常用的一种固相支持物。PVDF 膜是疏水性的,膜孔径有大有小,随着膜孔径的不断减小,膜对低分子量的蛋白结合就越牢固。很贵,节约原则不可裸手触碰VDF膜不可受潮湿取用时戴干净手套用完后及时收好PVDF膜即聚偏二氟乙烯膜(polyvinylidenefluoride)是蛋白配置转膜缓冲液5x 转膜缓冲液tris58g*1200mlddH?。溶解Glycine29g,定容至 1600mlSDS37g 室温保存,用时:ddHQ5x 转膜缓冲液:甲醇=3:1:

8、1120ml:40ml:40ml(转膜缓冲液:需 4 4 度预冷,现配现用,不能放太久。)1、转印滤纸:全胶长 8.5cm,宽5.5cm,需剪裁成 7 层滤纸,压平后约 3mm。需在转膜缓冲液中平衡浸泡备用。2、海绵垫:在转膜液中平衡浸泡备用。3、PVDF 膜:剪裁 8.5cm*5.5cm,需在甲醇中浸润 2min(活化膜上正电基团),然后在转膜缓冲液中平衡浸泡备用。4、凝胶:凝胶也需要在预冷的转膜转膜缓冲液中平衡浸泡 3-5 分钟。否则在转膜过程中会出现皱缩,导致出现转移的条带变形。三明治夹心法:负极(黑)-海绵垫-滤纸-胶-PVDF 膜-滤纸-海绵垫-正极(白)转膜时间:通电恒流,60V,

9、一个槽 100mA 左右,1h(注意:在操作过程中用玻棒赶走气泡。装置转膜仪时注意黑对黑(负对负),白对红(正对正)。装置运行时需冰浴。)五、封闭忡 buffer10Xe00m|ddHQ 溶解ris24,2g1定容至IL熠X网室温保存II.TBE 怕父林*孕至”其+丁加匕日口 20(0Q5%)K5Q0ml|脱脂铅用封闭液 5%妍粉:TBST=0.5g:10ml时间:1h牛血清白域白限闭液准血清二 TBST=0.3g:10ml螭酎m才BS10*30ml:ddHQ45OZ;加 een202 切回封间气果.好对谢效果不吁话含胃黑好在进行抗体杂交之前,需要先对转印膜进行封闭,以防止抗体对非转印蛋白区域

10、的非特异性吸附。封闭一般采用异源性蛋白质或去污剂,本实验室常用的有 5%BSA5%BSA10%10%脱脂奶等,至于选择哪一类封闭液,首先应考虑与检测目的相适应(做 l l 酪氨酸磷酸化时不推荐 non-fatmilknon-fatmilk 封闭)。1 1、将脱脂奶粉封闭液(IxTBSTBIxTBSTB 脂奶粉二 20mL:2g20mL:2g 一块膜用量。牛血清蛋白、5%BSA效果更好)倒好。2 2、将 PVDF 膜取出放入封闭液中,盖子改好。3 3、封膜一般常温 1-2 小时即可,也可 4c 封闭过夜。一抗抗体反应主要采用间接法:即先加入未标记特异性一抗与膜上抗原结合后,再加入标记的二抗进行杂

11、交检测,标记二抗物质有放射性核素,酶,以及生物素等。1、将封闭后的杂交膜,在摇床上用 TBST 洗膜 3 次 x5min,2、加入经 TBSTW 释的一抗(用血清封闭液)3、4c 孵育过夜或室温摇动孵育 2-4 小时回收一抗稀释液七、洗膜1、之后,在摇床上用 TBST 洗膜 3 次 X5min,八、二抗一抗回收防腐剂)OBgNaN91mlddHQ=11小3母液Smi2/311500配置一抗: 用封闭液U3B1-300011-61:2000COI3A1b800111Actin15004t保存fill-arc保存制:EllOmfSdZ/3-Bl好间漉 1。鬲一擅 10+1500 闻 0067ml=

12、67ulSmid2/330Mh力小的胶片,保鲜膜平整赶走气泡,北培主后玩陋绳贪门.不置手机通人旧时不可隼川(景的.察叁川电电红光器作.事出一化收月后.*1下为眈U要立三的俄叵依片盒中.位片的J里干净.不可以局阻.好XI干净的手!LCQIIAI30Mm关闭1、加入标记的二抗室温 1-2 小时,二抗不回收注忌:一抗稀释液(稀释 20002000 到 40004000)及孵育条件,孵育时间最好严格按说明书要求来例如:CSCS 琢些磷酸化抗体要求 5%BSAffi5%BSAffi 释液稀释,4c4c 平缓震荡过夜。根据不同的目的条件和目标抗体,可剪膜后孵育抗体,即使做单一条带,仍推荐剪膜,在相同体积抗

