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文档简介

1、2XCTAB法植物总DNA提取液氮研磨1g左右的植物组织,转移到离心管中。改用研磨枪在冰上研磨,不加B-巯基乙醇研磨时可加入适量的PVP、B-巯基乙醇。若CTAB准备2-3天内用完,则可将PVP、B-巯基乙醇直接加入其中。C:TABPVP|3-mere0.5ml0.02&2.515nil0.2?20mlo.sg100pl加入500卩1的2*CTAB(60C或65C预热),颠倒混合均匀后在60C或65C水浴30m-lh小时,其间要上下颠倒混匀数次。3取出离心管,加入等体积的24:1(三氯甲烷:异戊醇),上下颠倒充分混合。若量多,则可以直接侧立于摇床上晃动10分钟。4.12000转速离心5-10m

2、in。将离心管动作轻缓的取出转子,放置于离心管架上。离心后溶液分三层:上层为水相;中层为碎片和蛋白相;底层为氯仿迅速进入下一步,以免各相混合5用移液枪吸取管中上层水相,动作一定要轻缓,不可搅动其它两层。此步骤要宁舍不贪多,尽量避免吸取到下层液体。若上步骤中中间层较厚,则继续加入等体积24:1,再次抽提一次,直至中间层较薄。在抽提出的水相中加入1/3体积的5M的KAc及等体积的异丙醇(4C预冷),轻轻晃动混合均匀后在-20C沉淀。沉淀至少15分钟至过夜。6-1在抽提出的水相中加入1/10体积醋酸钠(pH5.2,3M),混匀后,加入2倍体积预冷的无水乙醇,-20C沉淀15min至过夜。6-3.在抽

3、提出的水相中加入加入2倍体积预冷的无水乙醇,-20C沉淀15分钟至过夜。a.时间越长,DNA的产量越多,污染也越多12000转速离心5-10min,去上清,倒置于吸水纸上数分钟,加入700卩170%的酒精,上下颠倒数次,洗涤沉淀。12000转离心5-10m,去上清,倒置于吸水纸上数分钟。重复一遍。12000转速离心5-10min,去上清,倒置于吸水纸上数分钟,最后置于超净工作台中吹干。在离心管中加入30-50卩1的灭菌去离子水或者TE溶液,4C放置数小时,使其充分溶解。用琼脂糖凝胶检测结果。-20C70C低温保存。去除总DNA中的RNA污染先做预扩增实验,若RNE污染无严重影响则舍去该步骤A在

4、总DNA溶液中加入灭菌去离子水或者TE溶液调整总体积至200卩1,加入10卩RNase-A(10mg/ml)4C过夜,或者37C1h.用等体积的24:1抽提。沉淀DNA洗涤DNA干燥DNA溶解DNA20C70C低温保存。B直接加入10卩RNase-A(10mg/ml)后冷冻保存。试剂配方IMTris-HCl(pH7.4,7.6,8.0)pH浓HClTris去离子水7.4约70ml121.1g定容至1升7.6约60ml121.1g定容至1升8.0约42ml121.1g定容至1升高温高压灭菌后,室温保存注意:应该在溶液冷却至室温后再调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升

5、高1C,溶液的pH大约降低0.03个单位5XTBE缓冲液Tris硼酸0.5MEDTA(pH8.0)去离子水54g27.5g20ml定容至1L室温保存50XTAE缓冲液Tris冰乙酸0.5MEDTA(pH8.0)去离子水242g57.1ml100ml定容至1L室温保存2XCTAB成分终浓度已有溶液浓度配100ml所加量CTAB2%2gTris-HCl(pH8.0)100mM1M10mlEDTA20mM0.5M4mlNaCl1.4M5M28ml0.5MEDTA(pH8.0)二水乙二胺四乙酸二钠Na2EDTA2H2ONaOH去离子水186.1g约20克定容至1L高温高压灭菌,室温保存。注:只有pH值

6、接近8.0时,EDTA才能完全溶解。溶解过程可在磁力搅拌器上剧烈搅拌。耗材准备:需要灭菌者:1.5ml离心管、研磨枪头、蓝色枪头、黄色枪头、其他:卫生纸(吸水用)、镊子、封口膜、挑菌针、酒精灯、70%酒精、离心管架子、离心管盒子、移液枪。CTAB法提取植物基因组药品:2*CTAB终浓度组分药品用量0.1M/L20nM/L1MTris-HCl(pH8.0)0.5MEDTA(pH8.0)NaClCTABPVP40100ml40ml82g20g20g加去离子水800ml充分溶解定容到IL。120C1.5个大气压,灭菌20分钟用之前加0.2-1%的0.5MEDTA(pH8.0)配制量:1L配制方法:称

