章分子流行病学PPT学习教案

1、会计学1第1页/共55页第2页/共55页第3页/共55页第4页/共55页第5页/共55页第6页/共55页志志信息大分子：信息大分子：DNA、RNA和和蛋白质。蛋白质。第7页/共55页1990年启动，年启动，2003年发表完整的基因序列图年发表完整的基因序列图第8页/共55页10第9页/共55页第10页/共55页人类基因组流行病学网站人类基因组流行病学网站 - HuGE Net第11页/共55页第12页/共55页第13页/共55页第14页/共55页 ？分子流行病学分子流行病学ExposureCancer第15页/共55页“冰山冰山” 现象现象患患者者亚亚临床者临床者健健 康康 者者 “海平面海平

2、面” 第16页/共55页 健 康 疾 病主观感主观感觉觉客观指标客观指标健康指标健康指标疾病指标疾病指标 模式模式I I 暴露因素暴露因素 健康态健康态 潜在疾病态潜在疾病态临界疾病态临界疾病态亚临床态亚临床态临床态临床态 机体易感性因素机体易感性因素模式模式IIII图图16-1 健康疾病连续带示意图健康疾病连续带示意图（health-disease continuum，HDC）亚健康态亚健康态潜在疾病态潜在疾病态健康态健康态临床态临床态亚临床态亚临床态临界疾病态临界疾病态第17页/共55页传统流行病传统流行病学学暴暴露露疾病疾病 ？ 前瞻性研究前瞻性研究回顾性研究回顾性研究分子流行病学分子流

3、行病学图图16-2 16-2 传统流行病学与分子流行病学的关系（传统流行病学与分子流行病学的关系（EDCEDC模型）模型） （Schulte,1993Schulte,1993） 暴露暴露疾病疾病第18页/共55页（Elston RCElston RC, , 20022002）第19页/共55页第20页/共55页第21页/共55页DNADNA加合物加合物 苯并（苯并（a a）芘）芘、亚硝胺、亚硝胺 白细胞白细胞生物学标志生物学标志环境暴露物质环境暴露物质生生物材料物材料蛋白质加合物蛋白质加合物（血红蛋白）（血红蛋白） 环氧乙烯环氧乙烯红细胞红细胞第22页/共55页第23页/共55页第24页/共5

4、5页第25页/共55页第26页/共55页第27页/共55页高危险易感基因高危险易感基因低危险易感基因低危险易感基因外显性外显性高高低低相对危险度相对危险度RR高高低低归因危险度归因危险度AP高高低低人群归因危险度人群归因危险度PAR低低高高基因频率基因频率1%1%90%分析方法分析方法连锁分析（连锁分析（linkage）关联分析（关联分析（association）环境影响环境影响相对较小相对较小非常重要非常重要第28页/共55页单核苷酸多态性（单核苷酸多态性（SNPs）第29页/共55页指在人群中出现的频率指在人群中出现的频率1%的先天的先天DNA突变。突变。第30页/共55页BiologyR

5、esponseDiseasePrevention（Nature, 2003）SNPs 单单核苷酸多态性核苷酸多态性第31页/共55页第32页/共55页 第33页/共55页第34页/共55页第35页/共55页第36页/共55页XRCC1(TC)基因型基因型病例组病例组(710例例)对照组对照组(710例例)粗粗OR(95%CI)No %No %TT500 70.4558 78.61.00CT198 27.9148 20.91.49(1.171.91)CC 12 1.7 4 0.53.55(1.0710.45)CT/CC vs TT(显性模型显性模型)- - -1.54(1.211.96) CC

6、vs CT/TT(隐性模型隐性模型)- - - 3.03(0.979.45)相加模型相加模型- - -1.54(1.231.93)（Hu et al, 2005)第37页/共55页个体个体易感性易感性基因基因环境交互作用环境交互作用环境环境暴露暴露人群人群表表16-3 16-3 病例对照研究基因环境交互作用分析病例对照研究基因环境交互作用分析* *基因基因暴露暴露因素因素病病例例对对照照OR-abOR00 =1.00-+cdOR01=cb/ad+-efOR10=eb/af+ghOR11=gb/ah* 1-暴露，暴露，0-非暴露。非暴露。OR10为基因的主效为基因的主效应，应，OR01为环境的主

7、效应，为环境的主效应，OR11为环境为环境-基因基因的联合作用，交互作用的相对比值比的联合作用，交互作用的相对比值比ORint可可由公式由公式 ORint = OR11 /（ OR01 OR10）计算获）计算获得。得。第38页/共55页第39页/共55页 要求要求l在采集和储存过程中不能受到在采集和储存过程中不能受到“污染污染” l储存的生物标本在任何时候进行检测都可以获得储存的生物标本在任何时候进行检测都可以获得一致的结果一致的结果l所有的生物标本都应有详细的背景材料和鉴别标所有的生物标本都应有详细的背景材料和鉴别标识识生物标本选择和储存生物标本选择和储存 分子流行病学研究成功的分子流行病学

8、研究成功的关键关键第40页/共55页第41页/共55页第42页/共55页第43页/共55页l核酸研究技术（核酸研究技术（DNA & RNA）核酸体外扩增核酸体外扩增核酸电泳图谱核酸电泳图谱 核酸酶切电泳图谱核酸酶切电泳图谱核酸分子杂交核酸分子杂交 l蛋白质研究技术蛋白质研究技术 凝胶电泳、蛋白质转印杂交凝胶电泳、蛋白质转印杂交、色谱分析、蛋白质测序等、色谱分析、蛋白质测序等。l酶学技术酶学技术 包括定性和定量检测，要包括定性和定量检测，要求一定的条件。求一定的条件。多位点酶电泳法多位点酶电泳法l其它技术其它技术 免疫学技术、色谱技术、免疫学技术、色谱技术、生物芯片技术等。生物芯片技术等

9、。第44页/共55页DNA测测序序液液相相色色谱谱核核酸酸分分子子杂杂交交蛋蛋白白质质电电泳泳酶酶联联免免疫疫吸吸附附第45页/共55页凝胶时代：凝胶时代： 主要技术和方法主要技术和方法 ：限制性片段酶切多态限制性片段酶切多态性（性（RFLP），单链构象多态性（），单链构象多态性（SSCP），寡核苷酸连接分析（，寡核苷酸连接分析（OLA）等。）等。高通量时代：高通量时代： 按技术原理分按技术原理分 ：特异位点杂交（特异位点杂交（ASH），特异位点引物延伸（），特异位点引物延伸（ASPE），特异位），特异位点切割（点切割（ASC）和特异位点连接（）和特异位点连接（ASL）等）等。第46页/共55页48Illu