病毒学医学知识专题讲座专家讲座_第1页
病毒学医学知识专题讲座专家讲座_第2页
病毒学医学知识专题讲座专家讲座_第3页
病毒学医学知识专题讲座专家讲座_第4页
病毒学医学知识专题讲座专家讲座_第5页
已阅读5页,还剩99页未读 继续免费阅读

下载本文档

版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领

文档简介

病毒學

主講邱樂泉

Lqqiu@病毒學医学知识专题讲座第1页教學安排

章節

課時第一章緒論2第二章病毒命名與分類1第三章病毒學研究方法1第四章病毒結構2第五章病毒感染性繁殖4第六章病毒遺傳變異

2病毒學医学知识专题讲座第2页教學安排

章節課時第七章病毒起源與進化

2第八章病毒與腫瘤

4第九章人類與動物病毒

4第十章昆蟲病毒與生物防治2第十一章植物病毒與植物病毒病2第十二章病毒基因工程2病毒學医学知识专题讲座第3页參考書:《普通病毒學》謝天恩,胡志紅主編,科學出版社,年《動物病毒學》(第二版)殷震主編,科學出版社,1997年《分子病毒學》徐耀先,周曉峰等編著,湖北科技出版社,年4.MolecularVirology,2ndedition,DR.Harper,1999

病毒學医学知识专题讲座第4页考评方式考試方法:閉卷考試成績評定:平時成績20%

小論文20%

期終考試60%病毒學医学知识专题讲座第5页1.專業課,為《微生物學》等課程深入。2.掌握病毒學基礎知識、基本理論和發展方向。3.方法:廣泛閱讀,跟蹤進展,開拓視野(網路、期刊)。學習目标和方法病毒學医学知识专题讲座第6页

同人類爭奪地球統治權唯一競爭者就是病毒

——JoshuaLederberg

1958年諾貝爾獎獲得者

病毒學医学知识专题讲座第7页第一章緒論1.1病毒發現與研究歷史1.2病毒學研究物件及任務1.3病毒學資源1.4病毒學發展趨勢病毒學医学知识专题讲座第8页1.1病毒發現與研究歷史一、經驗時期病毒病由來已久

人類病毒:西元十世紀宋真宗時代接種人痘預防天花

1796英國醫生琴納(Jenner)接種牛痘

動物病毒:法國人巴斯德(Pasteur)在

1884年發明瞭狂犬疫苗古埃及石刻浮雕巴斯德(1822-1895)法國著名科學家發明巴氏消毒法、1884年研製成功狂犬疫苗病毒學医学知识专题讲座第9页昆蟲病毒:十二世紀中葉我國《農書》已经有關於家蠶“高節”、“腳腫”等病症記載植物病毒:鬱金香碎色病來源於生產實踐,不瞭解病毒本質9朵感染病毒鬱金香病毒學医学知识专题讲座第10页二、發現時期病毒發現與發現者1886年AdolfMayer發現煙草花葉病,認為可能是細菌病。1892年Ivanovski發現花葉病葉汁經過細菌濾器過濾也仍含有傳染性質,認為由細菌毒素引发1898年

Beijerinck命名Virus,認為這種侵染性物質要比通常細菌小,真正發現病毒存在。1.1病毒發現與研究歷史伊萬諾夫斯基貝傑林克開創了病毒學獨立發展歷程病毒學医学知识专题讲座第11页1.1病毒發現與研究歷史三、病毒學發展歷程

(一)病毒病害病原研究階段自病毒發現直到上個世紀30年代初,病毒學研究主要集中在:1.分離和鑒定引发各種病毒性疾病病毒2.病毒對疾體所引发特異性病理效應3.病毒傳播方式和感染宿主範圍4.各種理化因數對病毒感染影響等方面病毒學医学知识专题讲座第12页1898年德國細菌學家勒夫勒和弗羅施(Loeffler和Frosch)證實了口蹄疫病毒(Foot-and-mouthdiseasevirus)存在。1911年,勞斯(Rous)發現了引发雞惡性腫瘤勞斯肉瘤病毒(Roussarcomavirus,RSV)。1915-1917年,托特和代列爾(Twort和d′Herelle)分別發現了噬菌體。相繼發現流感、骨髓灰質炎、幾種腦炎、狂犬病、兔粘液瘤、馬鈴薯花葉病、卷葉病、和條斑病、黃瓜花葉病、小麥花葉病病毒病等。在機體水準上研究了病毒感染症狀、傳播途徑、傳播介體以及病毒繁殖特徵。主要貢獻勞斯(1879-1970)美國著名病毒學家,證明動物癌症由病毒引发,1966年獲諾貝爾生理學醫學獎病毒學医学知识专题讲座第13页1899年古巴流行黃熱病,細菌學家裡德(Reed)證明是伊蚊傳播。1929年證明鬱金香碎色病是蚜蟲傳播。發現一些非常有趣病毒生物學現象:病毒變異:一種病毒通過變異,產生致病力強弱不等毒株。幹擾現象:同一種病毒不一样毒株彼此間有拮抗。病毒與免疫:還有些人發現把病植株汁液注入到動物體內後,動物血清和病汁液起特異反應。對病毒本質認識還很膚淺,認為病毒是一種與細菌類似病原體,所不一样僅在於病毒必須在生活細胞內才能繁殖,能夠通過細菌濾器。稱之為“超顯微濾過性病毒”。主要貢獻病毒學医学知识专题讲座第14页1.1病毒發現與研究歷史三、病毒學發展歷程