13、体下,更小的膜可以使抗原和抗体孵育更充分。回收的一抗可加入叠氮钠抑菌(-20-20保存影响不大)。二抗作用时间不可太长,2 2 小时之后已无抗原抗体结合,导致背景过深。九、洗膜1、在摇床上用 TBST 洗膜 3X5min十、显影1 1、打开电源,预冷成像系统,同时开机,打开 GEGE 成像软件,等待显示 camerareadycameraready。2 2、暗室红灯下操作,按 EPEP 管中加显色剂 A A、B B(4C4C 保存)按 1:11:1 剂量混匀,ECLECL 发光液现配现用。3 3、用滤纸吸干 PVDFPVDF 膜上的 TBSTaTBSTa 涤液。不同的蛋白显劣时间不一样不一样T

14、要自己摸索要自己摸索盖上另一半保鲜膜,放上合适大4 4、平整铺上保鲜膜,5 5、将配好的 ECLECL 发光液均匀的涂布于 PVDFPVDF 蛋白膜上,平整的棚工保部腌显影、定影取出胶片放入显影液中4-5minT清水漂洗 t 定影液中2-3分钟 t 自来水冲洗 T 晾晒显影液、定电液可回收(避光常温保存)PVDF膜可以洗膜5min后重新显影6 6、曝光时间:根据需要,可先曝 10-30S,10-30S,视首曝决定是否再曝,或曝光时间7 7、曝光后可对图像进行调节,通过调试背景亮度及曝光度。显色后strippingStrippingsolution:100100mM2-mercaptoethan

15、ol,mM2-mercaptoethanol,2%2%(w/vw/v)SDS,62.5mMSDS,62.5mMTris-HCl,pH6.7Tris-HCl,pH6.7方法:将用过的膜浸入 strippingbufferstrippingbuffer 中,置 50c50c 水浴箱中 30min30min, ,间断振摇。之后用 TBSTBS 设 4*5min4*5min 就好。此时你已经可以按新的转移好的膜来再次使用了。该方法的优点:省事,省力,省钱。十一、常见问题聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺聚合而成,聚合过程由自由基催化完成。催化聚合的常用方法有两种:化学聚合法(常用)和光聚合法

16、。PAGE 根据其有无浓缩效应,分为连续系统和不连续系统两大类。连续系统电泳:体系中缓冲液 pH 值及凝胶浓度相同;带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷和分子筛效应。不连续系统:由于缓冲液离子成分、pH、凝胶浓度及电位梯度的不连续性;带电颗粒在电场中泳动不仅有电荷效应,分子筛效应,还具有浓缩效应,因而其分离条带清晰度及分辨率比连续系统电泳的较好。不连续体系由电极缓冲液、浓缩胶及分离胶所组成。浓缩胶是由 AP 催化聚合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为 pH6.7 的 Tris-HC1。分离胶是由 AP 催化聚合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为 pH8.9Tris-HC1。电极缓冲液是 pH8.3Tris-甘氨酸

17、缓冲液。2 种孔径的凝胶、2 种缓冲体系、3 种 pH 值使不连续体系形成了凝胶孔径、pH 值、缓冲液离子成分的不连续性,这是样品浓缩的主要因素。SDS-PAG骼试齐I作用1 .过硫酸钱(APSAPS)为催化剂2 .四甲基乙二胺(TEMEDTEMED)为加速剂:在聚合过程中,TEMED 催化过硫酸钱产生自由基,后者引发丙烯酰胺单体聚合,同时甲叉双丙烯酰胺与丙烯酰胺链间产生甲叉键交联,从而形成三维网状结构3 .SDS 是阴离子去污剂,作为变性剂和助溶试剂,它能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破成像仪盖子,开始曝光坏蛋白分子的二、三级结构。4 .强还原剂如疏基乙醇,二硫苏糖醇能使半胱氨酸残

18、基间的二硫键断裂。在样品和凝胶中加入还原剂和 SDS 后,分子被解聚成多肽链,解聚后的氨基酸侧链和SDS 结合成蛋白-SDS 胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白原有的电荷量,这样就消除了不同分子间的电荷差异和结构差异。5 .聚丙烯酰胺一一为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关;制胶缓冲液选择 trisHCL 系统;AP 一一提供自由基;TEMED 一一催化剂,催化自由基引起的聚合反应进行;十二烷基硫酸钠(SDS阳离子去污剂,作用:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。1,配胶缓冲液系统对电泳的影响?在SDS-PAG环连

