药物筛选中信息资源利用

概述中药/化学药物研发中信息意识的培养药学信息的基本来源及构成（信息、知识、情报、文献及其相互关系）信息资源的高效利用查阅资料、鉴别和获得中药学信息的一些技巧第一页，共118页。目的提高信息获取能力（INFORMATIONLITERACY）丰富获得各种中药/化学药物信息资源和相关数据库的知识第二页，共118页。INFORMATIONLITERACY（信息素养）正确分析信息需求了解不同的信息源，知道如何获得其中的信息正确评价、利用检索到的信息第三页，共118页。信息获取能力对研发人员的重要性

信息爆炸：网络信息量不到18个月翻一番；全世界科技期刊超过40000种，每年文章超过百万篇。纷繁复杂的信息如何进行有效的归类综合？信息差距造成人们成就、收入上的差异信息对研发至关重要：先知者先觉第四页，共118页。信息、知识、情报与文献信息：是事物存在方式和运动规律的一种表现形式，是客观事物本质特征千差万别的反应。知识：来源于信息，是经过人脑加工处理过的系统化了的信息，是人类经验和智慧的总结。情报：是传递着的有特定效用的知识。知识性、传递性和效用性是其基本属性。文献：记录有知识的一切载体。决策、解决具体问题所需的是正确的知识和情报第五页，共118页。情报的价值信息是与物质、资源并列的一种宝贵资源。人们情报意识的强弱决定着信息的开发利用效率。对于情报意识强者，信息有用且可以增值；对情报意识弱者，则视而不见，听而不闻，完全失去作用。“情报就是为了解决一个特定问题而需要的知识。”，要求及时性和针对性，是人们对特定知识的需求。可见情报的本质是知识，具有传递性和实用性的特点。第六页，共118页。文献的利用文献仍然是人们获取信息、知识和情报的主要方式，习惯使然。因此，文献是一种非常重要的信息源，但又不是唯一的信息源。文献调研和回顾是从事药物研发最为基础的工作。没有这一环节，很难找到有价值的项目。除了文献信息外，还有非文献信息源。如实物、样品、展览、交谈、会议、广播等可以利用。第七页，共118页。文献利用需注意的问题不能仅仅局限于相关数据库和图书馆。论文收入数据库大都滞后三个月到一年。如果只依靠这些渠道,很可能遗漏最新的文献。还需要关注最近半年甚至1年内出版的相关学术刊物和学术著作（书店、网站）。选择权威文献。判断依据：1.引用越多则越权威,越值得关注；2.期刊质量（如核心期刊）越高，其发表的论文质量就越有保障；3.作者的知名度和所属单位是否有权威性。

第八页，共118页。如何提高文献利用效率提高文献选择效率。与一个研发问题相关的文献可能大部分都是重复他人的低质量文献，需要排除：高质量的研究文献都会有大量来源广泛的注释，以支撑其学术观点，而没有注释或注释很少的文献可以不读;临床研究是否随即双盲对照；结论是否经统计学检验等。核心文献亲自阅读，不能仅仅依靠他人对这些文献的评介或综述判断。这样可以避免他人的误导。质疑（怀疑）意识：报刊、杂志和书籍给的结论未必正确，不能盲目相信文献中的既有结论和观点。这是从事研究工作的基本素质之一。

第九页，共118页。研发信息利用面临的主要问题信息渠道单一虽然可以访问大量的专业数据资源，但缺乏对分散数据进行快速综合分析、组织和加工成信息和知识的能力。检索技巧有待提高：无论什么数据库，都是一种工具，要发挥出这个工具的最佳性能依靠检索者的检索技巧和能力。检索和查询中对通用搜索引擎如谷歌、百度等依赖过多，导致专业信息的查询效率低第十页，共118页。信息获取途径讨论、个人接触学术会议INTERNET图书馆数据库获取信息书期刊报告论文网络书目事实全文email推送第十一页，共118页。介绍内容获取网络信息文摘数据库的有效利用专利数据库快速获取原文第十二页，共118页。网络医药信息资源评价标准时效性：信息何时发布、更新；链接是否有效等权威性：信息的生产者或责任者是谁.org,.gov,.edu,com；作者=专家，由大学，公司还是私人出版？目的是什么：盈利or非盈利准确性公正性：事实还是观点？谁负责：.ORG,.COM,EXPERT等全面性是否有链接内容和范围：题目内容是否相符；文件结构是否容易了解全貌外观：对颜色搭配、语言、文字、图标、照片的印象

第十三页，共118页。需要考虑的一些事实…….