(二)病毒化學和結構研究階段

1.確定病毒化學組分1935年,美國生化學家斯坦利(Stanley)提純了煙草花葉病毒(TMV),1946年獲得諾貝爾獎。Stanley研究論文1953年發表在Science雜誌上,他在論文中寫道:“煙草花葉病毒是一種含有自我催化能力蛋白質,它增殖需要活體細胞存在”。斯坦利(1904-1971)美國著名化學家1955年,Scaffer和Schwerdt成功地結晶了脊髓灰質炎病毒,它是第一個被結晶出來動物病毒。病毒學医学知识专题讲座第15页TMV是核蛋白1936年,Bawden和Pirie等在純化TMV中發現了含磷和糖類組分,它們以核糖核酸形式存在,通過熱變化,這種核酸能够從病毒粒子中釋放出來,這一發現也被Stanley很快證實,Stanley及其同事證實幾種不一样植物病毒核酸也能從核蛋白形式中被分離出來。TMV結晶及其化學本質發現是對醫學和生物科學巨大貢獻,它不僅引導人們從分子水準去認識生命本質,而且為分子病毒學和分子生物學誕生奠定了基礎。病毒學医学知识专题讲座第16页2、電子顯微鏡應用(二)病毒化學和結構研究階段1931年,由M·克諾爾與E·魯斯卡在柏林工學院製造出第一台透射電子顯微鏡。由於病毒只有在電子顯微鏡下才能被觀察到,電子顯微鏡發明促進了病毒學建立。獲得1986年諾貝爾物理獎。

電子顯微鏡三、病毒學發展歷程

病毒學医学知识专题讲座第17页TMVTYMVPhage1939年,G.A.Kansche在電鏡下直接觀察到了TMV,是一種直徑為1.5nm,長為300nm長杆狀顆粒;番茄黃化花葉病毒(Tomatoyellowmosaicvirus,TYMV)顆粒為球形,直徑為25nm。d′Herelle噬菌體最初電鏡照片曾引发很大轟動,僅為10nm病毒學医学知识专题讲座第18页其它主要貢獻分離鑒定了近百種病毒在機體水準上研究了病毒繁殖、發病機理和免疫反應等認為病毒學只是微生物學一個分支對病毒化學本質瞭解也較為膚淺还未形成獨立學科,还有很大爭論,眾說紛紜。1934年M.Schlesinger獲得了純化噬菌體1938年W.J.Elford測定了各種病毒顆粒大小等採用敏感動物(如小白鼠)或動物胚胎(如雞胚)來研究病毒病毒學医学知识专题讲座第19页1.1病毒發現與研究歷史三、病毒學發展歷程

(三)病毒研究細胞水準時期本世紀40年代至60年代1、利用大腸桿菌研究噬菌體感染過程取得了快速發展。

M.Delbruck和A.D.Hershey等領導“噬菌體小組”

1940年M.Delbruck闡明瞭噬菌體複製週期

1950年A.Lwoff揭示了溶原性噬菌體誘導原理

1952年A.D.Hershey證明瞭噬菌體DNA感染性

1952年N.D.Zinder發現了噬菌體轉導現象

1952年E.Wollman發現了溶原性噬菌體M.Delbruck1969年諾貝爾生理學或醫學獎病毒學医学知识专题讲座第20页1.1病毒發現與研究歷史三、病毒學發展歷程

(三)病毒研究細胞水準時期2、組織培養技術開始應用於動物病毒研究

1943年,黃禎祥利用雞胚組織塊在試管內進行病毒傳代、定量滴定及中和試驗。

1958年,高尚蔭在國際病毒學研討會上宣讀《培養膿細胞組織培養方法研究》昆蟲病毒

1949年,J.J.Enders利用單層細胞培養繁殖脊髓灰質炎病毒取得成功,1954年獲得諾貝爾獎逐步形成了一門獨立學科對病毒化學本質有了更清楚認識病毒學医学知识专题讲座第21页1.1病毒發現與研究歷史三、病毒學發展歷程

