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文档简介
异种移植用无指定病原体医用供体猪:微生物
学监测
1范围
本部分规定了异种移植用无指定病原体(DesignedPathogenFree,DPF)医用供体猪微生物学等
级分类、检测要求、检测程序、检测方法、检测规则、结果判定、判XX论、样本保存等。
本部分适用于异种移植用DPF医用供体猪微生物学等级监测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T14926.1实验动物沙门氏菌检验方法
GB/T14926.4实验动物皮肤病原真菌检测方法
GB/T14926.8实验动物支原体检测方法
GB/T14926.27实验动物小鼠腺病毒检验方法
GB/T14926.30实验动物兔轮状病毒检测方法
GB/T14926.46实验动物钩端螺旋体检测方法
GB/T14926.47实验动物志贺氏菌检测方法
GB/T14926.48实验动物结合分枝杆菌检测方法
GB/T14926.56实验动物狂犬病病毒检测方法
GB/T16551猪瘟诊断技术
GB/T17013包虫病诊断标准及处理原则
GB/T18090猪繁殖与呼吸综合征诊断方法
GB/T18448.1实验动物体外寄生虫检测方法
GB/T18448.2实验动物弓形虫检测方法
GB/T18448.6实验动物蠕虫检测方法
GB/T18638流行性乙型脑炎诊断技术
GB/T18641伪狂犬病诊断技术
GB/T18646动物化X氏菌病诊断技术
GB/T18647动物球虫病诊断技术
GB/T18935口蹄疫诊断技术
GB/T19200猪水泡病诊断技术
GB/T19915.1猪链球菌2型平板和试管凝集试验操作规程
GB/T19915.2猪链球菌2型分离鉴定操作规程
GB/T19915.3猪链球菌2型PCR定型检测技术
GB/T19915.7猪链球菌2型荧光PCR检测方法
GB/T2I674猪圆环病毒聚合酶链反应试验方法
GB/T22333日本乙型脑炎病毒反转录聚合酶链反应试验方法
GB/T22915口蹄疫病毒荧光RT-PCR检测方法
GB/T22917猪水泡病病毒荧光RT-PCR检测方法
GB/T27536猪流感病毒分离与鉴定方法
GB/T2I674猪圆环病毒聚合酶链反应试验方法
GB/T34757猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法
GB/T36871猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒和猪轮状病毒多重RT-PCR检测方法
NY/T537猪放线杆菌胸膜肺炎诊断技术
NY/T541动物疫病实验室检验采样方法
NY/T545猪痢疾诊断技术
NY/T546猪菱缩性鼻炎诊断技术
NY/T548猪传染性胃肠炎诊断技术
NY/T550动物和动物产品沙门氏菌检测方法
NY/T564猪巴氏杆菌病诊断技术
NY/T679猪繁殖和呼吸综合征免疫陋试验方法
SN/T0420出口猪肉旋毛虫检验方法消化法
SN/T1379.1猪瘟单克隆抗体酶联免疫吸附试验
SN/T1396弓形虫病间接血凝试验
SN/T1446.1猪传染性胃肠炎阻断能联免疫吸附试验
SN/T1699猪流行性腹泻检疫技术规范
SN/T1919猪细小病毒病红细胞凝集抑制试验操作规程
SN/T2708猪圆环病毒病检疫技术规范
SN/T3499新泡子虫病检疫技术规范
SN/T4235猪戊型肝炎检疫技术规范
SN/T5124猪Delta冠状病毒检疫技术规范
DB22/T3283猪血凝性脑脊髓炎病毒检测TaqMan荧光定量PCR法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
异种移植用DPF医用供体猪medicalgradeDPFdonorpigforxenotransplantation
