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文档简介
1、主要内容PubMed数据库检索技巧CBM中国生物医学文献数据库GOOGLE SCHOLAR 检索技巧 PubMed数据库PubMed主要内容PubMed概况 PubMed数据类型PubMed检索方法My NBCI个性化服务 PubMed概况创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)1997年6月开始向全球开放特色:具有收录范围广(约占世界医学文献期刊的80%以上)、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点,每篇文献都有全文通道链接(linkout),便于检索者方便地找到所需的原文。收录文献的时间范围: 1950- 每日更新(周二-周六)检索全世界生物医学期刊论文的重要工具
2、网址:/pubmed 或 PubMed概况 PubMed数据类型(状态)PubMed除了1966年以前的OldMedline,其余文献按处理过程分4种类型(或状态)PubMed - as supplied by publisher PubMed - in process PubMedPubMed - indexed for MEDLINE 属于Medline收录范围,建立ti、au、ab等基本书目信息。(暂)不属于Medline收录范围,但也建立ti、au、ab等基本书目信息。赋予MeSH、PT等字段并被index。PubMed检索方法1. 检索机制自动转换匹配功能(Automatic Ter
3、m Mapping) 对于输入的检索词,PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换,再进行检索。词表匹配转换顺序是:MeSH表 期刊刊名注释表 短语表 作者索引短语检索(Phrase Searching)要将短语作为一个词组进行检索,可用双引号“ ”将其引起来。如:“drug therapy”作为词组进行检索的词,系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。PubMed检索方法怎么用?MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词,则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同
4、时进行检索。例如,如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索:(“BiotinMeSHOR vitamin htw)vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如,如果你输入“New England Journal of Medicine”,PubMed将按“N Engl J Medta”查询。如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词,PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表,如果输入的检索词在以上词表中未找到,且该词后有一或二个字母,PubMed就会查检作者索引。如果在作
5、者索引中仍未找到匹配词,PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词,PubMed将该词组的每个单词用AND组配并在所有字段中查找。布尔逻辑组合检索,常用的逻辑关系词有AND,OR,NOT等A BA B 逻辑与(AND) -检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如:A AND B (AIDS and therapy) 逻辑非(NOT) -在含检索词A的记录中,去掉含检索词B的记录。 如:A NOT B( Hepatitis not Animal) 逻辑或(OR) -检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如:A OR B ( AIDS or Acq
6、uired Immunodeficiency Syndrome)A BPubMed检索方法怎么用?2. 布尔逻辑运算符基本检索高级检索主题检索默认检索字段为主题、作者、期刊PubMed检索方法怎么用?一.基本检索关键词、词(词组)或短语: 输入任意关键词:liver cancer、Lung cancer; 带有双引号“ ”作为短语检索:“cancer therapy”; 带有连接号“-”作为一个词组检索:interleukin-6。限制检索字段:如liver cancerti作者:Smith J 、 仅知道作者姓,则必须加上字段标识,如: Smithau 2002年以后的文献若文中有作者全称可
