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文档简介
第十章
基因组和染色体基因组(genome)是指一个细胞中遗传物质的总量。核型(Karyotype)C值(Cvalue)原核基因组含有大量单一顺序(unique-sequences),仅有少量的重复顺序。
真核基因组含少量单一顺序和大量重复顺序。原核生物的细胞中除了主染色体以外,还含有各种质粒和转座因子。真核生物除了核染色体以外,还存在细胞器DNA。
第十章基因组和染色体基因组(genome1第一节
原核生物基因组的结构特点E.coli2.4×109Da,42000Kb(1300微米),闭合环状,约编码2000个基因。类核(nucleoid)。支架(scafford)100个DNA环组成,每个环长40Kb,13微米。每200bp就有一个负超螺旋(=0.05),即基因组中含5%的负超螺旋。超螺旋以两种状态存在:(1)自由状态的超螺旋,可在环内传递张力。(2)超螺旋受到束缚,不能传递张力。第一节
原核生物基因组的结构特点E.coli2.42基因组和染色体课件3一.类核的结构一.类核的结构4表10-1
E.coli含有的各种DNA结合蛋白蛋白结构功能含量/每细胞相当于其核蛋白基因HUα和β亚基,每个9KD使DNA压缩、类核凝聚,刺激复制,和1HF有关4万个二聚体H2BhupA.BH两个相同亚基,各28KD促使双链的互补、复性3万个二聚体H2A?IHFα:10.5KD;β:9.5KD有助于att位点配对重组??himA.D.H1(H-NS)15KD亚基和DNA结合,与DNA拓扑结构有关1万?osZbglYpilGHLP117KD单体?2万?firAP3KD亚基??鱼精蛋白(DNA结合蛋白)?
表10-1E.coli含有的各种DNA结合蛋白蛋白结构功能5二
重叠基因(overlappinggene)
莲人在绿杨津采一玉漱声歌新阙
采莲人在绿杨津,在绿杨津一阙新;一阙新歌声漱玉,歌声漱玉采莲人。二重叠基因(overlappinggene)61977年Sanger首先发现重叠基因他对单链环状的噬菌体X174进行了测序。5386Nt11基因,3个转录单位,由3个启动子(pA,pB,pD)启动。X174含有的5386Nt最多能编码1795个氨基酸,若每个氨基酸的平均分子量为110,则总的蛋白质分子量为197,000Da,但实际蛋白质总分子量却为262,000D。将全部DNA顺序和蛋白质的氨基酸顺序进行比较,发现了重叠基因1977年Sanger首先发现重叠基因7基因组和染色体课件8重复基因OverlappingGenes重复基因OverlappingGenes9三.质粒(plasmid)1.抗性质粒(Resistance(R)plasmids):2.
致育因子(Fertility(F)plasmids)3.
Col质粒:有编码大肠杆菌素(colicins)基因。4.
降解质粒(degradativeplasmids)。这种质粒编码一种特殊蛋白,可使宿主菌代谢特殊的分子,如甲苯或水杨酸。5.
侵入性质粒(virulenceplasmids)。这些质。如Ti
质粒,此是在根癌农杆菌(Agrobacterium
tumefaciens)中发现的
三.质粒(plasmid)1.抗性质粒(Resistanc10基因组和染色体课件11第二节
真核基因组的复杂性
分子量约为3×1012道尔顿长度为2×106Kb,形态为线状,约编码10万个以下的基因。人类细胞在二倍体的核中DNA长约30亿个碱基对估计编码3万个基因,每条染色体含碱基8千万至3亿不等。现已有5千个基因被编目,1900个基因已进行了染色体定位,600个已被克隆分离出来。若将一个细胞中每条染色体的DNA首尾彼此相接,全长约200cm。第二节真核基因组的复杂性分子量约为3×1012道尔顿12RenatoDulbecco于1986年首先提出了“人类基因组计划”,原计划约10-15年完成,耗资30亿美元,其宏伟的程度堪与Manhatto原子弹计划和Appolo登月计划相提并论。
1990年开始实施1999破译出人类第22号染色体的遗传密码。2000完成了人类第21号染色体的测序。预计从原定的2003年6月提前到2001年6月完成。2000年6月26日美,英,日,德,法,中六国共同宣布人类基因组工作草图绘制成功。RenatoDulbecco于1986年首先提出了“人132000年3月塞莱拉公司宣布完成了果蝇的基因组测序。12月14日英美等国科学家宣布绘出拟南芥基因组的完整图谱。这是人类首次全部破译一种植物的基因序列。2001年:1、2月,HGP和美国塞莱拉(Sequencing)公司将各自测定的人类基因组工作框架图分别发表在Nature和Science上,这表明人类基因组计划(HGP)进入了一个展新的阶段。2000年142000,4,5:以杨焕明为首的中国科学家在Science发表了水稻全基因组框架序列图。基因总数:46022~55615,约为人类的2倍;其中10000个基因的功能已确定;水稻的“垃圾”序列多位于基因外,人类的“垃圾”序列多位于基因内;水稻的基因平均长度为4500bp,人类基因平均长度为72000bp,拟南芥约有25000个基因,80%在水稻中都存在,二者之间有关信号传导的基因差别最大2000,4,5:以杨焕明为首的中国科学家在Science发15基因组和染色体课件16一.
