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文档简介
1、一Microorganism/microbe: (微生物)所有形体微小,单细胞或个体结构简单的多细胞,生殖无细胞结构的低级生物的总称二colony: (菌落)单个细菌大量繁殖后,可在适宜的固体培养基表面或内部形肉眼可见的,有一定形态结构的子细胞群体。Lawn: (菌苔)多个菌落连成一片LPS: (脂多糖)G-细胞壁中重要成分,有O特异多糖 核心多糖与内脂A组成Protoplast (原生质体)G+在人为条件下,用溶菌酶除去原有细胞壁或用青霉素阻止新细胞壁合成,得到的仅有细胞膜包裹的球状渗透敏感细胞L-form of bacteria: (L型细菌)细菌在某种环境条件下(或实验室条件下)通过自发
2、突变形成的遗传稳定的细胞壁缺陷变异型Mycoplasma: (支原体)由于长期进化过程中形成的,适应自然环境的无细胞壁原核生物。PHB (聚羟丁酸)原核生物中最常见的内含物之一 由羟丁酸单体组成的类似于脂类的碳源类贮藏物。Flagellum (鞭毛)菌体表面着生的一根或数根又细又长的,螺旋形丝状附属物Fimbriae (菌毛):细胞表面生出的比鞭毛更短,更细,更多的丝状结构Endospore (芽孢) 某些细菌在其生长发育后期,形成的圆形或椭圆形,壁厚,含水量极低,抗逆性极强的休眠体Actinomycetes (放线菌):一类以菌丝生长,分生孢子繁殖,具高G+C含量的革兰氏阳性陆生性很强的原核
3、生物Cyanobacterium (蓝细菌): 含叶绿素a,进行放氧型光合作用的原核生物Spirochete/spirochaete (螺旋菌) 具有独特形态结构和运动机制的特殊的革兰氏阴性菌Rickettsia 一类介于细胞和病毒之间,以节肢动物为媒介的,专性细胞内寄生的革兰氏阴性菌Chlamydia (衣原体)一类介于立克次氏体与病毒之间,可以通过细菌滤器,真核细胞内严格专性能量寄生的革兰氏阴性原核生物原体有病原性Archaea (古生菌)独立于细菌与真核生物之外的第三种生命形式三Fungi (真菌)具有真正细胞核;通常有分支繁茂的丝状体,菌丝呈顶端生长;细胞壁坚硬,含有几丁质与葡聚糖,少
4、数含纤维素;以无性孢子和有性孢子进行繁殖,营养方式为化能异养好氧Mold (霉菌)一些丝状真菌的总称,通常指菌丝体发达又不产生大型肉质子实体的真菌Chlamydospore (厚垣孢子)菌丝中不规则而肥大的菌丝细胞,不良环境下,原生质体收缩,变圆,外面形成厚壁,用以抵御不良环境,表面一般具有刺状或瘤状突起Haustorium (吸器)许多植物寄生真菌的菌丝体生长在寄主表面,从菌丝发生旁支侵入寄主细胞吸取养料。吸器并不刺破寄主原生质膜,而是一种简单的凹入,围绕着吸器,宿主细胞形成包围吸器的囊状的鞘Appressorium (附着胞)寄生真菌在穿透完整植物形成的特殊结构,功能是分泌粘液,把菌丝固定
5、在寄主表面,并产生细的穿透菌丝侵入植物细胞壁。Rhizoid (假根)毛霉目的真菌常形成延伸的匍匐状菌丝,当菌丝蔓延到一定程度,在基物上生成根状菌丝,即为假根,再向前形成新的匍匐状菌丝Rhizomorph (菌索)一些真菌的菌体出现集群现象而形成的特殊的运输结构。Sclerotiumm (菌核)由菌丝聚集和粘附形成的一种休眠体,同时也是碳水化合物和脂类营养物质的贮藏体。Stroma (子座)许多有隔菌丝生长到一定程度形成的聚集物,有规律或无规律的膨大形成结实的团块状组织,这种有密丝组织形成的具有一定形状的结构。Yeast (酵母菌)单细胞,一般为出芽生殖,以糖类发酵产能,细胞壁含葡聚糖和甘露聚
6、糖,常生活在含糖量高,酸度较大水生环境中Pseudomycelium (假菌丝) 在酵母菌出芽生殖过程中,芽体往往不从母体脱落又出芽,长此以往,许多酵母细胞首尾相连形成假的菌丝链。五Growth factor (生长因子)微生物生长所必须,需要量很少,微生物自身不能合成或合成量很少,不能满足生长需求,需要在培养基加入才能使其生长的有机化合物。Auxotroph (营养缺陷型)某些菌株突变后,失去合成某种对该菌生长所必须物质的能力,要从外界该物质获取才能进行生长繁殖的突变型菌株,Prototyoph (原养型)与营养缺陷型相对的野生型菌株Photolithoautotrophy (光能无机自养型
