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文档简介

PCR技术中“引物”分析1.引物存在的必要性2.引物的设计原则3.PCR循环时与引物相关的计算4.引物的选择和互补链的判断5.引物与PCR反应时复性温度和时间的关系6.引物设计与定点突变

突破一、引物存在的必要性1.DNA复制为什么需要引物?课前反馈:(1)PCR反应体系中含有热稳定DNA聚合酶,下面的表达式________(能、不能)正确反映DNA聚合酶的功能,这是因为_______。(2)若用PCR技术扩增HMA3基因,需要在PCR扩增仪中加入_________种引物,其作用是_______________________。利用PCR技术扩增基因HMA3时,设计引物序列的主要依据是___________。(1)不能DNA聚合酶只能将单个脱氧核苷酸结合到已有的引物链(核酸单链)上

(2)2使耐高温的DNA聚合酶从引物的3´端开始连接脱氧核苷酸

HMA3基因两端的部分核苷酸序列。优化P1421.(2023·浙江卷)某研究小组利用转基因技术,将绿色荧光蛋白基因(GFP)整合到野生型小鼠Gata3基因一端,如图甲所示。实验得到能正常表达两种蛋白质的杂合子雌雄小鼠各1只,交配以期获得Gata3-GFP基因纯合子小鼠。为了鉴定交配获得的4只新生小鼠的基因型,设计了引物1和引物2用于PCR扩增,PCR产物电泳结果如图乙所示。图甲图乙下列叙述正确的是(

)A.Gata3基因的启动子无法控制GFP基因的表达B.翻译时先合成Gata3蛋白,再合成GFP蛋白C.2号条带的小鼠是野生型,4号条带的小鼠是Gata3-GFP基因纯合子D.若用引物1和引物3进行PCR,能更好地区分杂合子和纯合子B例1、为研究水稻D基因的功能,研究者将T-DNA插入到D基因中,致使该基因失活,失活后的基因记为d。(1)运用农杆菌转化法时,为鉴定筛选出的(农杆菌)菌落中是否含有正确插入目的基因的重组质粒,拟设计引物进行PCR鉴定。图2所示为甲、乙、丙3条引物在正确重组质粒中的相应位置,PCR鉴定时应选择的一对引物是__________。某学生尝试用图中另外一对引物从某一菌落的质粒中扩增出了400bp片段,原因是________________________。乙丙目的基因的反向连接突破一、引物存在的必要性图2T-DNA目的基因乙小结:利用PCR鉴定目的基因是否插入到质粒上时,一个引物与质粒DNA互补结合,另一个引物与目的基因DNA互补结合,这样只有以重组DNA为模板才能获得扩增产物。实验思路:随机选取F2植株若干,提取各植株的总DNA。分别用引物“Ⅰ+Ⅲ”组合及

“Ⅱ+Ⅲ”组合进行PCR,检测是否扩增。预期结果:若两种引物组合均可完成扩增,则相应植株的基因型为Dd;

若只有“Ⅰ+Ⅲ”组引物可完成扩增,则相应植株的基因型为dd;

若只有“Ⅱ+Ⅲ”组引物可完成扩增,则相应植株的基因型为DD;(2)(改编题)现以野生植株和突变植株作为亲本进行杂交实验,为探究F2植株基因型。研究者根据D基因,T-DNA的序列,设计了3种引物,如图所示。请利用PCR技术设计实验,写出实验思路和预期试验结果。(提示:完整的T-DNA过大,不能完成PCR)思维拓展1:1.若构建基因表达载体时,基因反接,可抑制相关基因的表达,简述其原理。2.选择下图中的引物__________组合可扩增出两侧的未知序列。转录出的mRNA与原mRNA碱基互补配对,抑制基因的翻译过程①④优化P13010.设计引物是PCR技术关键步骤之一。某同学设计的两组引物(只标注了部分碱基序列)都不合理(如图),请分别说明理由。提示

引物Ⅰ和引物Ⅱ局部发生碱基互补配对而失效,引物Ⅰ'自身折叠后会出现局部碱基互补配对而失效突破二、引物的设计与应用引物设计一般要遵循以下原则:(1)典型的引物长度为18-30个碱基。短的引物(15个核苷酸以下)能非常高效地结合---但是它们的专一性

