生化专业常用英文缩写及应用指导手册

生化专业常用英文缩写及应用指导手册引言在生物化学及分子生物学、细胞生物学等交叉领域的研究与实践中，英文缩写的广泛使用极大提升了学术交流与文献阅读的效率。然而，缩写的多义性（如“AMP”既指腺苷一磷酸，也可能指代“氨苄青霉素”或“抗微管相关蛋白”）、领域特异性（如“RACE”在核酸领域指“快速扩增cDNA末端”，在免疫学中可能关联“受体编辑”相关概念），以及新缩写的持续涌现，常导致理解偏差或操作失误。本手册聚焦生化核心领域，系统梳理核酸、蛋白质、酶学、代谢通路、实验技术等方向的高频缩写，结合其全称、定义内涵、典型应用场景展开解析，为科研工作者、学生及技术人员提供精准的缩写认知与应用参考，助力学术沟通的准确性与科研实践的规范性。一、核酸与基因相关缩写核酸（DNA、RNA）是遗传信息的载体，其研究涉及大量序列、结构及操作技术的缩写，需结合分子生物学背景理解。1.DNA相关核心缩写gDNA（genomicDNA）：基因组DNA。包含生物体全部遗传信息的DNA（含外显子、内含子及调控序列），常用于基因定位、多态性分析（如全基因组测序、SNP检测）。dsDNA/ssDNA（double-stranded/single-strandedDNA）：双链/单链DNA。dsDNA是天然DNA的主要存在形式（如染色体）；ssDNA在PCR引物、DNA测序（如Sanger法的测序引物结合单链模板）及重组技术（如M13噬菌体载体的单链文库构建）中应用广泛。2.RNA相关核心缩写mRNA（messengerRNA）：信使RNA。携带基因编码信息、指导蛋白质合成的RNA，是转录组学（如RNA-seq）、翻译调控研究的核心对象（如通过qPCR检测mRNA丰度分析基因表达）。rRNA（ribosomalRNA）：核糖体RNA。与核糖体蛋白共同构成核糖体，参与蛋白质合成的催化与结构支撑，其序列保守性常用于系统发育分析（如16SrRNA用于微生物分类）。tRNA（transferRNA）：转运RNA。负责在翻译过程中携带氨基酸至核糖体、与mRNA密码子配对，其反密码子突变可能导致遗传疾病（如线粒体tRNA突变引发的神经肌肉疾病）。siRNA/miRNA（smallinterferingRNA/microRNA）：小干扰RNA/微小RNA。均为非编码小RNA：siRNA通过RNA干扰（RNAi）特异性降解靶mRNA（如基因功能的敲低实验）；miRNA通过结合mRNA的3’UTR调控翻译（如肿瘤发生中miRNA的异常表达与靶基因调控）。二、蛋白质与氨基酸相关缩写蛋白质是生命活动的主要执行者，其结构、功能研究涉及氨基酸、修饰、相互作用等方向的缩写。1.氨基酸与肽相关AA（AminoAcid）：氨基酸。蛋白质的基本组成单位，20种天然AA的侧链结构决定其化学性质（如疏水性、带电性），是肽段设计、蛋白质工程的基础（如突变AA残基优化酶活性）。pep（Peptide）：肽。由AA通过肽键连接形成的短链（通常<50个AA），如信号肽（引导蛋白质亚细胞定位）、抗菌肽（参与天然免疫）。MALDI-TOF（Matrix-AssistedLaserDesorption/Ionization-TimeofFlight）：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱。虽为技术缩写，但常用于肽段/蛋白质的分子量鉴定（如蛋白组学中肽段的质谱分析）。2.蛋白质修饰与结构PTM（Post-TranslationalModification）：翻译后修饰。蛋白质合成后发生的共价修饰（如磷酸化、乙酰化、泛素化），调控蛋白质活性、定位与相互作用（如p53的磷酸化激活其肿瘤抑制功能）。Dom（Domain）：结构域。蛋白质中具有独立折叠和功能的结构单元（如SH2结构域结合磷酸化酪氨酸，参与信号转导），是蛋白质功能预测的关键特征（如通过保守结构域数据库CDD分析蛋白功能）。HMW/LMW（High-Molecular-Weight/Low-Molecular-Weight）：高分子量/低分子量蛋白。用于描述蛋白质的分子量范围，如HMW蛋白可能参与细胞骨架组装（如肌动蛋白的高分子量聚合形式），LMW蛋白如细胞因子（分子量通常<30kDa）。三、酶与催化相关缩写酶是生物催化剂，其分类、活性调控涉及大量专业缩写。1.酶分类与活性Km（Michaelis-Mentenconstant）：米氏常数。酶促反应动力学参数，反映酶与底物的亲和力（Km越小，亲和力越高），用于酶的底物特异性分析（如比较不同同工酶的Km值筛选优势底物）。kcat（Turnovernumber）：转换数。单位时间内单个酶分子催化的底物分子数，反映酶的催化效率（kcat/Km为酶的催化效率常数，用于评估酶的优劣）。2.酶抑制剂与激活剂KI（KinaseInhibitor）：激酶抑制剂。靶向抑制蛋白激酶活性的小分子（如Imatinib抑制BCR-ABL激酶，用于白血病治疗），是药物研发与信号通路研究的工具（如用KI阻断MAPK通路分析下游基因表达）。AI（AllostericInhibitor）：别构抑制剂。结合酶的别构位点而非活性中心，通过构象变化抑制酶活性（如ATP对磷酸果糖激酶-1的别构抑制，调控糖酵解）。AA（Aminoacylase）：氨基酰酶。催化氨基酸与酰基的水解反应，在氨基酸制备（如拆分外消旋氨基酸）中有应用，但需注意与“氨基酸（AA）”缩写的区分，需结合上下文判断。四、代谢通路与小分子相关缩写代谢是生物化学的核心研究内容，涉及糖、脂、核酸代谢及小分子调控。1.糖代谢与能量相关Gly（Glycolysis）：糖酵解。