基于DGE测序分析人乳腺癌MDA-MB-231细胞受青藤碱影响产生细胞周期抑制的机制(共6页)

1、基于DGE测序分析(fnx)人乳腺癌MDA-MB-231细胞受青藤碱影响(yngxing)产生细胞周期抑制(yzh)的机制立题依据1.青藤碱的临床应用现状及机制研究青藤碱（Sinomenine,SIN）又名（9，13，14）-7,8-二脱氢-4-羟基-3,7-二甲氧基-17-甲基吗啡喃-6-酮，为防己科防己属植物青风藤及毛青藤的干燥藤茎中提取的生物碱单体，其分子式为C19H23NO4,分子量329.381。中国药典1990年版记载：青风藤味苦、性平、归肝脾经，具有祛风湿、通经络、利小便、止痛之功效，是治疗风湿痹痛的良药。目前，已有正清风痛宁片、青藤碱缓释片、盐酸青藤碱注射剂、毛青藤碱片等多种制

2、剂应用于临床，在治疗类风湿性关节炎等各种风湿病以及心律失常取得较好的疗效。目前对于青藤碱药理作用的研究多集中在抗炎和免疫抑制方面。其中，抑制炎症局部前列腺素E2（PGE2）的合成是青藤碱抗炎的主要机制。研究发现，青藤碱是通过选择性的抑制PGE2合成过程中重要的限速酶：环氧化酶-2（COX-2）的活性，来达到抑制PGE2合成的目的，但其抑制COX-2的机制尚未见明确报道。王文君等发现青藤碱可较强的抑制COX-2蛋白的活性，但进一步研究证实对COX-2 mRNA的表达则无明显影响，而陈炜等发现青藤碱对COX-2 mRNA和COX-2蛋白均有明显的抑制作用。青藤碱的免疫抑制作用表现在可引起小鼠胸腺及

3、脾脏重量减轻，对小鼠抗羊红细胞抗体产生及对羊红细胞诱导的迟发超敏反应均有明显的抑制作用。2.青藤碱的抗肿瘤作用 研究表明，COX-2蛋白在食道癌、胃癌、结肠癌、肝癌、肺癌和乳腺癌等肿瘤中均有表达增高，COX-2 mRNA也出现异常扩增，其改变的强度与肿瘤组织类型和分化程度有关。进一步研究还发现COX-2与肿瘤的发生、分化、浸润、转移及预后等方面均存在一定的相关性，一些COX-2抑制剂在体外及动物模型中证实具有较明显的抗肿瘤作用。因此，同样作为COX-2抑制剂的青藤碱的抗肿瘤作用研究也日益增多。最新的研究发现：青藤碱可以抑制大鼠魔肾小球系膜细胞，人巨噬细胞、成纤维样滑膜细胞的增殖，并诱导其凋亡；

4、青藤碱可通过抑制COX-2的表达从而抑制了胃腺癌细胞SGC-7901的增殖5，青藤碱可通过参与细胞周期的抑制和半胱天冬酶依赖的细胞凋亡可抑制人类肝癌细胞的生长6，青藤碱在体外可抑制人类肺癌细胞NCI-H460的增殖并促进其凋亡7。并且进一步研究发现青藤碱除了能显著抑制白介素-1（IL-1）激活的人滑膜肉瘤细胞系外，还能抑制与肿瘤发生密切相关的基因如：白介素6（IL-6）、胎盘生长因子（PIGF）、热休克蛋白27（HSP27）等的表达。3青藤碱抗肿瘤的机制(jzh)研究 目前研究发现青藤碱可以通过诱导肿瘤细胞凋亡来抑制多种肿瘤细胞系的增殖，其相关机制已经(y jing)在若干细胞系上进行了研究。

5、有研究(ynji)发现：青藤碱可以在体外显著抑制胃癌细胞株hBGC-823细胞生长，诱导凋亡，其机制可能与Caspase-3的激活和Bax/Bcl-2的比率上调密切相关；青藤碱诱导肝癌HepG2细胞凋亡可能与Bcl-2及Fas基因表达和线粒体功能改变有关；青藤碱对前列腺癌PC-3M细胞增殖也具有抑制作用并诱导凋亡；青藤碱在体外能抑制宫颈癌Hela细胞生长，其机制可能与其抑制COX-2和Bcl-2蛋白表达，促进肿瘤细胞凋亡相关；青藤碱诱导白血病K562细胞凋亡是通过抑制COX-2与NF-B的水平来实现的；青藤碱可能通过线粒体途径诱导肺癌细胞系NCI-H460的凋亡，青藤碱可能通过调控Bcl-2家