经人工饲养与培育,遗传背景明确或者来源清楚,12月龄体重宜不超过50kg,不携带世界卫生组
织(WorldHealthOrganization,WHO)指定供体动物应排除的潜在感染或条件致病和感染性人畜共患
疾病病原,必须利用生物安全屏障环境防止病原体感染,不得使用抗生素或疫苗,用于医用异种移植供
体、科学研究、教学、生产和质量控制鉴定以及其他科学实验的小型猪。
4微生物学等级
异种移植用DPF医用供体猪微生物学等级为医用供体无指定病原体级。
5检测要求
2
5.1临床观察
外观检查无异常。
5.2微生物检测项目
异种移植用DPF医用供体猪病原微生物检测项目见表1。
6检测程序
检测程序见图1。
图1异种移植用DPF医用供体猪检测程序
结合临床症状和实验室检查结果,需要进一步确证时,可取特定样本进行检测。
7检测方法
检测方法见表lo
表1异种移植用DPF医用供体猪病原微生物检测项目及检测方法(续)
类型序号检测项目检测方法
3猪痢疾蛇样螺旋体Serpulina-hyodysenteriaeNY/T545
4牛型分枝杆菌Mycobacteriumbovis附录A
5结核分枝杆菌MycobacteriumtuberculosisGB/T14926.48
细胞内鸟型结核分枝杆菌复合物
6附录R
Mycobacteriumavium-intracelluarecomplex
7猪肺炎支原体MycoplasmahyopneiunoniaeGB/T14926.8
细菌类
8沙门氏菌SalmonellatyphiGB/T14926.1;NY/T550
Bacterium
9志贺氏菌ShigellaGB/T14926.47
10支气管败血波氏杆菌BordeteUabmnchisepticaNY/T546
11多杀巴氏杆菌PasteurellamultocidaNY/T546:NY/T564
12猪胸膜肺炎放线杆菌ActinohacilluspleumpneumoniaeNY/T537
GB/T19915.1-3;
13猪链球菌2型Streptococcussuistype2
GB/T19915.7
14皮肤病原真菌PathogenicdermalfungiGB/T14926.4
真菌类
15新型隐球菌Cryptococcusneoformans附录c
Fungi
16荚膜组织胞浆菌Histoplasmacapsulation附录D
17体外寄生虫氏tozoaGB/T18448.1
18猪蛔虫AscarissuumGB/T18448.6
19棘球绦虫Echinococcussp.GB/T17013
20等抱球虫属IsosporaspGB/T18647
寄生虫类
21猪兰氏类圆线虫Slrongyloidesransomi附录E
Parasites
22弓形虫ToxoplasmagondiiGB/T18448.2;SN/T1396
23旋毛虫TrichinellaspiralisSN/T(M20
24新彳包子虫NeosporaSN/T3499
25布氏姜片吸虫Fasciolopsisbuski附录F
26猪腺病毒Adenovirus(porcine)GB/T14926.27
27猪脑心肌炎病毒Encephalomyocarditisvirus附录G
28猪流感病毒porcineInfluenzavirusGB/T27536
29人流感病毒HumanInfluenzaviruses附录H
病毒类30猪巨细胞病毒Porcinecytomegalovirus附录I
Viruses
31疱疹病毒Porcinegaina-herpesvirus附录J
猪繁殖与呼吸综合征病毒
32GB/T18090:NY/T679
Porcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus
33猪细小病毒ProcineparvovirusSN/T1919
34轮状病毒RotavirusGB/T14926.30
