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文档简介

目的:掌握不同微生物能量代谢的特点;了解微生物代谢的调节。重点:产能代谢,生物固氮和肽聚糖的合成。难点:生物固氮机制。第五章微生物的新陈代谢关于新陈代谢的几个概念新陈代谢(Metabolism)发生在活细胞中的各种分解代谢和合成代谢的总和。合成代谢(Anabolism)(同化作用)在合成酶系催化作用下,由简单小分子、ATP形式的能量和[H]形式的还原力一起合成复杂大分子的过程。分解代谢(Catabolism)(异化作用)复杂的有机物分子通过分解代谢酶系的催化,产生简单小分子、ATP形式的能量和还原力的过程。主要内容第一节微生物的能量代谢第二节微生物独特合成代谢途径第三节微生物的代谢调节和发酵生产主要内容:一化能异养微生物的产能代谢二化能自养微生物的产能代谢三光合自养微生物的产能代谢第一节微生物的能量代谢能量代谢的目的:生物体把外界环境中多种形式的最初能源转换成对一切生命活动都能使用的通用能源(ATP)。最初能源有机物还原态无机物日光化能异养微生物化能自养微生物光能营养微生物ATP一化能异养微生物的生物氧化生物氧化(biologicaloxidation)在活细胞中的一系列产能性氧化反应的总称。氧化的形式包括:得氧、脱氢和失去电子。过程包括脱氢(电子)、递氢(电子)和受氢(电子)3个阶段。功能:产ATP,[H],小分子中间代谢产物。类型:有氧呼吸、无氧呼吸和发酵。底物脱电子的四种方式以葡萄糖为例EMP途径(占大多数,又称糖酵解途径)葡萄糖经10步反应后生成2分子丙酮酸、2分子NADH+H+,2分子ATP。(即相当于8个ATP)HMP途径(戊糖磷酸途径)葡萄糖通过该途径被彻底氧化,产生ADPH+H+及多种中间代谢产物。ED途径是存在于某些缺乏EMP途径的微生物中的一种替代途径,葡萄糖经4步反应后,生成丙酮酸、ATP、NADPH2、NADH2。TCA循环丙酮酸经10步反应彻底氧化、脱羧后,生成ATP,GTP,NADH2和CO2EMP途径(Embden-MyerhpfPathway)总式:葡萄糖+2NAD+2Pi+2ADP→2丙酮酸+2NADH+2H++2ATP+2H2OC6→→→2C3

→→→→→2NADH+H+丙酮酸4ATP→2ATP→耗能阶段产能阶段2ATPEMP

途径的意义EMP途径的生理学功能①为合成代谢供应ATP形式的能量和NADH2形式的还原力②为合成代谢提供多种中间代谢产物③连接三羧酸循环(TCA)、HMP途径和ED途径的桥梁④通过逆向反应可进行多糖合成EMP途径与人类的关系乙醇、乳酸、甘油、丙酮和丁醇的发酵HMP途径:Pentosephosphatepathway,旧称HMP途径(Hexosemonophasphatepathway),此途径存在于大多数生物体内。C7C4C5C5C5C6C3C6C36C6→→→6C5

→→→

→5C6→经一系列复杂反应后→重新合成己糖12NADPH6CO2

→经呼吸链36ATP1ATP

→35ATP总反应式:6葡萄糖-6-磷酸+12NADP++6H2O→5葡萄糖-6-磷酸+12NADPH+12H+6CO2+PiHMP途径的意义微生物生命活动:1.供应合成原料提供戊糖磷酸:参与核酸、NAD+、NADP+、FAD、CoA等合成;赤藓糖-4-磷酸:合成芳香族氨基酸2.产还原力:NADPH23.作为固定CO2的中介:核酮糖-5-磷酸4.扩大碳源利用范围:C3~C75.连接EMP途径:果糖-1,6-二磷酸,甘油醛-3-磷酸生产实践—可提供重要发酵产物核苷酸氨基酸辅酶乳酸多数好氧菌和兼性厌氧菌都存在HMP途径,而且通常与EMP途径同时存在。只有HMP而无EMP途径的微生物较少,如弱氧化醋杆菌等。ED途径(N.EntnerandM.Doudorroff)