组蛋白组蛋白类型碱性氨基酸氨基酸数分子量(Da)LysArgH129%1%21523,000H2A11%9%12913,960H2B16%6%12513,775H310%13%13515,340H411%14%10211,280表12-2小牛胸腺DNA的组蛋白的特点一.
组蛋白组蛋白碱性氨基酸氨基酸数分子量L17二.
核小体(nucliesome)1956年Wilkins和VittorioLuzzati对染色质进行了X衍射研究,发现染色质具有间隔为100埃的重复性结构。这意味着甚麽?Clark和Felsenfeld于1971年首先用葡萄球菌核酸酶(Staphylococcalnuclease)来作用染色质,不敏感的区域比较均一。这暗示甚麽?接着Hewish和Burgoyun(1973年)用内源核酸酶消化细胞核,再从核中分离出DNA,结果发现一系列DNA片段,它们相当于长约200bp的一种基本单位的多聚体。表明甚麽?M.Noll(1974年)用外源核酸酶处理染色质,然后进行电泳,测得前三个片段的长度分别为205,405,605bp长,表明甚麽?二.
核小体(nucliesome)1956年Wilkins18Olins夫妇(1974)和PierreChambon等(1975)在电镜下观察到染色质的“绳珠”状结构,小球的直径为100埃,Olins并把这种小球称为小体。X衍射图表明组蛋白的多聚体是紧密相联,并无可容纳像DNA分子那样大小的孔洞,表明甚麽?1974年Kornberg和Thomas
先用小球菌核酸酶稍稍消化一下染色质,切断一部分200核苷酸对单位之间的DNA,使其中含有单体、二聚体、三聚体和四聚体等。然后经离心将它们分开。每一组再通过凝胶电泳证明其分子大小及纯度。然后分别用电镜来观察各组的材料;结果单体均为一个100埃的小体,二聚体则是两个相联的小体,同样三聚体和四聚体分别由三个小体和四个小体组成,表明甚麽?1984年Klug和Butler进行了修正核小体模型。Olins夫妇(1974)和PierreChambon等(19基因组和染色体课件20基因组和染色体课件21核小体的
梯度离心
和电泳核小体的
梯度离心
和电泳22
第十章
基因组和染色体基因组(genome)是指一个细胞中遗传物质的总量。核型(Karyotype)C值(Cvalue)原核基因组含有大量单一顺序(unique-sequences),仅有少量的重复顺序。
真核基因组含少量单一顺序和大量重复顺序。原核生物的细胞中除了主染色体以外,还含有各种质粒和转座因子。真核生物除了核染色体以外,还存在细胞器DNA。
第十章基因组和染色体基因组(genome23第一节
原核生物基因组的结构特点E.coli2.4×109Da,42000Kb(1300微米),闭合环状,约编码2000个基因。类核(nucleoid)。支架(scafford)100个DNA环组成,每个环长40Kb,13微米。每200bp就有一个负超螺旋(=0.05),即基因组中含5%的负超螺旋。超螺旋以两种状态存在:(1)自由状态的超螺旋,可在环内传递张力。(2)超螺旋受到束缚,不能传递张力。第一节
原核生物基因组的结构特点E.coli2.424基因组和染色体课件25一.类核的结构一.类核的结构26表10-1
E.coli含有的各种DNA结合蛋白蛋白结构功能含量/每细胞相当于其核蛋白基因HUα和β亚基,每个9KD使DNA压缩、类核凝聚,刺激复制,和1HF有关4万个二聚体H2BhupA.BH两个相同亚基,各28KD促使双链的互补、复性3万个二聚体H2A?IHFα:10.5KD;β:9.5KD有助于att位点配对重组??himA.D.H1(H-NS)15KD亚基和DNA结合,与DNA拓扑结构有关1万?osZbglYpilGHLP117KD单体?2万?firAP3KD亚基??鱼精蛋白(DNA结合蛋白)?