7、)能以CO2为唯一或主要碳源;进行光合作用获取生长所需能量;以无机物如H2、H2S、S、H2O等作为供氢体或电子供体,使CO2还原为细胞物质Photoorganoheterotrophy 光能有机异养型 不以CO2为主要或唯一的碳源,而以CO2和简单有机物为碳源;以有机物作为供氢体,利用光能将CO2还原为细胞物质;在生长时大多数需要外源的生长因子;Chemolithoautotrophy 化能无机自养型 以CO2作为唯一或主要碳源;能量来自无机物氧化过程中放出的化学能;利用H2、H2S、Fe2+、NH3或NO2-等作为电子供体使CO2还原成细胞物质。Chemoorganoheterotroph
8、y 化能有机异养型 以适宜的有机碳化合物为基本碳源,以有机物氧化过程中释放的化学能为能源,以有机物为供氢体进行生长的微生物通称为化能有机异养型。Medium (培养基)人工配置的适合不同微生物生长繁殖或积累代谢产物的营养物质的组合六 代谢Fermentation (发酵) 指微生物在无氧条件下利用底物代谢时,将有机物氧化释放的电子直接交给底物本身未完全氧化的某种中间产物(内源受体),经底物水平磷酸化产生少量ATP的过程,称为发酵,同时产生各种不同的发酵产物。广义:任何利用好氧或厌氧微生物来生产有用代谢产物或食品、饮料的一类生产方式。aerobic respiration (有氧呼吸) 氧化过程
9、中有机物经生物氧化脱下的氢和电子经完整的电子传递链传递,最终被外源分子氧接受,产生了水和CO2并释放出ATP形式的能量。anaerobic respiration (无氧呼吸) 氧化过程中有机物经氧化脱氢后,经部分呼吸链递氢,最终由氧化态的无机物(NO3-、NO2-、SO42-、S2O32-、CO2)或有机物(延胡索酸)受氢,并完成氧化磷酸化产能反应。Respiration (呼吸) 微生物在降解底物的过程中,将释放出的电子交给NAD(P)+、FAD或FMN等电子载体,再经电子传递系统传给外源电子受体,从而生成水或其它还原型产物并释放出能量的过程,称为呼吸作用dissimilative nit
10、rate reduction (异化性硝酸盐还原作用)/ denitrification (硝酸盐呼吸或反硝化作用) 在无氧条件下,某些兼性厌氧微生物利用硝酸盐作为呼吸链的最终氢受体,把它还原成亚硝酸、NO、N2O直至N2的过程。Entner-Doudoroff pathway (ED途径)由Entner和Doudoroff发现的 一分子葡萄糖最终生成2分子丙酮酸,1分子ATP,1分子 NADPH,1分子NADH的途径Carbon dioxide fixation? CO2的固定 自养微生物以CO2作为唯一的碳源,它们利用光合磷酸化或氧化磷酸化获取的能量与还原力,将空气中的CO2同化吸收转变成
11、糖和细胞物质,整个过程称为CO2固定。Glycans synthetic peptide? (肽聚糖合成)biological nitrogen fixation (生物固氮)在常温常压下由微生物固氮酶催化,将大气中的N2还原为NH3 的生化过程。七growth curve (生长曲线)单细胞、二分裂繁殖的细菌群体细胞,接种到营养物质与体积恒定的液体培养基中,在适宜的条件下进行分批培养。在培养过程中,定时取培养液检测细菌数量。以培养时间为横坐标,以细菌数量为纵坐标,可绘制一条在不同培养时间反映细菌数量变化规律的曲线,称为生长曲线。specific growth rate (比生长速率)单位数量
12、的细菌或物质在单位时间(h小时)内所增加的数量,用表示;generation time (代时)一个细菌分裂繁殖一次或细菌数量增倍所需的时间,用G表示。diauxic growth (二次生长)当培养液中同时存在速效和迟效碳源(或氮源)时,微生物首先利用速效营养物而进行对数生长,待速效营养物耗尽而进入稳定期后,微生物经短暂的适应,才开始利用迟效营养物再次进入对数生长,直至进入新的稳定期,表现为二阶式双峰生长曲线,称为二次生长。synchronous growth (同步生长) 指创造条件使群体中个体细胞处于相同的生长阶段,呈现一致的形态结构和生理生化特征。Synchronous culture
