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文档简介
核酸的结构和功能StructureandFunctionofNucleicAcid核酸(nucleicacid)
是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。核酸的分类及分布
90%以上分布于细胞核,其余分布于核外如线粒体,叶绿体,质粒等。分布于细胞核、胞液。(DNA)(RNA)脱氧核糖核酸
核糖核酸携带遗传信息,决定细胞和个体的基因型(genotype)。参与细胞内DNA遗传信息的表达。某些病毒RNA也可作为遗传信息的载体。第一节核酸的化学组成及其一级结构TheChemicalComponentandPrimaryStructureofNucleicAcid一、核酸的化学组成1.元素组成C、H、O、N、P(9~10%)2.分子组成
碱基(base):嘌呤碱,嘧啶碱
戊糖(ribose):核糖,脱氧核糖磷酸(phosphate)核苷酸核苷嘌呤(purine)
腺嘌呤(adenine,A)鸟嘌呤(guanine,G)碱基嘧啶(pyrimidine)胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶(thymine,T)戊糖(构成RNA)1´2´3´4´5´核糖(构成DNA)脱氧核糖二、核苷酸的结构1.核苷的形成碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)。1´1核苷酸:AMP,GMP,UMP,CMP脱氧核苷酸:dAMP,dGMP,dTMP,dCMP
2.核苷酸的结构与命名核苷(脱氧核苷)和磷酸以酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)。
体内重要的游离核苷酸及其衍生物含核苷酸的生物活性物质:
NAD+、NADP+、CoA-SH、FAD
等都含有
AMP
多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP
环化核苷酸:cAMP,cGMPAMPADPATPcAMPNADP+NAD+三、核酸的一级结构定义核酸中核苷酸的排列顺序。由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。5´端3´端核苷酸的连接方式:
核苷酸之间以磷酸二酯键连接形成多核苷酸链,即核酸。CGA核酸的一级结构AGP5
PTPGPCPTPOH3
书写方法5
pApCpTpGpCpT-OH3
5
ACTGCT
3
第二节DNA的空间结构与功能DimensionalStructureandFunctionofDNA一、DNA的二级结构—双螺旋结构模型(一)DNA双螺旋结构的研究背景
碱基组成分析Chargaff
规则:[A]=
[T][G]
[C]
碱基的理化数据分析A-T、G-C以氢键配对较合理
DNA纤维的X-线衍射图谱分析ErwinChargaff
(1905-1995)Chargaff
规则:
A%=T%G%=C%DNA分子X射线衍射照片RosalindFranklin
MauriceWilkins
FrancisHarryComptonCrick
JamesDeweyWatson
MauriceHughFrederickWilkins
TheNobelPrizeinPhysiologyorMedicine1962.
"fortheirdiscoveriesconcerningthemolecularstructureofnucleicacidsanditssignificanceforinformationtransferinlivingmaterial"(二)DNA双螺旋结构模型要点(Watson,Crick,1953)DNA分子由两条相互平行但走向相反的脱氧多核苷酸链组成,两链以”脱氧核糖-磷酸”为骨架,以右手螺旋方式绕同一公共轴盘。螺旋直径为2nm,形成大沟(majorgroove)及小沟(minorgroove)相间。碱基垂直螺旋轴居双螺旋内側,与对側碱基形成氢键配对(互补配对形式:A=T;G