。非常长的引物能提高专一性,但是复性效率

,从而导致PCR产物量

。(2)引物设计应避免两个引物互补结合。(3)引物本身不能折叠配对差低低突破二、引物的设计与应用优化P144

(2022·山东卷)(1)为构建重组载体,需先设计引物,通过PCR特异性扩增P基因。用于扩增P基因的引物需满足的条件是______________________________________

。为使PCR产物能被限制酶切割,需在引物上添加相应的限制酶识别序列,该限制酶识别序列应添加在引物的

(填“3'端”或“5'端”)。

突破二、引物的设计与应用能与P基因母链的一段碱基序列互补配对、短单链核酸5'端原则(4)引物的延伸是从

端开始的,不能进行任何修饰。3′

若想在DNA两侧添加限制酶识别序列,可利用PCR技术对DNA进行扩增时,在

引物A、B的

端分别添加限制酶识别序列。5’引物A引物B3’5’3’5’引物A引物B5’5’第1次第2次第3次引物A引物B5’5’引物A引物B3’3’引物A引物B引物A引物B引物A引物A引物B引物B“最长原则”1.(2023·浙江·二模)下列有关生物技术与工程中所用技术操作与原理的叙述,错误的是(

)A.动物细胞培养——应用酶的专一性原理可对所需材料用胰蛋白酶进行处理B.制备单克隆抗体——应用细胞膜流动性原理对脾细胞与骨髓瘤细胞进行融合C.PCR技术的退火(复性)——应用碱基互补配对原理使引物结合在DNA模板链的5'端D.细胞核移植——细胞质可调控细胞核基因表达,选用卵细胞质使重组细胞表现出全能性引物A引物Ba链b链C突破二、引物的设计与应用专题突破练P2184.(2)①为保证双功能醇醛脱氢酶基因(Adh)能通过双酶切以正确方向插入质粒,需设计引物1和引物2,其中引物1的序列为5'-

-3'。

GGTACCGTACCTTTGT考前增分练P237

1.(1)研究者进行PCR扩增前根据epEGF基因设计了一对引物,据图1分析,该对引物序列的设计要求是_________________________________________________________________________________________________________________和____________________________________________________________________。

突破二、引物的设计与应用引物之间以及引物自身不能发生碱基互补配对,为了防止出现非特异性扩增片段,其长度不能过短,通常为20~30个核苷酸序列在两个引物的5'端分别添加上限制酶BamHⅠ和XhoⅠ的识别序列图1图2考前增分练P238

2.(2)培育“超级菌”。对菌株WZ改造后的CD3D基因进行研究,把CD3D基因和His标签基因(His标签由6个组氨酸组成)连接起来构建融合基因,并构建重组基因表达载体,下图为载体、CD3D基因的结构、不同限制酶的识别序列及切割位点,欲将标签基因连接在CD3D基因编码区的末端,已知组氨酸的密码子为CAU,终止密码子为UAG。①写出His的基因编码链的碱基序列5‘-

-3'。②为构建融合基因并将其插入载体,科研人员设计了一对与CD3D基因编码区两端序列互补配对的引物,设计时需在引物

(填“A”或“B”)的5'端增加相应的限制酶识别序列和His基因的编码序列,请写出该引物开头的12个碱基序列:5'-

-3'。CATCATCATCATCATCATTAGBCTCGAGCTAATG考前增分练P238

3.(1)为使甘蓝具有抗除草剂能力,科研人员将除草剂草甘膦抗性基因转入甘蓝植株,获得抗草甘膦转基因甘蓝。(1)草甘膦抗性基因一条链的两端序列如下,采用PCR技术获取和扩增草甘膦抗性基因,应选用的引物组合为(

)A.5'-CTTGGATGAT-3'和5'-TCTGTTGAAT-3'B.5'-CTTGGATGAT-3'和5'-TAAGTTGTCT-3'C.5'-ATTCAACAGA-3'和5'-ATCATCCAAG-3'D.5'-ATTCAACAGA-3'和5'-GAACCTACTA-3'A突破三

引物的选择和互补链的判断优化P142

3.(2023·福建厦门模拟)下图表示PCR过程中某个阶段反应体系的情况,①②③④表示相关物质,L、R表示方向。下列叙述正确的是()A.②链从L到R的方向为3'→5',①②链均可作为子链合成的模板B.PCR过程需要通过解旋酶断开氢键,且为边解旋边复制C.以1个DNA为模板经3次循环需消耗8个引物③D.物质③的5'端添加了某序列,至少需经2次循环才可获得该序列的双链产物D突破四PCR循环时与引物相关的计算引物A引物B目的基因引物A引物B目的基因引物A引物B目的基因(1)(2)(3)Q1:在DNA扩增过程中,由于半保留复制,至少经过