表1异种移植用DPF医用供体猪病原微生物检测项目及检测方法(续)
类型序号检测项目检测方法
35伪狂犬病病毒PseudorabiesvirusGB/T18641
36狂犬病病毒RabiesvirusGB/T14926.56
37口蹄疫病毒FootandmouthdiseasevirusGB/T18935:GB/T22915
38猪瘟病毒ClassicalswinefevervirusGB/T16551;SN/T1379.1
39日本乙型脑炎病毒JapanesesencephalitisvirusGB/T18638:GB/T22333
40猪圆环病毒
猪圆环病毒1型Porcinecircovirustype1GB/T21674:SN/T2708
猪圆环病毒2型Porcinecircovirustype2
41猪冠状病毒
猪传染性胃肠炎病毒GB/T36871;NY/T548;
PorcinetransmissiblegastroenteritisvirusSN/T1446.1
病毒类GB/T36871;GB/T34757:
猪流行性腹泻病由Porcineepidemicdiarrheavirus
VirusesSN/T1699
猪德尔塔冠状病毒PorcinedeltacoronavirusSN/T5124
猪急性腹泻综合征冠状病毒
附录K
Swineacutediarrheasyndromecoronavirus
猪呼吸道冠状病等PorcineRespirator),Coronavirus附录L
猪血凝性脑脊髓炎病毒
DB22/T3283
Porcinehemaggkitinatingencephalomyelitisvirus
42猪水泡病病毒SwinevesiculardiseasevirusGB/T19200:GB/T22917
猪内源性逆转录病毒C
43附录M
PorcineendogenousretrovirusC(PF.RV-C)
44猪淋巴性疱疹病毒Porcinelymphotropicherpesvirus(PLHV)附录N
45戊型肝炎病毒HepatitisEvirus(HEV)SN/T4235-2015
新型冠状病毒SevereAcuteRespiratorySyndromeCoronavirus
46附录0
2(SARS-CoV-2)
8检测规则
8.1检测频率
每6个月至少检测一次。
8.2抽样
方式
选择6月龄以上的异种移植用DPF医用供体猪用于检测,随机抽样。
数量
根据异种移植用DPF医用供体猪群体大小,抽样数量见表2。
6
表2抽样数量
群体大小抽样数量
<50头不少于3头
50-100头不少于5头
100-500头不少于25头
>500头不少于5%
注:临床应用的猪需要进行100%抽样检查。
方法
.1按病毒、细菌、真菌、寄生虫检测要求联合采样。
.2采样方法按照NY/T541以及医学采样程序进行。
8.3样本标识要求
样本要求有明显标识,写明检品名称、品系、等级、数量、编号、栏舍及检测项目等内容,安全送
达实验室。
9结果判定
9.1合格判定
按各个微生物检测项目结果判定方法判定检测结果,抗体检测项目,血清抗体阴性为合格,抗原和
核酸检测项目,未见阳性为合格。
10判XX论
所有项目的检测结果均合格,判为符合DPF等级标准。否则,判为不符合DPF等级标准。
11样本保存
11.1样本资料、样本来源、动物编号、样本种类及编号,按医学病理资料档案管理规范保存。保存时
间为I年V
11.2检测样本应一式两份,其中一份应该保存于液氮罐中,保存器具应该标志清晰,符合病理标本保
存规范。
附录A
(规范性附录)
牛分枝杆菌PCR检测方法
A1原理
以牛分枝杆菌16SrRNA基因和IS6110基因为靶序列,建立双重PCR方法。
A2样品采集
A2.1样品类型
有明显的结节状、干酪样坏死组织的猪病变组织
A2.2样品采集用无菌剪刀剪取病料组织约0.5-lg,置无菌1.5mLEP管中;加入400pL的组织消化液
