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文档简介
1、解惑练4新冠病毒的检测.检测患者因新冠病毒而产生的特异蛋白质新型冠状病毒IgM抗体快速检测试剂盒,该试剂盒采用间接法检测人新型冠状病毒IgM抗体, 仅需采取一滴血就有望在15分钟内肉眼观察获得检测结果,且患者的血浆稀释500至1 000 倍后,仍能检测出阳性条带。其实质为利用抗原一抗体杂交技术,但是无论如何,现在抗体 检测还不能完全替代核酸检测。.检测新冠病毒的核酸新型冠状病毒是一种仅含有RNA的病毒,病毒中特异性RNA序列是区分该病毒与其他病原 体的标志物。检测原理:核酸检测盒包括:逆转录酶试剂、病毒核酸标准试剂、热稳定DNA聚合酶、引物序列、特 异性的荧光DNA探针(带荧光的一段特异性的新
2、冠病毒的核酸序列,这个是最关键的,如果 特异性不强或者是病毒在这一段发生变异,则很可能会判定为阴性,影响结果)等。目前采用 RT-PCR技术(逆转录荧光PCR技术)。先从样本中提取RNA, RNA中可能有新冠病毒的RNA,同时也存在很多采样患者的组织 和存在于采样部位的微生物的RNAo先通过逆转录酶将样本的RNA逆转录为cDNA。因为新冠病毒中的核酸为RNA,而RNA 极易降解,为了防止我们检测的物质在检测过程中降解,我们把它转换为更稳定的DNA。检测扩增出的PCR产物,即DNA片段。我们扩增的病毒DNA片段能够发出荧光而被仪 器检测到。这些扩增出的供我们检测的产物的多少,很大程度上取决于样本
3、中目标RNA量 的多少。而目标RNA量的多少又与样本中病毒的多少相关。下图显示了相关原理:在PCR反应体系中,包含一对特异性引物以及一个Taqman探针,该 探针为一段特异性寡核甘酸序列,两端分别标记了报告荧光基团和淬灭荧光基团。探针完整 时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;若反应体系存在靶序列,PCR反应时探针与 模板结合,DNA聚合酶沿模板利用酶的外切酶活性将探针降解,报告基团与淬灭基团分离, 发出荧光。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子产生。荧光定量PCR仪能够监测出荧光 到达预先设定阈值的循环数(Ct值)与病毒核酸浓度有关,病毒核酸浓度越高,Ct值越小。L热变性 引物探针包淬灭
4、荧荧光基团y5光基团2 .引物复性/探针与模板的杂交聚合昭.探针杂交电3.延伸反应懑二一多【跟踪训练】1. (2022.潍坊期末考试)“防疫攻坚进行时,不再是说走就走的旅行”,为控制跨境传播,我 国驻多国大使馆先后发布通知,赴华人员需要提供新冠病毒核酸检测及血清抗体检测的双阴 性证明。目前,PCR技术(荧光PCR法)是病毒核酸检测的主流方法,是新冠病毒检测试剂盒 采用最多的技术。IgM/IgG联合检测(胶体金法)是新冠抗体检测试剂盒主要采用的技术。请分 析回答下列问题:新冠病毒是RNA病毒,所以需对样本进行 处理后再PCR扩增,如果样本存在目标病原体,则会因为 的特异性,扩增出相应的目标基因片
5、段,由此判断是否为阳性。(2)荧光PCR法,又称qPCR法,是指在反应体系中加入,通过专门仪器实现实时 荧光检测,以 来测定PCR循环后产物中核酸水平。(3)IgM和IgG均属于免疫球蛋白家族,是机体在抗原物质刺激下由浆细胞产生的抗体。 IgM/IgG检测试剂盒的原理是,通过检测人体内相应抗体间接证明是 否感染。被病毒感染后,机体会产生一系列的变化来抵御这种入侵,其中IgM和IgG的含量 会发生如图所示变化。抗体检测升1W : 及- 沼: 我- 妾:I矍广 IgM+IgG7IgG抗体: ;IgM抗体IgG再次感染IgM+agGIgG : g病Ig力抗体、I-14 -7 0 7 14 21 28