(四)分子病毒學研究時期1953年,Watson和Crick建立了DNA雙螺旋結構理論1962年,D.L.D.Casfar闡明瞭許多病毒二十面體結構1962年,D.Nathans成功地進行了噬菌體RNA體外翻譯1965年,S.Spiegelman成功地在體外複製出Qβ噬菌體RNA1967年,M.Goulian成功地體外複製ΦX174噬菌體1967年,T.O.Diener發現了馬鈴薯紡錘形塊莖病類病毒(Viroids)1968年,P.H.Duesberg發現流感病毒多節段RNA基因組1970年,P.H.Duelerg發現Rous肉瘤病毒含有癌基因v-src1970年,H.M.Temin和D.Baltimor分別發現了病毒逆轉錄酶病毒學医学知识专题讲座第22页1977年,英國劍橋大學Sanger完成了ΦX174-DNA全部序列測定1977年,L.T.Chow闡明瞭腺病毒轉錄過程中mRNA拼接現象1978年,W.Fiers和V.B.Reddy測定了SV40-DNA一級結構由5224個堿基對組成。SV40是第一個全部核苷酸序列被搞清楚真核病毒1981年,D.K.Kleid等利用重組DNA技術製備出口蹄疫病毒疫苗1982年,J.Summers等發現乙型肝炎病毒DNA複製中有逆轉錄過程1982年,B.Moss和E.Paoletti用痘苗病毒作為載體表達外源基因1983年,Montagnier和R.C.Gallo分別分離到與AIDS相關人類逆轉錄病毒(HIV);病毒學医学知识专题讲座第23页

1993年,美國科學家K.Mullis由於發明瞭PCR儀而與第一個設計基因定點突變Smith共用諾貝爾化學獎。

1993年,Roberts和Sharp發現斷裂基因

1997年,美國加利福尼亞大學神經病學和病毒學教授S.Prusiner由於發現了羊瘙癢病致病因數是朊病毒(prion),以及提出了瘋牛病、Creutz-feldt-Jakob氏病、Kuru病等腦退化性疾病是由朊病毒引发理論,而獲得了諾貝爾醫學獎。巴爾摩(1938-)美國著名細胞生物學、免疫學和病毒學家,發現了逆轉錄酶,獲1975年諾貝爾生理學醫學獎桑格(1918-)英國著名化學家,兩次榮獲諾貝爾化學獎,確定了胰島素氨基酸排序和噬菌體(φχ174)DNA序列病毒學医学知识专题讲座第24页

病毒學經過上述四個時期發展,逐漸形成和成熟起來,隨著病毒基因組複製、基因表達調控原理、病毒與宿主細胞相互作用規律,病毒感染和致病分子機制揭示,以及分子病毒學在技術上革新和進步,它將為人類克服和戰勝病毒病做出貢獻。病毒學医学知识专题讲座第25页1.2病毒學研究物件及任務(一)什麼是病毒一、病毒學研究物件病毒(virus)是指那些在化學組成和增殖方式上獨具特點,只能在宿主細胞內進行複製微生物或遺傳單位。(P8)超顯微、沒有細胞結構、專性活細胞內寄生病毒概念在不斷發展,至今尚難以給出準確定義濾過性可結晶蛋白體核蛋白體類病毒朊病毒假病毒、缺点病毒反轉子(retron)病毒學医学知识专题讲座第26页1.2病毒學研究物件及任務(二)病毒性質兩重性(P16-18)

1.生命形式兩重性存在形式:化學分子與細胞內寄生結晶體與非結晶體顆粒體形式與基因形式一、病毒學研究物件病毒學医学知识专题讲座第27页雜種病毒與純種病毒2.結構和功效兩重性標準病毒與缺点病毒假病毒與真病毒缺点病毒:裝配不完全病毒(缺損病毒,defectivevirus,Di顆粒)標准病毒:產生缺点病毒原親代病毒假型病毒:一種病毒核酸被另一病毒外殼包裹假病毒:細胞DNA被病毒外殼包裹真病毒:一種病毒外殼包裹自己核酸雜種病毒:在混合感染中,病毒外殼包裹兩種病毒核酸。病毒學医学知识专题讲座第28页

致病性與非致病性急性感染與慢性感染3.病理學兩重性過客病毒:某一病毒對宿主無致病性,則該病毒稱為此宿主過客病毒

病原病毒:某一病毒對宿主有致病性,則該病毒稱為此宿主病原病毒

病毒學医学知识专题讲座第29页一、病毒學研究物件(三)病毒類群

1.原核病毒細菌病毒:如大腸桿菌T4噬菌體其它原核病毒:放線菌、藻類衛星病毒:如丁肝病毒(HDV),需HBV作輔助病毒,常與HBV聯合感染。

2.真核病毒植物病毒:TMV

脊椎動物病毒:人類病毒、禽、畜病毒無脊椎動物病毒:昆蟲病毒病毒學医学知识专题讲座第30页二、病毒學研究任務1.2病毒學研究物件及任務1.防治和控制疾病2.基礎理論研究:生命起源與進化、認識生命本質3.利用病毒造福人類:生物防治、病毒基因工程病毒學医学知识专题讲座第31页1.2病毒學研究物件及任務三、病毒學研究分支學科普通病毒學醫學病毒學昆蟲病毒學獸醫病毒學昆蟲病毒學植物病毒學細菌病毒學腫瘤病毒學分子病毒學環境病毒學病毒學医学知识专题讲座第32页1.3病毒學資源外文期刊:JVIROLOGY5.241REVMEDVIROLOGY5.229VIROLOGY3.363JGENVIROLOGY