19、续电泳中, 制胶缓冲液使用的是Tris-HCl缓冲系统, 浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的 Tris甘氨酸缓冲系统。在浓缩胶中,其 pH 环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而 Cl 离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压梯度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。当样品进入分离胶后,由于胶中 pH 的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离

20、。所以,pH 对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解决问题的情况,应首要考虑该因素,当然其他的因素也可以从多方面考虑。2 .样品如何处理?根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法:还原 SDS 处理、非还原 SDS 处理、带有烷基化作用的还原 SDS 处理。1)还原 SDS 处理:在上样 buffer 中加入 SDS 和 DTT(或伊疏基乙醇)后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成 SDS 与蛋白相结合的分子,在电泳中,只根据分子量来分离。一般电泳均按这种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样 Buffer,离心,沸水煮 5min,再离心加样。2)带有烷基化作用的

21、还原 SDS 处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并经久牢固的保护 SH 基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕集过量的 DTT,而防止银染时的纹理现象。100ul 样品缓冲液中 10ul20%的碘乙酸胺,并在室温保温 30min。3)非还原 SDS 处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用 1%SDS 弗水中煮 3min,未加还原剂,因而蛋白折叠未被破坏,不可作为测定分子量来使用。3 .SDS-PAGSDS-PAG 由泳凝胶中各主要成分的作用?聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关;制胶缓冲液:浓缩胶选择 pH6.8,分离

22、胶选择 pH8.8,选择 Tris-HCl 系统,TEMED 与AP:AP 催化剂,催化单丙和双丙聚合成聚丙烯酰胺。TEMED 四甲基乙二胺,催凝剂,加速AP 催化作用;十二烷基磺酸钠(SDS:阴离子去污剂,作用有四:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。4 .提高 SDS-PAGSDS-PAG 由泳分辨率的途径?聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝胶的分辨率。建议做法:待凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。 忌即配即用或 4 度冰箱放置, 前者易导致凝固不充分, 后者可导致 SDS 结晶。一般凝胶可在室温下保存 4 天,SDS 可水解聚丙烯酰胺。一般常

23、用的有氨基黑、考马斯亮蓝、银染色三种染料,不同染料又各自不同的染色方法,具体可参照郭尧君编著的蛋白质电泳技术手册P82-103。5 .“微笑”(两边翘起中间凹下)形带原因?主要是由于凝胶的中间部分凝固不均匀所致,多出现于较厚的凝胶中。处理办法:待其充分凝固再作后续实验。6 .皱眉”(两边向下中间鼓起)形带原因?主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡未排除干净。处理办法:可在两板间加入适量缓冲液,以排除气泡。7 .为什么带出现拖尾现象?主要是样品融解效果不佳或分离胶浓度过大引起的。处理办法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液,加适量样品促溶剂;电泳缓冲液时间过长,重新配制;降低

24、凝胶浓度。8 .为什么带出现纹理现象?主要是样品不溶性颗粒引起的。处理办法:加样前离心;加适量样品促溶剂。9 .什么是鬼带”,如何处理?鬼带”就是在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时,常会出现在泳道顶端(有时在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀,主要由于还原剂在加热的过程中被氧化而失去活性,致使原来被解离的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔合,聚合成大分子,其分子量要比目标条带大,有时不能进入分离胶。但它却于目标条带有相同的免疫学活性,在WB 反应中可见其能与目标条带对应的抗体作用。处理办法:在加热煮沸后,再添加适量的 DTT 或 Beta 疏基乙醇,以补充不足的还原剂;或可加适量

25、EDTA 来阻止还原剂的氧化。10 .为什么澳酚蓝不能起到指示作用?我们在实验中常会遇到澳酚蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来的现象。主要与缓冲液和分离胶的浓度有关。处理办法:更换正确 pH 值的 Buffer;降低分离胶的浓度。11 .为什么电泳的条带很粗?电泳中条带很粗是常见的事,主要是未浓缩好的原因。处理办法:适当增加浓缩胶的长度;保证浓缩胶贮液的 pH 正确(6.7);适当降低电压;12 .为什么电泳电压很高而电流却很低呢?这种现象一般初学者易出现。比如电压 50v 以上,可电流却在 5mA 以下。主要是由于电泳槽没有正确装配,电流未形成通路。包括:a.内外槽装反;b.外槽液过少;c.