7、取186.1gNa2EDTA2H2O,置于1L烧杯中。加入约800mL的去离子水,充分搅拌。用NaOH调节pH值值8.0(约20gNaOH)。注意:pH值至8.0时,EDTA才能完全溶解。加去离子水将溶液定容至1L。适量分成小份后,高温高压灭菌。室温保存1MTris-HCl(pH8.0)氯仿:异戊醇24:1异丙醇流程1、研钵预冷,叶片放入研钵,加液氮,研磨成粉末,用小勺放入2.0mlEP管。2、加入65C预热的2*CTAB600ul,摇匀;3、65C水浴1小时,lOmin摇动一次4、12000rpm离心10min,取上清到一新的EP管中。(次步骤视情况可省略)5、加入200ul氯仿:异戊醇(2

8、4:1)。6、12000rpm离心10min,取上层水相到一新的EP管中。7、加入等体积的异丙醇,轻轻上下摇动10次,静置10min。8、12000rpm离心10min,弃上清9、加入75%乙醇1.0ml,摇动10、12000rpm离心2min,弃上清11、吸取多余乙醇,室温吹干12、加入50ul的ddH2O,或TE溶解。-20C保存CTAB法提取植物基因组DNACTAB法原理CTAB(Cetyltrimethylammoniumbromide),十六烷基三甲基溴化铵,是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,能与核酸形成复合物,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸的特性。当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3

9、mol/LNaCl)时,CTAB-核酸的复合物从溶液中沉淀,通过离心就可将其与蛋白,多糖类物质分开,在经过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA,而CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去在高离子强度的溶液中(0.7mol/LNaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,不能沉淀核酸。CTAB溶液在低于15C时会形成沉淀析出,因此,在将其加入冰冷的植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15C。另外,它还能保护DNA不受内源核酸酶的降解。主要试剂与溶液的配制:PVP(聚乙烯吡咯烷酮K30)巯基乙醇氯仿:异戊醇(24:1)异丙醇70%乙醇Tris-苯酚RNaseA无水

10、乙醇CTAB溶液:CTAB20g/LNaCl(58.44)1.4mol/L(81.816g)EDTA(292.25)10mmol/L(2.9225g)Tris(121.14)100mmol/L(12.114g)pH8.01XTE缓冲液:EDTA(292.25)1mmol/L(0.29225g)Tris(121.14)10mmol/L(1.2114g)pH8.0NaAC溶液:NaAC(82.03)3mol/L(246.09g)pH4.0植物总DNA的提取1、取适量甘薯新鲜叶片,用液氮迅速研磨,中间加PVP(聚乙烯吡咯烷酮K30)少许,成粉末后转入10mL的离心管中,放入液氮或-80C冰箱储存(在

11、研磨样品时,研的细和研的粗,提出的DNA量可以相差几倍,所以,在液氮保护的很好的情况下尽量多研磨几次)。2、将(200ml)CTAB溶液放于65C水浴锅中预热。3、力Mml巯基乙醇到预热的200mlCTAB中。4、速口3ml预热的CTAB到装有粉末的10mL离心管中,之后放入65C水浴锅中,保温3060min,期间轻摇数次(一般20min左右一次,刚投入水浴时可以稍快速的晃动,之后的晃动一定要轻柔)。5、加入34ml氯仿:异戊醇(24:1)(在通风橱中操作),轻摇混匀至乳白色(100200次,剧烈晃动会使DNA机械切割)。6、1520C,11000rpm离心15min(CTAB配平,相对应的离

12、心管,质量相差0.7mol/LNaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。CTAB提取缓冲液的经典配方Tris-HCl(pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,在于液相中;CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;卩-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;

13、同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。使用酚的优点:1有效变性蛋白质;2抑制了DNase的降解作用。缺点:1.能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。2.不能完全抑制RNase的活性。氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异

14、戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl或NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。简言之,无论哪种抽提方法,药品的作用基本都是一样的。CTAB法原理(植物DNA提取经典方法)发布:2010-06-0208:20|来源:生物吧|编辑:刘浩|查看:634次原理:CTAB(hexadecyltrimeth

15、ylammoniumbromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。在高离子强度的溶液中(0.7mol/LNaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。注:CTAB溶液在低于15C时会形成沉淀析出,因此,在将其加入冰冷的植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15C。一、CTAB提取缓冲液的经典配方:Tris-HCl(pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl提供一个高