3.300JMEDVIROLOGY2.629JVIROLOGICALMETHODS1.938INTERVIROLOGY1.441汉字期刊:病毒學報中國病毒學實驗和臨床病毒學雜誌一、主要期刊病毒學医学知识专题讲座第33页1.3病毒學資源二、主要機構國外研究機構:美國國家衛生研究院(NIH)全美傳染病軍事研究院(馬裡蘭州)德國RobertKoch研究所德國馬堡流感研究協會法國巴斯德研究所國內研究機構:預防醫學科學院中國軍事醫學科學院中科院武漢病毒所中國科學院微生物研究所中國疾病預防控制中心武漢大學浙江大學中山大學協和醫科大學解放軍長春農牧大學病毒學医学知识专题讲座第34页1.3病毒學資源//vlmicro/vl_virol.htm

/~zxiong/

三、網路資源中國期刊網、萬方資料/

(科學)

/microbiology/index.htm(微生物教學輔助網站)病毒學医学知识专题讲座第35页1.3病毒學資源四、著名病毒學家特明(1935~1994)美國病毒學家巴爾摩(1938~)美國病毒學家、分子生物學家勞斯(1879~1970)美國醫學家、病毒學家,發現勞斯肉瘤病毒,1966年獲諾貝爾獎。

1970年,特明和巴爾摩發現了“逆轉錄酶”,闡明瞭腫瘤病毒與細胞遺傳物質相互作用,並揭示了生物遺傳中由RNA形成DNA過程,是分子遺傳學重大突破。他們於1975年獲獎。病毒學医学知识专题讲座第36页1.3病毒學資源四、著名病毒學家杜爾貝科(1914~)義大利裔美國病毒學家,1958年,杜爾貝科發現了病毒導致正常細胞轉化為癌細胞過程;於1975年獲獎。

(左)瓦慕斯(1940~)美國微生物學家、病毒學家

(右)畢曉普(1936~)美國生物化學家、病毒學家他們在70年代發現動物致癌基因不是來自病毒,而是來自動物體內正常細胞內所存在一種基因──原癌基因。於1989年獲獎。病毒學医学知识专题讲座第37页1.3病毒學資源四、著名病毒學家何大一,洛克菲勒艾倫·戴蒙德愛滋病研究中心主任。發明著名雞尾酒療法.賴明昭,美國南加州大學醫學院教授,被譽為冠狀病毒研究之父。普魯西納(1942~)美國神經學家,70至80年代發現了一種比病毒還小、不存在核酸微生物致病因子──朊病毒,於1997年獲獎。病毒學医学知识专题讲座第38页1.3病毒學資源四、著名病毒學家黃禎祥(1910-1987)中國科學院院士,病毒學家從事醫學病毒研究高尚蔭(1909-1989)中國科學院院士,病毒學家從事煙草花葉病毒、流感病毒、昆蟲病毒等研究湯飛凡(1897-1958)第一個發現沙眼衣原體,早期研究研究皰疹、牛痘等病毒病毒學医学知识专题讲座第39页毛江森院士(1934-)浙江醫學科學院研究員、院長,70年代末分離出甲型肝炎病毒(HAV),培養出甲肝減毒活疫苗毒種(H2減毒株)候雲德,中國工程院副院長,工程院院士,分子病毒學家,在幹擾素及痘苗病毒基因結構與功效研究方面含有突出建樹田波(1931-)中國科學院院士,中國微生物研究所、武漢大學教授。從事分子病毒學和抗病毒和類病毒病基因工程植物研究。著名病毒學家病毒學医学知识专题讲座第40页朱既明(1917年-),病毒學家,中科院院士,

中國醫學科學院病毒研究所,從事醫學病毒研究(流感病毒)曾毅(1929-),中國科學院院士。中國預防醫學科學院院長。病毒學家。主要研究EB病毒與HIV,1987年分離出第一個中國HIV-1毒株。裘維藩(1912-)中國科學院院士,植物病理學家,北京農業大學教授,完成中國第一部《植物病毒學》專著著名病毒學家病毒學医学知识专题讲座第41页1.4病毒學發展趨勢一、病毒功效基因組學和蛋白質組學研究1.從核酸及蛋白質水準認識病毒,瞭解它們致病機理與診斷防治。2.系統生物學理論建立系統生物學是研究一個生物系統中全部組成成份(基因、mRNA、蛋白質等)構成,以及在特定條件下這些組分間相互關係學科。也就是說,系統生物學不一样於以往實驗生物學——僅關心個別基因和蛋白質,它要研究全部基因、全部蛋白質、組分間全部相互關係。顯然,系統生物學是以整體性研究為特徵一種大科學。