7、用全称检索 如:Joshua LederbergPubMed检索方法怎么用?一.基本检索 作者姓名检索 按照姓+名缩写(不用标点)的格式键入作者姓名,如:smith ja或jones k, 系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第一个字母可用大写也可用小写,姓前名后,姓用全称,名字一般用缩写。 考虑到作者姓名的不同形式,PubMed采用自动转换功能进行作者姓名检索,如:smith j将检索成smith ja, smith jc,smith jr 等。 精确检索:可以用双引号将作者名引起来,再加作者字段限定AU,如:smith jau,这样可避免PubMed自动转换,实现精确查找。PubMed检索
8、方法怎么用?一.基本检索作者姓名检索按照姓(全写)+名(缩写),之间不用标点键入作者姓名smith jPubMed检索方法怎么用?精确检索避免PubMed自动词汇转换,实现精确查找smith jau期刊刊名: 可用期刊全称:GENE THERAPYTA; 可用期刊简称:JAMATA;(The Journal of the American Medical Association) PubMed检索方法怎么用?一.基本检索期刊检索 在检索框中键入期刊名,如:molecular biology of the cell,系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成mol biol celljournal进
9、行检索。 也可以直接输入Medline的期刊标准缩写形式,如:mol biol cell,或者是输入刊物的ISSN(国际标准出版物代码)进行检索,如:1059-1524。 如果一个杂志名恰好是主题词或关键词,如:cancer, science,cell等,PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的主题词进行检索。因此,需要将检索请求进行标准化处理,即在杂志名后面加TA。如:celltaPubMed检索方法怎么用?一.基本检索期刊的一般检索,是在检索输入框中键入期刊名或期刊的ISSN号Eur J Immunol期刊的标准检索,是在期刊名后面加字段限定TA. 比如:celltacellta
10、复杂表达式:liver cancer AND therapy带有摘要文献的检索 :liver cancer AND has abstractPubMed检索方法怎么用?一.基本检索 截词检索截词检索的作用:扩大检索范围,提高查全率。截词符:用*表示,代表多个字符,将*加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索。如:bacter*,可以检出bacter,bacteria, bacteriophage ,bacterium,等最多600个单词。PubMed检索方法怎么用?一.基本检索截词检索可以扩大检索范围提高查全率。bacter*TI字段限制检索采用字段限制方式进行检索,其规则是:检索词1
11、字段标识 逻辑运算符 检索词2字段标识如:查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面的文献.检索式:DNAmh AND crickau AND 1993dpPubMed检索方法怎么用?1.基本检索常用字段组成标识符 字段名称TI TitleAU AuthorAD AffiliationAB AbstractDP Publication DateSO SourceTA Journal Title AbbreviationMH MeSH TermsPT Publication Type 字段限制检索其规则是:检索词+字段标识 DNAmh AND crickau AND 1993dp高级检
12、索高级检索输入区检索区检索史分析该课题,可知:作者为:俞光岩(yu gy)作者单位为: 北京大学(peking university)高级检索举例: 查阅北京大学俞光岩的文章.MeSH主题词检索 主题词也称为叙词,是描述文献重点讨论的内容,是对自然语言进行规范化处理后的结果,主要用于文献的标引和检索。 副主题词是用于对主题词进一步限定的词,又称限定词。 MeSH主题词检索注意:主题词检索只适用于有主题标引的MEDLINE数据!进入主题词检索界面,两个途径。糖尿病(Diabetes )治疗(therapy)方面的文献。 主题词检索开始第一步:输入检索词:diabetes第二步:确定规范的主题词第