13、 (同步培养) 分离处于相同生长阶段的同步细胞并进行同步培养。continous culture (连续培养)如果采用不断补充营养物质并以同样速率移出培养物的开放系统培养,可保持细菌以恒定的比生长速率持续对数生长,这样的培养方式称连续培养batch culture (分批培养)培养基一次加入,不予补充,不再更换的培养方式。turbidostat (恒浊器连续培养) 不断调节流速而使细菌培养液浊度保持恒定。Chemostat (恒化器连续培养) 使培养液保持恒定的流速的连续培养方式Sterilization (灭菌)杀死包括芽孢在内的所有微生物;Disinfection (消毒)杀死或灭活病原微
14、生物(营养体细胞);antisepsis (防腐)防止或抑制霉腐微生物在食品等物质上的生长;chemotherapy (化疗)杀死或抑制宿主体内的病原微生物;inhibition (抑制)生长停止,但不死亡;death (死亡)生长能力不可逆丧失;antimicrobial agent (抗微生物剂)是一类能杀死或抑制微生物生长的化学合成或生物合成的物质。Antimetabolite (抗代谢药物)是一类化学结构与微生物细胞内所必须的代谢物(生长因子)结构相似,从而干扰微生物细胞正常代谢并抑制其生长的化学物质。Antibiotic (抗生素)抗生素是一类由微生物或其它生物合成的次生代谢产物或半
15、合成衍生物,低浓度就能抑制或干扰它种生物的生命活动。四Virus (病毒)超显微,无细胞结构,细胞外核蛋白非生命颗粒,专性活细胞寄生,在寄主细胞内以复制展现生命特征的生物naked virus (裸露病毒)无包膜包裹的病毒enveloped virus (有包膜病毒)有包膜包裹的病毒腺病毒(Adenovirus)Attachment (吸附)病毒感染宿主细胞首先要识别宿主表面特异性受体并与之结合,这个过程称为吸附virulent phage (烈性噬菌体)噬菌体侵染宿主细胞后,立即进行增殖,导致宿主细胞裂解,并释放子代噬菌体,这种在短时间内连续完成增殖裂解循环的噬菌体称为烈性噬菌体。one s
16、tep growth curve (病毒一步生长曲线)利用烈性噬菌体的生活周期,通过测定噬菌体侵染和成熟病毒粒释放的间隔(潜伏期),并用以估计每个被侵染的细胞释放出新噬菌体粒数量(裂解量)的曲线。burst size (裂解量)每个病毒粒感染一个细胞所产生的子代病毒颗粒的平均数。Plaque (噬菌斑)在固体培养基表面涂布经不同时间培养的二元培养物(敏感宿主细菌和适量相应烈性噬菌体),一定时间后,宿主细胞被裂解形成具有一定形状、大小、透明、边缘清楚的空斑(噬菌斑)。temperate phage (温和噬菌体)既可进入增殖裂解途径,又可进入溶源化途径的噬菌体。Prophage/ proviru
17、s (原噬菌体/原病毒) 整合在宿主细胞染色体中的噬菌体基因组。lysogenic bacteria (溶源性细菌)染色体中携带有原噬菌体的细菌。溶源性转变(lysogenic convertion)脊髓灰质炎病毒(poliovirus)单纯疱疹病毒(herpes simplex virus)狂犬病病毒(rabies virus)Retrovirus (反转录病毒)一种特殊的RNA病毒,携带有反转录酶,通过反转录酶通过反转录方式进行复制的病毒核衣壳组成毒粒(virion)=病毒?defective interfering particles (干扰缺损颗粒)病毒基因组缺陷,单独在允许细胞内不能
18、复制,为非增殖感染,必须借助其他病毒基因组或基因产物才能复制的病毒,称为干扰缺损颗粒(可称为缺陷病毒)。Virino (朊病毒)蛋白侵染因子,是一种比病毒更小、仅含具有侵染性的疏水蛋白质分子,是一类能引起哺乳动物的亚急性海绵样脑病的病原因子。Operon (操纵子)gene mutation (基因突变)一个基因内部的遗传结构或DNA序列,发生一对或少数几对碱基的任何改变(置换、插入或缺失),而导致的遗传变化称为基因突变。resistant mutant (抗药突变型)对某种药物,特别是对抗生素由某种抵抗能力的突变型conditional lethal(sensitive)mutant (条件
19、致死突变型) 在某一温度下可生长,在另一温度下不可生长的突变型morphological (形态突变型)基因型变化引起表型变化,使细胞的个体形态与菌落形态发生改变的突变型mutagen (诱变剂) 能使突变频率提高到自发突变水平以上的物理、化学和生物因子。induced mutation (诱发突变) 用诱变剂处理后,能提高突变率的方法。Degeneration (衰退)自发突变的结果致使某种微生物原有的一系列生物性状发生退化现象。Conjugation (接合作用)经细胞间直接接触,并由接合质粒介导的基因转移和重组过程。transduction (转导)由病毒做载体将一个细菌的DNA转移到另