3.新診斷/預防/藥物發展與利用病毒學医学知识专题讲座第42页二、新出現或再現病原微生物特征與診斷、防治

新傳染病不斷出現,近20年來,新增加了30多種新傳染病,如愛滋病、軍團菌病、萊姆病(Lyme)、埃博拉出血熱(Ebola)、拉沙熱(Lassa)、O139型霍亂、致病性大腸桿菌O157∶H7引发出血性腸炎、瘋牛病(克-雅氏病)、病毒性肝炎丙型、丁型、戊型、庚型等等。當今病毒引发疾病占全部傳染病四分之三。狂犬病:傳染病中死亡率最高。有疫苗能够預防。病毒性肝炎:傳染病發病率最高。艾滋病:年全球死亡300萬人,我國預測HIV感染人數以30%速度增加。年達1000萬感染者。全球達4000萬感染者。SARS:5000余人發病,造成大量損失。其它:禽流感殺數百萬頭雞,Nipah病毒殺100萬頭豬。1.4病毒學發展趨勢病毒學医学知识专题讲座第43页近年新出現或再現病毒特點多數為人畜共患病病原,可能由動物傳給人。可能由昆蟲或節肢動物為中間媒介隨交通旅行或工作生活習性改變、環境氣候變化而傳播。所致疾病診斷需作病原學確證1.4病毒學發展趨勢病毒學医学知识专题讲座第44页1.生命起源、變異、毒力改變、進化。2.病毒與宿主相互作用3.腫瘤病毒學1.4病毒學發展趨勢三、病毒分子病理學研究病毒學医学知识专题讲座第45页GAMEISOVER.病毒學医学知识专题讲座第46页病毒學

主講邱樂泉

Lqqiu@病毒學医学知识专题讲座第47页為什麼要對病毒進行分類?

1、系統分類

根據病毒間親緣關係來進行劃分成一定類群→科學名稱→適當描述

2、實用:按照一定分類系統製成份類表,方便對未知病毒進行鑒定。

病毒生命形式獨特征決定其分類複雜性:在性質上毫不相關病毒含有相同形態特徵。含有特殊繁殖方式,主要採用複製方式來完成生長。含有種類繁多核酸類型:比如病毒有DNA病毒或RNA病毒,還分為單、雙鏈,線、環狀,進一步分為侵染性、非侵染性。病毒在生長繁殖中轻易發生變異,產生缺損病毒,假病毒。全部這些現象給病毒分類造成很大困難。第二章病毒分類與命名病毒學医学知识专题讲座第48页

当前已發現病毒種類約4000多種,為了使如此多病毒種類能夠得到科學命名和分類,國際病毒分類委員會(InternationalComitteeonTaxonomyofViruses,ICTV)已提出和屡次修訂了病毒命名和分類原則,並且建立了由目、科(亞科)、屬和種分類階元構成病毒分類系統。病毒學医学知识专题讲座第49页1937年

Levaditi和Lepine就曾根據病毒對組織親和性進行分類。

1948年

Holmes提出根據病毒所引发宿主症狀分類方案。

1950年第五屆國際微生物學會提出了有關病毒分類8項原則。

1963年國際微生物命名委員會病毒分會根據安德魯斯(Andrewes)提出分類建議提出了新8項分類原則:

①核酸類型、結構和分子量;

②病毒粒子形狀和大小;

③病毒粒子結構;

④病毒粒子對乙醚、氯仿等脂溶劑敏感性;

⑤血清學性質和抗原關係;

⑥病毒在細胞培養上繁殖特征;

⑦對除脂溶劑以外理化因數敏感性;

⑧流行病學特徵。一、病毒命名與分類系統進展概況病毒分類和命名大事記病毒學医学知识专题讲座第50页1966年在莫斯科舉行第九屆國際微生物學會上成立了國際病毒命名委員會

(InternationalCommitteeonNomenclatureofViruses,ICNV),並通過了上述新8項分類原則。

1971年

ICNV公佈了關於病毒分類和命名第一次報告,將當時瞭解得比較清楚500多種病毒分為RNA和DNA病毒兩大類,並且分為43個病毒屬。

1973年

ICNV正式更名為國際病毒分類委員會(InternationalCommitteeon

TaxonomyofViruses,ICTV)。

1976年

ICTV公佈了病毒分類和命名第二次報告,將病毒已建立屬(組)

