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文档简介
DNA甲基化
———表观遗传学DNA的甲基化真核生物的DNA甲基转移酶DNA的去甲基化DNA甲基转移酶的抑制剂主要内容(一)DNA的甲基化1.DNA甲基化:在DNA甲基转移酶(DNAmethyltransferase,DNMTs)的作用下,将一个甲基添加的胞嘧啶的5’-碳分子上,形成5-甲基化胞嘧啶(5-methylcytosine)2.胞嘧啶甲基化后产生5-甲基化胞嘧啶能够自发的脱氨基形成胸腺嘧啶(Thymine):5mC->T3.哺乳动物中,~1%的DNA碱基能够发生甲基化修饰4.DNA甲基化的分布:
(1)转座子
(2)逆转录病毒衍生的重复序列(3)大多数功能基因的编码区1.DNA的甲基化1.DNA甲基化的模式:(1)线虫:无甲基化的胞嘧啶(2)果蝇:极少量的甲基化胞嘧啶,识别模式CpT(主要)vs.CpG(极少)(3)哺乳动物:CpG(~70%)或者CpNpG2.CpG–CytosinephosphateGuanine3.镶嵌的甲基化(mosaicmethylation):基因组中,高度甲基化的部分DNA序列被大的非甲基化DNA序列所分隔开4.难以被DNA修复系统所识别:CG→TG是可遗传的2.DNA的甲基化的过程3.DNA甲基化的检测1.传统实验方法Methylation-sensitiverestrictionenzymesMethylation-specificenzymeMcrBC2.现代方法MeDIP:methylatedDNAimmunoprecipitationassayMBD:methylationbindingdomain3.DNA甲基化位点的确定:Bisulfitegenomicsequencing直接干扰机制间接机制
(1)Themethyl-CpGbindingProteinsMeCP1andMeCP2能够与甲基化的DNA结合
(2)MeCP2能够招募Sin3a,HDACs,形成复合物,阻遏转录4.DNA甲基化的作用机制(二)真核生物的DNA甲基转移酶1.哺乳动物:DNMT1,DNMT3A,DNMT3B,DNMT3L,DNMT22.拟南芥:DRM2,MET1,DNMT2,CMT
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