2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖酸裂解途径微生物特有与EMP途径相连与EMP途径相连有O2时与TCA相连无O2时进行酒精发酵特点:特征性反应:KDPG裂解为丙酮酸和3-磷酸甘油醛特征性酶:KDPG酶终产物2分子丙酮酸的来历不同:KDPG直接裂解和3-磷酸甘油醛经EMP途径转化而来。产能效率底:1molATP/1molGlucose反应式:葡萄糖+NAD++NADP+Pi+ADP→2丙酮酸+NADH+H++NADPH+H++ATP具有ED途径的微生物(EMP途径不完整的细菌所特有)Pseudomonassaccharophila(嗜糖假单胞杆菌)Ps.aeruginosa(铜绿假单胞杆菌)Ps.fluorescens(荧光假单胞杆菌)Ps.lindneri(林氏假单胞菌)Z.mobilis(运动发酵单胞菌)Alcaligenseutrophus(真氧产碱菌)丙酮酸的代谢的多样性EMP途径,不完全的HMP途径,ED途径都可以产生丙酮酸,生成的丙酮酸:进入TCA循环进一步氧化分解,产生还原力NADPH2,ATP和合成代谢所需要的小分子C架发酵作用Fermatation:细菌酒精发酵林氏发酵单胞菌、嗜糖假单胞菌、运动发酵单胞菌等(微生物好氧菌),经ED途径,发酵葡萄糖生成丙酮酸,脱羧成乙醛,进一步被NADH2还原为乙醇的代谢。

TCA循环(Krebs循环)C2C6C6C6C5C4C4C4C4C4丙酮酸在进入三羧酸循环之先要脱羧生成乙酰CoA,乙酰CoA和草酰乙酸缩合成柠檬酸再进入三羧酸循环。循环的结果是乙酰CoA被彻底氧化成CO2和H2O,每氧化1分子的乙酰CoA可产生12分子的ATP,草酰乙酸参与反应而本身并不消耗。C3→→→CH3CO~CoA→FADH24NADH+H+1GTP3CO2呼吸链12ATP呼吸链2ATP1ATP底物水平从丙酮酸进入循环:丙酮酸+4NAD++FAD+GDP+Pi+3H2O→3CO2+4(NADH+H+)+FADH2+GTP15个ATP从乙酰-CoA进入循环:乙酰-CoA+3NAD++FAD+GDP+Pi+2H2O→2CO2+3(NADH+H+)+FADH2+CoA+GTP12个ATP(1)循环一次的结果是乙酰CoA的乙酰基被氧化为2分子CO2,并重新生成1分子草酰乙酸;(2)整个循环有四步氧化还原反应,其中三步反应中将NAD+还原为NADH+H+,另一步为FAD还原;(3)为糖、脂、蛋白质三大物质转化中心枢纽。(4)循环中的某些中间产物是一些重要物质生物合成的前体;(5)生物体提供能量的主要形式;(6)为人类利用生物发酵生产所需产品提供主要的代谢途径。如柠檬酸发酵。TCA循环的重要特点产能形式EMPHMPEDEMP+TCAATPGTP2122(2ATP)NADH+H+2(=6ATP)1(=3ATP)2+8*(=30ATP)NADPH+H+12(=36ATP)1(=3ATP)FADH22(=4ATP)净产ATP835**736~38***葡萄糖经不同途径后的产能效率*在TCA循环的异柠檬酸至-酮戊二酸反应中,有的微生物产生的是NADPH+H+**在葡萄糖转变为葡糖-6-磷酸过程中消耗1ATP***真核生物的呼吸链组分在线粒体膜上,NADH+H+进入线粒体要消耗2ATP。经上述脱氢途径生成的NADH、NADPH、FADH等还原型辅酶通过呼吸链等方式进行递氢,最终与受氢体(氧、无机或有机氧化物)结合,以释放其化学潜能。递氢和受氢ATP的产生生物氧化的三种类型根据受氢体性质的不同,生物氧化可分为三种类型:呼吸无氧呼吸发酵广义发酵任何利用微生物来生产大量菌体或有用代谢产物或食品饮料的一类生产方式狭义发酵在无氧等外源受氢体(外源最终电子受体)条件下,底物脱氢以后产生的还原力[H]未经过呼吸链传递而直接交给某一内源中间代谢产物接受,以实现底物水平磷酸化产能的生物氧化反应。C6H12O6