和蛋白酶K(终浓度为1mg/mL);55℃,水浴8h,其间间隔半小时颠倒EP管几次,以使病料组织与
消化液充分反应;8000rpm,离心5min,取上清液置另一无菌1.5mLEP管中;加入等体积的苯酚:氯
仿:异戊醇(25:24:1)液体,反复颠倒几次:12000rpm,离心10min,取上层液体于•无窗1.5mLEP
管中;重复抽提I次;加入等体积的异丙醇,充分混匀后,置-20℃30min;l20()0rpm,离心lOmin,
弃上清;沉淀用70%乙醇清洗,并置37℃,至乙醇挥发完全;加入30RLTE,并加入RNA酶,37℃,
放置40min;将所得液体作为模板,并置-20C保存。
A3操作步骤
A3.1引物的设计
参照MycobacteriumbovisAF2122^97[gi:31742509]基因序列设计出16SrRNA基因和IS6110基因引物。
引物序列如下:
16SrRNAPl5-CACATGCAAGTCGAACGGAAAGG-3'
16SrRNAP2:5,-GCCCGTATCGCCCGCACGCT-3,扩增片段大小约为584bp.>
IS6110Pl:5'-GGCTTGCCGGGTTTGA-3」S6110P2:5'-
TTTGTCACCGACGCCTACGCT-3,扩增片段大小约为309bp。
A3.2PCR反应
根据引物设计时,oligo6.0软件提供的建议Tm值,PCR反应体系为:原理模板2^L(1.75pg-l.75pg),
lOxPCRbuffer2.5gL,dNTPs2pL,IS6110引物各0.5pL(5pM),16SrRNA引物各1.5pL(15pM),蒸
储水14吐,Taq酶0.5pL(2.5U);体系总体积为25比。
PCR扩增的反应条件:95℃预变性lOmin,95℃变性30s,59.5℃退火30s,72℃延伸45s,30个循
环,最后延伸7min,4"C保存。
A3.3PCR扩增产物的鉴定
0.8%的X脂糖,电压I2OV,电泳12-I5min,在凝胶成像系统中检测。
8
A4结果判定按照设定的双重PCR反应体系和扩增条件,如果出现大小309bp的1S6110基因和约584bp
的I6SrRNA基因的目的片段说明PCR结果阳性。
附录B
(规范性附录)
细胞内鸟型分枝杆菌PCR检测方法
BI以鸟型分枝杆菌特异性插入序列IS1245,设计一对特异性引物,用于检测和鉴定皮肤组织中鸟型
分枝杆菌。
B2样品采集
B2.1样品类型
猪皮肤组织
B2.2样品采集
无菌条件下取上述组织1g左右,置入1.5mL洁净EP管。
B3操作步骤
B3.1组织处理
将皮肤组织去脂、剪碎,用组织研磨器研磨后补加适量蒸储水,制成组织匀浆2mL,低速离心后
取上清液,2倍连续稀释后装于微量离心管中。
B3.2PCR扩增和检测
扩增插入序列IS1245:
弓I物1为5<GCCGCCGAAACGATCTAC-3'
引物2为5AGGTGGCGTCGAGGAAGAC-3'
5()RLPCR反应体系含lOxPCR缓冲液5pL,25mmol/LMgCI25|.iL,dNTPs200pmol/L,引物各
Ipmol/L,模板DNAIOpL,TaqDNA聚合酶lUo循环条件:94℃预变性5min,其后按94℃30s,65℃30s,
72c45s,扩增产物于1.5%X脂糖凝胶电泳,花青素染色,用紫外检测仪观察结果并摄影。
B4结果判定。
出现427bp扩增带为阳性,未见427bp扩增带为阴性。
附录c
(规范性附录)
新型隐球菌DNA实时荧光定量PCR检测
CI以新型隐球菌的ITS基因序列中一段高度保守序列为目的序列,设计出特异引物和探针,应用实
时荧光定量PCR技术进行检测,
C2样品采集
C2.1样品类型
猪肺部分泌物
C2.2样品采集
对送检的猪解剖后用棉拭子取下肺部的分泌物,用PBS洗脱棉拭子,洗下的液体经冻融二次,离
心取上清,加入双抗保存备用。
C3操作步骤
C3.1引物的设计
根据新型隐球菌的基因序列设计引物为:
FP:5,-TTACCTGTTGGACTTGGATTTGG-3,