13、三步:确定副主题词第三步:找到相应副主题词第四步:检索检索结束 选择检索条件 加权与不加权 主题词“加权”表示主题词的重要程度,反映文章论述的核心内容。加权主题词在数据库用“ * ”表示,如“ * 肝肿瘤”。 加权检索表示仅对加星号(*)主题词 (主要概念主题词) 检索; 不加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词(非主要概念主题词)均进行检索。 “加权检索”可提高检索结果的相关性。加权与不加权如果想更准确,可进行加权检索加权检索不加权检索1、可查看期刊的详细信息,包括出版国家,出版社,出版语言,期刊类目等等;2、可根据期刊的主题分类,查看medline收录的各学科的期刊,比如查看medli
14、ne收录的关于口腔医学(Dentistry)方面的期刊;3、方便检索某本期刊上被PubMed收录的所有文章。期刊数据库(Journal database)期刊数据库在PubMed首页导航栏的右下角部分期刊数据库期刊检索dentistry期刊检索MyNCBI个性化服务My NCBI存储检索式,定期发送最新相关文献。设定检索过滤器,使检索结果更加个性化。存储检索结果文献。My NCBI个性化服务结果的显示与管理北京协和医学院博硕学位论文数据库中国医学科普文献数据库中国生物医学文献数据库(CBM) SINOMED检索功能介绍中国医学科普文献数据库北京协和医学院博硕学位论文库收录2000年以来国内出版
15、的医学科普期刊近百种,文献总量8万余篇,重点突显养生保健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营养等与医学健康有关的内容。每月更新。收录1981年以来协和医学院培养的博士、硕士研究生学位论文,学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相关专业,内容前沿、丰富,可在线浏览全文。每季更新。中国生物医学文献数据库 (CBM)CBM概况介绍数据库检索规则常用的检索方法定题检索服务CBM概况介绍中国生物医学文献数据库收录 1978 年以来 1600 多种中国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录,年增长量约 40 万条。学科覆盖范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学
16、等生物医学的各个领域。中国生物医学文献数据库注重数据的规范化处理和知识管理: 美国国立医学图书馆最新版医学主题词表; 中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表; 中国图书馆分类法 医学专业分类表。 规范化处理之前标题:氯沙坦对肾血管性高血压大鼠血清中血管紧张素-1受体自身抗体产生的影响 著者:支建明; 刘忠保; 焦向英; 刘迎旭; 赵荣瑞著者单位:太原山西医科大学生理学教研室 030001文摘:目的和方法:采用两肾一夹型肾血管性高血压(RVH)模型,以合成的大鼠血管紧张素-1受体(AT1R)细胞外第二环165-191位氨基酸序列作为特异性抗原,用ELISA法检测大鼠血清中血管紧张素-
17、1受体自身抗体,动态观察(13周)氯沙坦(术后第2周开始,5 mg/kg dig,连续12周)治疗对模型大鼠AT1R自身抗体产生的影响。结果:RVH组大鼠血清中AT1R自身抗体从术后1周起阳性率、滴度逐渐升高;给予氯沙坦治疗不仅可抑制模型大鼠心脏功能和结构的改变,而且使血清AT1R自身抗体的阳性率和滴度明显低于肾血管性高血压组。结论:氯沙坦坦有抑制AT1R自身抗体产生而达到降压的作用。出处:中国应用生理学杂志 2003.02.28; 19(1): 43-46关键词:大鼠; 氯沙坦; 肾血管性高血压; 受体; 血管紧张素; 自身抗体规范化处理之后分类号: R-332; R392.11; R544
18、.140.53; R916.4; R978.5 标题:氯沙坦对肾血管性高血压大鼠血清中血管紧张素-1受体自身抗体产生的影响 著者:支建明; 刘忠保; 焦向英; 刘迎旭; 赵荣瑞 著者单位:太原山西医科大学生理学教研室 030001 文摘:目的和方法:采用两肾一夹型肾血管性高血压(RVH)模型,以合成的大鼠血管紧张素-1受体(AT1R)细胞外第二环165-191位氨基酸序列作为特异性抗原,用ELISA法检测大鼠血清中血管紧张素-1受体自身抗体,动态观察(13周)氯沙坦(术后第2周开始,5 mg/kg dig,连续12周)治疗对模型大鼠AT1R自身抗体产生的影响。结果:RVH组大鼠血清中AT1R自