16、盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;B-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除。二、CTAB提取缓冲液的改进配方:PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖;蛋白质的去除:酚/氯仿抽提使用变性剂变性(SDS、异硫氰酸胍等)高盐洗涤蛋白酶处理核酸分离,纯(2)DNA降解,DNA提取常见问题。实验材料不佳或量少,破壁或裂解不充分,吸附或沉淀不完全,洗化;多糖的去除:高盐法:用乙醇沉淀时,在待沉淀溶液中加入1/2体积的5MNa

17、CI,高盐可溶解多糖。用多糖水解酶将多糖降解。在提取缓冲液中加一定量的氯苯(1/2体积),氯苯可以与多糖的羟基作用,从而去除多糖。用PEG8000代替乙醇沉淀DNA:在500pLDNA液中加入200川20%PEG8000(含1.2MNaCI),冰浴20min.核酸分离,纯化;多酚的去除:在抽提液中加入防止酚类氧化的试剂:B-巯基乙醇、抗坏血酸、半胱氨酸、二硫苏糖醇等加入易与酚类结合的试剂:如PVP(聚乙烯吡咯酮),PEG(聚乙二醇),它们与酚类有较强的亲和力,可防止酚类与DNA的结合;盐离子的去除:70%的乙醇洗涤核酸吸附,沉淀和溶解使用合适的吸附材料吸附核酸,其它的杂质均被洗掉,达到纯化DN

18、A的目的另一种方式加入1/10体积的NaAc(pH5.2,3M),用预冷的乙醇或异丙醇沉淀RNA吸附或沉淀后应用70%的乙醇洗涤,以除去盐离子等若长期储存建议使用TE缓冲液溶解TE中的EDTA能螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNasepH值为8.0,可防止DNA发生酸解。三、基因组DNA提取常见问题DNA中含有蛋白、多糖、多酚类杂质。DNA在溶解前,有酒精残留,酒精抑制后续酶解反应,DNA中残留有金属离子,有RNA的存留。对策:重新纯化DNA,去除蛋白、多糖、多酚等杂质,重新沉淀DNA,让酒精充分挥发,增加70%乙醇洗涤的次数(2-3次),加入RNase降解RNA。(1)DNA样品不纯,抑制

19、后续酶解和PCR反应。DNA提取常见问题:材料不新鲜或反复冻融、未很好抑制内源核酸酶的活性、提取过程操作过于剧烈,DNA被机械打断,外源核酸酶污染反复冻融。尽量取新鲜材料,低温保存材料避免反复冻融,液氮研磨或匀浆组织后,应在解冻前加入裂解缓冲液。在提取内源核酸酶含量丰富的材料的DNA时,可增加裂解液中螯合剂的含量,细胞裂解后的后续操作应尽量轻柔。所有试剂用无菌水配制,耗材经高温灭菌。将DNA分装保存于缓冲液中,避免反复冻融。涤时DNA丢失。尽量选用新鲜(幼嫩)的材料,动植物要匀浆研磨充分;G+菌,酵母裂解前先用生物酶或机械方式破壁。高温裂解时,时间适当延长(对于动物细胞,细菌可增加PK的用量)

20、。增加吸附的时间、或低温沉淀小心操作。要用冰冻材料提出高质量的基因组DNA,应确保以下几点:确保采样后立即投入液氮中保存.在磨样时一定要一直使材料处于低温状态。研磨前先将液氮倒入研钵,研钵彻底冷却后,再放入材料,研磨过程中,一定不要让液氮挥发净使材料回温!否则会DNA降解得很厉害。装管的时候,材料一定要有液氮的保护才行!否则研磨时的液氮保护DNA不都前功尽弃了?可以这样做:将几个离心管放入一个容器,向容器中加液氮,将其冷冻一下,使之处于低温状态,将液氮还为挥发干净的材料放入管内,不要急着盖盖子,因为液氮不挥发干净就盖上会再次弹开。将离心管放入盛有液氮的容器,等管内的液氮挥发干净盖上盖子即可。另

21、外,如果是在离心管上编号,最好在冷冻前写好,否则离心管冷冻后材料会受影响不说,也很难写上。提取DNA时加液氮的目的主要是防止DNA的降解,所以必须一直提醒自己,减少材料回温的机会,液氮保护必须自始至终。3在用CTAB法提取时,刚投入水浴时可以稍快速的晃动,之后的晃动一定要轻柔!加酚/氯仿/异戊醇静置30min后,离心温度不可过低。尽量保持在15度以上。将DNA加入异丙醇析出时用的枪头一定要剪过的。这点很重要。过尖的枪头会把DNA链弄断。加入异丙醇后出现的DNA絮状物尽量要挑出,尽量不要离心,因为离心后虽然产量会增大,但是不完整的DNA也增多了。另外,看楼主的电泳图条带比较弱,看来不只是降解,提