C)。相邻碱基平面距离0.34nm,螺旋一圈螺距3.4nm,一圈10对碱基。氢键维持双链横向稳定性,碱基堆积力维持双链纵向稳定性。碱基互补配对TAGC碱基互补原则:腺嘌呤(A)总是跟胸腺嘧啶(T)配对,形成两个氢键;鸟嘌呤(G)总是跟胞嘧啶(C)配对,形成三个氢键(三)DNA双螺旋结构的多样性不同类型的DNA双螺旋结构B-DNAhelixZ-DNAhelixA-DNAhelix二、DNA超螺旋结构及其在染色质中的组装
所有生物的基因组DNA的长度通常比含有DNA的细胞直径大得多。因此,DNA在形成双螺旋结构的基础上,必须进一步折叠成超级螺旋结构,且在蛋白质的参与下,再进行精密的包装。这样,DNA才能存在于细胞核中。(一)DNA的超螺旋结构
超螺旋结构(superhelix
或supercoil)DNA双螺旋再盘绕即形成超螺旋结构。正超螺旋(positivesupercoil)
盘绕方向与DNA双螺旋方同相同。负超螺旋(negativesupercoil)
盘绕方向与DNA双螺旋方向相反。(二)原核生物细胞中DNA的高级结构
绝大部分原核生物的DNA都是闭合环状双螺旋结构,不与蛋白质结合,双螺旋分子可进一步螺旋化形成超螺旋。环状DNA结构示意图(三)DNA在真核生物细胞核内的组装
在真核细胞内,DNA分子较原核细胞大得多,所以它们压缩得更为致密。真核细胞的DNA与蛋白质结合,以染色体的形式存在于细胞核内。核小体是真核生物染色体的基本结构单位。
核心颗粒连接区核心组蛋白:组蛋白八聚体(H2A、H2B、H3、H4各2分子)DNA双螺旋分子(140bp)在核心组蛋白缠绕1.75圈DNA(60bp)组蛋白H1
连接核心颗粒核小体的构成核小体组成核小体的折叠及染色体组装2nm11nm30nm300nm1400nm700nm真核生物DNA在细胞核内的组装三、DNA的功能以基因的形式储存、携带和传递遗传信息。是DNA分子中特定区段核苷酸的排列顺序,即碱基序列信息,它决定了基因的功能。基因:基因组:一个遗传体系所有基因总和的一整套遗传信息。第三节
RNA的结构与功能StructureandFunctionofRNARNA的种类、分布、功能一、信使RNA的结构与功能
信使RNA(mRNA)的作用就好像一种信使,将存在于细胞核内的基因的遗传信息转移到细胞质中,作为蛋白质合成的模板,细胞中mRNA的种类最多,代谢最快。真核生物的mRNA前身称为不均一核RNA(hnRNA)。hnRNA在核内经过一系列的剪接、修饰和加工,成为成熟的mRNA并转移到细胞质中。TheNobelPrizeinPhysiologyorMedicine1965InstitutPasteur
Paris,FranceJacquesMonod
AndréLwoff
FrançoisJacob
InstitutPasteur
Paris,FranceInstitutPasteur
Paris,France原核和真核细胞基因表达过程简图DNAmRNA蛋白转录翻译原核细胞细胞质细胞核DNA内含子外显子转录转录后剪接转运mRNAhnRNA翻译蛋白真核细胞*真核mRNA结构特点1.大多数真核mRNA的5´末端均在转录后加上一个7-甲基鸟苷,同时第一个核苷酸的C´2也是甲基化,形成帽子结构:m7GpppNpNp……。2.大多数真核mRNA的3´末端有一个多聚腺苷酸(polyA)结构,称为多聚A尾。mRNA分子上的每三个核苷酸为一组,构成遗传密码,可以决定多肽链上某一个氨基酸,又称为三联体密码。mRNA核内向胞质的转位
mRNA的稳定性维系翻译起始的调控帽子结构和多聚A尾的功能真核成熟mRNA结构4、mRNA前体(hnRNA)的剪接DNAhnRNA成熟mRNA内含子外显子真核生物mRNA转录后剪接外显子编码序列内含子编码序列TheNobelPrizeinPhysiologyorMedicine1993"fortheirdiscoveriesofsplitgenes"
RichardJ.Roberts
PhillipA.SharpNewEnglandBiolabs
Beverly,MA,USAMassachusettsInstituteofTechnology(MIT),CenterforCancerResearch