→2CO2+2C2H5OH(一)发酵(fermentation)发酵的特点微生物部分氧化有机物获得发酵产物,释放少量能量;氢供体与氢受体(内源性中间代谢产物)均为有机物还原力[H]不经过呼吸链传递;产能方式:底物水平磷酸化反应。底物磷酸化:指在发酵过程中往往伴随着高能化合物生成,如EMP途径中的1,3-二磷酸甘油酸和磷酸烯醇氏丙酮酸,其可直接偶联ATP和GTP的产生。发酵产能是厌氧和兼性好氧菌获取能量的主要方式。多糖转化为单糖才能用于发酵。微生物直接发酵的碳源物质主要是葡萄糖和其它单糖,以微生物发酵葡萄糖最为重要。和底物脱氢的途径有关的和称为Stickland反应的四类重要发酵由EMP途径中丙酮酸出发的发酵通过HMP途径的发酵通过ED途径进行的发酵Stickland反应由EMP途径中丙酮酸出发的发酵由葡萄糖经EMP途径形成丙酮酸,进一步降解形成各种发酵产物(同型)酒精发酵(酿酒酵母)同型乳酸发酵(德氏乳杆菌)丙酸发酵(丙酸杆菌)混合酸发酵(大肠杆菌)2,3-丁二醇发酵(产气肠杆菌)丁酸发酵(丁酸梭菌)由丙酮酸出发的6条发酵途径①酵母型酒精发酵②同型乳酸发酵③丙酸发酵④混合酸发酵⑤2,3—丁二醇发酵⑥丁酸发酵方框内为发酵产物由EMP途径中丙酮酸出发的发酵的意义工业发酵:大规模生产这些代谢产物;菌种鉴定:发酵中的某些独特代谢产物是鉴定相应菌种的重要生化指标。V.P.实验(Vogos-Prouskauer

test)产气肠杆菌(E.aerogenes)产生乙酰甲基甲醇,碱性条件下氧化成双乙酰,与含有胍基的精氨酸反应,产生特征性的红色反应(呈V.P.阳性),而E.coli

