第二章数量遗传学基础-重复力

第二章数量遗传学基础第三节数量性状遗传参数分析数量性状遗传研究的基本统计方法*总体(poputlation)和样本(sample)*总体参数(parameter)与样本统计量(statistic)资料均值资料变异程度*资料相关程度资料变异程度用以衡量群体数量资料的变异程度(也称离中性/分散程度)的参数主要有：方差/均方(variance,V/S2)；标准差(standarddeviation,S)。总体资料的参数由样本的统计量估计：方差的计算公式；标准差的计算公式。当样本容量大于30时，可用n代替n-1计算方差与标准差。*资料相关程度用以衡量同一遗传群体不同数量性状间相互关联程度的参数主要是：协方差(covariance,C)；相关系数(correlationcoefficient,r)。总体协方差与相关系数也由样本统计量估计：样本协方差的估计；样本相关系数的估计。遗传参数参数（parameter）反映总体特征的数遗传参数(geneticparameter)反映总体遗传特征的参数,即指为了进行基因型选择而估计育种值时所必须参考的一些常数。数量性状的三个最重要的遗传参数：重复力，遗传力，遗传相关不可观测，只能用统计学方法进行估计一、重复力重复力（repeatability）的定义：同一个体某一性状各次度量之间的相关（可重复的程度）,用统计学语言表达，是指同一个体不同次生产记录的组内相关系数（intraclasscorrelation）。在时间上的重复：产奶量、产仔数在空间上的重复：羊毛品质影响同一个体同一性状各次度量之间相关性的因素：遗传：各次度量值受相同的遗传因素（基因型）影响环境：持久性环境效应 组间方差=遗传方差+持久环境方差一、重复力重复力的估计模型：个体（组）效应（随机）随机误差一、重复力方差分析一、重复力重复力的估计一、重复力重复力的估计重复力的主要用途一、重复力确定n次度量的相对精确性：一次度量：n次度量平均数：重复力的主要用途n次度量的相对精确性：作为遗传力估计值的上限用于育种值估计重复力的主要用途不同度量次数的相对精确性re=0.5re=0.75re=0.25re=0.1重复力的主要用途估计个体终生平均生产能力

根据个体的前n次记录的平均数估计其终生平均生产能力

n次度量平均数的重复力个体终生平均生产能力估计值群体平均数二、遗传力（一）遗传力（heritability）的定义遗传变异占总变异(表型变异)的比率，用以度量遗传因素与环境因素对性状形成的影响程度，是对杂种后代性状进行选择的重要指标。P=G+E=A+D+I+Es+Er=A+R （一）遗传力（heritability）的定义广义遗传力(heritabilityinthebroadsense):遗传方差占总方差(表型方差)的比率PrGEGEH狭义遗传力（heritabilityinthenarrowsense）:加性方差占总方差的比率。PrGEARh二、遗传力遗传力=0.25（一）遗传力（heritability）的定义期望的后代平均性能亲本的性能（与群体均数的离差）h2=0.5h2=0.25h2=0.10（一）遗传力（heritability）的定义（二）遗传力的估计基本原理根据亲属之间的相关性估计

P1A1R1hP2A2R2hrA假定：亲属间不存在非加性效应相关和环境相关在非近交群体中（二）遗传力的估计估计方法利用亲子资料：A.子亲回归

亲代观测值：单亲观测值或双亲平均值（中亲值）子代观测值：一个后代观测值或多个后代平均值（二）遗传力的估计子亲回归系数:遗传力估计值:单个亲本：中亲：注意：

-不同亲本之间不能有亲缘关系不同亲子对之间不能有系统环境差异

-当性别对性状表达有影响时，应采用同一性别的 子亲回归，常用女母回归（二）遗传力的估计

B.公畜内子母回归:

适用于在不同公畜家系间存在系统环境差异的情形父亲 母亲 后代数据资料S1D11D12O11

O12O1nS2D21D22D2nO21O22O2n

D1n

（二）遗传力的估计计算公畜内平方和及乘积和母亲平方和：后代平方和：子母乘积和：（二）遗传力的估计公畜内子母回归系数遗传力估计值（二）遗传力的估计女母回归或相关法式中，N为亲子对数；O为女儿性状表型值；P为母亲性状表型值；VP为母亲性状表型方差；COVOP为女儿与母亲同一性状的表型协方差。

该方法仅限于母畜（禽）表现的限性性状，性状遗传率为女儿产量对母亲产量回归系数的2倍，即：利用同胞资料-同胞分析（sibanalysis）（父系）半同胞资料S1D11D12O11

O12O1nS2D21D22D2nO21O22O2n

D1n

（二）遗传力的估计同胞相关法动物的同胞有全同胞和半同胞之分，因此估测遗传率的方法可分为半同胞相关法和全同胞相关法。根据半同胞相关估测遗传率的公式为:同理，用全同胞相关估测遗传率的公式为：原理rHS=半同胞组内相关（二）遗传力的估计1）数据结构:2）模型:（二）遗传力的估计3）方差分析（二）遗传力的估计4）半同胞组内相关系数5）注意：

-所有亲本间不能有亲缘关系

-

不同家系间不能有系统环境差异（二）遗传力的估计子亲回归:6）遗传力估计值的标准误公畜内女母回归:单亲:中亲:（二）遗传力的估计6）遗传力估计值的标准误同胞分析-半同胞资料（二）遗传力的估计(三)遗传力的用途如前所述，遗传率可作为杂种后代性状选择指标的指标，其高低反映：性状传递给子代的能力、选择结果的可靠性、育种选择的效率；通常认为遗传率：

>50%高； =20%~50%中； <20%低.1.制定育种方案:对遗传率高的性状宜采用本品种选育，对遗传率低的性状则宜采用杂交育种。2.确定选择方法:根据h2高低，确定是采用个体表型选择（h2高者）呢还是采用家系选择（植物叫群内选择）（h2低者）。或二者兼顾。3.育种值估计4.预测选择反应:子代群体均值与亲代群体均值之差称为遗传进展或选择反应，用△R表示：△R=Sh2

其中：S——留种群均值与供选群体均值之差，称为选择差。(三)遗传力的用途亲属间的遗传相关：指有