分子育种-p张家港市三阳泰农业科技

报

告

大

纲组选择（GS）全流程商业化育种的整体体系从分子辅助选择（MAS）到全表型/

型/系谱综合选育平台分子育种在种业科研中的推进进度外引材料、前育种、群体材料、杂交种T1T2T3C1C2C32个测试阶段 测试点4个15个90个自交系培育（杂交作物）或群体选系（自交8作个物）杂交种组配（杂交作物）或者选系材料测试40（个自交作物）病虫害鉴定、QTL定位/GWAS双单倍体生产、MAS/GS筛选全流程商业化育种的整体流程表型/型数据分群Structure产量测试：GWAS

Cross

Validation全组和选择多环境产量性群内/群间材料组配全流程商业化育种的整体流程PRISM育种全流程商业化育种的整体流程Combined

Approach：先使用MAS分子选择，然后在种植田间进行表型选择从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）Cloutier,2012少量质量性状，例如抗病性，株高、穗位从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）Nelson,2008从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）从分子辅助选择（MAS）到全 组选择（GS）采用常规鉴别寄主鉴定技术,分析采自2005年和2006年我国10省份的100份玉米大斑病病菌分离物的致病性变异.鉴定结果表明,共鉴定出15个类型的生理小种,0、1、2、3、N、12、13、1

N、23、2N、3N、12N、123N、123、23N;我国玉米大斑病菌的小种组成在继续变化之中,在范围内已无优势小种的存在;1、0号生理小种虽然是主要小种类群,但所占比例也仅有约20%,生理小种组成趋于多元化;北方地区小种的毒力组成较南方地区复杂,且毒力更强,不仅有能够克服单抗性的小种,而且有能够克服4个抗性几乎所有组合类型的小种.抽雄期、产量、雄穗长度、雄穗分枝、雄穗夹角、植株高度、上部叶片夹角、叶片宽度、叶片长度、10粒重、穗轴直径、籽粒高度、穗长度、穗轴种、籽粒全重等18个性状从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）低成本高密度分子标记考虑所有标记和单倍型覆盖主效 和微效加性效应标记效应第一时间在training群体检测使用标记效应测试群体中值在育种值GS的选择相应比MAS高18-48%从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）Field：expensiveLab：Cheap全流程商业化育种的整体流程全流程商业化育种的整体流程Osorio，

2013A群：A1,

A2,……A100B群：B1,B2,……B100A1A2……A100A1xA2…xx…xA100B1B2……B100B1xB2…xx…xB100B群新中间材料A群新中间材料A群典型测配种B群典型测配种从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）群内组配--初级测试：GCA一般配合力使用群内选系部分DH群体BLUE，群内选系其他DH群体的BLUP从分子辅助选择（MAS）到全 组选择（GS）T1T2T3C1C2C32个群间组配--高级测试：SCA一般配合力测试阶段 测试点4个15个90个自交系培育（杂交作物）或群体选系（自交作物）8个杂交种组配（杂交作物）或者选系材料测试（4自0交个作物）育种-初级测试GCA一般配合力育种—高级测试SCA特殊配合力B101B102…B125A101A102xx…xA125从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）使用群间组配杂交种的BLUE，预测间组配其他杂交种的BLUP从分子辅助选择（MAS）到全组选择（GS）表型/型/系谱综合选育平台大田数据信息管理平台PRISM分子数据信息管理平台LIMS跨平台的数据分析系统做图工具分析工具工具决策工具群体大田测试数据获取做图工具(分子数据)：遗传连锁图谱分析工具（分子/大田数据）：QTL定位，GWAS，种质资源分析工具（分子/大田数据）：BLUP计算决策工具（分子/大田数据）：MAS,GS，组配材料最后重新回到大田育种部分进行育种圃/田间测试工作表型/

型/

系谱综合选育平台表型数据型数据1型数据2系谱数据表型/型/系谱综合选育平台镒，2016表型/型/系谱综合选育平台0500100015002000250030000

2

4

6 8

10seq(1:m)t(-log10(p))表型/型/系谱综合选育平台经过传统大田、MAS和GS选育的材料一起进入产量测试经过多年多点测试、验证进行品种的生态区定位表型/型/系谱综合选育平台大田育种现状（Are

you

ready？）数据库规范稳定（PRISM）骨干自交系确定（Key

inbred）基础QTL定位的Training群体建立（Bi-parental

vs.Mixed

pop）系谱记录规范且准确（命名规则，Kinship，structure）性状范围广（Columns足够覆盖感

范围）性状 精准（数量vs.质量，测量vs.感官认知）完成多年多点数据积累经费支持（丰俭由人）分子育种在种业科研中的推进进度群体的建立大田育种的key

inbred和种质资源资源结构分析：structure，分群的概念性状：大斑病、丝黑穗、茎腐病、南方锈病、株高、穗位、脱水、倒伏、含水量和产量pop群体建立：biparental，Asssociation

Map Pop,

NAMpop原则：分子育种必须充分利用大田育种资源和信息，结果必须帮助提升大田育种价值，并推动新品种研究和开发分子育种在种业科研中的推进进度层次分子标记数量目标材料对象目的150K或者更高，甚至全骨干自交系信息储备，GWAS， 挖掘2384-3072SNP非骨干自交系QTL

population杂交种DH材料QTL定位GWAS淘汰质量性状340SSR杂交种一致性鉴定420SNPDH材料定向分子辅助选育，一次选择2-3个性状：抗病、株高、穗位分子育种：先淘汰，后选育分子育种在种业科研中的推进进度年份工作任务目标2015熟悉PRISM的基础使用的信息化QTL

map育种一线

至少2人熟悉使用PRISM基层技术员全部实习使用

系统储备和稳定性2016熟悉PRISM的中高级使用整合

PRISM兼容的APPQTLmap熟练使用PRISM的人数保证每站1-2名获得一定规模、可靠的性状相关的QTL位点2017整合分子数据管理平台PRISM分子辅助育种QTLmap使用分子辅助育种校正QTL位点2018分子数据和PRISM平台对接使用分子辅助育种校正QTL位点2019PRISM分子辅助育种大规模使用完成至少2-3个抗病性状成功完成分子回交2019-2022大规模QTLma