RP:55-CATAGGCCCAGCGAAACTTATT-3,
C3.2DNA的提取
取气管分泌物上清加入SDS和蛋白随K,50℃水浴lh,每15分钟摇一次。用酚及酚氯仿抽提,
乙醉沉淀,用20ul无菌双蒸水溶解备用。在反应体系中加入5ul模板,总量为50uL。
C3.3目的基因的扩增
以50jxLPCR反应体系进行反应:lOxPCRBuffe以含15mmR/LMgCI2)5gL,dNTPmixture(1Ogmol/L)
IpL,TaqDNA聚合酶(5U/|iL)0.4RL、DNA模板2RL,上式游引物各3pL,加ddH2O至50pL,于
扩增仪扩增,循环条件:94℃Smin,94c30s、58℃Imin共40个循环。
C4结果判定
取5HLpcR产物于1.5%X脂糖(含10%GoldView)中,5V/cm电压电泳60-75min,紫外透视仪上
检测,荧光条带在124bp处即为阳性。
附录D
(规范性附录)
抗荚膜组织胞浆菌抗体ELISA检测方法
D1用中国药品生物制品检定所研制的荚膜组织胞浆菌蛋白提取物(purifiedproteinfromHistoplasma
capsulatum,P-HTPM)为抗原,建立检测猪血清中抗真菌英膜组织胞浆菌抗体的酶联免疫吸附试验。
D2样品采集
D2.1样品类型
猪血清
D2.2样品采集
无菌条件下用一次性注射器取耳静脉血3mL-5mL,置于试管中,分离血清,待检。
D3操作步骤
D3.1用1座孔的抗原包被酶标板,50/L/孔,37℃孵育2h。
D3.2弃去孔中液体,加入洗涤液(含0.05%Tween-20的0.01mol/LpH7.4PBS、PBST),300山孔,
洗涤3次,每次3min。
D3.3扣干。
D3.4加入封闭液(含5%犊牛血清的PBST),100pL/孔,37c封闭30min。
D3.5弃去封闭液,加入待检血清(稀释度为1:1000),100R孔,37℃作用30“山1。
D3.6洗涤3次(方法同前)。
D3.7扣干。
D3.8加入1:10000的酶标抗体(二抗)100山孔,37c作用45min。
D3.9洗涤3次。
D3.10扣干。
D3.ll加入底物TMB显色液,IOORL/孔,室温避光显色10-l5min。
D3.12每孔加入50nL2moi/LILSOj终止反应。
D3.13测定吸光度值,按照下列公式计算P/N值:P/N值二阳性对照孔OD均值/阴性对照孔OD均值。
D4结果判定
当被检样品的A值>0.135时,判定为阳性;当样品的A值在0.059-0.135之间时,判定为可疑;当
样品的A值<0.059时,判定为阴性。
12
附录E
(规范性附录)
猪兰氏类圆线虫病镜检法诊断
EI消化道蠕虫粪学检查。
E2样品采集
E2.I样品类型
猪粪便
E2.2样品采集
从猪舍地面及猪直肠分别采集猪的粪样。
E3操作步骤
E3.I饱和食盐水漂浮法检查
取粪样10g溶于饱和食盐水中,用玻璃棒搅拌均匀后用40目的金属筛反复过滤,除去大的粪渣,
将滤液置于大试管中,让液面突出于试管口,静止30min后蘸取液面制压片,在40倍显微镜下检查。
E3.2尼龙箍淘洗法检查
取粪样25g置于大烧杯中,用常水溶解并用玻璃棒充分搅拌均匀后,经金属筛反复过滤,除去大的
美渣,将滤液置入260目的尼龙筛内,用清水反复淘洗,直至淘洗液澄清透明位置,吸取尼龙筛内沉积
物制压片,在10倍和40倍显微镜下检查。
E4结果判定
E4.I饱和食盐水漂浮法
经饱和食盐水飘浮法对猪的粪便进行检查,从直肠采取的粪样中查到虫卵,椭圆形,无色透明,卵
克薄,大小为(42-53)pmx(24-32)gm,内有幼虫。鉴定为兰氏类圆线虫卵。
E4.2经尼龙筛淘洗法
对猪的粪便进行检查,从地面采集的粪样中查到虫体,虫体细小,呈乳白色,毛发状,镜下透明,
食道短,呈柱状,有两个食道球,虫体大小为(3.1-4.6)mmx(0.055-0.080)mm。鉴定为兰氏类圆线
旦的杆型幼虫。
附录F
(规范性附录)
