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文档简介

高中生物中涉及的有关蛋白质的计算问题,实质是对氨基酸及蛋白质结构的认识和理解的问题。因此,我们先整理一下相关的基础知识。1.基础知识1.1.生物体中组成蛋白质的氨基酸约有20种(人类有21种,新人教版)。这些氨基酸有着类似的结构:即每种氨基酸都至少含有一个氨基(—NH2)和一个羧基(—COOH),且都有一个氨基(—NH2)和一个羧基(—COOH)连在同一个碳原子上,这个碳原子还连接一个氢原子(—H)和一个R基(—R)。20种氨基酸在结构上的差异就是R基不同。R基中可能含有另外的氨基或羧基。氨基酸中都含有C、H、O、N四种元素,有些氨基酸中还有S。氨基酸分子可以表述成这样的分子通式:C2H4O2N—R。即氨基酸分子至少含2个C,5个H(最简单的氨基酸是甘氨酸,其R基是H),2个O,1个N。S只可能在R基中。1.2.氨基酸之间通过脱水缩合,形成肽键(—CO—NH—)相互连接为肽链。脱水缩合:在核糖体上相关酶的作用下,一个氨基酸的羧基脱去“—OH(一个H和O)”,相邻的另一氨基酸的氨基脱去一个氢原子(—H),脱下的三个原子结合为1分子水(H2O)。剩余的羧基残基(—CO—)与氨基残基(—NH—)结合成肽键(—CO—NH—)。每2个相邻的氨基酸之间都可发生1次脱水缩合,形成1个肽键。通过这些肽键将许多个氨基酸结合成新的化合物(多肽)。位于多肽(肽链)两端的氨基和羧基不发生脱水缩合,不形成肽键,保留为氨基或羧基。因此,1条肽链至少含1个氨基和1个羧基。1条肽链中的肽键数=脱水数=氨基酸数-1。蛋白质或肽链水解时发生的变化与此相反。每断裂1个肽键,消耗1个H2O分子,肽键中氨基残基与羧基残基变回氨基和羧基。1.3.肽链能盘曲、折叠,形成一定的空间结构。一个蛋白质分子可能包含1或多条肽链。每条肽链都要形成一定的空间结构,肽链之间通过一定的化学键(氢键、分子间作用力等)结合在一起,形成更加复杂的空间结构。有些蛋白质还与其他物质(如血红蛋白中的Fe)结合在一起,共同构建蛋白质的特定的空间结构。因此,每一种蛋白质都有着特定的空间结构。1.4.蛋白质结构和功能都具有多样性和特异性的特点。蛋白质结构的多样性和特异性既与组成蛋白质的氨基酸的种类、数量和连接顺序相关,也与肽链盘曲、折叠成的空间结构有关。蛋白质结构的多样性决定了其功能的多样性。2.相关计算2.1.常规计算根据上述对蛋白质结构的描述,我们可以总结出蛋白质结构中如下一些规律:(若氨基酸平均相对分子质量为a)肽链数氨基酸数肽键数脱水数相对分子质量氨基数羧基数1mm-1m-1ma-(m-1)×18至少1个至少1个nmm-nm-nma-(m-n)×18至少n个至少n个即:⑴蛋白质中肽键数=脱水数=氨基酸数-肽链数=m-n

⑵蛋白质相对分子质量=氨基酸总质量-脱水总质量

=氨基酸数×氨基酸相对分子质量-脱水数×水的相对分子质量

=ma-(m-n)×18

⑶蛋白质中氨基或羧基数=末端氨基/羧基数+R基中氨基/羧基数

=肽链数+R基中氨基/羧基数(1条肽链有1个末端氨基和1个末端羧基,R基中氨基、羧基数量不确定。故用至少n个——肽链数表示。)若为环肽,即链状多肽的末端氨基和末端羧基形成1个新的肽键,使之变为环状。可以将肽链数视为零,上面总结的规律仍符合。有时候还要考虑其他化学变化的影响,如二硫键形成造成的脱氢、R基中氨基和羧基形成肽键等。【例1】:若某蛋白质的相对分子质量为11935,在合成这个蛋白质的过程中脱去水的相对分子质量为1908,假设氨基酸的平均相对分子质量为127,则组成该蛋白质分子的肽链有()A.1条B.2条C.3条D.4条【解析】:蛋白质相对分子质量=氨基酸的数目×氨基酸平均相对分子质量-脱去水的相对分子质量氨基酸的数目=(蛋白质相对分子质量+脱去水的相对分子质量)/氨基酸平均相对分子质量=(11935+1908)/127=109肽键数=脱去水分子数目=脱去水的相对分子质量/水的相对分子质量=1908/18=106肽链数=氨基酸数目-肽键数=109-106=3。选择答案C。以上是蛋白质相关计算的第一类,也是常见的形式。除此之外,还有蛋白质中某些原子(C、H、O、N、S)数量的计算、某些特殊氨基酸数量的计算、及氨基酸连接顺序多样性的计算等。下面一一讨论。2.2.蛋白质中某些原子数量的计算:⑴S:组成蛋白质的20种氨基酸中甲硫氨酸和半胱氨酸中各有1个S。蛋白质中S原子数是甲硫氨酸、半胱氨酸的和。⑵C:蛋白质的全部氨基酸的C的和。脱水缩合不影响C的数。⑶H:蛋白质的全部氨基酸的H的和-脱去水中的H(脱水数×2)-二硫键数×2