(与产气肠杆菌近缘)呈V.P.阴性,故极易区别两菌。通过HMP途径的发酵异型乳酸发酵(Heterolacticfermentation

)凡是葡萄糖经过发酵后除主要产生乳酸,还产生乙醇、乙酸和二氧化碳等多种产物的发酵进行异型乳酸发酵的微生物异型乳酸发酵的经典途径L.mesenteroides(肠膜明串珠菌)、L.cremoris(乳脂明串珠菌)、L.brevis(短乳杆菌)、L.fermentum(发酵乳杆菌)等异型乳酸发酵的双歧杆菌途径Bifidobacteriumbifidum异型乳酸发酵的经典途径凡葡萄糖经发酵后除主要产生乳酸外,还产生乙醇、乙酸和二氧化碳等多种产物的发酵。异型乳酸发酵的双歧途径特点:2分子葡萄糖产生2分子乳酸,3分子乙酸,5分子ATP同型乳酸发酵和异型乳酸发酵的比较ED途径的发酵—细菌酒精发酵林氏发酵单胞菌、嗜糖假单胞菌、运动发酵单胞菌等(微生物好氧菌),经ED途径,发酵葡萄糖生成丙酮酸,脱羧成乙醛,进一步被NADH2还原为乙醇的代谢。氨基酸发酵产能—Stickland反应什么是Stickland反应?以一种氨基酸作底物脱氢(氢供体),以另一种氨基酸作氢受体实现生物氧化产能的独特发酵类型。氢供体氨基酸丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、组氨酸、色氨酸、丝氨酸等氢受体氨基酸甘氨酸、脯氨酸、精氨酸、鸟氨酸以丙氨酸和甘氨酸为例:丙氨酸+甘氨酸+ADP+Pi→3乙酸+3NH3+CO2进行Stickland反应的微生物C.sporogenes(生胞梭菌)C.botulinum(肉毒梭菌)C.sticklandii(斯氏梭菌)该反应效率很低,一个分子的Aa只产生1个ATP。注:stickland反应对生长在厌氧和蛋白质丰富环境中的微生物非常重要,使其可以利用氨基酸作为碳源、能源和氮源,如生孢梭菌。和发酵产物有关的重要的发酵类型

降解产物为乙醇(乙醇发酵)酵母菌和细菌可进行乙醇发酵。葡萄糖2丙酮酸2乙醛2乙醇脱羧酶酵母菌,八叠球菌的乙醇发酵:EMP运动发酵单孢菌和厌氧发酵单孢菌乙醇发酵:ED应用:酿酒乙醇发酵、乳酸发酵、丙酸发酵、混合酸发酵、丁酸发酵等乙醇脱氢酶注:酵母菌乙醇发酵中,发酵条件对发酵过程与产物影响很大。如发酵过程中的通气状况、培养基组成及pH控制均对发酵终产物产生影响。乙醇发酵是一种厌氧发酵,如将厌氧条件改为好氧条件,葡萄糖分解速度降低,乙醇生成停止,这种有氧呼吸抑制发酵的现象称为巴斯德效应。当重新返回厌氧条件时,葡萄糖分解加速,伴随大量乙醇产生。酵母菌利用葡萄糖进行发酵的三种类型Ⅰ型发酵:即正常的乙醇发酵,在弱酸性条件下进行,1分子葡萄糖经发酵产生2分子乙醇和2CO2;Ⅱ型发酵:乙醇发酵中,在发酵培养基中加入适量NaHSO3,发酵转变为甘油发酵,形成大量甘油和少量乙醇。Ⅲ型发酵:乙醇发酵中,将发酵液pH改成弱碱性(pH7.6),发酵主产物为甘油,伴随产生少量乙醇、乙酸和CO2。(二)有氧呼吸(aerobicrespiration)是一种最普遍又重要的生物氧化或产能方式。1特点有电子传递链(呼吸链);因氧化彻底,产能多;最终电子受体是分子态的氧;能量的产生,有底物水平磷酸化,也有电子传递水平磷酸化。2过程葡萄糖经过糖酵解(EMP途径)作用形成的丙酮酸,丙酮酸进入三羧酸循环(简称TCA循环),被彻底氧化生成CO2和水,同时释放大量能量。

过程图G2丙酮酸2乙酰CoA2ATP+2NADH22NADH2+2CO2呼吸链6CO2+6H2O36或38ATPTCA6NADH2+2FADH24CO2+2CoA+2GTP注:NADH2(被氧化):3ATPGTP(被转化):1ATPFADH2(被氧化):2ATP(三)无氧呼吸(anaerobicrespiration)

