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文档简介
朝鲜族男性人群DYS388基因座遗传多态性分布研究
【关键词】基因型;遗传多态性;人种群
[摘要][目的]探讨Y染色体特异性短串联重复序列基因座DYS388的遗传多态性在吉林省延边地区朝鲜族人群中的分布情况.[方法]应用PCR,PAGE技术分离扩增产物,结合银染显带技术对DYS388基因座进行调查.[结果]在DYS388基因座中检测出6个等位基因,其频率分别为,,,,,,个人识别率为[结论]所得到的等位基因频率数据可为朝鲜族人群法医学个人识别、亲权鉴定及遗传学研究提供依据.
[关键词]基因型;遗传多态性;人种群
AllelefrequencyofDYS388STRlocusinKoreannationalityethnicgroup
CUIHong1,ZHANGYong-ji2,XUQing-song1
ABSTRACT:OBJECTIVEToinvestigatetheDYS388STRlocusalleledistributionamongKoreannationalityethnicgroupinYanbianarea,JilinTheamplificationwascarriedoutbyPCRandPAGE,andtheDYS388STRlocusalleledistributionwasanalyzedbythetechniqueofpolyacrylamidegel
electrophoresiswithsilverTotalsixalleleswereobservedamongallsamplesandthefrequencies,,,,,calculatedgenediversityThedataobtainedcanbeusedinindividualidentification,paternitytestandpopulationgeneticsinvestigationforKoreannationalityethnicwords:gene;polymorphism;ethnicgroups
人类Y染色体特异的短串联重复序列为常用的Y染色体特异性遗传标记,在法医物证学、个人识别、亲权鉴定及人类遗传学分析等领域具有特殊的应用价值[1,2].本文采用PCR,PAGE技术对吉林省延边地区182名无血缘关系的朝鲜族男性个体进行了DYS388位点的遗传多态性研究,获得了该位点的遗传多态性参数.
1材料与方法
样本182名无血缘关系的朝鲜族男性个体的枸橼酸钠抗凝血由延边大学医院提供.
基因组DNA的提取采用韩国Kisanbiotech公司提供的全血基因组DNA纯化系统,采用有机法提取DNA[3].
PCR扩增引物序列选自基因组数据库DYS388如下:上游引物序列为5′-GTGAGTTAGCCGTTTAGCGA-3′,下游引物序列为5′-CAGATCGCAACCACTGCG-3′.PCR在20μL反应体系中进行,内含/LdNTP,100g/LPCR缓冲液,/μLTaq酶,加入均为μmol/L的上游引物和下游引物,将样品混匀后置入GeneAmpPCR2004系统中进行扩增.扩增参数为95℃预变性3min,94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,共30个循环后于72℃继续延伸10min,产物置于4℃保存.
扩增产物的电泳分型及检测
电泳分型取扩增产物3μL与等体积上样缓冲液混合,上样于5%变性聚丙稀酰胺凝胶中进行电泳,恒定功率为50W,电泳时间为90min.
银染显色将电泳完毕后的凝胶取下,按如下步骤进行操作:双蒸水冲洗1次15s,置于10g/LHNO3溶液中,轻摇5min;双蒸水冲洗1次15s,置于2g/LAgNO3溶液中,轻摇15min;双蒸水冲洗1次15s,置于30g/LNa2CO3溶液中,轻摇10min;可见清楚的条带时加入适量100g/L乙酸停止显色.
等位基因分型标准物的制备及命名等位基因分型标准物由混合不同表型个体DNA后进行扩增而得[4].所制备的分型标准物与PCR产物同步进行电泳,比较样本PCR产物的电泳谱带,对应分型标准物所处的位置,确定样本表型,根据国际法医遗传学会DNA委员会推荐原则命名等位基因[5].
数据处理遗传多样性的计算根据以下公式进行[6]:GD/HD=N/.
2结果
DYS388基因座中检测出10,11,12,13,14,15等位基因,其频率分别为,,,,,,个人识别率为,见表1.由表1可见,朝鲜族男性居民与韩国本国居民等位基因分布间无显着性差异,与普米族居民比较差异有统计学意义.表1朝鲜族男性与不同人群DYS388位点等位基因频率比较
3讨论
朝鲜族男性DYS388等位基因分布频率与韩国本国居民进行比较可见,朝鲜族男性与韩国人群DYS388等位基因分布间无显着性差异,符合与韩国人是同一祖先的历史学和民族学记载[9].延边朝鲜族与中国普米族DYS388等位基因分布间差异有统计学意义,提示Y-STR多态分布与常染色体STR位点一样在不同民族之间存在差异[10].本文所建立的朝鲜族男性群体Y染色体DYS388基因座的群体遗传学资料,为延边地区朝鲜族群体法医学个体识别、亲权鉴定及遗传学研究提供了
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