生物信息数据库与生物信息中心教学课件

计算机应用生物信息数据库与生物信息中心王禄山授课大纲生命信息学—生命科学与计算机技术的交叉生物信息学的研究内容:(1)生物信息中心(2)生物信息数据库及格式。生物信息数据的检索工具Entrez文献的检索与管理软件Referencemanager序列同源搜索分析工具—Blast核酸、蛋白质序列比对分析软件—dsgenedNASis生物大分子空间三维结构显示与分析软件Rasmol生物图像对比分析软件—Scionimage(NIHimage)生物科学数据处理软件OriginBioinformaticsBiologicalComputerDataCalculations生物傖研究内容1.重要生物信息中心2.重要生物信息数据库3.数据库检索工具4.生物分析相关软件GenBankPDBoDts重要生物信息中心BioinformaticscentresNCBINationalCenterforBiotechnologyInformation(US)EBIEuropeanBioinformaticsInstitute(EU)ebi.ac.ukDDBJDNADataBankofJapan(JPddbj.nig.ac.jpExPASyExpertofProteinAnalysisSystem(Switzerlandexpasy.chPDBProteinDataBank(US)/pdb/CBIPKU北京大学生物信息中心(CN)cbi.pkueducn/chineseBiasing中国生物信息中心(CN)EntrezDatabaseshtp/whng团eNCBIationalCenterforBiotechnologyInformationNationalLibaryofM.xineTEMAPbWhatdoesNCBldo?thebetterunderstandingofmoleculalandsofitLiteratu。·“dsearchresultsEntrezGenNCBIncbi.nlmnihgovOMIMPubMedFull-textElectronicJournalsNucleotideSequencesDGenomes|sequenceMapsProteinaxonomyEuropeanBioinformaticsInstituteebi.ac.uk/边Keaiencas-eSurhEalwoasitsEuropeanBointormatcsInstitutethepathtoknowledgeainingandEducationathREAIDNADatabaseofjapanddbjnig.acjp/DNADataBankojJapanJanenesePageSiteMapaboutDDBJsWhat'snewmodHied叫ar.11aboutDDBJntegrationotRustaMandDataSubmissioncompleteftptromUniProtssProt>nFebruaryelimnerynoticeorthsentrYRalasaotalargearmountofBLAST&DDBJGenomeetionoftormetonenDBJusenetworkto>CONanttsarayisinndaetolengthlimitetin(oct26,200DDBJ/EMBL/GenBankFeatureTableExample:Protein-codingregoPrototypicaleukaryoticgene3004001100UTRsignalpeptidematuretide3'UTRFEATURESL