电子受体为氧化态的外源无机盐类,少数为有机氧化物。1特点:电子受体为NO3-、NO2-、SO42-、CO32-、延胡索酸(有机物)等在能量分级释放过程中伴随有磷酸化作用生成的能量不如有氧呼吸产生的多鬼火(磷化氢)注:无氧呼吸和有氧呼吸一样需要细胞色素等电子传递体,在能量分级释放过程中伴随着磷酸化作用,也能产生很多能量,但只有部分能量随电子(或H)传递给氧化物,而且受体的氧化还原电位差都小于氧气,使得生成的能量不如有氧呼吸产生得多。无氧呼吸中电子的传递方向:NAD(P)→FP(黄素蛋白)→Fe.S蛋白→CoQ→Cytb→Cytc→Cyta→Cyta3。无氧呼吸的主要类型2.1硝酸盐呼吸(反硝化作用或脱氮作用)反硝化细菌(兼性厌氧微生物,如地衣芽孢杆菌、铜绿假单胞菌、脱氮硫杆菌等)以硝酸盐作为最终氢受体,NO3-还原成NO2-、N2O、N2等的过程。对农业和环境的影响有利:可消除水域中N素的富集(赤潮和水华);有害:N素损失,污染环境(NO和N2O)2.2

硫酸盐呼吸(反硫化作用)反硫化细菌(严格厌氧菌,如巨大脱硫弧菌、致黑脱硫肠状菌等)以SO42-为最终氢受体,使SO42-还原成H2S,并产生ATP。对农业和环境的影响有利:水域中,使S素以H2S的形式返回大气,避免S素大量聚集。有害:导致土壤硫素损失;引起水稻烂根;金属管道的腐蚀;饮用水的污染。

硫呼吸(专性或兼性厌氧菌)以无机硫为呼吸链最终电子受体并产生H2S的作用。是兼性或专性厌氧菌。铁呼吸(专性或兼性厌氧菌)

末端电子受体为Fe3+,在专性或兼性厌氧菌中存在。延胡索酸呼吸(兼性厌氧菌)

以延胡索酸为末端电子受体,生成琥珀酸。碳酸盐呼吸:

是CO2或碳酸盐作为呼吸链末端H受体。产甲烷菌的碳酸盐呼吸是产甲烷细菌(专性厌氧菌,古生菌)在厌氧条件下,利用H2还原CO2产生细胞物质,能利用CO2作为电子受体产生ATP和CH4。对农业和环境的影响:产沼气;肥料:沼气渣。注:沼气的产生并不只是产甲烷菌参与,还有一些发酵性细菌、产氢产乙酸细菌的参与,并且具有阶段性。有氧呼吸、无氧呼吸与发酵的比较呼吸类型有氧呼吸无氧呼吸发酵氧化基质有机物有机物有机物最终电子受体O2无机氧化物、延胡索酸氧化型中间代谢产物醛、酮等产物CO2、H2OCO2、H2ONO2、N2还原型中间代谢产物醇、酸产能多次之少电子传递链完整不完整无,底物水平磷酸化三种氧化产能方式的比较发酵有氧呼吸无氧呼吸最终电子受体有机物分子氧无机氧化物电子传递链无有有产能量少多较多氧化磷酸化底物水平底物水平、电子传递水平底物水平、电子传递水平1化能自养微生物一般为好氧菌,能在氧化无机物过程中,通过电子传递链氧化磷酸化获得能量,电子受体O2,通过逆呼吸链传递产生还原力,消耗能量。2产能方式硝化作用硫化作用铁的氧化氢的氧化二化能自养微生物产能方式化能自养的机理2.1硝化作用(氨的氧化)

NH3或亚硝酸(NO2-)被硝化细菌氧化产生能量。硝化细菌包括硝化细菌和亚硝化细菌。硝化细菌的特点:

专性好氧,

G+,无芽孢,分布广泛,对氧化基质有严格的专一性;亚硝化细菌和硝化细菌是互生菌;严格的专性化能自养,且大多数是专性无机营养型,不能在有机培养基上生长。

硝化作用对农业和环境的影响有利:氨氧化为硝酸以及大量的硝态氮化肥为作物生长提供氮素营养,有利于产量提高。有害:但硝酸盐的溶解性强(比铵盐强),易随雨水流入江、河、湖、海中,它不仅大大降低肥料的利用率(硝酸盐氮肥一般是40%),而且会引起水体的富营养化,进而导致“水华”或“赤潮”等严重污染危害(大面积发生就很难治理)。

