利用基因芯片检测基因的差异表达虚拟仿真实验操作手册

利用基因芯片检测基因的差异表达

虚拟仿真实验操作手册

(V1.0)

宇馨科括

YlXINTECHNOIXX；'

目录

1.背景概述1

2.系统登录...........................................................1

3.实验预习模块.......................................................2

4.实验介绍模块.......................................................3

5.实验操作模块.......................................................5

6.实验评价模块......................................................19

7.实验报告模块......................................................20

1.背景概述

“利用基因芯片检测基因的差异表达虚拟仿真实验”是基于分子生物学核心实验课程进

行设计开发，基因芯片检测基因的差异表达，尽管是科研领域常用的检测手段，但受限于硬

件设备的限制，教学尚未开展此实验，本着科研向教学的方向转化，结合“以虚补实”的仿

真教学宗旨，故我院针对此实验进行仿真开发。仿真软件不仅弥补了教学方面的空白，同时

也满足了学生随时随地的进行操作实习的需求，而不再受困于场地和设备的局限，也丰富了

教师的教学手段。为人才培养目标的实现起到了保驾护肮的作用！

2.系统登录

>在文件夹或者桌面双击软件程序图标4利用基因芯片检测基因的差异表达虚拟仿…打开进

入系统界面；

>在系统登录界面输入对应账号（admin）和密码（123456）,点击登录系统。

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>系统登录成功后将直接跳转到软件模块登录接口界面（若无法进入该界面或无法登陆等

情况请于技术人员联系）；登陆成功界面如图所示：

利用a田芯片例娼团的m口*达呐6亶=验

3.实验预习绍模块

实验预习模块包括：实验目的、实验原理、实验仪器设备、实验材料、实验步骤和实验注意

事项等内容。

>点击进入“实验预习”按键，进入实验预习模块后，如图所示:

0“质实■HI习

一、实验目的

1.学生通过本项目虚实结合的学习过程,，握DNA芯片的基本方法及其对结果的分析能力。

2.学习肿痛发病机制的分析思路，培养其科学探索精神和创新能力.

二、实验原理

基因芯片(GeneChip.DNAChip),又称DNA微阵列(DNAMicorarray),是指按照愦定位置固定在图相载体上很小

面积内的千万个核酸分子用组成的触点阵阵列。在一定条件下,载体上的核酸分子可以与来自样品的序列互朴的核酸片

段杂交,如果杷样品中的核酸片段进行标记，在专用的芯片阅读仪上就可以检测到杂交信号。

应用范围：基因芯片可用于星因表达检测、突变检测、基因姐多态怪分析和基因文摩作图以及杂交酒序等方面，在

疾病诊断和治疗、药物筛选、农作物的优育优选、司法鳌定、食品卫生监督.环境检测、国防、航天等许多领域都能发

下一页

>点击I后进行下一页查看，如图所示:

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0/黑芋纥

实M习

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三、实验仪器设备

周心机、水浴锅、冰箱、金属浴、揭床等

离心机水浴锅泳箱

上一页

・空干燥采电仪SureScanD(◎阵外芯片扫播仪

下一页

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⑥善算带优

实M返回

*AX»CUMAiasm

四、实验材料

癌组织和癌旁出线;tl子，缓冲液.含有。ligo-dT的寓心柱，红绿灵光标记液,芯片洗脱液,芯片扫描仪,移液器

和枪头,对心管等。

e

谓子芯片洗脱液寓心管

移液器移液枪头上一页

下一页

上一页

>软件支持回顾学习操作，点击I可返回进行查看。

返回

>学习完成后点击右上方I，返回功能模块界面。

4.实验介绍模块

实验介绍内容主要运用FLASH加文字解析，针对实验过程原理进行动态解析。

>在软件主界面单击“实验介绍”按钮，进入实验介绍模块：

a利用“因芯片嘘园的UR表达丽仿K实蛉

>界面中咄汨■犍主要针对当前动画进行播放控制，点击后出现动画解析，并出现

■SB3键;支持当前动画往复查看学习。

•利用“国万片检知烟的v异衰凶mas*宾蛉-x

>UI±11»按键主要针对动画顺序进行前进和后退的查看，支持往复学习。

e利用■国芯片检窝“因的m号喂达盲算仍直买蛉

返回

>学习完成后点击右上方返回功能模块界面

5.实验操作模块

实验操作内容主要包括“制作荧光标记的cDNA”和“芯片杂交”两方面内容。

>在软件主界面单击“实验操作”按钮，进入实验操作模块:

<3利用“欧;片检触烟的V印1gtKK6H安玲

>软件左边栏为分项步骤短语；左下角为详细步骤介绍；右边为工具栏，便于进行实验物

品转移。

司“用—x松im因的叁目袁达。①亶力稳

>跟据提示，加入oligoDT：

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<3利用“因u片检窝“因的m号表的r投仿K女电

>操作过程中，溶液带了名称属性，便于学生理解实验。

>RNA水浴变性:

<3利用WE9芯片啥剧疆田的且异**达虎K16真通

工具栏

水浴条件：70t/10min

单位：min

>学习查看相关知识点。

43利用H既片核2国的圣a澳达由USJI富通

>学习反转录原理动画:

>加入反转录体系:

W利用响弓片怆au脸？e®表达dtttt仿・安蛉

>cDNA离心纯化;

就“辛悦

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号■•三次加但・化M”>・lZ3r>*Olmc取出Hl.m!MT点开,RUU9中用

>反转录产物浓缩干燥:

>加入杂交液:

>知识点查看学习:

>杂交液变性:

>标记序列阵:

>转移杂交液于序列阵上:

舱上H垸

MAXIMO

>杂父原理动画学习:

>摇床孵化2小时:

>冰箱过夜存放

>去除序列阵上的水珠:

>一次洗脱:

>二次洗脱:

>三次洗脱:

>保存序列阵玻片:

>实验完成。

工具栏

芯片处理：

1.打开SureScaiDx微阵列芯片扫描仪，打开扫描软

件

2%击扫描红色出现红色的矩阵

3.点击扫描雅

4片击合成异红色和绿色，将两矩阵合并。

5.分析数据：红色的点代表在癌组织中高表达的基因

绿色的点代表右:总旁组织中高衰达的基因。

6.实验评价模块

实验评价模块主要由实验评价试题组成。

>在软件主界面单击“实验评价”按钮，进入实验评价模块:

实*评价

AK*M*IMVUtMTl

1.下列那种初质是基因表达的中间产物，并且是检测特定基因是否表达的常用指标.（）

A.mRNA