蛋白质中H在5个地方:末端羧基;末端氨基;中心C连接的H;肽键;R基中

=末端羧基数×1+末端氨基数×2+氨基酸总数×1+肽键数×1+全部R基中的H总数

=肽链数×1+肽链数×2+氨基酸总数×1+(氨基酸总数—肽链数)×1+全部R基中的H总数

=肽链数×2+氨基酸总数×2+全部R基中的H总数【例2】:1个十肽中至少含H原子数多少?【解析】:十肽是由10个氨基酸组成的1条肽链,最简单的氨基酸是甘氨酸,其R基是H。因此,十肽至少含H原子:1×2+10×2+1×10=32⑷O:蛋白质的全部氨基酸的O的和-脱去水中的O(脱水数)

蛋白质中O在3个地方:末端羧基;肽键;R基中

=末端羧基数×2+肽键数×1+全部R基中的O总数

=肽链数×2+(氨基酸总数—肽链数)×1+全部R基中的O总数

=肽链数+氨基酸总数+全部R基中的O总数=肽链数×2+肽键数+全部R基中的O总数⑸N:蛋白质的全部氨基酸的N的和。脱水缩合不影响N的数。

蛋白质中N在3个地方:末端氨基;肽键;R基中

=末端氨基数×1+肽键数×1+全部R基中的N总数

=肽链数×1+(氨基酸总数—肽链数)×1+全部R基中的N总数

=氨基酸总数+全部R基中的N总数=肽链数+肽键数+全部R基中的N总数【例3】:某三十九肽中共有丙氨酸(R基为—CH3)4个,现去掉其中的丙氨酸得到4条长短不等的多肽(如图)。下列说法错误是(

