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文档简介
3微生物代谢调节本章内容:第一节基本代谢的调节第二节
次级代谢的调节第三节
代谢工程第一节基本代谢的调节新陈代谢:发生在活细胞中的各种分解代谢(catabolism)和合成代谢(anabolism)的总和。 新陈代谢=分解代谢+合成代谢分解代谢:指复杂的有机物分子通过分解代谢酶系的催化,产生简单分子、腺苷三磷酸(ATP)形式的能量和还原力的作用。合成代谢:指在合成代谢酶系的催化下,由简单小分子、ATP形式的能量和还原力一起合成复杂的大分子的过程。代谢概论复杂分子(有机物)分解代谢合成代谢简单小分子ATP[H]C.glutamicum
合成生物絮凝剂的代谢网络代谢控制机制酶活性的调节
---活化或钝化酶合成的调节
---诱导或阻遏遗传控制酶合成水平的调节一般比酶活的调节更为经济。调节步骤主要存在于转录和转译的启动部位,在多步骤生物合成或分解代谢途径中其关键部位酶活的快速调节主要靠变构控制机制。共价修饰变构效应缔合与解离竞争性抑制酶活性的调节方式共价修饰
可逆修饰不可逆修饰可逆共价修饰细胞中有些酶存在活性和非活性两种状态,两者可以通过另一种酶的催化作共价修饰而互相转换。酶的可逆共价修饰作用的意义因酶构型的转换是由酶催化的,故可在很短的时间内经信号启动,触发生成大量有活性的酶,有效控制细胞生理代谢这种修饰作用可更易控制酶的活性以响应代谢环境的变化。(随时响应)
不可逆共价修饰酶原激活——无活性的酶原被相应的蛋白酶作用,切去一小段肽链而被激活。胰蛋白酶原的活化靠从N-端除去一个己肽。胰蛋白酶原活化是信号放大的一个典型例子。一旦胰酶完成了其使命后,便被降解而不能再恢复为酶原——这种酶活性的关闭作用是极其重要的。变构控制变构效应:别构/副位效应,一种小分子物质与一种蛋白质分子发生可逆的相互作用,导致这种蛋白质的构象发生改变,从而改变这种蛋白质与第三种分子的相互作用。变构酶:具有变构作用的酶。协同作用协同作用:酶蛋白分子的一个位点与配基的结合会影响同一分子的另一位点与基质的结合。正协同作用:若起始的配基结合促进分子的另一位置的更多的基质的结合,便认定这种蛋白质具有正向协同作用。负协同作用:若这种结合使进一步结合受阻。代谢途径的支点和代谢可逆步骤中常发现变构控制酶。其它调节方式缔合与解离——
蛋白质活化与钝化是通过组成它的亚单位的缔合与解离实现的。竞争性抑制——
一些蛋白质的生物活性受代谢物的竞争性抑制。需要氧化性NAD+的反应可能被还原性NADH的竞争性抑制;需ATP的反应可能受ADP或AMP的竞争性抑制;一些酶常受其反应过程产物的竞争性抑制。酶合成的调节方式酶的诱导分解代谢物阻遏终产物的调节(反馈调节)协调控制诱导作用组成酶:酶的合成速率受基质浓度变化的影响很小。无需诱导自动合成。诱导酶:只有诱导物存在时才被合成。诱导物可以是基质,也可以是基质的衍生物,甚至是产物。酶基质的结构类似物常是很好的诱导物,但不作为基质被酶转化(安慰诱导物)。意义:保证能量与氨基酸不浪费。诱导作用分子水平的机制Jacob-Monod模型(操纵子假说)假说认为:
(1)编码一系列功能相关的酶的基因在染色体中紧密排列在一起(2)它们的表达与关闭是通过同一控制位点协同进行的。分解代谢物阻遏能快速利用的基质,其分解代谢物会阻遏另一种异化较难利用基质的酶的合成。早期称为葡萄糖效应!分解代谢物效应许多工业生成的酶都受这类调控。如何克服分解代谢物阻遏??培养基中不使用阻遏性碳源筛选耐分解代谢物阻遏突变株采用过程补糖的方法限制生产菌的糖耗速率筛选原理:
以一种受分解代谢物阻遏的基质作为唯一的氮源,用含有这种氮源的培养基的琼脂平板培养筛选经诱变的菌株。例如:
鼠伤寒杆菌突变株,在葡萄糖-脯氨酸琼脂平板上筛选耐分解代谢物阻遏的脯氨酸氧化酶生成菌株;耐分解代谢物阻遏突变株的获得终产物的调节(反馈调节)氨基酸、嘌呤和嘧啶核苷酸生物合成的控制总是以反馈调节方式进行。生理意义:避免物流的浪费及不需要的酶的合成。反馈调节的类型:反馈抑制与反馈阻遏反馈调节反馈阻遏:通过阻遏蛋白对操纵子的控制抑制酶基因转录。反馈抑制:终点产物对该途径的酶的活性调节,所引起的抑制作用。反馈阻遏的分子作用机制反馈抑制如何实现的??反馈阻遏呢?两种机制都起着调节代谢途径末端产物的生产速率的作用,以适应细胞中大分子合成对前体的需求。两种作用相辅相成,其联合作用可使细胞生物合成途径达到高效调节。反馈阻遏是转录水平的调节,产生效应慢,反馈抑制是酶活性水平调节,产生效应快。此外,前者的作用往往会影响催化一系反应的多个酶,而后者往往只对是一系列反应中的第一个酶起作用。反馈抑制与阻遏的异同反馈调节作用的消除?策略:限制末端产物积累(筛选营养缺陷型)。
代谢途径中酶的诱导和阻遏常常是平行的。
例如:负责乳糖分解代谢的酶在合成速率方面显示出协同控制作用,即其合成速率在所有生长条件下均以恒定的比例进行。当β-半乳糖苷酶被诱导时,其他两种Pr,半乳糖苷透酶和β-半乳糖苷转乙基酶也同时被诱导出来。前者负责乳糖和其他有关物质,如硫-β-D半乳糖苷运输到细胞内,后者生理作用不明。
微生物的协调控制精氨酸生物合成途径——部分显示协同控制作用将细胞从含有精氨酸的培养基移种到缺少它的培养基中,鸟氨酸氨甲酰转移酶去阻遏达
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