布氏姜片吸虫镜检法诊断
FI消化道蠕虫粪学检查。
F2样品采集
F2.1样品类型
猪新鲜粪便
F2.2样品采集
从猪舍地面及猪直肠分别采集猪的粪样。
F3操作步骤
F3.1直接涂片法
先取2-3滴蒸偏水(或50%的甘油水)于载玻片上,再用火柴棒取新鲜的粪便混合均匀,去除污秽
后,用低倍镜检查。
F3.2沉淀法
取5J0g的粪便于烧杯中加20mL水,用筛过滤后,装入嘲心器然后倒上清液,再进行离心,反复
数次,取沉淀渣滴于玻片上,用低倍镜检查。
F4结果判定
采用以上两种方法对猪的粪便进行检查,从地面采集的粪样中查到虫体或虫卵,虫体肥厚、背腹扁
工、前端狭窄、后端钝圆,形似鲜姜之切片;虫卵长椭圆形、淡黄色、卵壳薄均匀、前端卵盖扁小不易
看出,长宽比约为130-145Nmx85-97pm,鉴定为布氏姜片吸虫阳性。
14
附录G
(规范性附录)
猪脑心肌炎病毒间接ELISA检测
G1由于2c蛋白为猪脑心肌炎病毒的非结构蛋白,参与病毒的复制,因此在病毒复制时才会产生该蛋
白并刺激机体产生抗体,通过重组2C蛋白为包被抗原建立检测猪脑心肌炎病毒抗体间接ELISA方法。
G2样品采集
G2.1样品类型
猪血清
G2.2样品采集
无菌条件下用一次性注射器取耳静脉血3mL-5mL,置「试管中,分离血清,待检。
G3操作步骤
G3.1将重组蛋白2C用包被液(0.05mol/L>pH9.6的碳酸盐缓冲液)稀释为适当浓度按IOOJIL/孔包被
解标板,37c孵育lh后4c过夜。
G3.2弃去孔中液体,加入洗涤液(含0.05%Tween-20的O.Qlmol/LpH7.4PBS、PBST),300匹/孔,
洗涤3次,每次3min.
G3.3扣干。
G3.4力口入封闭液(含5%犊牛血清的PBST),IOORL/孔,37c封闭lh。
G3.5弃去封闭液,加入待检血清(一抗),lOOpL/孔,37℃作用45min。
G3.6洗涤3次(方法同前)。
G3.7扣干。
G3.8加入适当稀糅的酶标抗体(二抗)lOOpL/孔,37℃作用45min.
G3.9洗涤3次。
G3.10扣干。
G3.ll加入底物TMB显色液,lOOpL/孔,室温避光显色1045min。
G3.12每孔加入5()gL2mol/LH2SO4终止反应。
G3.13测定OD450nm光吸收值,按照下列公式计算P/N值:P/N值=阳性对照孔OD均值/阴性对照
孔OD均值。
G4结果判定当被检样品的OD俏>0.27时,判定为阳性;当样品的OD值<0.27时,判定为阴性。
附录H
(规范性附录)
人流感病毒多重PCR检测
HI根据流感病毒HA基因和M基因设计引物,进行RT-PCR方法检测。
H2样品采集
H2.1样品类型
鼻咽拭子
H2.2样品采集标本采集后,冷冻12h内运送至实验室,24h内进行流感病毒分离培养和快速检测试验。
H3操作步骤
H3.1多重PCR引物设计分别设计扩增引物扩增
HA全基因片段:
H1F-5^agcaaaagcaggggaaaata-S'
HIR-5'-aacaagggtgtttttcctca-S'
H3F-5^agcaaaagcaggggataaltc-S'
H3R-5'-ctcaaaigcaaatgligcacc-3'
BF-5'-gggacatgaacaacaaagatgc-3'
BR-5,-tgtcagctattatggagctg-3,
Hl、H3和乙型扩增产物分别431bp、210bp和390bp。
H3.2病毒RNA提取
提取病毒RNA作为RT-PCR模板,用于反转录试验或置-20℃保存备用。
H3.3病毒逆转录
用试剂盒进行病毒RNA逆转录。
、
H3.4多重PCR反应体系25卜也,各反应物浓度lOxBuffcr2.'iL、MgCl2(25mM)2RLdNTP2pL、
Taq(5U/pL)0.4gL>H对引物(lOmM)各I.25RL、逆转录生成的cDNA4pL、力口水至lj25匹。反应程
序:94"C3min,30s、51℃lmin、68℃Imin共35个循环,68℃10min.