)A.该过程减少8个肽键B.这些肽链比三十九肽增加了3个氨基和3个羧基C.碳原子减少12个D.氧原子数目减少1个【解析】根据图解,三十九肽是一条多肽链,故有39个氨基酸,38个肽键,该多肽中丙氨酸的位置是第8、18、27、39,根据丙氨酸的位置可知去除4个丙氨酸后将导致7个肽键断裂,A项错误;原三十九肽至少有一个氨基和一个羧基,而水解形成的4条短肽至少有4个氨基和4个羧基,所以氨基和羧基分别增加3个,B项正确;一个丙氨酸含有3个碳原子,去除4个丙氨酸形成短肽后C原子减少12个,C项正确;7个肽键断裂(水解)需要7个水分子(7个O),同时脱去了4个丙氨酸(8个O),所以O原子数目减少1个,D项正确。选择答案A。2.3.蛋白质中某些特殊氨基酸数量的计算:氨基酸的分子通式是:C2H4O2N—R。由于R基中C原子数不确定,H原子较多,其他原子(N、O、S等)无或较少,因此常以蛋白质中N、O、S等的数量特别是R基中N、O、S等的数量为突破口来推算某些特殊氨基酸的数量。蛋白质中N原子的位置及数量:①末端氨基×1、②肽键×1、③R基中的氨基×1。蛋白质中O原子的位置及数量:①末端羧基×2、②肽键×1、③R基中的羧基×2。蛋白质中S原子的位置及数量:R基中的S原子×1。⑴R基中含氨基的氨基酸数=蛋白质中N原子数-氨基酸数=N原子数-肽键数-肽链数⑵R基中含羧基的氨基酸数=(蛋白质中O原子数-肽键数-2×肽链数)/2⑶R基中含S的氨基酸数=蛋白质中S原子数【例4】经测定,某多肽链分子式是C21HxOyN4S2,其中含有一个二硫键(—S—S—)。已知该多肽是由下列几种氨基酸中的几种作为原料合成的:苯丙氨酸(C9H11O2N)、天冬氨酸(C4H7O4N)、丙氨酸(C3H7O2N)、亮氨酸(C6H13O2N)、半胱氨酸(C3H7O2NS)。下列关于该多肽的叙述,不正确的是A.该多肽水解后产生的氨基酸分别是苯丙氨酸、亮氨酸和半胱氨酸B.该多肽中H原子数和O原子数分别是30和5C.该多肽形成过程中至少需要3种tRNAD.该多肽在核糖体上形成,形成过程中相对分子量减少了54【解析】由分子式C21HxOyN4S2可知此多肽中含S原子2个、N原子4个,推出此多肽是由4个氨基酸组成四肽,其中含S的氨基酸——半胱氨酸(C3H7O2NS)2个。在根据C原子数推算出另外两个氨基酸中C原子数的和是15(21-2×3=15),则另外两个氨基酸必为苯丙氨酸(C9H11O2N)和亮氨酸(C6H13O2N)(15=9+6)。该多肽由苯丙氨酸、亮氨酸和半胱氨酸组成的,多肽水解后产生的氨基酸分别是半胱氨酸、丙氨酸和亮氨酸,A正确;该多肽由2个半胱氨酸、1个苯丙氨酸和1个亮氨酸经脱水缩合失去3分子水和2个氢原子形成,该多肽中H原子数=2×7+11+13-3×2-2=30个、O原子数=2×2+2+2-3=5个,B正确;该多肽由2个半胱氨酸、1个苯丙氨酸和1个亮氨酸组成,氨基酸的种类为3种,形成过程至少需要3种tRNA,C正确;该多肽形成时的脱水数为3个,另外由于形成一个二硫键失去2个氢原子,所以该过程中相对分子质量减少3×18+2=56,D错误。故选择答案D。【例5】:某多肽链为199肽,其分子式为CxHyNAOBS2(A>199、B>200),并且由下列5种氨基酸组成。那么这条多肽链彻底水解后得到的赖氨酸、天冬氨酸分子的个数分别是A.A-199;(B-200)/2B.A-200;B-200C.A-199;(B-199)/2D.A-200;(B-200)/2【解析】:如图显示了5种氨基酸的结构式,从中可以看出出以下几个特点:⑴只有半胱氨酸含S,数量1;⑵只有赖氨酸有2个氨基,2个N;⑶只有天冬氨酸有2个羧基,4个O。除R基之外,此199肽至少有N原子199个,至少有O原子(198+1×2)=200个。我们可以依据N原子数推算赖氨酸数,依据O原子数推算天冬氨酸数。因此,这条多肽链彻底水解后得到的赖氨酸分子的个数=A-199;天冬氨酸分子的个数=(B-200)/2。选择答案A。2.4.氨基酸连接顺序(多肽或蛋白质)多样性的计算:蛋白质或多肽是由氨基酸为基本组成单位构成的多聚体。氨基酸的种类、数量、连接顺序都会影响蛋白质的结构。若氨基酸数量相同,则蛋白质结构受氨基酸的种类、连接顺序影响;若氨基酸种类、数量都相同,则受连接顺序影响。【例6】现有足量的甘氨酸、丙氨酸、谷氨酸3种氨基酸,它们能形成的三肽种类以及包含3种氨基酸的三肽种类分别最多有()A.9种,9种B.6种,3种C.18种,6种D.27种,6种【解析】用“□―□―□”表示三肽,若3种氨基酸足量,每1位置都有3种可能,三肽的种类为3×3×3=27种;若形成包含3种氨基酸的三肽,3个位置可能性依次为3、2、1,这样的三肽种类是3×2×1=6种。选择答案D。【例7】一个由20种、500个氨基酸组成的蛋白质,它的氨基酸的排列顺序可能是:A.20500种B.50020种C.10000种D.2020种【解析】500个氨基酸组成的蛋白质,每个位置的氨基酸都有20种可能性,因此它的排列顺序可能是50020种。选择答案B。2.5.还有一类计算是讨论DNA(基因)、mRNA中核苷酸(碱基)数与蛋白质中氨基酸数。这类计算要依据中心法则原理,理解DNA(基因)中核苷酸(碱基)数、mRNA中核苷酸(碱基)数与蛋白质中氨基酸数之间有3对(6个)∶3个∶1个的数量关系(不考虑基因中的非编码序列、不考虑mRNA中的起始密码与终止密码等)。氨基酸数量与密码子数量相关,氨基酸种类与tRNA种类相关。1种氨基酸可能对应不止1种密码子,也可能由不止1种tRNA运输。【例8】现代生物工程能够实现在已知蛋白质的氨基酸序列后,再人工合成基因。现已知人体生长激素共含190个肽键(单链),假设与其对应的mRNA序列中有A和U共313个,则合成的生长激素基因中G至少有()A.130个B.260个C.313个D.无法确定【解析】人的生长激素含190个肽键,则生长激素是由191个氨基酸组成。根据中心法则,则其对应的mRNA和其基因中有碱基573个和1146个;又由于碱基互补配对的关系可知,mRNA中的(G+C)/全部碱基与D

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