网络信息资源良莠不齐、真伪共存

要用全部的知识去判断、评价已经建立的对其他媒体的评价标准对网络媒体仍然适用

第十四页，共118页。网络医药信息资源第十五页，共118页。（一）搜索引擎

网上可索引的网页数每4个月增长一倍各种搜索引擎数量近万，是用户得知新网站的最重要途径80%用户习惯通过搜索引擎以"关键词"搜索的方式查询感兴趣的信息使用率仅次于EMAIL，在各种网络应用中位居第二位。第十六页，共118页。（二）专题型检索工具第十七页，共118页。MICROMEDEX（）提供医疗保健、药品、健康环境等相关信息，以最大程度满足临床信息需求、为用户提供最相关的信息为原则。Corporate&Industrial：提供环境与安全、药品等相关信息。经过专家的组织、序化和整合及审查。主要由药品信息系统、毒理学信息系统、紧急救护信息系统、病人教育信息系统及化学品和有害物质管理信息系统等几部分组成，并附有产品列表。

第十八页，共118页。第十九页，共118页。提供药学信息的专业网站，旨在服务于病人和卫生专业人员。

数据每2天更新一次。每月最高点击率达200万次。

Pharmweb

()

第二十页，共118页。第二十一页，共118页。Rxlist()美国提供处方药物和其它药物信息的网站包含5000种以上处方药物。有药名检索、药学新闻、Rx论坛、替代医学、TOP200、网上药方等栏目。TOP200列出美国处方药市场每年度排名前200种药物。对医药工业研究人员有一定价值。第二十二页，共118页。第二十三页，共118页。1.人员查询Whowhere（）专门用于查找人员提供各领域人员信息：EMAIL，电话，个人主页等可对国别、城市、学校、所在机构、个人爱好等进行限定最好方法是访问其所在机构或协会的网页第二十四页，共118页。CommunityofScience专门查找科研人员信息的网站与许多知名研究机构合作,提供世界范围480,000位专家及学者的信息

第二十五页，共118页。2.机构查询ScholarlySocietiesProject

提供世界范围内约2400个学术机构网站信息约30%来自于非英语国家

第二十六页，共118页。2.机构查询ScholarlySocietiesProject

提供世界范围内约2400个学术机构网站信息约30%来自于非英语国家

第二十七页，共118页。医学会议

医学会议是科研人员了解最新科研动态、交流科研成果、获取最新科研信息的重要途径。及时了解会议信息，就不会因知晓过晚而错失良机。

第二十八页，共118页。

M

www.专门提供医学会议信息可检索7000多条会议指定学科领域，可得到每月一期的即将举行的学术会议的EMAIL提醒会议组织者可向该网站提供信息，扩大影响在CONFERENCESEARCH栏中，直接输入会议名称，也可按时间、学科、关键词等多项限定，检索符合要求的会议

第二十九页，共118页。提供医学会议信息预报按主题分类，检索方便可通过会议召开时间、地点、主题检索

第三十页，共118页。第三十一页，共118页。（三） 导航系统优秀的网络信息导航系统，有系统的学科分类信息来源经过专业人员鉴别、整理，去粗取精能使信息查找事半功倍

