第1章-2 核酸的性质与研究方法(郭蔼光主编配套课件)_第1页
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主讲老师:白生文bsw4588384@163.com2011-2012学年第一学期核酸2023/9/171§1.3核酸的理化性质§1.4核酸的分离纯化、测定及研究方法【主要内容】:2023/9/172一.物理性质1.性状:RNA及其组分核苷酸、核苷、嘌呤碱、嘧啶碱的纯品都呈白色的粉末或结晶;DNA则为疏松的石棉一样的纤维状固体。2.溶解性:RNA和DNA都是极性的化合物,一般说来,这些化合物都微溶于水,不溶于乙醇、乙醚、氯仿等有机溶剂。它们的钠盐易溶于水。DNA和RNA在生物细胞内都与蛋白质结合成核蛋白,DNA核蛋白与RNA核蛋白的溶解度受溶液的盐浓度的影响而不同。DNA蛋白在低浓度的盐溶液中随盐浓度的增加而增加,在1mol/L的NaCl溶液中溶解度比纯水高2倍,在0.14mol/L的NaCl溶液中溶解度最低,仅为水的1%,几乎不溶解;而RNA蛋白在盐溶液中其溶解度受盐浓度的影响较小,在0.14mol/L的NaCl溶解度较大。因此,在核酸的提取中,常用此法将两种核蛋白分开,然后用蛋白质变性剂去除蛋白质。3.粘性:核酸的水溶液粘度很大,粘度DNA大于RNA。核酸变性后,粘度下降。1.3核酸的理化性质及其应用2023/9/173碱解二.核酸可被酸、碱或酶水解,DNA比RNA稀碱稳定。2023/9/174三.核酸的两性电离与等电点

核酸的磷酸基具有酸性,碱基具有碱性,因此,核酸具有两性电离的性质。但核酸中磷酸基的酸性大于碱基的碱性,故其等电点偏酸性。DNA的pI约为4~5,RNA的pI约为2.0~2.5,在pH7~8电泳时泳向正极。2023/9/175两性电离的性质

2023/9/176核酸分子中的嘌呤和嘧啶碱基中含有共轭双键体系,因而具有特殊的紫外吸收光谱,其最大吸收峰位于260nm处,而蛋白质最大吸收峰280nm。利用这一性质可定量测定核酸的含量或鉴定核酸的纯度。通常从A260/A280的比值既可判断样品的纯度四.核酸紫外吸收2023/9/177核酸

:OD260

蛋白

:OD280

酚类:OD320

①DNA:≈1.8纯品

OD260/OD280>1.8RNA污染<1.8pro污染②RNA:

OD260/OD280≈2.0纯品所以,样品中如含有蛋白质及苯酚等杂质,此比值明显降低。核酸的紫外吸收2023/9/178对于纯的样品,只要读出A260即可算出含量:

1OD相当于50ug/毫升双链DNA;或40ug/毫升单链DNA/RNA;或20ug/毫升寡核苷酸.对于不纯的样品,可以琼脂糖凝胶电泳分离出带后,经啡啶溴红染色而粗略估计其含量2023/9/179五.DNA的变性、复性与分子杂交(一)DNA变性(denaturation)1.DNA变性的概念:指DNA分子中的双螺旋结构解链为无规则线性结构的现象。2.DNA变性的本质:维持双螺旋稳定性的氢键断裂,碱基间的堆积力遭到破坏,但不涉及到其一级结构的改变。3.导致DNA变性的因素:凡能破坏双螺旋稳定性的因素,如加热、极端的pH、有机试剂甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺等,均可引起核酸分子变性P26-272023/9/17102023/9/17114.变性DNA的特征:(1)溶液粘度降低:DNA双螺旋是紧密的刚性结构,变性后转化成柔软而松散的无规则单股线性结构,因此粘度明显下降;(2)旋光性发生变化:变性后整个DNA分子的对称性及分子构型改变,使DNA溶液的旋光性发生变化;(3)紫外吸收增强;(4)密度上升.2023/9/1712增色效应(hyperchromiceffect):指DNA变性后其紫外吸收明显增强的效应。在DNA双螺旋结构中碱基藏入内侧,变性时DNA双螺旋解开,于是碱基外露,碱基中电子的相互作用更有利于紫外吸收,故而产生增色效应。减色效应:复性的DNA溶液紫外吸收下降称为减色效应。核酸紫外吸收值比其各核苷酸成分的紫外吸收值之和减少30%-40%的现象。2023/9/17132023/9/1714

通常将核酸加热变性过程中,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为核酸的解链温度,由于这一现象和结晶的融解相类似,又称熔解温度,在Tm时,核酸分子内50%的双螺旋结构被破坏。熔解温度(Tm,meltingtemperature)。2023/9/17152023/9/1716影响DNA的Tm值的因素:DNA的均一性DNA分子中碱基组成的均一性:只含有一种碱基对的多核苷酸片段,比天然DNA的Tm值范围窄。因它在变性时的氢链断裂几乎可“齐同”进行,故所要求的变性温度更趋于一致。待测样品DNA的组成是否均一:如样品中只含有一种DNA,其Tm值范围较窄,若混杂有其它来源的DNA,则Tm值范围较宽。原因也与DNA的碱基组成有关。2023/9/17172023/9/1718不同生物中(G+C)含量:20%-80%A

=T,G≡C,破坏G-C间氢键需比A-T氢键付出更多的能量。DNA中(G+C)含量高能增强结构的稳定性,

所以,DNA分子中的(G+C)的含量越高,Tm值越高。当DNA溶于0.2mol/LNaCl:

(G+C)%=(Tm-69.3)×2.44Tm=69.3+0.41(G+C)%DNA的(G+C)含量2023/9

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