26、电泳槽底部的绝缘体未去掉(比如倒胶用的橡胶皮)。处理办法:电泳槽正确装配即可。13 .浓缩胶与分离胶断裂、板间有气泡对电泳有影响吗?这主要出现在初学者中,一般对电泳不会有太大的影响。前者主要原因是拔梳子用力不均匀或过猛所致;后者是由于在解除制胶的夹子后,板未压紧而致空气进入引起的。14 .凝胶时间不对,或慢或快,怎么回事?通常胶在 30MIN-1H 内凝。如果凝的太慢,可能是 TEMED,APS 剂量不够或者失效。APS 应该现配现用,TEMED 不稳定,易被氧化成黄色。如果凝的太快,可能是 APS 和 TEMED 用量过多,此时胶太硬易裂,电泳时易烧胶。15 .电泳时间比正常要长?可能由于凝

27、胶缓冲系统和电级缓冲系统地 PH 选择错误,即缓冲系统地 PH 和被分离物质的等电点差别太小,或缓冲系统的离子强度太高。16 .分离胶加上后为什么要立即加水?加入分离胶后,立即覆一层双蒸水,一是为了使分离胶界面保持水平,用水就可以把它压平,使蛋白质分子跑时在同一水平线上;二是阻止空气中的氧气对凝胶聚合的抑制作用。17 .连续分离胶体系配制(凝胶板厚度 0.75mm,长度 10cm)100ml 体系:双蒸水 37.5ml尿素 20-50g10XTBE 冲液 8ml30%丙烯酰胺 10mlAPS(过硫酸镂)500-800ul注:现配现用TEMED(四甲基乙二胺)23.5ulSDS-PAGE 电泳的

28、原理及浓缩胶浓缩样品的原理(甘氨酸的作用)SDS-PAGE 十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳)是目前最常用的分离蛋白质的电泳技术。下面就SDS-PAGE 勺基本原理做简单介绍。SDS-PAGE 电泳的基本原理?SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进 SDSSDS 能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质的二级和三级结构,强还原剂能使半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白质在一定浓度的含有强还原剂的 SDS 溶液中,与 SDS 分子按比例结合,形成带负电荷的 SDS-蛋白质复合物,这种复合物由于结合大量的 SDS 使蛋白质丧失了原有的电荷状态形成仅保持原有分子大小为特征的负离子团块,从而

29、降低或消除了各种蛋白质分子之间天然的电荷差异,由于SDS蛋白质的结合是按重量成比例的,因此在进行电泳时,蛋白质分子的迁移速度取决于分子大小。当分子量在 15KD 到 200KD 之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW 为分子量,X 为迁移率,k、b 均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。SDS-PAG 曲泳成功的关键是什么?溶液中 SDS 单体的浓度 SDS 在水溶液中是以单体和 SDS 多肽胶束的混合形式存在, 能与蛋白

30、质分子结合的是单体。为了保证蛋白质与 SDS 的充分结合,它们的重量比应该为 1:4 或 1:3。样品缓冲液的离子强度因为 SDS 结合到蛋白质上的量仅仅取决于平衡时 SDS 单体的浓度,不是总浓度,而只有在低离子弓 II 度的溶液中,SDS 单体才具有较高的平衡浓度。所以,SDS电泳的样品缓冲液离子强度较低,常为 10-100mM。二硫键是否完全被还原只有二硫键被完全还原以后,蛋白质分子才能被解聚,SDS 才能定量地结合到亚基上从而给出相对迁移率和分子质量对数的线性关系。Samplebuffer 中的 3-疏基乙醇的浓度常为 4-5%,二硫苏糖醇的浓度常为 2-3%o 前者有挥发性,最好使用

31、前加入。SDS-PAG 暖冲液系统的选择,Tris-Glycine、Tris-Tricine、Tris-硼酸盐或者其他?一般来说,在被分析的蛋白质稳定的 pH 范围,凡是不与 SDS 发生相互作用的缓冲液都可以使用,但缓冲液的选择对蛋白带的分离和电泳的速度是非常关键的。Tris-甘氨酸系统是目前使用最多的缓冲系统。如果要测定糖蛋白的分子量,最好采用 Tris-硼酸盐缓冲系统,对于分子质量小于15kDa 的蛋白样品,可以使用 SDS 尿素系统,也可以采用 Tris-tricine 缓冲系统。积层胶(或称浓缩胶)的作用原理?在缓冲系统中的弱酸,如甘氨酸,在 pH6.7 时很少解离,其有效泳动速率很