20、一细菌并实现基因重组的过程 。transductant (转导子)由转导作用而获得部分新性状的重组细菌。generalized transduction (普遍性转导)通过极少数完全缺陷噬菌体对供体基因组上任何小片段DNA进行“误包”,而将其遗传性状传递给受体。specilized transduction (局限性转导)通过部分缺陷的温和噬菌体把供体菌的少数特定基因携带到受体菌中,并与后者的基因组整合、重组,形成转导子的现象。完全普遍性转导(complete transduction) 流产普遍性转导(abortive transduction)低频转导(low frequency tran
21、sduction)高频转导(high frequency transduction)genetic transformation (遗传转化)自然或人工感受态细菌从外界摄取同源或异源DNA分子,经重组得以表达的基因转移过程。natural genetic transformation(自然遗传转化)人工转化parasexual reproduction (准性生殖)不经减数分裂就能导致基因重组的生殖过程。Plasmid (质粒) 独立于染色体之外,能进行自主复 制的细胞质遗传因子。共价闭合环状(covalently closed circle,简称CCC)Compatibility (亲和性)
22、几种质粒在同一宿主细菌内皆能复制且能稳定遗传,质粒间有亲和性Incompatibility (非亲和性)含一种质粒的细菌导入另一种质粒,几代后在细菌内只存在一种质粒,而丢失另一种质粒,这两种质粒相互排斥不能共存的关系称为非亲和性。fertility factor (致育因子)与结合作用有关的质粒resistance factor (抗性因子)-R因子 抗药性或抗金属离子colicin plasmid (细菌素质粒)-Col质粒 产生的抑制或杀死相关种群和种内敏感菌株virulence plasmid (毒性质粒)编码毒性蛋白metabolic plasmid (代谢质粒)含有能降解有毒有机化合
23、物,以此为碳源和能源。cryptic plasmid (隐秘质粒)不显示任何表型效应插入序列(insertion sequence, IS )转座子(transposon element , Tn)转座噬菌体(Mm phage)negative control (转录负调控)在转录水平上抑制基因表达最简单的一种调控方式,如酶的诱导和阻遏。enzyme induction (酶诱导)通常是指参与物质分解代谢的酶类只有当其作用底物存在时才合成。enzyme repression (酶阻遏)诱导的互补。通常如果培养基中存在一定量的某种产物,那么催化合成该产物的酶就不能合成。positive cont
24、rol (转录的正调控) 在转录水平上调控蛋白激活RNA聚合酶,促进基因表达的一种调控方式。global control system (全局调控系统)通过调节多个不同基因的表达来对环境信号做出应答的调控机制。glucose effect (葡萄糖效应)在分解代谢物阻遏中,当大肠杆菌在含有葡萄糖的培养基中生长时,各种与葡萄糖初级代谢无关酶的合成就会受到抑制。由于葡萄糖是第一个引起此现象的底物,所以分解代谢物阻遏也称为葡萄糖效应。diauxic growth (双峰生长)由于葡萄糖效应可引发第二个对数生长期,所以称为双峰生长。分解物激活蛋白: catabolite activator prote
25、in (CAP)signal transduction (信号转导)一些胞外信号不能直接传递到调节蛋白,而是首先被感受器接收,然后由感受器将信号传递至胞内的调控装置上,这一过程称为信号转导。双组分调控系统(two-component regulatory systems)九Evolution (进化)生物与其生存环境相互作用过程中,其遗传系统随时间发生一系列不可逆的改变。在大多数情况下,导致生物表型改变和对生存环境的相对适应。Phylogeny (系统发育):生物进化的历史signature sequence (寡核苷酸印迹)通过对16S rRNA全序列资料的分析比较, 发现在不同种群水平上特
