宏基因测序技术在成人医院获得性肺炎中的临床应用专家共识解读2026

宏基因测序技术在成人医院获得性肺炎中的临床应用专家共识解读202601020304背景与临床意义mNGS检测流程报告解读规则应用展望与共识CONTENTS目录背景与临床意义中国医院感染中，HAP占比首位（51.7%），美国占院内感染21.8%。HAP的全球与国内发病率常见病原体包括鲍曼不动杆菌、铜绿假单胞菌等，多重耐药率高达64.9%。常见病原体及其耐药性HAP延长住院时间，增加医疗费用及病死率，既往抗生素暴露史显著增加耐药风险。临床负担与危险因素HAP的流行病学010203传统病原检测如痰/BALF涂片、培养及核酸检测需24-72小时，影响及时诊断。传统方法难以快速识别混合感染或耐药基因，尤其在罕见或未知病原体时。高比例的人源DNA干扰检测结果，导致定植菌与实际感染菌的鉴别困难。检测周期长敏感性低人源核酸干扰传统检测的局限性mNGS的优势与挑战mNGS技术能够同时检测细菌、真菌、病毒、寄生虫和耐药基因，提供全面的病原体信息。无偏性检测所有病原核酸通过mNGS技术，可以在24-48小时内完成病原体检测，相比传统方法大大缩短了诊断周期。缩短诊断时间mNGS技术在识别混合感染或罕见/未知病原体方面表现出色，尤其是对真菌和胞内菌的检出率较高。提高混合感染检出率mNGS检测流程共识1强调了BALF或气道抽吸物作为首选样本，其次是诱导痰和深部痰/肺组织。样本采集优先级共识2建议对免疫功能低下、危重患者联合使用微生物培养和mNGS进行检测。免疫功能低下患者的采样策略采集应在抗感染治疗前进行，以减少口咽污染并确保结果的准确性；经验医师的操作对于提高样本质量至关重要。样本采集时机与操作要点样本采集与处理通过56℃加热30分钟对样本进行灭活，以消除潜在的生物危害。灭活处理采用酶法、化学法或珠磨法破坏细胞壁，提高胞内病原体和真菌的检出率。破壁处理使用差异裂解法温和裂解宿主细胞，并结合DNA酶降解，减少人源核酸干扰。人源核酸去除前处理步骤核酸提取与质控采用DNA+RNA共提策略，确保不遗漏RNA病毒，提高检测的全面性。提取策略的选择设定严格的质控标准，如OD260/280比值和核酸量要求，保证样本质量。质控标准的重要性确保提取的核酸量大于1ng，是进行有效测序分析的前提。核酸量的监测报告解读规则需结合临床表现确定主导病原，考虑混合感染的可能性。高毒力株标志如K1/K2血清型、rmpA2等提示病原体的高致病性；常见耐药基因包括ESBLs和mcr-1等。胞内菌、支原体/衣原体、口腔定植菌及真菌的检出需特别关注，可能影响诊断和治疗决策。多细菌检出的解读毒力基因和耐药基因的意义特殊病原体的报告要求阳性结果解读阴性结果分析无活动性感染的可能性低病原载量与检测限制取样和处理方法的影响阴性结果可能表示患者已无活动性感染，或前期抗菌治疗有效抑制了病原载量。胞内菌如结核分枝杆菌或RNA病毒载量低于mNGS的检测限，可能导致假阴性结果。样本采集过程中的污染或不当处理，如口咽部定植菌的混入，也可能导致mNGS检测结果为阴性。010203特殊病原体识别mNGS技术能有效识别军团菌和分枝杆菌，尤其在供水系统污染提示中发挥关键作用。胞内菌的识别在重症HAP患者中，低致病率的支原体和衣原体检出需谨慎排除取样过程中的污染。支原体与衣原体的检测高丰度的口腔定植菌可能因误吸或取样污染影响诊断，特别是在机械通气患者中需特别注意。口腔定植菌的影响应用展望与共识010203免疫失衡机制分析mNGS联合宿主转录组研究靶向测序在免疫应答分析中的应用过度炎症或免疫抑制是HAP中常见的宿主免疫应答失衡现象。通过mNGS技术揭示病原特异性的免疫模式，辅助免疫调节治疗。利用靶向测序方法探查特定病原的免疫反应，优化治疗方案。宿主免疫应答分析010203探针捕获技术的应用成本效益分析科室特异性筛查通过设计特异性探针，靶向测序能够高效捕获并分析特定病原核酸，提高检测的灵敏度和准确性。相较于全面mNGS，靶向测序由于仅针对特定病原进行测序，显著降低了测序成本，同时保持了高检测效率。在临床实践中，靶向测序可用于特定科室（如ICU）常见耐药菌的筛查，有助于快速识别并管理院内感染。靶向测序优势010203三代测序技术的应用便携设备的发展成本与效益分析三代测序技术因其长读长优势，适合床旁快速检测，可提供更全面的病原体信息。随着科技的