过程:NH3亚硝化菌NO2-+ATPNO2-硝化菌NO3-+ATP2.2

硫化作用硫化合物(包括硫化物、单质硫、硫代硫酸盐、硫酸盐和亚硫酸盐)

被硫细菌能够利用产生能量最后生成H2SO4的过程。对农业和环境的影响产生SO42-,作为植物直接吸收的S素物质;解除H2S毒害和除臭使土壤的微域环境酸化,促进难溶S素的有效化,但同时可能导致作物酸害。2.3铁的氧化少数细菌能将亚铁氧化到高铁状态并产生能量的反应,如氧化亚铁硫杆菌。氧化亚铁硫杆菌存在于酸性环境中,因为亚铁仅在酸性条件下是稳定的。2.4氢的氧化(氢细菌)

通过氧化氢获得能量。

H细菌

G-,兼性化能自氧菌,利用分子氢氧化产生的能量同化CO2,也能利用其它有机物生长。

三光合自养微生物的光合磷酸化(一)光合微生物类群蓝细菌,光合细菌,嗜盐细菌1光合细菌:均为原核生物,红螺菌目。1.1所含色素菌绿素和类胡罗卜素,两种比例不同,使菌体呈红橙、绿、紫及褐等不同颜色。光合细菌为典型水生菌,广泛分布于深层(缺氧)淡水与海水中。注:光合色素可分为三类:叶绿素(chl)或细菌叶绿素(Bchl),类胡萝卜素和藻胆素。但所有光合生物都有类胡萝卜素,其有捕获光能的作用,能把吸收的光能高效地传给细菌叶绿素(或叶绿素)。1.2光合细菌分类根据所含细菌叶绿素(Bchl)种类不同分三类:绿硫细菌:含Bchlc.d.e.

以H2S,H2为供H体,还原CO2。红硫细菌:含Bchla.b.

以H2S为供H体.红螺菌:含Bchla.b.

以有机物为供H体,有些以H2,H2S为供H体.2嗜盐细菌兼性光能菌,属嗜盐菌科(Halobacteriaceae)的盐杆菌属(Halobacterium)。嗜盐细菌在生理上具有高度特异性:能在高浓度的饱和盐溶液(3.5~5.0mol/LNaCl)中栖息,细胞酶在2mol/L的盐浓度中才能保持活性与稳定性。

光合磷酸化的实质就是将光能转化为化学能的过程,具体过程为当一个叶绿素(菌绿素)分子吸收光量子后,被激活,释放一个电子(氧化),释放的电子进入电子传递系统,在电子传递过程中释放能量,产生ATP。

按照光合磷酸化中电子的流动路线及ATP形成方式,可分为:环式光合磷酸化(原始、电子的循环传递)非环式光合磷酸化(电子传递非环式)嗜盐菌紫膜的光合作用(嗜盐菌紫膜光合磷酸化)(二)光合磷酸化分类1循环光合磷酸化1.1紫硫细菌、绿硫细菌、紫色非硫细菌、绿色非硫细菌。1.2

是厌氧光合细菌通过光驱动下的电子循环式传递,在传递过程中形成ATP的过程。

1.3循环光和磷酸化的特点:电子传递途径属循环方式,即在光能驱动下,电子从菌绿素上逐出,通过类似呼吸链的循环,又回到菌绿素,其间产生了ATP;在供应ATP的条件下,可以产生还原力。产ATP和还原力[H]分开进行,不产O2。还原力(NADPH2)来自H2S等无机氢供体,是反向电子传递产生的。