H3.5PCR产物的鉴定
取PCR产物5gL,加入上样孔后进行1%X脂糖凝胶电泳。
H4结果判断出现431bp、210bp或390bp条带,判定为阳性。
附录I
(规范性附录)
猪巨细胞病毒FQ-PCR检测
II原理
TaqMan探针法是高度特异的定量PCR技术,是利用Taq睡的外切核酸酶活性,切断探针,
产生荧光信号。由于探斜与模板是特异性结合,囚此从荧光佶号的强弱就可以判断模板数量。
12样品采集
12.1样品类型
病变组织
12.2样品采集
无菌条件下取上述组织1g左右,置入1.5mL洁净EP管。
13操作步骤
13.1总RNA提取1.5mL样品离心管中,加入ImLTrizol试剂,静置5min或马上-70C保存,12000rpm
离心15min,分相为三层,取上清液至新1.5mL管,加入200ul氯仿,振荡混匀30s,室温静置3・5min
分层,l2000rpm离心I5min,取上清液至新1.5mL管,中间层和红色下层4c保存,便于提取DNA和
蛋白,上清液加入约0.5mL的异丙醇(预冷),振荡混匀30s,室温下静置I5min,12000rpm离心lOmin,
弃上清,RNA沉淀管底,如沉淀不明显,则再离心数秒吸出上清,加入1mL75%乙醇(预冷),温和震
荡悬浮沉淀,8000rpm离心5min,弃上清,短暂快速离心(5s),弃上清,室温放置2min晾干,沉淀
加入15卜iLDEPC处理水,轻弹管壁溶解,少量样品55-60℃水浴孵育10J5min,测量OD260/280值后,
样品放置-70C保存。
13.2反转录
0.2mL离心管加入1匹总RNA,1迎随机引物oligo(dt),lOpiLDEPC处理水,混匀,瞬时离心
5s,7(TC水浴5min,迅速冰浴2min,瞬时离心,加入4匹5xBuffer,2pL0.1MDTT,2pLlOMmdNTPs,
混匀,温浴2min,加入IpL反转录酶,42c温育50min,70℃孵育lOmin灭活,-70℃冰箱保存。
13.3引物与TapMan探针的设计与合成
设计一对特异引物P1/P2和TapMan探针:
PI:5,-TGGCACTGATACTTGACAAGC-3,
P2:5,-CTCCCGTGAAGCCGTAAA-3,
TapMan探针:FAM-5'・CAGCTTGCCCTCAAGGTGACGTG-3'-TAMRA.
