系统进化树的制作课件

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对比NJ法和MP法做出来的树，NJ法的自展支持率相对较高，且两树中个别序列的位置也不同。对比NJ法和MP法做出来的树，NJ法的

以同样的方法制作cox1序列的系统发育树结果如下以同样的方法制作此为NJ法的原始树此为NJ法的原始树此为NJ法经过Bootstrap计算的树并选择左边图标PlaceRootonBranch选择NC006081作为外群此为NJ法经过Bootstrap计算的树此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这此为MP法原始的树此为MP法原始的树此为MP法经过Bootstrap计算的树并选择左边图标PlaceRootonBranch选择外群此为MP法经过Bootstrap计算的树此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这打开ClustalX打开ClustalX系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件进行完全比对进行完全比对系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件由于后面无法用aln格式转化的meg格式打开，所以此改用fasta格式保存并命名为cob2由于后面无法用aln格式转化的meg格式打开，系统进化树的制作课件选择此项可打开比对过的文件选择此项可打开比对过的文件系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件系统进化树的制作课件选择邻接法（NJ法）构建系统发育树选择邻接法（NJ法）构建系统发育树设置Bootstrap值为100设置Gap处理为两两删除设置模型为Kimura-2-Parameter设置Bootstrap值为100设置Gap处理为两两删除设置此为原始的树此为原始的树此为经过Bootstrap计算的树并选择左边图标PlaceRootonBranch选择NC006081为外群此为经过Bootstrap计算的树此为树根，即所有物种最近共同祖先外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。此为树根，即所有物种最近共同祖先外群树上的数字代表自展支持率选择最大简约法（MP法）构建系统发育树选择最大简约法（MP法）构建系统发育树设置Bootstrap值为100设置Bootstrap值为100此为原始的树此为原始的树此为经过Bootstrap计算的树并选择左边图标PlaceRootonBranch选择NC006081作为外群此为经过Bootstrap计算的树此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这一支的可能性越高，图上属于同一支的即代表在进化上相对较近。此为树根外群树上的数字代表自展支持率，支持率越高就代表属于这

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