按宿主分為五大類。

1979年公佈了病毒分類和命名第三次報告,並根據病毒核酸類型,包膜有無將病毒分為7大類,總共有53個科(組或群)。病毒分類和命名大事記一、病毒命名與分類系統進展概況病毒學医学知识专题讲座第51页1982年公佈了病毒分類和命名第四次報告,將7大類病毒分為54個科(組)和

5個可能科。同時還提出了22條病毒命名規則和新病毒分類方

案。病毒總數為1372種。1991年

ICTV公佈了病毒和命名第五次報告,將2430種病毒分類73個科(組),比第四次報告增加了19個科(組),並且首次公佈了比科更為高級分類階元,即單分子負鏈RNA病毒目。

1995年

ICTV公佈了病毒分類和命名第六次報告,將現在所知約4000多種病毒

分為49科,11個亞科,164個屬(包含:22個未定科屬),其中植物病毒分類不再採用組、亞組,而統一使用科、屬、種分類階元。

1996年在耶路撒冷第10屆國際病毒大會期間,ICTV對第六次報告作了修改和

補充,確定了38條新病毒分類和命名準則。1997年

ICTV在法國斯特拉斯堡召開常務會議,正式同意病毒分類系統有2個

目,55個科,189個屬(有23個屬分科未定)。一、病毒命名與分類系統進展概況病毒分類和命名大事記病毒學医学知识专题讲座第52页1998年

ICTV在美國加州SanDiego召開了第27次常務會議,會上又增設了1

個目,6個科,26個屬。同時同意了41條新分類和命名規則。

1999年根據“Virustaxanomy-1999”、病毒分類系統達到了3個目,62個科。另外亞病毒感染因數(Subviralagent)下設衛星、類病毒和朊病毒,其中

類病毒分類新設立了2個科,7個屬。

ICTV公佈第七個國際病毒分類報告,植物病毒分類有了非常大進

展,列出15個植物病毒科、73個植物病毒屬,其中已歸科屬有49個,未歸到科屬有24個。年出版《病毒分類:國際病毒分類委員會第八次報告》,超過5450株病毒能够歸類到3個病毒目、73個病毒科、9個病毒亞科、287個病毒屬、1938個病毒種年日本札幌ICTV第九次報告,報告中包含6000多株病毒,分為6個目,87個科,19個亞科,348個屬,2285個種。

当前:分類依據:病毒形態學、理化性質、核酸、蛋白質、脂類、糖類、分子生物學特征(基因序列及序列派生特征等)。主要結果:

6個目,87個科,19個亞科,348個屬。一、病毒命名與分類系統進展概況分類報告發表在《ArchivesofVirology》上病毒學医学知识专题讲座第53页《國際病毒分類委員會第九次報告》(VirusTaxonomy--NinthReportoftheInternationalCommitteeonTaxonomyofViruses)已於最近出版,報告中收錄了中國科學院武漢病毒研究全部關草魚呼腸孤病毒(Grasscarpreovirus,GCRV)研究結果。

病毒學医学知识专题讲座第54页病毒分類許多病毒學家建議病毒分為:

亞界,綱,目,亞目和科等分類階元。不过当前病毒分類體系中僅出現“目”,沒有更高分類階元。所以,現在病毒分類只能是以下圖所表示體系:

綱目科屬種株亞種變種(總科)(亞科)病毒學医学知识专题讲座第55页病毒學医学知识专题讲座第56页病毒學医学知识专题讲座第57页1.病毒命名規則二、病毒分類和命名規則

國際病毒分類系統採用目(order)、科(family)、屬(genus)、種(species),但不是全部病毒科都必須隸屬一個目,在沒有適當目标情況下,科能够是最高病毒分類等級,在科下面允許設立不一样亞科或不設立亞科,病毒分類和命名不恪守優先法則,所用命名應該便於使用和記憶,在設立新分類等級時,不能使用人名命名,上標和下標字元、連字號、斜線、希臘字母在新命名中不能使用,假如縮拼字對這一領域病毒學研究工作者是有意義,而且經過幾個國際病毒研究小組建議,那麼縮拼字命名是能够接收。現有病毒分類名稱只要是有用就應保留,新命名不能與已經承認病毒名稱重複。人工產生病毒和實驗室雜種病毒在分類學上不予考慮。病毒學医学知识专题讲座第58页

病毒種定義和命名

病毒“種”是指構成一個複制譜系(replicatinglineage)

、佔據一個特定小生境(ecologicalniche)

、含有多個分類特徵病毒。病毒種是一個群體;這就是說病毒種分類和命名不是單純由某一個分類特徵、而是由多原則分類特徵決定,包含病毒基因組組成,病毒顆粒形態結構、生理生化特征和血清學性質等;

病毒種一個複製譜系則強調了病毒種系統進化特征,即現今全部病毒種可能起源於共同病毒祖先;

