文献检索与论文写作 课件 3.4 生物医学文摘库PubMed

生物医学文摘库PubMed主讲人：武祥龙第三章文摘型数据库副教授《文献检索与论文写作》目录CONTENTS1.PubMed系统概况2.检索途径和方法PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)的国家生物技术信息中心(NCBI)研发1997年6月面向公众免费开放/pubmed/PubMed的资讯并不包括期刊论文的全文，但可能提供指向全文提供者（付费或免费）的链接。PubMed数据主要来源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Recordinprocess、Recordsuppliedbypublisher等。数据类型：期刊论文、综述、其它数据库链接。1.PubMed系统概况PubMed系统可以免费使用吗？可以不可以AB提交单选题1分学科范围：基础生命科学 临床生命科学生物科学解剖学 组织学 化学与药物心理学 社会医学 农业医技设备学医技工业学 医学信息学使用词表：MeSH（医学主题词表）PubMed数据库

（1）MEDLINE数据库

收录1966年以来的包含医学、护理、兽医、健康保健系统及前临床科学的文献2900万余条书目数据，记录的标记为[PubMed-indexedforMEDLINE]。

数据来源于70多个国家和地区的4800多种生物医学期刊，

数据涉及30多个语种，回溯至1966年的数据涉及40多个语种，90%左右为英文文献，70%~80%的文献有著者撰写的英文摘要。（2）InProcessCitations数据库1996年8月开始，每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据，该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为[PubMed-inprocess]。

当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时，每星期转入MedLine一次，而被处理前的数据从该数据库中删除。（3）OLDMEDLINE数据库：

含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要，记录的标记为：[PubMed-OLDMEDLINEforPre1966]。（4）Publisher-SuppliedCitations

（ArticlesNotinMEDLINEorINProcess）是由出版商提供的电子文献，每条记录标有[PubMed–assuppliedbypublisher]。

这些文献包括两种来源：MEDLINE收录范围的文献，每日被添加到InProcessCitation中去，换上[PubMed–inprocess]的标记，并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI；

不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID而没有MEDLINEUI。（1）2种登录方式2.检索途径和方法方式一：浏览器输入PubMed网址/

直接进入PubMed检索系统主页。输入检索内容方式二：先登录NCBI主站，其网址是/，再选择数据库为PubMed。输入检索内容（2）基本检索在搜索框中输入所要查询内容，然后单击“Search”按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的相关结果显示屏幕上。输入检索内容，例如：“livercancer（肝癌）”注意检索词的使用截词检索当检索词结尾不确定时,可用*替代例如：输入cell*[ti]可以查出标题中含cell、cells、celliferous、cellophane和cellular等词的文献。精确检索用英文双引号“”将要检索的多个词限定为一个词进行检索例如：“genetherapy”，将其做为不可分割的整体进行检索检索结果列表结果排序结果分析保存、导出、发送结果单篇结果文献题目摘要作者数据库信息期刊信息文章DOI全文链接（3）高级检索点击位于基本检索框下面的Advanced按钮，即可进入高级检索界面输入检索内容Add增加检索框选择检索字段直接编辑检索式关键词为“diabetes”，期刊名为：“Nature”检索结果MeSHDatabase的一般检索过程包括以下几个步骤：①进入NCBI主站点（/），在主页检索框左侧选择MeSH，点击search后进入检索界面；②在搜索框中输入主题概念，点击Search按钮执行主题词查询；③在主题词注释列表中寻找与检索需求相符的主题词，点击该词；④根据检索需求，在副主题词列表中选择与主题词匹配的副主题词；⑤选择逻辑算符（AND，OR或NOT），点击Addtosearchbuilder按钮，将所选副主题词添加至检索框（Searchbox）；⑥检查检索框中的检索策略式，确认无误后点击SearchPubMed按钮执行检索；⑦系统给出检索结果。（4）主题词检索医学主题词表（MeSH，MedicalSubjectHeading）进入NCBI主站点（/），在主页检索框左侧选择MeSH，点击search后进入检索界面；“FK506副作用和肾移植”相关文献为例，对检索过程进行解析。MeSHDatabase主题词轮排表界面他克莫（Tacrolimus）又名FK506，是从链霉菌属中分离出的发酵产物，其化学结构属23元大环内酯类抗生素。为一种强力的新型免疫抑制剂MeSHDatabase副主题词选择界面副主题词选取的界面中，还包含其他信息，比如：加权检索、不扩展检索、该物质的曾经信息、药理学作用信息等。主题词检索结果Pubmed上可以直接获取原文？对吗？对不对不知道刚才没有听ABCD提交单选题1分参考资料与致谢王细荣，张佳，叶芳婷主编，文献信息检索与论文写作（第8版）[M]，上海交通大学出版社，2022年8月出版。张言彩，文献检索与毕业论文写作（第三版）[M]，西安电子科技大学出版社，2022年。李振华，文献检索与论文写作[M]，清华大学出版社，2022年