第三十二页，共118页。1.瑞典图书馆的生物医学链接（BiomedicalLinks）

免费自动搜索，人工鉴别内容涉及生物医学各领域，20000余链接23大类，有检索功能日访问量逾万人次定期更新，维护极好

第三十三页，共118页。第三十四页，共118页。第三十五页，共118页。2.生物医学重点学科导航

（中国高等院校文献保障系统CALIS）将网上的优秀生物医学资源进行分类和整理，建成生物医学重点学科导航系统内容涉及生物医学各领域分工协作，资源共享第三十六页，共118页。第三十七页，共118页。（四）机构网站美国FDA（）：上市/批准信息，处方、申报资料如药理毒理学资料等中国国家药监局（):注册信息，政策法规等第三十八页，共118页。(五）数据库第三十九页，共118页。第四十页，共118页。第四十一页，共118页。限定（LIMITS）字段限定fields出版类型限定(publicationtypes)年龄（ages)系统收入时间（entrezdate):限定时间，定期检索出版日期（publicationdate)是否带文摘（onlyitemswithabstracts）语言：英、法、德、日、俄等Humanoranimal:human,animalgender:femaleormale第四十二页，共118页。第四十三页，共118页。第四十四页，共118页。第四十五页，共118页。第四十六页，共118页。临床试验数据库包括在173个国家进行的近10万项临床试验提供试验目的、受试者条件、实施地、处于临床几期等详细信息第四十七页，共118页。第四十八页，共118页。Toxnet

()第四十九页，共118页。TOXNET毒理数据库资源DerwentDrugFileIRIS综合性危险信息系统

美国环境保护署（EPA）提供的500多种化合物对人类健康的危害鉴定和剂量反应评价方面的信息

HSDB危险物质数据库

潜在有害化合物毒理学事实型数据，包括人类和动物有害物质接触、安全与处理方法、环境灾难等

CCRIS化学致癌研究信息系统

8000多种化合物对致癌、致突变、促进或抑制肿瘤生长的试验结果

GENE-TOX遗传毒理学数据库

3000多种化学物质的遗传毒理学试验数据TOXLINE毒理学文献数据库毒理学书目型数据库，内容为药物和其他化学物质在生化、药理、生理及毒理学方面的作用

DART/ETIC发育与生殖毒理学和环境致畸信息中心

提供畸形学、发育与生殖毒理学方面的书目数据

TRI有毒化合物排放目录

ChemIDplus化学物质信息数据库

35万多条化学物质和10万多个分子结构信息的化学物质词典，并可链接其它含有化学物质的信息

HSDBStructures危险物质结构数据库

提供潜在危险物质的二维和三维结构信息

NCI-3D化学物质二维和三维结构

提供由美国癌症研究所编纂的抗肿瘤化学物质的二维和三维结构信息

第五十页，共118页。Ensemble数据库提供近20万种生物活性化合物包括化学结构在内的必要信息，如分子式，化学名，公司代码，通用名，商标，注册信息，药物活性和作用机制，研发阶段，CAS登记号，专利信息等，包括数据、文本和图象资料。每月更新一次，每年增加约1万种新化合物。覆盖了全球药物各阶段开发和市场方面的信息。可从药品专利开始，再通过其临床前和临床研究资料，注册信息、市场概况及其他相关信息来跟踪药物。

第五十一页，共118页。Pharmaprojects（1）-特点智能型数据库，包括1980年以来3万多个处于开发阶段的药物，每月都有1000多个药物的更新信息。监控着国际上处于开发阶段的每一个重要新药，跟踪着国际上处于研发活跃阶段的候选药物，可为客户提供产品开发的全面资料。是跟踪国际新药开发动态、寻找新药机会及市场合作开发伙伴和分析市场收益的有用工具。第五十二页，共118页。Pharmaprojects（2）-包含信息主要信息：包括药物名称、开发阶段、各国上市情况。原始开发公司、开发状况、上市国家。药效分类、药理作用、适应证描述、给药途径等药理依据。化学依据：包括化合物代号、CA注册号、分子量、分子式、化学名、结构式。专利情况。该药物开发过程中的重大事件。药物开发的进度、市场评测。该药物的市场和临床前以及临床情况。世界1300余家主要制药和生物技术企业的相关文件。第五十三页，共118页。中医药信息数据库

现代文献数据库居多。中医药古代文献的信息资源开发不足。大部分可以实现网上查询、资源共享。第五十四页，共118页。多媒体数据库《中药学图像和文字数据库》（四川省中药研究所）《中草药化学成分的晶体结构图谱库系统》（医学科学院药物研究所）《中医药珍善本古籍多媒体数据库》（科技部）第五十五页，共118页。中医药信息评价应用价值、方剂的组成规律和原则等对其时效性进行初步评价；信息传播是否久远、对医学理论体系的影响力；信息的来源、载体、著者，如中医药古籍版本；一般为统治者编辑，流传较广的如《古今图书集成医部全录》、《永乐大典医药集》、《中国分省医籍考》学术价值较大。要具备从时间、空间、完整性、可靠性、先进性等方面考察和评价中医药信息的能力。第五十六页，共118页。中国中医药数据库检索系统中国中医科学院中医药信息研究所1984年开始研建数据库总数40余个，数据总量约110万条，包括中医药期刊文献数据库、疾病诊疗数据库、各类中药数据库、方剂数据库、民族医药数据库、药品企业数据库、各类国家标准数据库（中医证候治则疾病、药物、方剂）