6、35 42发病后天数-14 -7 0 7 14 21 28 35再次感染天数通过对COVID19患者研究发现,病毒侵入人体后,大约需要57天产生IgM抗体,IgG抗体在感染后1015天时产生。通过检测外周血中IgM和IgG,不仅可以鉴别是否感染, 还可以辨别检测者是近期感染或者是既往感染。当核酸检测结果为阳性,IgM(+)IgG(一)时, 可判断检测者为:已治愈的患者检测结果应为答案(1)逆转录引物(2)荧光物质荧光强度(3)抗原与抗体特异性结合近期感染 核酸检测结果为阴性,IgM( 一)IgG( + )解析(1)基因工程中,目的基因的获取方法有两种,一种是直接从基因文库中获取,另外一 种是人
7、工合成,人工合成的方法必须已知目的基因序列,方法有两种,DNA合成仪合成和 PCR技术合成。PCR是扩增DNA的一种方法,如果是RNA病毒,首先要转化成DNA,也 就是逆转录;利用PCR技术进行新冠病毒核酸检测时,如果样本存在目标病原体,就会因为 引物的特异性,扩增出相应的目标基因片段,由此判断是否为阳性。荧光PCR是通过荧 光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,通过专门仪器实现实时荧光 检测,以荧光强度的高低来判断PCR循环后产物中的核酸水平。(3)新型冠状病毒基因编码 多个结构蛋白,这些蛋白包括多个抗原位点,利用抗原与抗体特异性结合的原理,可通过抗 体检测抗原的存在,从
8、而直接证明样本中含有新型冠状病毒,间接证明机体感染与否。2”实时荧光定量qPCR”是新冠疫情防控的一把利刃,通常在12 h内即可得到检测结果。 TaqMan探针是实时荧光定量RTPCR技术中一种常用探针(如图1),其5端连接荧光基团 (R), 3端连接淬灭剂(Q)。当探针完整时,R发出的荧光信号被Q吸收而不发荧光。在PCR 扩增过程中,当ZqDNA聚合酶遇到探针时会使探针水解而释放出游离的R和Q, R发出的 荧光信号被相应仪器检测到,荧光信号的累积与PCR产物数量完全同步(如图2)。请据图回 答:病毒样品RNA双链DNA引物、探针与模板链结合I/T叫Man探针新链延伸遇到探针TaqMan探针T
9、aq酶切割探车产感J、一选驾荧光色吗,R在猫、 仪器检测Jaq酶/、一新链聚合完成、血结合图1和图2分析,“荧光RT-PCR技术”所用的试剂盒中通常都应该含有 酶、酶、TaqMan探针、引物、dNTP、Mg2+缓冲剂等。这种分子层面的荧光RTPCR检测具有特 异性和灵敏性都很高的特点,主要与试剂盒中的、 有关。(2)根据TaqMan探针功能分析,探针中碱基序列的设计应主要依据。新冠病毒 (2019 nCoV)是冠状病毒大家庭中的新的一员,其碱基序列与引起SARS的冠状病毒碱基序 列有79.5%的相似性,与流感病毒碱基相似度也较高,因此在设计TaqMan探针时应筛选出2019 nCoV特有序列,
10、以避免(填“假阴性”或“假阳性”)的出现。(3)根据图1和图2,八的DNA聚合酶除了能催化DNA子链的延伸,还能。(4)若每分子探针水解释放的R基团荧光强度为定值a,则反应体系中某时刻荧光信号强度(Rn) 主要与、有关。在检测过程中,随着PCR的进行,反应产物 不断累积,“杂交双链”荧光信号的强度也等比例增加,增加了检测结果的准确性,一般要 达到或超过阈值时才确诊。可通过荧光强度的变化监测产生量的变化从而得到一条荧光扩增 曲线图(如下图)。“平台期”出现的最可能的原因是试剂盒中 等有限,超出一定的循环数后,荧光标记的“杂交双链”不再增加。卜平台期1卜平台期1Cycle(循环数)阈值(熙阳M联)UX(5)虽然荧光RTPCR是当前被广泛认可的检测手段之一,但是不断有“假阴性”现象报道, 通过上述过程分析,“假阴性”的可能原因有(填字母)。a.通过咽拭子取样不规范或取样所获样本量不足b.在样本运输、检测中出现了损坏和污染c.病毒相应关键序
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