次循环,才有可能获取与目的基因等长的片段。引物A引物B目的基因(1)第1次引物A引物B第2次引物A引物B引物B引物A第3次引物B引物A引物A引物B若目的基因在DNA片段中间,则在DNA扩增过程中,由于半保留复制,至少经过

次循环,才有可能获取与目的基因等长的片段。3每次都选长度最短的DNA单链作为PCR模板“最短原则”引物A引物B目的基因(2)第1次引物A引物B目的基因第2次引物A引物B若目的基因在DNA片段一侧,则在DNA扩增过程中,由于半保留复制,至少经过

次循环,才有可能获取与目的基因等长的片段。22.(2024·黑龙江牡丹江·一模·节选)“中天杨”是由我国科学家采用生物转基因技术,历经8年时间培育成功的抗盐碱、耐干旱的杨树新品种。如图为培育“中天杨”的操作流程,①~⑥表示操作过程,该过程中可能用到的限制酶如表所示。回答下列问题。注:Ti质粒中的Tetr为四环素抗性基因,Ampr为氨苄青霉素抗性基因限制酶BclIEcoRIXbaISau3AIBamHI切割位点T↓GATCAG↓AATTCT↓CTAGA↓GATCG↓GATCC(3)采用PCR技术扩增目的基因时,在PCR反应体系中需加入引物,引物的作用是

,至少经过

次循环,可获取与目的基因等长的DNA单链。PCR完成以后,常采用

法来鉴定PCR的产物。(4)培育转基因杨树的核心工作是

,在进行该工作时,应在mtl-D基因的两侧添加限制酶

的识别序列。使DNA聚合酶能够从引物的3'端开始连接脱氧核苷酸2琼脂糖凝胶

电泳基因表达载体的构建XbaI、BclI突破五

PCR定点突变技术PCR定点突变技术是最常用的基因定点突变技术,通过设计含有非特异性配对碱基的引物,再通过PCR将突变位点引入产物中。PCR定点突变技术具有突变回收率高、可在任何位点引入突变、材料和试剂容易获得、操作简单等优点,它又可以分为重叠延伸PCR、大引物PCR等。重叠延伸PCR大引物PCR金版

2.(2022·辽宁东北育才学校)重叠延伸PCR技术是一种通过寡聚核苷酸链之间重叠的部分互相搭桥、互为模板,通过多次PCR扩增,从而获得目的基因的方法。该技术在扩增较长片段的DNA、不同来源的DNA片段拼接、基因的定点诱变等方面具有广泛的应用前景。下图是利用重叠延伸PCR技术扩增某目的基因的过程。下列分析不正确的是(

)CA.第一阶段过程中的产物是依赖引物1、引物2和引物3、引物4扩增的结果B.引物2和引物3上均含有与模板链不能互补的碱基C.PCR过程中需要先加热至90℃以上后再冷却至72℃左右D.第三阶段需要利用引物1和引物4获得目的基因否则引物2和引物3会发生互补,导致引物失效重叠延伸PCR重叠延伸PCR是发展最早的PCR定点突变技术。该技术要使用四条引物。其中引物2和3的×处代表与模板链不能互补的突变位点,而这两条引物有部分碱基(包括突变位点)是可以互补的。因此,分别利用引物1和2,引物3和4进行PCR后,得到的DNA片段可以通过引物2和3互补的碱基杂交在一起,再在DNA聚合酶的作用下延伸,就能成为一条完整的DNA片段。最后,用引物1和4进行扩增得到含有突变位点的DNA片段。通过测序可以检验定点突变是否成功。专题突破练P219

2.(1)在定点诱变获取突变基因时,PCR1中使用的引物有

,PCR2中使用的引物有

。PCR1和PCR2不能在同一个反应体系中进行,原因是

。图1引物A、引物C引物B、大引物b引物之间能结合,会干扰引物和模板链的结合,影响PCR过程大引物PCR大引物PCR需要用到三条引物进行两轮PCR,这三条引物分别是突变上游引物、常规上游引物和常规下游引物。该技术的流程如图所示。第一轮PCR利用突变上游引物和常规下游引物进行扩增,

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