19、身抗体从术后1周起阳性率、滴度逐渐升高;给予氯沙坦治疗不仅可抑制模型大鼠心脏功能和结构的改变,而且使血清AT1R自身抗体的阳性率和滴度明显低于肾血管性高血压组。结论:氯沙坦坦有抑制AT1R自身抗体产生而达到降压的作用。 出处: 中国应用生理学杂志 2003.02.28; 19(1): 43-46 关键词:大鼠; 氯沙坦; 肾血管性高血压; 受体; 血管紧张素; 自身抗体 主题词 :大鼠, 近交SHR; 高血压, 肾血管性/*药物疗法; 高血压, 肾血管性/免疫学; 疾病模型, 动物; 洛沙坦/*治疗应用; 受体, 血管紧张素/*免疫学; 受体, 血管紧张素/拮抗剂和抑制剂; 自身抗体/*血液
20、特征词: 大鼠; 动物 利用中国图书馆分类法 医学专业分类表利用主题词表CBM概况介绍中国生物医学文献数据具有如下特点: 词表辅助检索功能:检索系统具有多种词表辅助检索功能,建有主题词表、中英文主题词轮排表、分类表、期刊表、索引词表、作者表等多种词表,且有丰富的注释信息。检索入口多:除 30 多个检索入口外, 更提供特色的主题词检索、分类检索、第一著者检索、文献类型、资助项目和参考文献等检索方式。检索功能完备:定题检索、限定检索、截词检索、通配符检索,各种逻辑组配检索功能会大大提高检索效率。全文获取:目前CBM已经实现了与维普全文数据库的链接功能,对于1989年以来的全文,可以直接链接维普全文
21、数据库。1.逻辑运算符and; or; notCBM检索规则 2.截词符 ? 单字通配符,代替任一半角字符或中文字符 % 任意通配符,可代替任意多个字符 如:胃?癌、肝%疫苗 对于词根检索,如: TGF有TGF-、TGF- 等, MDR有MDR1、MDR-TB等 如果不加通配符“”,仅输入TGF会漏检TGF- 、 TGF- 1,仅输入MDR会漏检MDR-TBCBM检索规则进入数据库检索(一)快速检索 (二)高级检索(三)主题检索 (四)分类检索(五)作者检索 (六)机构检索检索途径*缺省字段:在中国生物医学文献数据库(CBM)中,是中文标题、摘要、作者、关键词、主题词和刊名内容的组合。*智能检
22、索:在“缺省”字段,自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索。如:在“缺省”字段输入“艾滋病”,勾选“智能检索”后点击“检索”按钮,系统自动检出在缺省字段中含“艾滋病”和“获得性免疫缺陷综合征”的所有文献。注:输入多个检索词,检索词之间默认为“AND”运算。如:肝炎预防 智能检索不支持逻辑匹配快速检索快速检索牙髓病的治疗快速检索限定条件:可以限定文献的年代范围、类型(如综述、病例报告等),研究对象年龄组、性别等。快速检索快速检索高级检索牙髓炎治疗的综述文献高级检索高级检索高级检索高级检索高级检索主题词是经过规范化的具有检索意义的专业术语。副主题词是限制主题词范围或明确某个
23、方面的专用词汇。 如 肝肿瘤/治疗 胃肿瘤/分类,并发症主题检索可用中文主题词、英文主题词及同义词进行查找,可浏览主题词注释信息和树形结构,帮助确定恰当的主题词。主题检索 美国国立医学图书馆医学主题词表(MeSH)中译本、中国中医药学主题词表是CBM进行主题标引和主题检索的依据。基于主题概念检索文献,有利于提高查全率和查准率。主题检索的功能将非主题词引见到主题词形式提供主题词的定义和注释显示主题词之间的族性关系(上位词、下位词、同位词)举例1: 口腔癌发病原因方面的文献注意: 采用主题检索的第一步永远是先查找检索词所对应的规范主题词 查找规范主题词 1、选择检索入口,输入检索词 2、 查找到规
24、范主题词1233、选择与其相匹配的副主题词链接检索4、主题检索结果不加权 扩展 762篇加权 不扩展 37篇 若觉得该词范围过窄,可进一步查找上位词,扩大检索范围。分类检索可通过分类号和分类名进行检索,通过选择是否扩展、是否复分会使检索结果更为贴切。 分类检索单独使用或与其它检索方式组合使用,可发挥其族性检索的优势。 分类检索分类检索分类检索分类检索分类检索期刊检索期刊检索期刊检索作者检索作者检索作者检索作者检索作者检索第一作者分析报告作者的主要研究领域作者的主要合作者作者检索机构检索机构检索机构检索机构检索机构检索定题检索定题检索定题检索定题检索定题检索整理出所需检索式定题检索定题检索保存检