第五十七页，共118页。中国中医药期刊文献数据库1949至今的有关中医药学内容的期刊文献信息，含18个专题数据库，与中药研发密切相关的如：

中药文献数据库；中药化学文献数据库；中药药理学文献数据库；中药不良反应和毒理学文献数据库；肿瘤文献数据库；中医老年病文献数据库；中医名医经验数据库；中医临床试验文献数据库；中医药学历史文献数据库；中医药研究课题数据库；中医药学文摘数据库；艾滋病中药数据库；中医诊治骨折外伤文献数据库；中医疫病文献数据库；中医诊治褥疮文献数据库第五十八页，共118页。其他中医药数据库（I）中国中药对数据库（事实型）中国中药化学成分数据库少数民族药如：中国藏药数据库，维吾尔药数据库，苗药数据库，傣药数据库，瑶药数据库；中国方剂数据库（文献型）:从古至今的中药方剂方剂现代应用数据库（事实型）第五十九页，共118页。其他中医药数据库（II）-药品类国家药品标准化学药说明书临证用药配伍指南数据库中国藏药药品标准数据库中国中药新药品数据库中药成方制剂标准数据库中药非处方药数据库中国药典数据库(2005版)第六十页，共118页。专利信息的重要性据统计，我国关于中药新药的研发有90％都是重复研究；国家专利局每年大约2000多件会被漏检的外国专利、各国期刊论文，以及其他事实和规则予以推翻，最终被宣告无效。很多个人和企业信息不通，无法获得全面可靠的专利信息，盲目开发或引进，造成了大量的资源浪费。事前的专利分析和专利检索是避免重复研究的最好方法。第六十一页，共118页。专利检索国家知识产权局（）第六十二页，共118页。国内专利文献

能提供专利全文的网站能提供专利文摘的网站第六十三页，共118页。国外专利文献能提供专利全文的网站

美国专利检索欧洲专利

.其它国外专利网站可参考知识产权网站的链接第六十四页，共118页。上述数据库的优缺点优点：免费缺点：基本都是未经加工的原始专利信息，检索功能相对简单，难以查全，尤其是中国专利。因为药物名称的特殊性导致了关键词检索的局限性。第六十五页，共118页。收费的专利数据库（I）IMSpatentfoucus：IMS公司监控和收集全球的药物专利的信息而编译的数据库，是经过加工了的专利数据库。INPADOC：国际专利文献DerwentInnovationsIndex（简称DII）：Derwent专利数据库，每周更新，提供经情报专家重新编写、标引的全球专利信息第六十六页，共118页。收费的专利数据库（II）-世界传统药物专利数据库收录了1985年以来世界22个国家和组织的以中药为核心的所有天然药物及其提取物方面的专利信息；数据经深度加工，标引专利信息11万条、共含同族专利20余万条；具备较高的查全与查准率。是世界上收录天然药物专利最全的数据库。第六十七页，共118页。前述收费专利数据库的特点均经过情报专家的标引和整理，是经过系统加工了的专利信息；适合专业化的检索要求易于查全、查准。第六十八页，共118页。实例-国外药物在国内的专利检索策略【Dialog收费资源】IMSPatentFocus数据库（找到目标药物的专利）INPADOC同族专利群（找全目标药物的专利）国内专利Derwent专利（筛选和分析）。