葡萄糖分解为丙酮酸的代谢途径，产生ATP与NADH，是细胞无氧/有氧代谢的共同起始步骤（如肿瘤细胞的Warburg效应依赖高Gly活性）。TCA（TricarboxylicAcidcycle）：三羧酸循环（又称Krebs循环）。丙酮酸氧化为CO₂的循环反应，产生大量NADH、FADH₂，是能量代谢的核心（如线粒体功能障碍常伴随TCA紊乱）。AMP/ADP/ATP（AdenosineMono/Di/Triphosphate）：腺苷一/二/三磷酸。细胞能量货币，ATP水解为ADP/AMP释放能量，参与酶活性调控（如AMP激活AMPK，调控细胞能量稳态）。2.脂代谢与信号分子FA（FattyAcid）：脂肪酸。脂类的基本组成单位，分为饱和（如棕榈酸）与不饱和（如油酸），参与膜结构、能量储存（如甘油三酯合成）及信号分子合成（如花生四烯酸衍生前列腺素）。PL（Phospholipid）：磷脂。细胞膜的主要脂质成分（如磷脂酰胆碱、磷脂酰肌醇），其代谢产物（如IP₃、DAG）是重要第二信使（如PLC水解PIP₂产生IP₃和DAG，激活钙信号与PKC）。ROS（ReactiveOxygenSpecies）：活性氧。如超氧阴离子、过氧化氢等，低水平参与信号转导（如H₂O₂激活MAPK通路），高水平引发氧化应激（如衰老、疾病中的ROS积累）。五、实验技术与仪器相关缩写生化实验依赖大量技术方法，其缩写需结合操作原理与应用场景理解。1.分离与检测技术SDS-PAGE（SodiumDodecylSulfate-PolyacrylamideGelElectrophoresis）：十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳。通过SDS使蛋白带负电，按分子量分离蛋白（如分析蛋白纯度、分子量），是蛋白研究的基础技术。HPLC（High-PerformanceLiquidChromatography）：高效液相色谱。基于物质在固定相和流动相的分配差异分离化合物，用于代谢物定量（如检测血液中葡萄糖浓度）、蛋白纯化（如反相HPLC分离肽段）。ELISA（Enzyme-LinkedImmunosorbentAssay）：酶联免疫吸附测定。通过抗体-抗原特异性结合与酶催化显色，定量检测蛋白、抗体或小分子（如检测血清中细胞因子浓度）。2.分子操作技术PCR（PolymeraseChainReaction）：聚合酶链式反应。通过DNA聚合酶扩增特定DNA片段，用于基因克隆、突变检测（如RT-PCR检测RNA反转录产物，qPCR定量基因表达）。CRISPR/Cas9（ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats/CRISPR-associatedprotein9）：规律间隔成簇短回文重复序列/CRISPR相关蛋白9。基因编辑技术，通过sgRNA引导Cas9切割靶DNA，实现基因敲除、敲入（如构建基因编辑细胞系研究基因功能）。ChIP（ChromatinImmunoprecipitation）：染色质免疫沉淀。通过抗体富集与靶蛋白结合的DNA片段，研究蛋白质-DNA相互作用（如分析转录因子的靶基因结合位点）。六、生物信息与数据库相关缩写生物信息学加速了生化数据的整合与分析，其工具与数据库缩写需精准掌握。1.数据库与资源PDB（ProteinDataBank）：蛋白质结构数据库。存储蛋白质、核酸及复合物的三维结构，用于结构生物学研究（如分析酶的活性中心结构设计抑制剂）。KEGG（KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes）：京都基因与基因组百科全书。整合基因、代谢通路、疾病相关信息，用于通路富集分析（如差异基因的KEGG通路注释）。2.分析工具与算法BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool）：基本局部比对搜索工具。用于序列相似性比对（如核酸/蛋白序列的同源性分析，鉴定新基因的同源物）。RNA-seq（RNASequencing）：RNA测序。通过高通量测序分析转录组，定量基因表达、鉴定新转录本（如比较肿瘤与正常组织的RNA-seq数据筛选差异基因）。七、应用指导与注意事项1.缩写的歧义性规避多义缩写需结合上下文判断：如“IP”在代谢中是“肌醇-1,4,5-三磷酸（Inositol1,4,5-Trisphosphate）”，在蛋白研究中是“免疫沉淀（Immunoprecipitation）”；“R”在酶学中是“气体常数（GasConstant）”，在核酸中是“嘌呤（Purine）”或“限制性内切酶（RestrictionEnzyme，如EcoRⅠ）”。首次出现缩写需标注全称：学术写作、报告中首次使用缩写时，需在括号内注明全称（如“采用PCR（PolymeraseChainReaction）扩增目的基因”），避免读者误解。2.领域交叉的缩写适配跨领域缩写需参考所属领域：如“CD”在免疫学中是“分化簇（ClusterofDifferentiation，如CD4⁺T细胞）”，在蛋白结构中是“圆二色性（CircularDichroism）”；“MS”在代谢组学中是“质谱（MassSpectrometry）”，在神经科学中是“多发性硬化（MultipleSclerosis）”。3.新缩写的跟踪与验证前沿领域（如合成生物学、单细胞组学）的新缩写需通过权威文献、数据库验证：如“scRNA-seq”（Single-cellRNASequencing）需结合“单细胞”