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文档简介

1、会计学1生物信息学数据库检索生物信息学数据库检索经典生物医学实验经典生物医学实验大量零碎数据大量零碎数据数据收集整理数据收集整理大规模组学实验大规模组学实验海量组学数据海量组学数据数据存储、注释数据存储、注释数数 据据 库库生物医学应用生物医学应用理论分析理论分析检索查询检索查询生物学研究生物学研究国际主要蛋白质数据库的数据来源及其关系吴松锋等, 遗传, 2005, 27(5): 687-693 Fasta格式蛋白质特性参考文献物种起源原序列复制后,可到BLAST中进行相似性对比获得多个蛋白信息 Display设置输送到文件、剪切板等上传序列文件 315条记录 70条记录 名称是所需要的 蛋白

2、SwissProt号以P/Q开头gi号 Fasta格式序列 基因定义 碱基数、核酸类型序列长度 物种来源 参考文献 染色体特性 蛋白质代码蛋白质描述:来自死海古菌的铁氧化还原蛋白发表文献生物体分类名称显示三维结构参考文献蛋白质链栏,鼠标放在栏上,显示残基;点击显示分子各条链、邻族结构点击显示存储域点击显示序列获取FMR1基因组3, 5端序列染色体位点内容目录相关数据库连接5种查询方式输入SP号,gi号或序列 上传比对序列文件 工作名称 选择比对数据库 生物组织名称 选择算法参数,可用默认值 类似性图谱比对结果描述详细比对结果数据库标识符蛋白定义积分值检索序列匹配的数据库记录打分情况匹配结果进入Primer3输入序列起始序列数引物长度熔点引物中碱基gc的比例引物起始处与寡合苷酸任意区域的互补指数引物与寡合苷酸3端的互补指数引物序列结构域名称、起始位置、终止位置、可靠性概率图形化的结构域示意图自动模式联配模式项目模式在蛋白质数据库中输入关键词或识别号(如:p41047)获取序列选择序列格式显示选择fasta格式复制序列输入框中输入待测序列选择匹配记录蛋白质特征数据库Pfam、PROSITE中获取功能描述数据库标识符蛋白定义积分值起始序列数引物长度熔点引物中碱基gc的比例引物起始处与寡合苷酸任意区域的

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