遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座

第三章遗传作图和基因定位基因定位genemapping：将基因定位于某一特定染色体详细位置，以及测定基因在染色体上线性排列次序与距离。遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第1页遗传作图、基因定位意义展开基因功效研究需要；说明发育分子机制、分子标识辅助育种工作基础；对于农作物等基因组序列冗长物种，作图定位是基因克隆必备步骤。

遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第2页3.1基因定位基本方法两点测验：经过一次杂交和一次测交来确定两对基因重组率，然后依据重组率确定距离。首先将三对性状两两组合成三组，进行三次杂交和三次测交，求算每两对相对性状基因重组率，推出三个基因排列次序。遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第3页ShShCCshshcc同源染色体ShCshcShcshCShCCShshshccc（交换）同源染色体同源染色体（交换后）CCccshshShSh（后期II染色单体分开）同源染色体配对、交换重组示意图交换都发生在同源染色体相靠近非姊妹染色体之间遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第4页ShCshc二分体ShCShCShCShCShCshcshcshcshcshcshCShcCShCShCShcShCshcshcshcsh全部亲本型1/2亲型1/2重组型F1交换交换F1新新一部分染色体交换发生在连锁基因之内，→重组配子1/2重组、1/2亲型配子所以重组型配子自然少于50%交换发生在连锁基因之外→非重组配子遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第5页玉米两点测验数据试验类别亲本和后代表现型及基因型种子粒数重组型配子（％）种类亲本组合或重新组合第一相个引试组验P1P2有色、饱满（CCShSh）无色、凹陷（ccshsh）测交(Ft)后代有色、饱满（CcShsh）有色、凹陷（ccShsh）有色、凹陷（Ccshsh）无色、凹陷（ccshsh）亲新新亲403215214940353.6T＝8368第二相个斥试组验P1P2糯性、饱满（wxwxShSh）非糯性、凹陷WxWxshsh）测交(Ft)后代非糯性、饱满WxwxShsh）非糯性、凹陷Wxwxshsh）糯性、饱满（wxwxShsh）糯性、凹陷（wxwxshsh）亲新新亲588515311488599120.0T＝14985第三相个引试组验P1P2非糯性、有色WxWxCC）糯性、无色（wxwxcc）测交(Ft)后代非糯性、有色（WxwxCc）非糯性、无色（Wxwxcc）糯性、有色（wxwxCc）糯性、无色（wxwxcc）亲新新亲2542739717271622.0T＝6714遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第6页由第一、二试验测得C－Sh间重组率为3.6％，Wx－Sh间重组率为20.0％，据此初步推测3个基因排列次序可能是：Wx20.0Sh3.6C23.6①Wx20.0Sh②C3.616.4由第三组试验测得Wx－C之间重组率为22.0％，与23.6％较为靠近，所以能够推断3个基因排列次序为第一个排列方式。Wx－C重组率为23.6％Wx－C重组率为16.4％两点测验繁杂，确定三个基因位置需要进行三次杂交和测交；以重组率代替交换值，未将双交换预计在内，在距离超出5个遗传单位时，可发生双交换，所以准确性较差。遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第7页三点测验（一定要掌握！）是三对连锁基因定位最惯用方法，首先用三对相对性状都有差异两纯合亲本杂交，然后用杂种F1与纯隐性个体进行测交，依据测交子代不一样类型占总类型百分数，确定F1所产生配子类型和百分比，用于预计双交换值、推出基因排列次序，并估算基因之间距离。三点测验经过一次杂交和一次测交，同时确定3对基因在染色体上位置，将双交换包含在交换值中，因而对距离估算愈加准确。又因只做一次杂交、一次测交，所以更便于控制环境影响。遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第8页玉米三点测验（+表示显性基因型）P

凹陷、非糯、有色×饱满、糯性、无色

sh+++wxcF1×凹陷、糯性、无色

遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第9页玉米三点测验数据测交子代表现型由测交子代表现型推知F1配子类型粒数F1配子起源饱满、糯性、无色+wxc2708亲型凹陷、非糯性、有色sh++3538亲型饱满、非糯性、无色++c626单交换Ⅰ型凹陷、糯性、有色shwx+601单交换Ⅰ型凹陷、非糯性、无色sh+c113单交换Ⅱ型饱满、糯性、有色+wx+116单交换Ⅱ型饱满、非糯性、有色+++4双交换型凹陷、糯性、无色shwxc2双交换型8种类型Ft子代，4种百分比，经典3对基因连锁遗传表现，可用于推断3对基因在染色体上次序，并计算距离。遗传学遗传图的制作和基因定位专家讲座第10页确定三对基因次序

依据测交子代表现型，推测F1杂合体3对连锁基因次序：双交换配子中，没有改变基因决定性状在中间。