Cambridge,MA,USA
二、转运RNA
转运RNA约占细胞中RNA总量的10%~15%,是分子量最小的一类核酸,由74~95个核苷酸构成,含较多稀有碱基(约10~20%)。tRNA的功能是转运氨基酸至核糖体用于蛋白质的合成。二氢尿嘧啶(DHU)
常见的稀有碱基假尿嘧啶(φ)甲基鸟嘌呤*tRNA的二级结构——三叶草形
氨基酸臂
DHU环反密码环额外环
TΨC环氨基酸臂*
tRNA的三级结构——倒L形*tRNA的功能活化、搬运氨基酸到核糖体,参与蛋白质的合成。三、核糖体RNA
核糖体RNA(rRNA)是细胞内含量最多的RNA,约占RNA总量的75%~80%。rRNA与蛋白质共同构成核糖体或称为核蛋白体,是细胞内蛋白质生物合成的场所。原核生物与真核生物的核糖体均由大亚基和小亚基构成。rRNA的结构特征
rRNA一级结构的一个特征就是甲基化残基的存在,主要的修饰位点在D-核糖的C2'-OH。二级结构的模型也已构建出来,rRNA分子内部局部碱基互补,形成许多“茎-环”结构,为核糖体蛋白的结合与组装提供了结构基础。原核生物16SrRNA的二级结构核蛋白体的组成原核生物(以大肠杆菌为例)真核生物(以小鼠肝为例)小亚基30S40SrRNA16S1542个核苷酸18S1874个核苷酸蛋白质21种占总重量的40%33种占总重量的50%大亚基50S60SrRNA23S5S2940个核苷酸120个核苷酸28S5.85S5S4718个核苷酸160个核苷酸120个核苷酸蛋白质31种占总重量的30%49种占总重量的35%局部双链tRNArRNAmRNA三叶草形、倒L形含稀有碱基多反密码子CCA—OH3'呈花状5'—m7GpppNm、3'—polyA编码序列单链局部双链结构蛋白质合成的模板搬运活化的aa到核糖体组成核蛋白体分子大小不一,量<10%,代谢快分子量小
120碱基稳定分子大
120碱基量>80%,稳定三种RNA内容小结功能四、其它小分子RNA及RNA组学核酶:具有催化功能的小RNA.TheNobelPrizeinChemistry1989"
fortheirdiscoveryofcatalyticpropertiesofRNA"SidneyAltmanThomasR.Cech核酸的理化性质ThePhysicalandChemicalCharactersofNucleicAcid第四节一、核酸的一般性质核酸溶液的黏度比较大,核酸粘度降低或消失,即意味着变性或降解。DNA分子的长度与直径之比达到107,极易在机械力的作用下发生断裂。核酸的沉降特性。二、核酸的紫外吸收
嘌呤和嘧啶碱基具有共轭双键,这使核苷、核苷酸及核酸可以吸收紫外光,最大吸收峰位于波长260nm附近,因此经常用A260(在260nm处的吸光度)或OD260(260nm处的光密度值)表示核酸的浓度。利用核酸的紫外吸收特性,可以用紫外分光光度法对DNA和RNA进行定性和定量分析。1.DNA或RNA的定量OD260=1.0相当于50μg/ml双链DNA40μg/ml单链DNA(或RNA)20μg/ml寡核苷酸2.判断核酸样品的纯度DNA纯品:OD260/OD280=1.8RNA纯品:OD260/OD280=2.0OD260的应用三、核酸的变性(一)变性(denaturation)
定义:在某些理化因素作用下,DNA双链解成两条单链的过程。方法:过量酸,碱,加热,变性试剂如尿素、酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮等。DNA变性的本质是双链间氢键的断裂变性引起紫外吸收值的改变DNA的紫外吸收光谱增色效应:DNA变性时其溶液OD260增高的现象。
解链曲线:如果在连续加热DNA的过程中以温度对A260(A260代表溶液在260nm处的吸光率)值作图,所得的曲线称为解链曲线.
Tm:变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称融解温度(Tm)。其大小与G+C含量成正比。
四、复性与杂交
变性DNA在适当条件下,两条互补的单链重新
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