反向电子传递:是逆着电子传递系统,将e从低能量(高电位)向高能量(低电位)传递。此过程消耗能量。反向e传递用的e来源于菌体外的一些物质如H2S,Fe2+,其它硫化物等.BchlP870红光或紫外光激发态菌绿素QBCytbc1Cytc2e-环式光合磷酸化Bphe-e-NAD(P)NAD(P)H2e-ATPADP+Pi外源电子供体外源H2消耗ATP逆电子传递QAQ库2非循环光合磷酸化

同时产生ATP、[H]和O2,[H]来源于H2O。

蓝细菌、藻类及各种绿色植物

2.1有两个光反应系统系统Ⅰ:产生还原力。系统Ⅱ:产生ATP。2.2

具体过程非循环光合磷酸化特点:电子传递的途径属于非循环式的;在有氧条件下进行;有PSⅠ和PSⅡ两个光合系统:有PSⅠ含有叶绿素a,反应中心的吸收光波为P700,有利于红光吸收,PSⅡ含有叶绿素b,反应中心的吸收光波为P680,有利于蓝光吸收;反应中可同时产生ATP、还原力[H]和O2;还原力NADPH2中的[H]来自H2O分子的的光解产物H+和电子。ChlP700ChlP680Fe·S-PrFdNADPH2NADPQBPce-

PhH2O2e-+2H++1/2O2Mn2+

e-

系统Ⅰ系统Ⅱ红光蓝光QAQ库cytbf注:Ph为褐藻素,Pc为质体蓝素,Fd为铁氧还蛋白ATP总结:水光解后产生的电子并产生O2,经系统Ⅱ、Ⅰ传递给NADP,在提供[H]的条件下,生成NADPH2,在传递过程中生成ATP.反应式:2NADP++2ADP+2Pi+2H2O2NADPH2+2ATP+O23紫膜光合磷酸化嗜盐菌在无叶绿素和菌绿素参与下,利用吸收光能产生ATP的过程,是目前所知道的最简单的光合磷酸化。嗜盐菌细胞膜分为红膜与紫膜两部分。红膜:主要成分为细胞色素、黄素蛋白和类胡萝卜素,进行经典的电子传递磷酸化;紫膜:进行光合磷酸化。含有细菌视紫红质,与人眼视网膜上柱状cell中所含的视紫红质蛋白相似,都含有紫色物质视黄醛。紫膜光合磷酸化的机理光量子驱动下,细菌视紫红质在将反应中产生的H+排至细胞膜外,使紫膜内外形成质子梯度;该梯度差驱使H+通过膜上的ATP合成酶中的孔道进入膜内,平衡膜内外质子差额,并产生ATP。注:环境中O2浓度高时,嗜盐菌以光合磷酸化产能,浓度很低时,可以在光照条件下合成紫膜,通过紫膜光合磷酸化合成ATP。

紫膜光合磷酸化主要特点:不经过电子传递,直接产生ATP意义:嗜盐菌紫膜光合磷酸化功能的发现,使在经典的叶绿素和菌绿素所进行光合磷酸化之外又增添了一种新的光合作用类型。紫膜的光合磷酸化是迄今所知道的最简单的光合磷酸化反应,这是研究化学渗透作用的一个极好的实验模型,对它的研究正在大力开展。对其机制的揭示,将是生物学基本理论中的又一项重大突破,并无疑会对人类的生产实践例如太阳能的利用和海水的淡化等带来巨大的推动力。四能量消耗主要用于合成细胞物质与代谢产物,还用于维持生命、生物发光或放出生物热。

1合成耗能大分子细胞物质合成及代谢产物合成消耗的总能量。如CO2的固定,生物固氮,糖类、蛋白质和核酸的合成。2主动运输和膜泡运输耗能3细胞运动真核生物中鞭毛和纤毛都具有ATP酶(可水解ATP产生能量)。但目前尚未在细菌鞭毛中发现该酶。4发光:发光细菌能将细胞内贮存的化学能转化为光能。

分解代谢与合成代谢的功能及相互联系因乙醛酸循环乙醛酸循环:在异柠檬酸裂解酶的催化下,异柠檬酸被直接分解为乙醛酸,乙醛酸又在乙酰辅酶A参与下,由苹果酸合成酶催化生成苹果酸,苹果酸再氧化脱氢生成草酰乙酸的过程.