病毒種所佔有小生境是指某種病毒特定生物學特征、地理分佈、宿主範圍、媒介嗜親性、致病機理等。病毒學医学知识专题讲座第59页

不採用雙名法和優先法則病毒種命名由幾個有實際意義片語成,但不應該只是由宿主名加“virus”構成。:噬菌體:由於寄主、病症類似,惯用字母,數位表示, 例:噬菌體T2、T4、T6等

植物和昆蟲病毒:寄主+病症+Virus:例:Tobaccomosaicvirus

(煙草花葉病毒)

Bombyxmorinuclearpolyhedrosisvirus(家蠶核型多角體病毒)病毒種定義和命名病毒學医学知识专题讲座第60页動物病毒:多種類型

寄主+病毒類型(+數位):

humanherpesvirus8——人皰疹病毒8型

寄主+病症+virus(+數字):

humanimmunodeficientvirus-1——人免疫缺点病毒

發現者+virus(現已取消,但已经有可沿用):

Eppestein-BarrVirus

——EB病毒

發現地+virus:

Nipahvirus——尼帕病毒病毒學医学知识专题讲座第61页

寄主症狀:麻疹病毒、口蹄疫病毒

感染寄主部位:鼻病毒、腺病毒

自然傳播方式:呼吸道病毒、腸道病毒

寄主種類:野兔痘病毒、馬傳染性貧血病毒

發現者姓名:勞斯氏肉瘤病毒、馬雷克氏病毒

發生或發現地點:野村病毒、瑪律堡病毒

例:動物病毒命名病毒學医学知识专题讲座第62页病毒名稱用斜體書寫,首字母大寫現共有已定名病毒6000餘種暫定種(tentativespecies):當ICTV不能必定某病毒分類地位時,該病毒能够作為暫定種列入適宜屬和科是病毒分類中一個特點暫定種不用斜體,第一個字母採用大寫。病毒種定義和命名病毒學医学知识专题讲座第63页

病毒屬是一群含有一些共同特徵種。其屬名詞尾“virus”,但在設立一個新病毒屬時必需有一個同時被承認代表種(typespecies)。普通而言,病毒顆粒形態、基因組組成、複製方式、病毒結構蛋白和非結構蛋白數量和大小,往往都能够作為病毒科、屬命名依據。病毒屬命名病毒學医学知识专题讲座第64页

1.病毒科是一群含有一些共同特徵屬,科名詞尾為“viridae”

2.还未將全部病毒科都歸屬入某一個“目”

3.“科”下面能够設立或不設立亞科。在沒有適當目标情況下,科能够是最高病毒分類等級。亞科名詞尾為“virinae”4.現共有近87個科,其中多數並不屬於已经有6個目.5.病毒科確定:病毒顆粒形態/基因組組成、結構/複製方式等。病毒科命名病毒學医学知识专题讲座第65页

病毒目:是当前最高分類階元病毒目是一群含有一些共同特徵科,目名詞尾為“virales”。病毒目标確定:病毒基因組核酸類型(DNA/RNA)、基因組單雙鏈、逆轉錄過程和病毒基因組極性(正鏈/負鏈)。現共有三個病毒目:有尾噬菌體目,單分子負鏈RNA病毒目,成套病毒目病毒目标命名病毒學医学知识专题讲座第66页例:目

Mononegavirales

(負單鏈RNA病毒目)Caudovirales(有尾噬菌體目)科

Caulimoviridae(花椰菜病毒科)Myoviridae(肌尾噬菌體科)亞科

–virinae

Caulimovirus(花椰菜病毒屬)T4-likeviruses(T4噬菌體屬)種

Tobacco

mosaic

virus/TobamovirusEnterobacteriaphageT4(煙草花葉病毒)(腸桿菌T4噬菌體)*无须使用全部分類等級;種為基本分類單位。病毒學医学知识专题讲座第67页1998年3月ICTV在第27次常務會上,對病毒種名書寫規則又重新作了修訂

病毒目、科、亞科、屬接收名(acceptedname)一律用斜體列印,名稱第一個字母要大寫。

種名用斜體列印,第一個詞首字母要大寫,除了是專有名詞(propernoun)外,其它詞首字母一律大寫。

在正式使用場合,分類階元名稱應放在分類階元術語前。如,各分類單元正式描述是…Reovirideae(科),…Phytoreovirus(屬),…woundtumorvirus(種)等二、病毒分類和命名規則

2.病毒名稱書寫規則病毒學医学知识专题讲座第68页例:Avianinfluenzavirus,AIVOrthomyxoviridae正粘病毒科Influenzavirus流感病毒屬按核蛋白和基質蛋白抗原性不一样,流感病毒被分為甲(A)、乙(B)和丙(C)三個血清型A:人、豬、馬、禽類、海豹等B:人C:人、豬病毒學医学知识专题讲座第69页各型流感病毒又根據其表面血凝素及神經氨酸酶抗原性不一样再分為若干亞型。A型流感病毒因其表面蛋白HA和NA抗原性不一样而被分為16個不一样HA亞型(H1~H16)和10個不一样NA亞型(N1~N10)感染人禽流感病毒亞型主要為H5N1、H9N2、H7N7,其中感染H5N1患者病情重,病死率高病毒學医学知识专题讲座第70页SARSsevereacuterespiratorysyndromecoronavirus,SARSCoV,嚴重急性呼吸系統綜合征冠狀病毒

