转座因子的遗传分析

关于转座因子的遗传分析Emerson于1914年发现玉米果皮花斑产生在于突变基因的不稳定性。1938年Rhoades研究玉米糊粉层时也发现了基因的不稳定性：转座因子引起花斑最初认为是双突变导致一转座因子的发现第2页,共42页，星期六，2024年，5月

40年代初，McClintock

研究玉米花斑糊粉层和植株色素产生的遗传基础

发现色素变化与染色体重组有关。染色体的断裂或解离（dissociation）有一个特定位点(Ds)。Ds不能自行断裂，受一个激活因子（activator）

Ac所控制。

Ac可以像普通基因一样进行传递，但有时表现很特殊，

可以离开原座位

转移到同一个或不同染色体的另一座位。

Ds也能移动，不过只有在Ac存在时才能发生。

McClintock把Ac和Ds称为控制因子或转座因子

“控制因子”假说。第3页,共42页，星期六，2024年，5月Ds转座导致籽粒斑点表型第4页,共42页，星期六，2024年，5月插入成分IS序列是在细菌中首次发现的跳跃基因，并在分子水平上得到证实第5页,共42页，星期六，2024年，5月美国遗传学家巴巴拉．麦克林托克（B．McClintock）

30年代初做出的发现、40年代提出的理论，到60年代末终于被重新提起，80年代初为科学界普遍接受。1983年,麦克林托克由于发现了可移动的遗传物质，被授予诺贝尔医学奖。第6页,共42页，星期六，2024年，5月3种不同类型的转座：（1）复制型转座（replicativetransposition）

作为自身移动的一个部分，转座子被复制，一个拷贝仍然保留在原来的位置上，而另一个则插入到一个新的部位，这样转座过程伴随着转座子拷贝数的增加。二DNA转座第7页,共42页，星期六，2024年，5月第8页,共42页，星期六，2024年，5月（2）非复制型转座

转座元件作为一个物理实体直接由一个部位转移到另一个部位。第9页,共42页，星期六，2024年，5月第10页,共42页，星期六，2024年，5月（3）保守型转座保守型转座是另一种非复制型的转座过程，该过程中转座元件从供体部位被切除并通过一系列的过程插入到靶部位，在该过程中每个核苷键皆被保留。该转座过程与λ的整合机制类似，并且转座酶与λ整合酶家族有关。第11页,共42页，星期六，2024年，5月第12页,共42页，星期六，2024年，5月三反转录转座子转座元件或转座子是基因组中可移动的独立的DNA序列，一个转座子可由基因组的一个位置移到另一个位置。从DNA到DNA的转移过程称为转座。从DNA到RNA再到DNA的过程称为反转座。反转座是经RNA介导的转座过程。第13页,共42页，星期六，2024年，5月必须经过RNA中间体的转座过程是真核生物所特有；一些真核细胞的转座子和反转录病毒的原病毒的一般组成结构相关，并且通过RNA中间体进行转座，这一类结构单位称为反转座子（retroposons）。第14页,共42页，星期六，2024年，5月第15页,共42页，星期六，2024年，5月反转座子共有的可鉴定的特性为：插入位点会产生短的靶序列的正向重复。反转录病毒首先被观察到的是以传染性病毒颗粒的形式存在，并能在细胞间传播；而反转座子是被当作基因组中的一部分而被发现的，它们可以在基因组内进行转座，但不能在细胞间迁移。第16页,共42页，星期六，2024年，5月第17页,共42页，星期六，2024年，5月根据分子结构与遗传特性可以分为三类。

具有转座能力的简单遗传因子，长度一般小于2kb，最少的插入序列如IS1仅768bp。

IS因子本身没有任何表型效应，只含与转座有关的基因与序列。共同特征是在其末端都具有一段反向重复序列（IR）。第二节原核生物中的转座因子一．插入因子（insertionsequence，IS）第18页,共42页，星期六，2024年，5月IS结构模式第19页,共42页，星期六，2024年，5月茎环结构的形成第20页,共42页，星期六，2024年，5月二转座子（transposons）

