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文档简介
高中生物奥赛辅导生化三羧酸循环第一页,共四十六页,编辑于2023年,星期二丙酮酸脱羧,乙酰辅酶A的氧化均发生在线粒体的基质。ATP的合成在线粒体的内膜上进行的第二页,共四十六页,编辑于2023年,星期二三羧酸循环(Tricarboxylicacidcycle)
TCACycleKreb’s循环(Kreb’scycle)柠檬酸循环(Citriccycle)3.1Asurveyofintroduction概述第三页,共四十六页,编辑于2023年,星期二
GlucosePyruvate
Acetal-CoA
TCACycleNAD+NADH+H+CoA-SHCO2CO2+H2OⅠⅢⅡGlycolysisYieldingofacetyl-CoAacetyl-CoAisoxidized
3.1.1葡萄糖的有氧分解包括三个部分第四页,共四十六页,编辑于2023年,星期二TheNobelPrizeinPhysiologyorMedicine1953"forhisdiscoveryofthecitricacidcycle"3.1.2三羧酸循环的研究简史第五页,共四十六页,编辑于2023年,星期二PyruvateisoxidizedandacetateistransferredtoCoA.AcetylCoAenterstheTCAcycle.AcetateisoxidizedtoCO2.
第六页,共四十六页,编辑于2023年,星期二PyruvateisoxidizedandacetateistransferredtoCoA.AcetylCoAenterstheTCAcycle.AcetateisoxidizedtoCO2.
第七页,共四十六页,编辑于2023年,星期二PyruvateisoxidizedandacetateistransferredtoCoA.AcetylCoAenterstheTCAcycle.AcetateisoxidizedtoCO2.
第八页,共四十六页,编辑于2023年,星期二Pyruvateistransportedintomitochondria(线粒体)
thenoxidizedtoacetyl-CoA(releasingCO2)beforeenteringthecitricacidcycle3.2Pyruvateisoxidizedtoacetyl-CoA丙酮酸脱氢酶系第九页,共四十六页,编辑于2023年,星期二Regulationofpyruvatedehydrogenasecomplex
砷化物对机体的毒害不仅限于糖酵解,它与丙酮酸脱氢酶复合物中E2辅基硫辛酰胺的巯基发生共价结合,使还原型硫辛酰胺形成失去催化能力的砷化物。第十页,共四十六页,编辑于2023年,星期二3.3.1Reactionprocessoftricarboxylicacidcycle(三羧酸循环,柠檬酸循环)3.3TricarboxylicAcidCycle乙酰CoA柠檬酸顺乌头酸异柠檬酸a-酮戊二酸琥珀酰CoA琥珀酸苹果酸延胡索酸草酰乙酸第十一页,共四十六页,编辑于2023年,星期二乙酰CoA柠檬酸顺乌头酸异柠檬酸a-酮戊二酸琥珀酰CoA琥珀酸苹果酸延胡索酸草酰乙酸第十二页,共四十六页,编辑于2023年,星期二3.3.1.1Thecyclebeginswiththecondensationofacetyle-CoAandoxaloacetatetoformcitrate草酰乙酸柠檬酸柠檬酸合酶Thehydrolysisthehighenergythioester(硫酯)drivesthereaction.第十三页,共四十六页,编辑于2023年,星期二合酶(synthase):催化加合反应,促使合成合成酶(synthetase):催化连接反应,一般需要NTP合酶与合成酶第十四页,共四十六页,编辑于2023年,星期二G0’=8.4kJ/molG0’=-2.1kJ/mol90%4%6%Fluoridecitrate(氟柠檬酸)isthespecialinhbitorofaconitase******3.3.1.2Citrateisomerizestoisocitrate(异柠檬酸)
viacis-aconitate(顺乌头酸)Aconitase(乌头酸酶)第十五页,共四十六页,编辑于2023年,星期二3.3.1.2Citrateisomerizestoisocitrate
viacis-aconitate
酶活性中心的只能结合底物的一部分,底物的部分具有手性,分子局部的手性,即分子的前手性.第十六页,共四十六页,编辑于2023年,星期二前手性、潜手性(pro-chiral)第十七页,共四十六页,编辑于2023年,星期二Reaction4and5****3.3.1.3Isocitrateundergoesoxidativedecarboxylation
(氧化脱羧)toforma-ketoglutarate(a-酮戊二酸)Isocitrateisoxidized(第一次脱氢)anddecarboxylated.(第一次脱羧)异柠檬酸脱氢酶第十八页,共四十六页,编辑于2023年,星期二第二次脱氢,第二次脱羧.E1酶不受磷酸共价调节.ReactionrequiresTPPandlipoateetc(6种辅酶).****3.3.1.4-ketoglutarateundergoesoxidative
