《函数的奇偶性》函数-模板

人類基因體計劃HumanGenomeProject(HGP)

約翰薩爾斯頓JohnE.Sulston人類基因體計劃

1國際人類基因組團隊版(InternationalHumanGenomeConsortium)

美國國家衛生研究院NIH(NationalInstituteofHealth)

美國國家能源部

英國Sanger中心(衛康信託基金會贊助)

德國法國日本中國………等十五個國家

超過六十個各別的大學和研究機構，分工進行定序工作負責總單位美國國家人類基因研究院(NationalHumanGenomeResearchInstitute)國際人類基因組團隊版2《函数的奇偶性》函数PPT-模板3塞雷拉版國際人類基因組團隊版DNA資訊來源基因藍圖由公立Gene基因藍圖由公立GeneBank和獨立資料庫同組成Bank單一來源築構基因組樣本5位不同性別種族人體數名匿名捐贈者定序鹼基長度99%連續90%(43%不連續)定序基因數目26,383完成23,147主要定序方法散彈定序法傳統physicalmapping+大片段逐步定序定位的SNPs約兩百一十萬約一百四十萬數量耗時9個月14+年計劃主持人CraigVenterPh.D

FrancisCollinsPh.D《函数的奇偶性》函数PPT-模板4《函数的奇偶性》函数PPT-模板5

61968高中畢業,入伍從軍參加越戰

1972畢業於加大聖地牙哥分校學士

1975加大聖地牙哥分校生理藥學博士

1976-79任教於紐約州立大學水牛城分校

1979-91任職於美國國衛院(NIH)研究中心

1992成立非營利基因研究機構TIGR(TheInstituteofGenomicResearch)

1998與PerkinElmar合作成立賽雷拉基因組公司

1968高中畢業,入伍從軍參加越戰

19727HumanGenomeProjectGoalsandCompletionDates

AreaGoalAchievedDateAchieved

GeneticMap2-to5-cM1-cM

(600–1,500markers)(3,000markers)September1994

PhysicalMap30,000STSs52,000STSsOctober1998

DNASequence95%gene-containingpart99%finishedto99.99%accuracyofApril2003

Cost500Mb/yearat>1,400Mb<$0.25base<$0.09baseNovember2002

Variation100,000SNPs3.7millionSNPsFebruary2003

GeneFull-lengthcDNAs15,000cDNAsMarch2003HumanGenomeProjectGoalsand8《函数的奇偶性》函数PPT-模板91.1%的基因組為製造人體"零件"的表現序列(exons)

24%為不被蛋白序列表達的裡序列(introns)75%左右的基因序列不是沒有實際作用就是功能未知HowManyGenesAreintheHumanGenome?

1.1%的基因組為製造人體"零件"的表現序列(exons)10《函数的奇偶性》函数PPT-模板11《函数的奇偶性》函数PPT-模板12《函数的奇偶性》函数PPT-模板13冠狀病毒0.03Mb黴漿菌0.58嗜血桿菌1.8大腸桿菌4.6酵母菌12瘧原蟲23果蠅180斑馬魚1700小鼠3000人類3150阿拉伯介125Mb稻米430蕃茄1000(2x)大豆1100馬鈴薯1800棉花2118大麥4900小麥16000(6x)冠狀病毒0.03Mb阿拉伯介14阿米巴原蟲類Amoebadubia670,000Mb

阿米巴原蟲類Amoebaproteus270,000狹葉瓶爾小草Ophioglossumpetiolatum160,000非洲肺魚Protopterusaethiopicus139,000川貝母Fritillariaassyriaca124,900

鐵炮百合Liliumlongiflorum90,000雙指兩棲螈Amphiumameans84,000泥蠑Necturusmaculosus81,300蘚苔松類Pinusresinosa68,000台灣百合Liliumformosanum36,000圓篩藻屬Coscinodiscus25,000蠑螈Trituruscristatus20,600洋蔥Alliumcepa18,000沙漠蝗蟲Schistocercagregaria9,300阿米巴原蟲類Amoebadubia15草履蟲Parameciumcaudatum8600盤古蟾蜍Bufobufo6900貓鯊屬Scyliorhinus[軟骨魚綱]6000土豚Orycteropusafer5763鼠類Peromyscuseremiticus5295原猴科Tarsiussyrichta5152猴科Cercopithecuscephus5142猴科Cercopithecusnigroviridis5117玉米Zeamays5000大麥Hordeumvulgare5000鼠類Thomomystownsendii4934http://www.cbs.dtu.dk/databases/DOGS/index.php草履蟲Parameciumcaudatum16BAC100-300kb(bacterialartificialchromosome)YAC1000kb(yeastartificialchromosome)Cosmid45kbPhage20-30kbBAC100-300kb(bacterial17《函数的奇偶性》函数PPT-模板18Contig連續性序列Scaffold由多個contig所連接城的大片段DNA架構GeneticMap遺傳圖譜PhysicalMap(物理)實質圖譜Draftsequence序列草圖-有片段不完整順序方向可能有些錯誤EST(ExpressedSequenceTag)會表現的基因中所選出的小片段可作為定位標記FinishedSequence每萬(10萬)個核酸錯誤少於一個排列位置或方向均正確幾乎沒有缺口人類基因組於2003年4月15日宣佈STS(sequenceTaggedSite)當做定位或序列組合時的標記

Contig連續性序列19《函数的奇偶性》函数PPT-模板201995嗜血桿菌1.83Mb,1740基因黴漿菌0.58Mb,517基因1996酵母菌12Mb,6