由几个基因组成特定的DNA片段

常带抗菌素抗性基因，易于鉴定。转座子可以分为以下两种系统：

①.复合转座子：IS因子

抗菌素抗性片段

IS因子

。

②

简单转座子：不含IS因子的Tn转座子。第21页,共42页，星期六，2024年，5月复合转座子与简单转座子结构

第22页,共42页，星期六，2024年，5月三Mu噬菌体（Mu）：

是E.coli

的温和噬菌体，溶源化后能起转座子作用。

Mu噬菌体也含有与转座有关的基因和反向重复序列。

Mu能够整合进寄主染色体，催化一系列染色体的重新排列。第23页,共42页，星期六，2024年，5月

Mu位点特异性的倒置第24页,共42页，星期六，2024年，5月

细菌转座子的转座机制研究最为清楚。

转座过程是一个非同源重组过程，通过这一重组过程，转座子出现在一个新的位置上，可是原来位置上的转座子并不消失。转座过程分子机制还有待进一步研究。第25页,共42页，星期六，2024年，5月第三节真核生物的转座因子一酵母菌基因组中的转座子

酵母Ty1转座子结构Solo的形成第26页,共42页，星期六，2024年，5月酵母Ty1的转座第27页,共42页，星期六，2024年，5月二果蝇基因组中的转座子第28页,共42页，星期六，2024年，5月果蝇的P因子与杂种劣势第29页,共42页，星期六，2024年，5月果蝇中的3种转座子结构第30页,共42页，星期六，2024年，5月

玉米籽粒色斑的产生、果蝇复眼颜色的变异、啤酒酵母接合的转换等现象都与转座因子在染色体上的转座有关。

玉米除Ac-Ds系统外，Spm控制因子也有自主控制因子

非自主控制因子。

Ac因子由4563个核苷酸组成

一个由11个核苷酸组成的未端反向重复区

两个与转座有关的酶基因（一个大基因和一个小基因）。三玉米基因组中的转座子

第31页,共42页，星期六，2024年，5月

Ds因子的大小差别很大。Ds9很象Ac，只是缺失了一些核苷酸。而一个最小的Ds因子只有Ac长度的1/10，仅仅包括了Ac因子的未端反向重复区。第32页,共42页，星期六，2024年，5月

来自不同植物种的元件往往有其共同的未端序列

同一家簇各成员的未端倒位重复存在某种程度的序列同源，其长度（6~13bp）和结构保守。例如Ac和Ds的未端倒位重复几乎一样。但有一个不同之处：Ac两端最外边的核苷酸是彼此不互补的T-G、Ds是互补的T-A。转座子未端序列是转座酶识别位点（保守性很强）。第33页,共42页，星期六，2024年，5月四人类基因组中的转座子

人类基因组中的几种主要转座子第34页,共42页，星期六，2024年，5月第五节转座因子的遗传学效应及应用一引起染色体结构变异

由转座子引起的染色体DNA缺失或倒位第35页,共42页，星期六，2024年，5月二诱发基因突变与启动外显子混编双转座启动不同基因间的外显子混编第36页,共42页，星期六，2024年，5月三调节基因表达转座子调节宿主基因表达第37页,共42页，星期六，2024年，5月四产生新的变异转座因子有时也会失活，失活主要与DNA甲基化有关。转座因子携带新基因，如抗生素抗性基因；使宿主基因发生重新组合或表达。表观遗传学：研究在DNA序列不出现变化的情况下基因表达出现可遗传变化的科学。研究对象包括：DNA甲基化、基因组印记、RNA编辑、

RNA干涉以及转座子调节等。第38页,共42页，星期六，2024年，5月五转座子标记目的基因

转座因子可作为基因的标记克隆目的基因。现已利用转座因子克隆出一些重要基因。方法：

从带转座因子生物筛选出发育、生理与行为等有突变品系。如果这些突变是由转座子DNA克隆所产生，则必定有与该突变体有关的基因存在（用转座子给未知目的基因加上标记）

以此突变基因的有关顺序作探针

从野生品系的基因文库中获得野生型目的基因。结合原来突变品系表型，可探知此基因功能，从分子水平上对基因进行研究与利用。第39页,共42