decarboyxlationtoformsuccinyl-CoA(琥珀酰CoA)a-酮戊二酸脱氢酶系第十九页,共四十六页,编辑于2023年,星期二**琥珀酰CoA合成酶(也称琥珀酸硫激酶)3.3.1.5Cleavageofthethioesterbond(硫酯键)insuccinyl-CoAiscoupledtoGTP(orATP)formationThethirdexampleofsubstrate-levelphosphorylation.琥珀酰CoA琥珀酸琥珀酸是对称分子,没有了手性.第二十页,共四十六页,编辑于2023年,星期二琥珀酸延胡索酸3.3.1.6Succinateisoxidizedtofumarate(延胡索酸)琥珀酸脱氢酶ThefreeenergychangeofthisreactionisinsufficienttoreduceNAD+.SuccinateDehydrogenaseisdirectlylinkedwiththeelectrontransportchain.立体异构体马来酸第二十一页,共四十六页,编辑于2023年,星期二丙二酸琥珀酸(丁二酸)3.3.1.6Succinateisoxidizedtofumarate(延胡索酸)1.Theenzymecatalyzesstereospecificdehydrogenation2.Malonate(丙二酸)istheinhibitorofthereaction第二十二页,共四十六页,编辑于2023年,星期二延胡索酸苹果酸3.3.1.7FumarateishydratedtoL-malate(苹果酸)延胡索酸酶Hydration(水合)第二十三页,共四十六页,编辑于2023年,星期二****or3.3.1.8Oxaloacetate(草酰乙酸)isregeneratedbytheoxidationofL-malate(苹果酸)Thestandardfreeenergyofthisreactionisverypositive.Theoxidationofmalateisdrivenbytheefficientremovaloftheproducts.苹果酸脱氢酶第二十四页,共四十六页,编辑于2023年,星期二ThelastthreereactionsoftheoftheTCAcyclearesimilartofattyaciddegradationandsynthesis,andsomeaminoaciddegradations.
oxidation–hydration–oxidation.Amethylenegroup(CH2)isconvertedtoacarbonylgroup(C=O).ThelastthreereactionsoftheoftheTCAcycle第二十五页,共四十六页,编辑于2023年,星期二Detailsworkedoutbystudyinghighlypurifiedenzymesofthecycleinvitro;
使用高度提纯的酶在体外实验证明了这一代谢途径Alsobyisotopetracerexperimentsinvivo;
通过体内同位素示踪法也证明了这一代谢途径Thecitricacidcyclewasconfirmedtobeuniversalincells
TCA循环被证明在细胞中是广泛存在的第二十六页,共四十六页,编辑于2023年,星期二第二十七页,共四十六页,编辑于2023年,星期二第二十八页,共四十六页,编辑于2023年,星期二1.总反应式:CH3-C-SCoA+3NAD++FAD+GDP+Pi
2CO2+3NADH•H++1FADH2+1GTP+CoA-SH2.Therearetwocarbonatomsintheformofacetyl-SCoAenterseverycycle;andtherearetwodecarboxylationstakeplaceineachcycle;
乙酰辅酶A中的二碳乙酰基进入TCA循环;在循环中发生两次脱羧反应.Notice:the2carbonatomsenteringthecyclearenotthesameasthoseleavingthecycleO3.3.2SurveyofTCAcycle第二十九页,共四十六页,编辑于2023年,星期二3.Therearefourdehydrogenationreactionstakeplaceineachcycle;
在循环中发生四次脱氢反应(3NADH,1FADH2)4.Thereisasubstratelevelphosphoralation;
循环中发生一次底物水平磷酸化3.3.2SurveyofTCAcycle第三十页,共四十六页,编辑于2023年,星期二5.Thereactionscatalyzedbyaconitaseandfumaraseisasymmetryreactions;
顺乌头酸酶和延胡索酸酶等催化非对称反应6.Alloftheintermediarymetabolismsarenotsynthesisanddecompositionnet.