32、低,而氯离子却有很高的泳动速率,蛋白质的泳动速率介于两者之间。加上电压以后,作为先导离子的氯离子和尾随离子的甘氨酸离子分离开来,并在其后面留下一个导电性较低的区带。由于导电性和电场强度成反比,这一区带便获得较高的电压梯度,加速甘氨酸离子的泳动,使其赶上氯离子,建立起甘氨酸和氯离子的电压梯度和泳动速率乘积相等的稳定态(我不太明白这句话),使这些带电颗粒以相同的速度泳动,两种离子之间有明显的边界。当甘氨酸、氯离子界面通过样品进入浓缩胶时,在移动界面前有一低电压梯度,界面后有一高电压梯度。由于在移动界面前的蛋白质分子泳动速率比氯离子低,因此氯离子能迅速越过。移动界面后的蛋白质处于较高的电压梯度中,其

33、泳动速率比甘氨酸快。因此,移动的界面将蛋白质分子堆积到一起, 形成一条狭窄的区带。 蛋白质在移动界面中的浓度作用仅取决于样品和浓缩胶中 Tris-HCl的浓度(为什么?),而与样品中蛋白质的最初浓度无关。由于浓缩胶为大孔凝胶,故对蛋白样品没有分子筛作用。当移动的界面到达浓缩胶和分离胶的界面时,凝胶的pH 明显增加,导致甘氨酸大量解离。此时,甘氨酸的有效泳动速率明显增加,超越蛋白分子,直接在氯离子后移动。由于凝胶孔径变小,蛋白质分子的迁移速率降低,落在后面的蛋白质便在均一的电压梯度和 pH 环境中泳动,并根据其固有的电荷与分子大小进行分离。可见,甘氨酸并非作为缓冲成分参与,而是作为尾随离子来参与

34、电泳过程。以上内容主要摘自蛋白质电泳实验技术第二版(郭尧君编著)。需要进一步了解相关内容的同学可以查阅该书。SDS-page 电泳小问答Q:SDS-PAGE 电泳的基本原理?A:SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进 SD&十二烷基硫酸钠),SDS能断裂分子内和分子间氢键,破坏蛋白质的二级和三级结构,强还原剂能使半胱氨酸之间的二硫键断裂,蛋白质在一定浓度的含有强还原剂的 SDS 溶液中,与 SDS 分子按比例结合,形成带负电荷的 SDS 蛋白质复合物,这种复合物由于结合大量的 SDS 使蛋白质丧失了原有的电荷状态形成仅保持原有分子大小为特征的负离子团块,从而降低或消除

35、了各种蛋白质分子之间天然的电荷差异,由于 SDS 与蛋白质的结合是按重量成比例的,因此在进行电泳时,蛋白质分子的迁移速度取决于分子大小。当分子量在 15KD 到 200KD 之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW 为分子量,X 为迁移率,k、b 均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。Q:配胶缓冲液系统对电泳的影响?A:在SDS-PAGE不连续电泳中, 制胶缓冲液使用的是Tris-HCL缓冲系统, 浓缩胶是pH6.7,分离胶

36、pH8.9;而电泳缓冲液使用的 Tris甘氨酸缓冲系统。在浓缩胶中,其 pH 环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而 CL 离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。当样品进入分离胶后,由于胶中 pH 的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离。所以,pH 对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解

37、决问题的情况,应首要考虑该因素。Q:样品如何处理?A:根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法:还原 SDS 处理、非还原 SDS 处理、带有烷基化作用的还原 SDS 处理。1、还原 SDS 处理:在还原剂中加入 SDS 和 DTT(或 Beta 疏基乙醇)后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成 SDS 与蛋白相结合的分子,在电泳中,只根据分子量来分离。一般电泳均按这种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样 Buffer,离心,沸水煮 5min,再离心加样。2、带有烷基化作用的还原 SDS 处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并经久牢固的保护SH 基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕集过量的 D

38、TT,而防止银染时的纹理现象。100ul 样品缓冲液中 10ul20%的碘乙酸胺,并在室温保温 30min。3、非还原 SDS 处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用 1%SDS 弗水中煮 3min,未加还原剂,因而蛋白折叠未被破坏,不可作为测定分子量来使用。Q:SDS-PAG 由泳凝胶中各主要成分的作用?A:聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关;制胶缓冲液:浓缩胶选择 pH6.7,分离胶选择 pH8.9,选择 trisHCL 系统,具体作用后面介绍;TEMED与 AP:促凝作用,加速聚丙烯酰胺的凝固;十二烷基硫酸钠(SDS

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

最新文档

评论

0/150

提交评论