关于某某人造蛋白质结构预测服务合同

关于某某人造蛋白质结构预测服务合同一、合同双方基本信息甲方（委托方）：名称：某某生物科技有限公司地址：中国XX省XX市XX区XX路XX号法定代表人：XXX联系人：XXX联系方式：电话XXX-XXXXXXXX，电子邮箱XXX@乙方（服务提供方）：名称：某某蛋白质工程研究中心地址：中国XX省XX市XX区XX路XX号法定代表人：XXX联系人：XXX联系方式：电话XXX-XXXXXXXX，电子邮箱XXX@二、服务内容与技术要求（一）服务范围蛋白质结构预测乙方需基于甲方提供的目标蛋白质氨基酸序列，利用AlphaFold、Rosetta等主流生物信息学工具，完成以下任务：生成3套以上候选三维结构模型；提供模型质量评估报告（包括置信度分数、Ramachandran图分析等）；针对甲方指定的功能位点（如活性中心、结合界面）进行结构细节优化。辅助分析服务蛋白质-配体对接模拟：针对甲方提供的小分子化合物，预测其与目标蛋白的结合模式及亲和力；结构稳定性分析：通过分子动力学模拟评估预测结构在生理条件下的稳定性；突变效应预测：对甲方指定的突变位点（不超过10个）进行结构影响分析，提供功能改变的可能性评估。（二）技术标准预测模型的全局模型质量评估分数（如pLDDT）需达到90分以上（满分100分），核心功能区域局部分数不低于95分；分子动力学模拟时长不少于100ns，结果需包含RMSD、RMSF等关键参数的统计分析；所有分析报告需提供原始数据、可视化图表及标准化解读说明，格式为PDF及可编辑的Excel文件。（三）数据交付交付内容：三维结构模型文件（PDB格式）；质量评估报告及原始数据分析结果；技术服务过程中产生的中间数据（如序列比对结果、模拟参数设置文件）；乙方使用的软件版本及参数配置说明。交付方式：通过加密云盘传输及纸质报告邮寄（一式两份）；交付时间：自甲方提供完整数据及预付款到账后60个工作日内完成首次交付，如需修订，乙方应在甲方反馈意见后15个工作日内完成二次交付。三、服务期限与验收（一）服务期限本合同服务期自双方签字盖章且甲方预付款到账之日起计算，总周期为90个自然日。其中：数据准备与模型构建阶段：1-30日；质量评估与优化阶段：31-50日；辅助分析与报告撰写阶段：51-60日；验收与修订阶段：61-90日。（二）验收标准甲方在收到乙方交付成果后15个工作日内完成验收，逾期未提出书面异议视为默认验收通过；验收指标包括：交付文件完整性（需涵盖合同约定的全部内容）；技术参数达标率（如模型质量分数、模拟时长等）；报告逻辑性与可读性（需满足甲方科研团队独立解读需求）。若验收未通过，甲方需向乙方出具书面修改意见，明确具体问题及修订要求，乙方应在15个工作日内完成优化并重新提交验收。四、费用及支付方式（一）服务费用本合同总费用为人民币XX万元（大写：XX元整），具体构成如下：|服务项目|金额（万元）|备注||------------------------|--------------|----------------------------||三维结构预测与优化|XX|含3套模型及质量评估||分子动力学模拟|XX|100ns模拟及数据分析||突变效应预测|XX|限10个突变位点||技术报告撰写与可视化|XX|含原始数据与图表||合计|XX|不含税费，税费按实际发生计算|（二）支付方式预付款：合同签订后7个工作日内，甲方向乙方支付总费用的40%（即人民币XX万元）；中期款：乙方完成三维结构模型初稿并经甲方确认后7个工作日内，支付总费用的30%（即人民币XX万元）；尾款：项目验收通过后15个工作日内，支付剩余30%（即人民币XX万元）。乙方收款账户信息：开户名：某某蛋白质工程研究中心开户行：中国XX银行XX支行账号：XXXXXXXXXXXXXXXXXXX五、知识产权与数据归属（一）知识产权归属甲方权利：甲方提供的原始氨基酸序列、实验数据等基础材料的知识产权归甲方所有；基于甲方数据产生的预测结果、分析报告等衍生成果，甲方享有独占使用权，可用于科研论文发表、专利申请等，但需注明乙方技术支持（格式为“本研究中蛋白质结构预测服务由某某蛋白质工程研究中心提供”）。乙方权利：乙方保留服务过程中使用的算法、软件工具及标准化流程的知识产权；未经甲方书面许可，乙方不得将甲方数据或项目成果用于其他商业或科研目的，但可在匿名化处理后用于技术方法学改进。（二）数据使用限制乙方仅可在本合同约定范围内使用甲方提供的数据，不得向第三方泄露或转让；甲方如需将预测结果用于商业开发（如药物研发、试剂盒生产等），需另行与乙方签订知识产权许可协议，具体费用及权限另行协商。六、保密条款保密范围：包括但不限于甲方的氨基酸序列、实验数据、未公开的研究成果，乙方的技术流程、算法参数、收费标准等；保密义务：双方均需对合作过程中获取的对方商业秘密和技术秘密严格保密，未经对方书面同意不得向任何第三方披露；保密期限：本条款自合同签订之日起生效，有效期为合同终止后5年；例外情形：因法律法规要求、司法机关或行政主管部门强制要求披露的信息，披露方应提前通知对方，并配合采取必要的保密措施。七、违约责任（一）甲方违约若甲方未按时支付款项，每逾期1日，需向乙方支付逾期金额0.05%的违约金，累计违约金不超过合同总金额的5%；若甲方提供的数据存在虚假或不完整，导致乙方服务无法正常进行，乙方有权暂停服务，且已支付费用不予退还，甲方需承担由此造成的额外成本。（二）乙方违约若乙方未按时交付成果，每逾期1日，需向甲方支付合同总金额0.05%的违约金，逾期超过30日的，甲方有权解除合同并要求乙方退还已支付费用；若乙方交付的成果未达到合同约定的技术标准，经2次修订后仍无法通过验收，甲方有权要求乙方退还50%已支付费用，并保留追究其他损失的权利；若乙方违反保密义务，需向甲方支付合同总金额20%的赔偿金，并承担由此造成的直接经济损失。八、争议解决与其他（一）争议解决双方在合同履行过程中发生的争议，应首先通过友好协商解决；协商不成的，任何一方均有权向合同签订地（XX市XX区）有管辖权的人民法院提起诉讼；争议解决期间，除争议事项外，双方应继续履行合同其他条款。（二）其他条款不可抗力：因地震、战争、政策调整等不可预见、不能避免的客观事件导致合同无法履行的，双方互不承担责任，应及时通知对方并协商后续处理方案；合同变更：任何对合同条款的修改需经双方书面确认并签署补充协议，补充协议与本合同具有同等法律效力；合同份数：本合同一式肆份，甲乙双方各执贰份，具有同等法律效力，自双