所有中间代谢产物在代谢中没有净合成或净降解.3.3.2SurveyofTCAcycle第三十一页,共四十六页,编辑于2023年,星期二1.Acetylinacetyl-S-CoAwasoxydized:
化学氧化释放的自由能:874.9kJ/mol
生物氧化释放的自由能:520.9kJ/mol
用于ATP合成的自由能:354kJ/mol3.4Theenergeticoftheaerobic
decompositionofglucose
葡萄糖有氧分解途径的能量计算第三十二页,共四十六页,编辑于2023年,星期二2.HydrationsinTCA-cycle:ThethirdH2OenteredinTCAcycle:Citryl-CoA+H20succinyl-CoA+H2OFumarate+H20Citrate+CoA-SHSuccidate+CoA-SHMatalteH2OH2O3.4TheenergeticoftheaerobicdecompositionofglucoseH2O第三十三页,共四十六页,编辑于2023年,星期二3.Dehydrogenationsinoxydationofglucose:
InEMP:C6H12O62×pyruvate+4HInTCAcycle:2×acetyl-CoA+2×3H2O16H+4CO2
2×CoA-SHSo: C6H12O6+6H2O24H+6CO2
6O2
12H2O
C6H12O6+6O26H2O+6CO2Informationofacetyl-CoA:
2×pyruvate2×CoA-SH2×acetyl-CoA+4H+2CO23.4Theenergeticoftheaerobicdecompositionofglucose第三十四页,共四十六页,编辑于2023年,星期二4.CaculationofenergyInEMP:ATP4-2NumbersofATP2NADH•H+2×2.5Informationofacetyl-CoA:2NADH•H+2×2.5InTCAcycle:3NADH•H+×23×2.5×2FADH2×21×1.5×2GTP×2
1×1×2Summery:32(→FADH2)(2×1.5)(30)3.4Theenergeticoftheaerobicdecompositionofglucose第三十五页,共四十六页,编辑于2023年,星期二
1.AllorganicchemicalscanbecompletelyoxidizedtoCO2andH2Oviaacycledpathway;
所有的有机化合物都可以通过TCA环彻底降解为CO2
和H2O;2.Plentyenergycanbeprovidedaccompanythecycledpathway;
伴随着这一循环途径,大量的自由能被转换;3.5TCA环的生理意义第三十六页,共四十六页,编辑于2023年,星期二3.Theintermediatesinthecycleareimportantsourcesforbiosyntheticprecursors;
TCA环中的中间代谢产物是重要的生物合成的前体4.Thecycleisanamphibolicpathway,andisametabolichingeofallbiochemicals
TCA环是一个分解合成无定向途径,是所有生物化合物的代谢枢纽。分解产能,合成前体.3.5TCA环的生理意义第三十七页,共四十六页,编辑于2023年,星期二Theylackthea-keto—glutaratedehydrogenase;
厌氧菌缺乏a-酮戊二酸脱氢酶Precursorsareprovidedforthesynthesisofaminoacids,nucleotides,hemeetc.
合成代谢的前体通过正向或逆向反应合成Useanincompletecitricacidcycleasasource,notofenergy,butofbiosyntheticprecursors.厌氧细菌(anaerobicbacteria)中TCA环是中断的第三十八页,共四十六页,编辑于2023年,星期二TCA循环在合成代谢中的作用合成其他物质的前体,必然导致草酰乙酸等浓度的降低,这使得乙酰CoA的受体大大减少,从而使TCA循环效率降低.卟啉第三十九页,共四十六页,编辑于2023年,星期二3.6Reactionsthatreplenishcitricacidcycleintermediates
–anapleroticreactions(TCA环的回补)增加草酰乙酸及苹果酸的数量第四十页,共四十六页,编辑于2023年,星期二PEP
Pyruvate
acetyl-CoAoxaloacetateCO2+ATPADP
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