表10-1E.coli含有的各种DNA结合蛋白蛋白结构功能27二
重叠基因(overlappinggene)
莲人在绿杨津采一玉漱声歌新阙
采莲人在绿杨津,在绿杨津一阙新;一阙新歌声漱玉,歌声漱玉采莲人。二重叠基因(overlappinggene)281977年Sanger首先发现重叠基因他对单链环状的噬菌体X174进行了测序。5386Nt11基因,3个转录单位,由3个启动子(pA,pB,pD)启动。X174含有的5386Nt最多能编码1795个氨基酸,若每个氨基酸的平均分子量为110,则总的蛋白质分子量为197,000Da,但实际蛋白质总分子量却为262,000D。将全部DNA顺序和蛋白质的氨基酸顺序进行比较,发现了重叠基因1977年Sanger首先发现重叠基因29基因组和染色体课件30重复基因OverlappingGenes重复基因OverlappingGenes31三.质粒(plasmid)1.抗性质粒(Resistance(R)plasmids):2.
致育因子(Fertility(F)plasmids)3.
Col质粒:有编码大肠杆菌素(colicins)基因。4.
降解质粒(degradativeplasmids)。这种质粒编码一种特殊蛋白,可使宿主菌代谢特殊的分子,如甲苯或水杨酸。5.
侵入性质粒(virulenceplasmids)。这些质。如Ti
质粒,此是在根癌农杆菌(Agrobacterium
tumefaciens)中发现的
三.质粒(plasmid)1.抗性质粒(Resistanc32基因组和染色体课件33第二节
真核基因组的复杂性
分子量约为3×1012道尔顿长度为2×106Kb,形态为线状,约编码10万个以下的基因。人类细胞在二倍体的核中DNA长约30亿个碱基对估计编码3万个基因,每条染色体含碱基8千万至3亿不等。现已有5千个基因被编目,1900个基因已进行了染色体定位,600个已被克隆分离出来。若将一个细胞中每条染色体的DNA首尾彼此相接,全长约200cm。第二节真核基因组的复杂性分子量约为3×1012道尔顿34RenatoDulbecco于1986年首先提出了“人类基因组计划”,原计划约10-15年完成,耗资30亿美元,其宏伟的程度堪与Manhatto原子弹计划和Appolo登月计划相提并论。
1990年开始实施1999破译出人类第22号染色体的遗传密码。2000完成了人类第21号染色体的测序。预计从原定的2003年6月提前到2001年6月完成。2000年6月26日美,英,日,德,法,中六国共同宣布人类基因组工作草图绘制成功。RenatoDulbecco于1986年首先提出了“人352000年3月塞莱拉公司宣布完成了果蝇的基因组测序。12月14日英美等国科学家宣布绘出拟南芥基因组的完整图谱。这是人类首次全部破译一种植物的基因序列。2001年:1、2月,HGP和美国塞莱拉(Sequencing)公司将各自测定的人类基因组工作框架图分别发表在Nature和Science上,这表明人类基因组计划(HGP)进入了一个展新的阶段。2000年362000,4,5:以杨焕明为首的中国科学家在Science发表了水稻全基因组框架序列图。基因总数:46022~55615,约为人类的2倍;其中10000个基因的功能已确定;水稻的“垃圾”序列多位于基因外,人类的“垃圾”序列多位于基因内;水稻的基因平均长度为4500bp,人类基因平均长度为72000bp,拟南芥约有25000个基因,80%在水稻中都存在,二者之间有关信号传导的基因差别最大2000,4,5:以杨焕明为首的中国科学家在Science发37基因组和染色体课件38一.
组蛋白组蛋白类型碱性氨基酸氨基酸数分子量(Da)LysArgH129%1%21523,000H2A11%9%12913,960H2B16%6%12513,775H310%13%13515,340H411%14%10211,280表12-2小牛胸腺DNA的组蛋白的特点一.
组蛋白组蛋白碱性氨基酸氨基酸数分子量L39二.
核小体(nucliesome)1956年Wilkins和VittorioLuzzati对染色质进行了X衍射研究,发现染色质具有间隔为100
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