两个关键酶:异柠檬酸裂合酶(ICL)和苹果酸合酶(MS)意义:1、乙醛酸循环特有的功能是实现了脂肪向糖类的转变,而在三羧酸循环中是不能实现的.2、乙醛酸循环提高了生物体利用乙酰-CoA的能力。只要极少量的乙酰草酸做引物,乙醛酸循环就可以持续运行,不断产生琥珀酸,为TCA回补四碳单位。第三节微生物独特合成代谢途径一自养微生物的CO2固定二生物固氮三肽聚糖的合成四、次生代谢(略)一、自养微生物的CO2固定(重点:关键酶和微生物代表种类)

Calvin循环、厌氧乙酰-COA途径、逆向TCA循环和羟基丙酸途径。

能源来源于光能或无机物氧化所得的化学能。(一)Calvin循环(光能自养和化能自养M固定CO2的主要途径)代表:绿色植物、蓝细菌、多数光合细菌、硫细菌、铁细菌、硝化细菌。两种关键酶:核酮糖二磷酸羧化酶(RuBisCO)和磷酸核酮糖激酶。三个阶段:羧化反应、还原反应和CO2受体的再生。(1)第1阶段3分子CO2固定成3-磷酸甘油酸(2)第2阶段3-磷酸甘油酸转变为甘油醛-3-磷酸(3)第3阶段从丙糖磷酸再生核酮糖-1,5-二磷酸(二)厌氧乙酰-COA途径乙酸菌、硫酸盐还原菌和产甲烷菌。关键酶:CO脱氢酶,催化CO2还原为CO的反应:CO2+H2=

CO+H2O厌氧乙酰-COA途径乙酰COACH3-CO-XCO2CO2CH3-B12CO-X乙酸CO2丙酮酸CO脱氢酶(三)逆向TCA循环1在绿色硫细菌中存在。2以草酰乙酸为CO2受体,每循环一周掺入2个CO2分子,并还原成乙酰COA,然后再固定1个CO2分子合成丙酮酸、丙酸等。3特殊酶:柠檬酸裂合酶。(四)羟基丙酸途径1存在于少数绿色硫细菌中。2乙酰COA为起始物质,经过2次羧化,最后形成乙酰COA和乙醛酸,乙酰COA重新进入循环,乙醛酸最为合成细胞物质的原料。3关键步骤:羟基丙酸的产生。二生物固氮

微生物通过固氮酶将N2转变成为NH3的过程。生物固氮主要在三方面进行研究用实验的方法提高主要农作物的固氮能力。模拟固氮酶,使工业生产N肥在常温、常压下进行。选择利用高效、优质的固氮微生物做为生物肥料(根瘤菌肥料和固氮菌肥料)。(一)固氮微生物主要是原核微生物(细、放、蓝等近50个属)。1自生固氮菌:如圆褐固氮菌。2共生固氮菌:一般能形成特殊的结构,如根瘤菌。3联合固氮菌:必须生活在植物根际、叶面或动物肠道等处,一般不形成特殊结构。(生脂固氮螺菌)圆褐固氮菌根瘤菌(二)生物固氮的条件1能量ATP的提供2还原力[H]及其传递体:[H]由铁氧还蛋白(Fd)或黄素氧还蛋白(Fld)传递至固氮酶上。3固氮酶:固二氮酶(组分Ⅰ,含铁和钼)和固二氮酶还原酶(组分Ⅱ,含铁)组成,两者在一起时才具有固氮作用。另外,“替补固氮酶”。4还原底物:N2

5镁离子6严格的厌氧微环境:固氮酶的高度氧敏感性。(三)固氮的生化机制呼吸无氧呼吸发酵光合作用NAD(P)H2ATPFd(Fld)

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