26、异的特征性寡核苷酸序列,或在某些特定的序列位点上出现的单碱基印迹。Microbial taxonomy (微生物分类学)研究微生物分类理论和技术方法的学科。classification (微生物分类)根据微生物表型特征相似性或系统发育相关性原则,对微生物分群归类,排列成系统,并对分类群特征进行描述,以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定。微生物系统学(systematics)Species (种)分类的基本单位,具有高度特征相似性的菌株群,这个菌株群较其它菌株群有很明显的区别。Supspecies (亚种)种内某些菌株与其它菌株有少数明显而稳定的变异特征,但又不足以区分成新种,可定为亚种。for
27、m or type (型)亚种下分类术语,亚种内菌株间差异不足以定为新亚种,称为型。Strain (菌株)从自然界分离的任何一种微生物纯培养物即称菌株。十Ecosystems (生态系统):在一定空间内,生物成分与非生物成分通过物质循环和能量流动的相互作用、相互依存而构成的一个生态学功能单位。Microbial Ecology (微生物生态学)研究生态系统中微生物之间、微生物与其他生物之间、微生物与环境之间的生态关系。Niche (特定小生境)微生物在自然界生长最好的主要小生态环境。Microenviroment (微环境)微生物实际生活并进行代谢所在的生境。Psychrophilic mic
28、roorganisms (嗜冷微生物)acidophilic microorganisms (嗜酸微生物)嗜碱微生物(alak;iphilic mictoorganisms)嗜盐微生物(Halophilic microorganisms)Population (种群):一定区域和一定生境中同种多个体结合成的一种单位communities (群落):一定区域和一定生境中各个微生物种群松散结合成的一种结构单位和生态功能单位。Metabiosis (互生):即代谢共栖 两种可单独生活的微生物,在一起时经各自的代谢活动而互为有利(协同作用),或偏利于一方(偏利作用)的生活方式。Symbiosis (共
29、生)互利关系高度发展,两种微生物彼此依赖,紧密共居,或联合成一种共生体,不能独立生活。氨化作用(ammonification)硝化细菌(Nitrification)十一Infection (感染)又称传染, 机体与病原体在一定条件下相互作用而引起的病理过程。immunity (免疫)生物体能够辩认自我与非自我,对非我做出反应以保持自身稳定的功能。Virulent (毒力)病原微生物致病性强弱称为毒力(virulent)Invasiveness (侵袭力) 病原微生物突破机体免疫防线,到达特定部位定居、繁殖、扩散的能力。毒素(toxin)Exotoxin (外毒素)病原细菌主要是一些革兰氏阳性菌
30、,在生长过程中合成并分泌到胞外的毒素,如破伤风痉挛毒素、白喉毒素等;也有存于胞内当细菌溶解后才释放的如痢疾志贺菌的肠毒素。Endotoxin (内毒素)革兰氏阴性菌脂多糖(LPS),菌体裂解时释放,对机体呈现毒性。杀细胞感染(cytocidal infection)稳定状态感染(steady state infection)整合感染(integrated infection)nonspecific immunity (非特异性免疫) 机体不需要特殊的刺激或诱导,而对任何异物防卫入侵的生理功能。innate immunity (天然免疫) 先天遗传免疫功能的称为天然免疫吞噬细胞 (phagocy
31、tes)自然杀伤细胞(natural killer cells, NK) 穿孔素(perforin)补体系统(complement system)Complement (补体)一组蛋白质,通常以无活性形式存在于人或动物正常血清和体液中,可被任何一对抗原抗体复合物激活并协助抗体杀灭抗原。Interferon (干扰素,IFN)宿主细胞产生抗病毒蛋白,抑制病毒蛋白质合成。Lysozyme (溶菌酶)吞噬细胞产生,溶解致病G菌的酶。Antigen (抗原,Ag)凡能刺激人或动物机体产生抗体或致敏淋巴细胞,并能与其在体内外发生特异性反应的物质。Antigen determinant group (抗原决定簇)抗原特异性是由抗原分子表面的特定化学基团决定,此基团称为抗原决定簇。表
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