6、族蛋白的表达，改变线粒体膜通透性，导致细胞色素C从线粒体释放入胞浆，从而激活线粒体途径而诱发肿瘤细胞凋亡，青藤碱诱导NCI-H460细胞凋亡过程中，伴随着MEK/ERK以及PI3K/Akt通路的活化，应用该通路的抑制剂可以拮抗其抗凋亡作用，提高青藤碱所诱导的NCI-H460细胞凋亡的效果。4 青藤碱在乳腺癌中研究(ynji)的必要性乳腺癌是妇女最常见的恶性肿瘤之一，尽管对乳腺癌的治疗已经取得了很大的进步，但仍然有25%的患者死于该病。目前乳腺癌相关药物治疗主要为化疗、内分泌治疗和分子靶向治疗，而这些治疗方法均存在一定的局限性：部分乳腺癌患者对化疗原发或继发耐药，而年老体弱者则无法耐受化疗；内分

7、泌治疗主要是针对激素受体阳性的患者，而对激素受体阴性者则几乎无效；作为未来最有希望治愈乳腺癌的分子靶向治疗，经过目前的临床应用也未能达到满意的疗效。因此，为了提高乳腺癌药物治疗的效果，必须(bx)继续寻找新的靶向治疗(zhlio)药物。青藤碱来源广泛、价格低廉、毒副作用少，具有很好的开发应用前景。检索文献，青藤碱除了常规抗炎等作用外，对多种恶性细胞均具有抑制作用，其抗肿瘤作用主要通过诱导肿瘤细胞凋亡来实现。而目前，青藤碱在乳腺癌领域的相关性研究还未见报道。5.DGE数据分析能够提供的信息已有的DGE测序的样本为经过青藤碱处理后的人乳腺癌MDA-MB-231细胞与未经处理的细胞，结果为药物处理后

8、与未处理细胞的基因的数量。而DGE数据分析则是以实验组和对照组为研究对象，先进行差异筛选，即较对照组有变化的基因的筛选，得到变化的基因命名为差异基因。然后，对差异基因进行功能性分析（GO-Analysis），得到差异基因所显著影响的功能。与此同时，对差异基因进行信号转导通路的显著性分析（Pathway-Analysis），得到差异基因所参与的显著性信号转导通路。继而以显著性信号转导通路所包含的差异基因（或者显著性Pathway和显著性GO中的交集差异基因）为研究对象构建基因间相互作用关系网络（Gene-Act-Net），从而得到差异基因构成的信号转导流程以及差异基因中起到中枢的核心调控基因。下

9、面为此次数据初步分析的部分(b fen)结果截图：图1图2 其中，图1为GO-Analysis的部分结果，即差异基因功能的分析，图2为Pathway-Analysis，即差异基因主要(zhyo)参与的信号转导通路的分析。两部分分析结果中，大部分均为参与细胞周期调控的功能和通路，所以此次课题主要通过(tnggu)DGE数据的分析探讨(tnto)青藤碱对人乳腺癌MDA-MB-231细胞的细胞周期的影响机制。所遇到的问题：当时做DGE测序前的具体实验过程是什么？包括细胞种类、数量、药物剂量等。我这里只知道做的是一组药物处理和的一组没有处理的，其他的信息没有。我看了很多相关的测序分析的文献，发现别人的很多测序分析前都有一个预实验，比如之前有没有预实验发现青藤碱作用乳腺癌细胞后其中的某个基因或蛋白的量有明显的升高或降低？这些可以说明DGE测序的必要性和可行性。这个DGE测序的结果之前(zhqin)的师兄师姐们都用了哪些结果？因为我必须得从没用过的结果中找思路和方向。如果方向可以选择细胞周期的话，我可能需要李晓师姐关于细胞周期这方面的研究(ynji)的部分结果的支持。参考文献定稿(dnggo)后附上。内容总结（1）基于DGE测序分析人乳腺癌MDA-MB-231细胞受青藤碱影响