25、索式定题检索定题检索定题检索定题检索Google学术搜索(Google Scholar)使用技巧Google 学术搜索概况Google 学术搜索是一项免费服务, 可以帮助快速寻找学术资料, 如专家评审文献、论文、书籍、预印本、摘要以及技术报告。作为此次扩展的一部分,Google 学术搜索在索引中涵盖了来自多方的信息,信息来源包括万方数据资源系统, 维普资讯, 主要大学发表的学术期刊、公开的学术期刊、中国大学的论文以及网上可以搜索到的各类文章。Google Scholar同时提供中文版界面( ), 供中国用户更方便地搜索全球的学术科研信息。Google 学术搜索的优点相关性 Google 学术搜
26、索根据相关性对搜索结果进行排序, 最相关的信息显示在页面上方。这一排序同时考虑到每篇文章的全文内容、作者、发表该文章的刊物, 以及该文章被其它学术著作引用的次数等要素。全文搜索 在可能的情况下, Google会搜索全文, 而不仅仅只是摘要部分, 给予用户对学术内容最为全面深入的搜索,与此同时也加强了搜索结果的相关性。非在线文章搜索 Google 学术搜索涵盖了各方面的学术著作, 包括还没有在线发布的学术研究结果。Google 学术搜索通过提供这些引用信息使搜索者了解到重要的未在线论文和书籍。受关注程度同一内容的不同版本Google学术搜索使用方法与技巧 Google 学术搜索的应用范围较广,
27、对于多数学者, 主要应用与文献相关的搜索, 其主要包括: 文献作者搜索、出版物特定搜索、特定时间文献搜索及交叉搜索。文献作者检索 输入加引号的作者姓名:“段宝岩” 或者 “Duan Bao-yan”。要增加结果的数量,请不要使用完整的名字,使用首字母即可, 如“Duan B Y” 。 如果找到太多提及该作者的论文,则可以使用 作者:操作符搜索特定作者。例如,可以尝试 作者:段宝岩、作者: Duan Bao-yan 或 作者: Duan B Y 。 Google学术搜索使用方法与技巧Google学术搜索使用方法与技巧 如果某个词既是人名也是普通名词, 最好使用“作者:” 操作符。该操作符只影响到
28、紧挨其后的搜索字词, 因此“作者:” 和搜索字词之间不能有空格。例如: 作者:flowers (人名弗劳尔, 也是花的意思) 会返回由名为“Flowers” 的人撰写的文章, 而flowers -作者:flowers 会返回关于花的文章, 而忽略由名为“Flowers” 的人撰写的文章(搜索字词之前的减号(-) 会排除包含这一搜索字词的搜索结果)。文献作者检索 采用学术著作、论文或报告的标题作为关键词进行Google学术搜索,可以查找到更准确的学术信息。标题搜索的具体操作是,【Google学术搜索】页面的【搜索】编辑框中输入加英文引号的标题(“DynamicPower Management f
29、or Embedded Systems”),然后单击【搜索】按钮, Google将会返回所示的学术信息。文献标题检索Google学术搜索使用方法与技巧 该选项只适用于高级学术搜索页。出版物限制搜索只返回来自特定出版物、针对特定字词的搜索结果。 通常情况下, 如果确定自己在找什么, 出版物限制的搜索是有效的, 但搜索范围比期望值要窄。 出版物限制检索Google学术搜索使用方法与技巧 该选项同样只出现在“高级学术搜索” 页中。在寻找某一特定领域的最新刊物时, 日期限制搜索可能会比较实用。 例如:想要搜索从2004 年陆续出版的牙髓炎治疗方面的文章, 但要记住: 有些网站资源没有标注出版日期, 而
30、日期限制搜索是无法搜索Google学术搜索不能辨别出版日期的文章的。所以, 如果您肯定一篇关于牙髓炎治疗的论文是在今年出版的, 但通过日期限制搜索没能找到, 请重新尝试不加日期限制的搜索。日期限制检索Google学术搜索使用方法与技巧 “+” 操作符确保您的搜索结果中包括Google 学术搜索技术通常忽略的普通字词、字母或数字, 如+de knuth; “-” 操作符排除所有包括搜索字词的结果, 如Flowers#-作者:Flowers ; 短语搜索只返回包括这一确切短语的结果, 如“随你便” ; “OR” 操作符返回包括搜索字词之一的结果, 如股票看涨期权OR 看跌期权; 标题:“ 操作符如在标题:mars 得到的结果只包括文件名中的搜索字词。Google学术搜索使用方法与技巧带布尔符的交叉搜索 在【Google 学术搜索】页面中, 单击检索框右侧的右侧的 , 将会打开Google 高级学术搜索页面, 可以完成对特定学术资源(如特定作者、特定出版物和特定日期等)的搜索操作。Google学术搜索使用方法与技巧特定学术资源搜索Google 高级学术搜索其他限定搜索方法1.对搜索的网站进行限制 “site” 表示搜索结果局限于某个具
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