22、取量也比较少。这里对于增加提取量想说明一点,在研磨样品时,研得细和研得很细,提出的DNA量可以相差几倍!所以,在液氮保护的很好的情况下多研磨几次,要比在后面的过程中离心以增加产量要划得来!主要试剂的配制参考(美)萨姆布鲁克(Sambrook,J.)等.分子克隆实验指南(下册)配置如下94:(1)0.5mol/LEDTA(pH8.0):称取EDTA-Na218.61g,力口80mL双蒸水,磁力搅拌器上剧烈搅拌。加入7mL10mo1/LNaOH调至pH8.0再用双蒸水定容到100mL,在1.03X105Pa下高压灭菌20min。(2)5mol/LNaC1溶液:称取NaCl29.22g,溶解于90m

23、L的双蒸水,加热到80C溶解,冷却,再用双蒸水定容100mL,在高压灭菌20min。(3)10mol/LNaOH溶液:称取40.00gNaOH溶于80mL的双蒸水,搅拌,定容到100mL。1mol/LTris-HCl溶液(pH8.0):称取12.114gTris碱,溶于80mL的双蒸水,加入浓HC14.2mL,调整PH值到8.0,加水定容到100mL,高压灭菌20min。10%CTAB(m/v):称取CTAB10.00g,溶解于80mL的双蒸水,加热促进溶解,加双蒸水定容到100mL,室温保存。5mo1/LKAc溶液(pH4.8和6.5):分别称取KAc晶体49.07g,溶于80mL的双蒸水,

24、再用冰乙酸调至pH4.8和6.5,加双蒸水定容到100mL,在1.03X105Pa下灭菌20min。4C保存。3mo1/LNaAc*3H2O溶液(pH5.2):称取NaAc晶体20.412g溶解于约30mL的双蒸水,用冰乙酸调至pH5.2,加双蒸水定容到50mL,高压灭菌20min。4C保存。提取缓冲液(0.4mol/L葡萄糖,3%PVP,2%B-巯基乙醇)250mL:称取葡萄糖19.817g、PVP7.50g,加水溶解并定容到250mL,在1.03X105Pa下灭菌20min,B-巯基乙醇现用现加。4C保存。裂解缓冲液(3%CTAB;100mmo1/LTris-HC1,pH8.0;20mmo

25、1/LEDTA,pH8.0;1.4mol/LNaCl;2%B-巯基乙醇)100mL:取10%CTAB30mL,加1mol/LTrisHC1(pH8.0)10mL,加0.5mo1/LEDTA(pH8.0)4mL,加5mol/LNaCl28mL并定容到100mL,高压灭菌20min,B-巯基乙醇现用现加。(11)TE缓冲液(10mmo1/LTris-HC1,pH8.0;1mmo1/LEDTA,pH8.0):取Tris-HCl溶液(pH8.0)1mL,EDTA(pH8.0)0.2mL,用双蒸水定容到100mL,高压灭菌20min。4C保存。(12)电泳缓冲液TAE(Tris-乙酸)的配制50XTAE

26、母液的配制:242.0gTris-Bace、57.1mL冰乙酸、100ml0.5mo1/LEDTA(pH8.0),用双蒸水空容至1000mL。1XTAE电泳缓冲液的配制:取50XTAE10mL,再加入490mL双蒸水,定容至500mL主要溶液如下:1MTris-HC1(pH8.0):在800mL水中溶解121gTris碱,用浓HC1调节pH至所需值pH8.0(约42mLHC1),加水定容1000mL,分装后高压灭菌。0.5MEDTA(pH8.0):在400mL水中加入90.05g二水乙二胺四乙酸二钠(EDTANa22H2O),搅拌溶解,用NaOH调pH至8.0(约10gNaOH颗粒),定容至5

27、00mL,高压灭菌。5MNaCl:称取292.2gNaCl,用双蒸水定容到1000mL,高压灭菌备用。TE缓冲液(pH8.0):10mMTris-HC1(pH8.0),1.0mMEDTA(pH8.0)。2XCTAB提取液(pH8.0):2%(w/v)CTAB,1.4MNaCl,20mMEDTA,100mMTris-HC1,0.2%巯基乙醇(v/v)。即称取CTAB2g,加蒸馏水40mL,力口1MTris-HCl(pH8.0)10mL、0.5MEDTA(pH8.0)4mL和5MNaCl28mL,待CTAB溶解后用蒸馏水定容到100mL。CTAB提取DNA缓冲液配方CTAB4gNaCl16.364