优点：能够查全缺点：费用较高

第六十九页，共118页。辛伐他汀MERCK、先灵保雅等多家企业拥有专利权，国内某企业具有该药物在烷基化过程中的交叉许可。通过EPO查不到关于辛伐他汀完整的“同族专利群”。通过CA＋DERWENT＋Pharmaproject＋Ensemble可以查全相关专利，一般不会漏检。CA或scifind（国图有），可查化合物的基础专利；Pharmaprojec（协和图书馆拥有）可以直接给出一些基础专利和主要制剂或是适应症方面的专利，但是不全；ensemble可以查到其收录的化合物药物的相关专利，相对应的基础化合物专利，主要制剂专利，适应症专利等等。最后再利用derwent根据化合物的基础专利再次重新查找其同族相关专利。

第七十页，共118页。国内网上标准信息资源

中国标准服务万方数据库：标准库

中国质量信息网第七十一页，共118页。第七十二页，共118页。国外网上标准化组织及其标准信息资源美国食品与药品管理局（FDA)U.S.FoodandDruyAdministration国际标准化组织(ISO)InternationalOrganizationforStandardization美国国家标准学会（ANSI）AmericanNationalStandardsInstitute

第七十三页，共118页。第七十四页，共118页。全文获取与原文提供第七十五页，共118页。免费期刊

第七十六页，共118页。

首页列出期刊名称、影响因子、滞后时间，1709种只提供到期刊主页的链接，不能检索PROCEEDINGSOFTHENATIONALACADEMYOFSCIENCES－1月MOLECULARBIOLOGYOFTHECELL－2月GENETICS－3月NEWENGLANDJOURNALOFMEDICNEJOURNALOFCELLBIOLOGY第七十七页，共118页。第七十八页，共118页。

第七十九页，共118页。

美国NIH于2000年建立的数字化生命科学期刊全文数据库，向全球免费开放；收录400多种医学生物学全文期刊，数量还在不断增加，提供全文200万篇；滞后时间0到2个月，多数为即期期刊，少部分延迟至3年，所有论文在PubMed中都有相应的记录，点击即可获得全文点击“期刊名”可看最新一期的目录点击‘ArchiveStartsWith’栏可阅读以往各期的内容有全文检索功能

第八十页，共118页。第八十一页，共118页。

第八十二页，共118页。第八十三页，共118页。第八十四页，共118页。

BioMedCentral（BMC）出版经过专家精审的医学、生物学各个研究领域的论文，分为生物学杂志和医学杂志两大类，约70种提供全字段、机构、作者、期刊名、卷、期、页、出版日期、文本词、题名等检索入口全部为即期期刊注册用户可通过网络向BMC提交论文可保存课题的检索史获得BMC提供的该课题的自动更新信息

第八十五页，共118页。斯坦福大学图书馆开发和维护，拥有1329种期刊、图书、工具书等；除印刷本的原文扫描，还有作者、文章和引文之间的链接漫游、高分辨率图像和多媒体具有可交互性及高级检索性能作者、关键词两种检索入口列出按字母顺序和专业分类编排的免费期刊名称及滞后时间，点击“info”可看到每种期刊的详细信息，如网址，从何时起提供网络版全文，是否免费等，有的直接链接到期刊主页

第八十六页，共118页。第八十七页，共118页。Google学术搜索（）可以从一个位置搜索众多学科和资料来源：来自学术著作出版商、专业性社团、预印本、各大学及其他学术组织的经同行评论的文章、论文、图书、摘要和文章。检索结果按相关性排序站在巨人的肩膀上第八十八页，共118页。中文全文数据库CNKI：万方数据：特色：百余种中华系列期刊维普资讯CBMDISC：中国生物医学期刊数据库，数据库结构和检索原理与PUBMED相同，1994年后的文献基本都有全文，是检索中文生物医学、药学文献的首选。第八十九页，共118页。国家科技图书文献中心：第九十页，共118页。NSTL虚拟的科技文献信息服务机构由中国科学院图书馆、工程技术图书馆（中国科学技术信息研究所、机械工业信息研究院、冶金工业信息标准研究院、中国化工信息中心）、农科院图书馆、中国医学科学院图书馆组成。宗旨：根据国家科技发展需要，面向全国开展科技文献信息服务。文献传递：2个工作日第九十一页，共118页。第九十二页，共118页。文献检索与原文提供第九十三页，共118页。第九十四页，共118页。第九十五页，共118页。第九十六页，共118页。第九十七页，共118页。第九十八页，共118页。第九十九页，共118