屬於巢狀(模式)病毒目(Order:Nidovirales)、冠狀病毒科(Family:Coronaviridae)、冠狀病毒屬(Genus:Coronavirus)。正義單鏈RNA病毒。在形態學上最顯著特徵是包膜(envelope)外有棒狀子粒,狀如王冠病毒學医学知识专题讲座第71页1.目、科、亞科、屬和種名均應寫成斜體

2.目、科、亞科、屬第一個字母應大寫

3.種第一單詞之第一字母應大寫,如遇專有名詞,則該名詞亦應大寫,如:Cassava

African

mosaic

virus

4.暫定種无须用斜體,但第一單詞第一字母要大寫

5.形容某物或指物實體,無需斜體,首字也不大寫,如:the

tobacco

mosaic

virus

polymerase,

particle

of

potato

virus

Y

病毒學医学知识专题讲座第72页

類病毒種詞尾是“viroid”,屬詞尾為“-viroid”,亞科詞尾是“-viroinae”(只用於需要這一分類階元時),科詞尾是“-viroidae”。

逆轉座子(retrotransposons)在分類和命名中被考慮作為病毒。

衛星和朊病毒不是按病毒分類,而是採用任意分類,並且這種任意分類對專門領域研究工作者是有用。3.

亞病毒感染因數規則病毒學医学知识专题讲座第73页

穩定性是指病毒名稱及其隸屬關係一旦確定下來,就應該盡可能保留。

實用性是指病毒分類體制應該對病毒學研究領域是有用。

認可性是指病毒分類階元和名稱應該為病毒學研究者樂意接收和使用,所以,認可性也是實用性必定結果。

靈活性是指病毒分類階元能够依據一些新發現而進行重新修訂和再確定。三、病毒分類原理及其依據原理:強調其分類和命名穩定性、實用性、認可性和靈活性。病毒學医学知识专题讲座第74页病毒粒子特征:

①病毒形態:如大小、形狀、包膜和包膜突起有無,衣殼結構及其對稱性

②病毒生理生化和物理性質:如分子量,沉降係數,浮力密度,病毒粒子在不一样pH、溫度、Mg2+、Mn2+、變性劑、輻射中穩定性③病毒基因組:如基因組大小、核酸類型、單雙鏈、線狀或環狀,正負鏈,G+C所占百分比、核苷酸序列等依據:主要以病毒粒子特征、抗原性質和病毒生物學特征等作為依據。三、病毒分類原理及其依據病毒分類與其它生物有明顯不一样。病毒是“分子生物”,其分類很大程度上依賴於生物化學和生物物理性質病毒學医学知识专题讲座第75页④病毒蛋白:如結構蛋白和非結構蛋白數量,大小以及功效和活性,氨基酸序列等;

⑤病毒脂類含量和特征;

⑥碳水化合物含量和特征;

⑦病毒基因組組成和複製:基因組結構、複寫原則、開放閱讀框數量和位置、轉錄轉譯特征、轉譯後加工、病毒蛋白聚集和病毒組裝位置,病毒成熟與釋放部位和特征

病毒抗原性質:

包含病毒血清學性質與其抗原關係。

病毒生物學特征:

包含病毒天然宿主範圍;

病毒在自然狀態下傳播與媒介體關係;

病毒地理分佈,致病機理,組織嗜親性;

病毒引发病理和組織病理學特點。病毒學医学知识专题讲座第76页隨著分子生物學,血清學和電子顯微術發展,分類學上基於特徵也越來越多。如今需要考慮原因包含:病毒形態學特徵、物理學和物理化學特徵、基因組、病毒蛋白、脂類、糖類、抗原和生物學特徵。有些人估計用來定義一個病毒必須考慮500~700個特徵。病毒學医学知识专题讲座第77页這樣病毒分類系統達到了

6個目,87個科,19個亞科,348個屬。另外亞病毒感染因數(subviralagent)下設衛星、類病毒和朊病毒,其中類病毒分類有2個科、7個屬。病毒學医学知识专题讲座第78页病毒學医学知识专题讲座第79页病毒學医学知识专题讲座第80页病毒學医学知识专题讲座第81页病毒學医学知识专题讲座第82页病毒分類

王金勇動物免疫研究室病毒學医学知识专题讲座第83页概述病毒分類規則動物病毒分類現狀小結病毒學医学知识专题讲座第84页一、概述ICTV(國際病毒分類委員會),現在已知病毒有4000多種,分屬於6

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

评论

0/150

提交评论