28、g1MTris-HCl20ml(PH8.0)0.5MEDTA8ml,先用70mlddH2O溶解,再定容至200ml灭菌。TE缓冲液配方TE的组成浓度为:10mMTris-HCl;1mMEDTAPH=8.0,配制过程如下:量取下列溶液于500ml烧杯中1MTris-HClBufferPH=8.05ml0.5MEDTAPH=8.01ml向烧杯中加入约400mlddH2O均匀混合;将溶液定容到500ml后,高温高压灭菌;室温保存.CTAB法提取植物基因组DNA1实验原理1、在生物体中核酸常与蛋白质结合在一起,以核蛋白的形式存在,在制备核酸时,通过研磨破坏细胞壁和细胞膜,使核蛋白被释放出来。2、在浓氯

29、化钠溶液(12mol/L)中,DNA核蛋白的溶解度很大,RNA核蛋白的溶解度很小而在稀氯化钠溶液(0.14mol/L)中QNA核蛋白的溶解度很小,RNA核蛋白的溶解度很大。因此,可利用不同浓度的氯化钠溶液将DNA核蛋白和RNA核蛋白从样品中分别抽提出来。3、进一步将蛋白等杂质除去,常采用的去除蛋白:用含异戊醇的氯仿振荡核蛋白溶液,使其乳化,然后离心除去变性蛋白质,此时蛋白质凝胶停留在水相和氯仿相中间,而DNA溶于上层水相。用两倍体积95乙醇溶液将DNA钠盐沉淀出来。反复使用上述方法多次处理DNA核蛋白溶液,就能将蛋白等杂质较彻底地除去,得到较纯的DNA制品。为了彻底除去DNA制品中混杂的RNA

30、,可用RNA酶处理。生物材料中含有的脂肪物质和大部分的多糖,在用盐溶液分离核蛋白和用乙醇或异丙醇分级沉淀时即被除去。在DNA提取、制备的过程中,核酸极不稳定,许多因素可破坏其完整结构:化学因素,核酸的结构在pH值4.011.0间较稳定,pH值在此范围外就会使核酸变性降解,故制备过程应避免过酸过碱。物理因素,DNA分子链很长,是双螺旋结构,既有一定的柔性。又有一定的刚性,故强机械作用如剧烈搅拌会令DNA分子断裂,不利于收集,应加以避免。酶的作用,细胞中普遍存在的核酸酶在细胞壁或膜遭到破坏时被释放出来,它会降解DNA分子。故须用酶的变性剂、抑制剂使之失活。常用的酶抑制剂有柠檬酸盐、氟化物、砷酸盐、

31、乙二胺四乙酸盐、(ETDA-Na)等。操作过程最好在低温(0C左右)下进行。SDS和苯酚作为蛋白变性剂,同时可使核酸酶被破坏而失活。CTAB法原理CTAB(hexadecyltrimethylammoniumbromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。在高离子强度的溶液中(0.7mol/LNaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。CTAB分离缓冲液2%CTAB,1.4mol/LNaCL,20mmol/LEDTA(PH8.0),1

32、00mmol/LTris-HCL(pH8.0),0.2%巯基乙醇100mL:2gCTAB,8.18gNaCL,0.74gEDTA.Na2.2H2O,加入10mL1mol/L的Tris-HCL(pH8.0),0.2mL巯基乙醇,加水定容到100mL。1、Tris-HCl(pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;2、EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;3、NaCl提供一个高盐环境,使DNP充分溶解于液相;4、CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;5、卜巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成酿,避免褐变,使酚容易去除;PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚

33、形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。1用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相。使用酚的优点:1.有效变性蛋白质;2抑制了DNase的降解作用。缺点:1.能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。不能完全抑制RNase的活性。所以提取RNA时只用氯仿抽提。2、氯仿的作用?氯仿:加速有机相与液相分层;去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)3、用酚-氯

34、仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡(异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定)4、用乙醇沉淀DNA时,为什么加入单价的阳离子?用乙醇沉淀DNA时,通常要在溶液中加入单价的阳离子,如NaCl或NaAc,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀。1.十六烷基三乙基溴化铵(CTAB)法在目前众多的DNA提取方法中,CTAB法是其中最为广泛应用的一种。它既可以裂解细胞,又可以有效地去除多酚类和多糖类物质的沉淀,因而经常被应用于植物的DNA提取工作中。1.1原理及方法CTAB是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜。同时它能与核酸形成复合物,这些复合物在高盐溶液中(0.7mol/LNaCl)是可解离的,从而可使DNA和多糖物质分开。当溶液盐浓度降低到一定程度(0.3m

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