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文档简介
生物学XX生物科技公司研发实习生报告一、摘要
2023年6月5日至8月22日,我在XX生物科技公司担任研发实习生,负责基因编辑实验平台的优化与数据分析。通过8周实践,我参与构建了5个标准化的CRISPRCas9实验流程,将载体转染效率从12%提升至28%,并完成32组小鼠模型基因敲除实验的数据整理,构建了包含217个有效样本的数据库。熟练应用Python对测序数据进行质控与聚类分析,开发的自动化脚本将数据处理时间缩短了40%。核心工作成果体现在优化实验方案与提升数据时效性,提炼出的“分阶段验证动态调整”实验设计方法论可推广至同类研究。专业技能涵盖分子生物学操作、生物信息学分析及实验记录标准化管理。
二、实习内容及过程
2023年6月5日入职后,我被分配到基因功能验证团队,跟着师兄做小鼠模型的构建与表型分析。团队主要研究神经退行性疾病的动物模型,我参与的项目是验证一种新的基因敲除方法在APP基因上的效果。初期负责建立CRISPRCas9的转染体系,实验数据反复失败,转染效率只有5%,远低于文献报道的15%以上。通过查阅文献和请教师兄,发现是血清浓度和聚乙二醇比例没调好,重新优化后效率提到12%,但离目标还是差。又花了2周时间调整PEI试剂的批次,同时改进电转参数,8月12日终于稳定在28%,这个数据让后续实验推进顺利。
实习中期接手数据处理工作,团队有几百G的测序原始数据,当时用的是自建脚本做质控,每天要花6小时手动筛选。意识到效率太低后,开始自学Python的Biopython库,9天后写了个自动化工具,把质控和STARalignment的时间压缩到2小时。拿32组小鼠的RNAseq数据做案例分析,发现基因敲除组中差异表达基因的聚类图能清晰分出3个亚型,这为后续的表型分析指明了方向。
遇到最大挑战是7月20日实验平台突然断电,超低温冰箱里的细胞冻坏了一大半。当时手头正好有10个待分析的样本,急得不行。赶紧联系设备部抢修,同时把剩余细胞分到3个备份冰箱,最后保住了6个。这件事让我意识到实验记录一定要留冗余,比如关键试剂的批次都要写清楚,万一出问题好追溯。
团队用的实验流程比较分散,不同组之间差异挺大,我花了1个月时间把它们标准化,编了份操作手册,现在新来的实习生都能独立上手。但过程中发现公司培训挺乱的,入职时没给完整的项目背景,很多专业术语要现学,比如m6A修饰这种新概念,一周后才完全搞懂。另外小鼠模型的管理也够呛,不同批次的动物数据混在一起,好几次差点搞错。
这8周让我对分子实验的每个环节都熟悉了,以前觉得基因敲除离我很远,现在真枪实弹做出来才发现细节多着呢。比如测序前的RNA质检,RIN值低于4就基本要重做,这种经验书里根本学不到。最大的收获是学会怎么把文献里的方法落地,像我优化转染体系那次,就是不断试不同参数才找到最优组合。以后想进生物公司做研发,还得在实验动手能力和数据分析上多下功夫。
三、总结与体会
这8周,从6月5日到8月22日,跟着团队把小鼠模型基因敲除的效率从5%拉到28%,这个过程像给我上了一堂生动的实践课。实习的价值闭环很明显,我学的CRISPR优化技巧,直接用在8月12日解决转染难题上,这种即学即用最实在。32组小鼠的RNAseq数据分析也让我体会到,生物信息学不只是跑软件,真正难的是怎么从复杂数据里挖出有意义的信号,比如那次聚类分析发现的小鼠亚型,差点就因为原始数据杂乱而过稿。
这段经历让我对职业规划有了更具体的想法。以前觉得做科研就是泡实验室,现在明白研发岗不仅要会做实验,还得懂项目管理。团队那套不成文的流程混乱,新来的实习生经常踩坑,这让我意识到自己以后要学的不仅是技术,还得补上实验标准化和团队协作这两块短板。9月底之前,我打算把Python的Bioconda环境搭起来,考个PMP证书试试,看看能不能把管理经验往科研上套用。
行业趋势这块,公司用的RNAseq数据处理还是老一套,每次跑STAR都要等好几个小时,隔壁组在用新的AI算法做变异检测,效率高多了。这让我觉得,以后生物技术发展肯定越来越依赖计算,我下学期打算多修几门计算机课,至少得会用些深度学习框架,不然以后真会被淘汰。
心态转变最明显的是抗压能力。7月20号那个晚上,实验平台断电,10个样本差点全泡汤,当时真是急得不行。现在回想起来,那种责任感让我连夜跑设备部协调,第二天还主动把备份冰箱的资源分了一半给别的组。这种经历以前在学校根本没遇到过,现在反而觉得挺带劲的。下个月去实验室做毕设,我打算主动揽些更复杂的实验,毕竟从学生到职场人的成长,就是一步步在解决实际问题的过程中磨出来的。
四、致谢
在XX生物科技公司这8周的实习,从6月5日到8月22日,非常感谢团队给我的机会。师兄在实验遇到困难时指导我调整转染参数,让我明白了文献方法落地要不断试错。同事们在数据分析和设备问题处理
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