13.4标准曲线的建立
用含pGEMT/PCMV重组质粒的溶液作标准品,10倍稀释成1.0x101()-1.0x100拷贝/回,共II个
稀释度,以不同浓度的重组质粒为模板进行FQ-PCR敏感性试验。以起始模板数的对数为X轴,以
FQ-PCR循环次数Ct值为Y轴作回归曲线,建立PCMV检测的标准曲线。
13.5FQ-PCR反应条件
采用5pmol/L的引物浓度和2.5pmol/L的探针浓度对质粒标准品进行检测,双温循环及60c的退火
温度为最佳的循环条件。FQ-PCR反应总体积为25pL,其中lOxExTaqBuffer2.5gL(Mg2+浓度为
2.0mmol/L),dNTPs2pLExlaq0.25gL,上下游引物各0.5ul(lOpmol/L),探针0.25pL(lOpmol/L),
模板IRL,ddlhOI8.00PL,混合均匀,置荧光定量PCR仪上进行自动化扩增反应。反应程序为:94℃
预变性4min,94℃变性15s,60℃退火延伸40s,40个循环。荧光模式设为FAM/TAMRA双标记模式。
13.6根据所得曲线作数据分析。
13.7取部分PCR产物进行X脂糖凝胶电泳,检测产物的特异性。
14结果判定
以电泳阴性对照为标准,根据电泳结果判断是否有阳性产物。
附录J
(规范性附录)
疱疹病毒核酸检测
J1原理
选取一对猪疱疹病毒I型(PHV)将异性引物,通过减裂解法提取猪疱疹病毒DNA,后名在耐热DNA
聚合酶(Taq酶)作用下,配以SD-Buffer(内含Mg2+、Tris-HQ等)、四种核甘酸单体(dNTPs)等成
分,通过聚合酶链式反应体外扩增法对猪疱疹病毒进行体外扩增,产物经凝胶电泳,EB染色,紫外灯
观察,从而达到快速检测之目的。
J2标本采集
J2.1样本类型
血消或病毒液
J2.2样本采集
发病猪脑、淋巴结、扁桃体、肾和脾等组织标本:无菌条件下取上述组织1g左右,置入1.5mL洁
挣EP管,立即送检。血清:用一次性无菌注射器抽取受检猪耳静脉或者前腔静脉静脉血2-5mL,静置
斜放待血清析出,lOOOOrpm离心3min,可取上清立即用于测试;或吸取上部血清(约200pL)转入无
茵1.5mLEP管,保存待检。
J3操作步骤
J3.1引物设计
设计引物序列
PHV-F:5,-GGGACGCTCTGATTAAGGAAT-3,
PHV-R:5,-CTTGGTGATCAGCAGCAGCTTG-3,
J3.2DNA提取
血清或病毒液,常规市售DNA提取试剂盒提取DNA,取提取液进行PCR扩增。
J3.3PCR扩增
反应总体积为25pL,其中IOxBuffer2.5NL(Mg?+浓度为2.0mmol/L),dNTPs2pLExTaqO.25pL,
上下游引物各0.5/L(lOpmol/L),DNA模板IpL,ddH2O19.00gL,混合均匀,置荧光定量PCR仪上
进行自动化扩增反应。按照下列条件扩增:循环条件:95℃预变性3min,53c退火45s,72c延伸3min,
共35个循环。
J3.4电泳检测
(1)2%X脂糠凝胶配制:稀释50xTAE至IxTAE.称4gx脂糖放于500mL锥形瓶中,IxTAE200mL.
置入微波炉中加热溶解-再加入20RLEB充分混匀。在电泳槽内放好梳子,倒入X脂
糖凝胶,待凝固后使用。
(2)电泳检测:直接取PCR扩增产物15回,用加样枪点样于X脂凝胶孔中,以5V/cm电压,IxTAE
中电泳,紫外灯下观察结果。
K4检测结果判定:
阴性无带出现(引物带除外),阳性出现242bp扩增带。若被检样品出现242bp扩增带,即为猪疱
疹病毒阳性,否则为阴性。
23
附录K
(规范性附录)
猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV)RT-PCR检测
K1原理
依据该病毒的保守N基因设计特异性引物,优化反应条件,建立RT-PCR检测方法。
K2样品采集
K2.1样品类型
粪便
K2.2样品采集
标本采集后,在-80C下保存,运送至实验室,进行猪急性腹泻综合征冠状病毒核酸提取。
K3.操作步骤
K3.1在样品中加入磷酸盐缓冲液(PBS)(20%w/v),冷冻并解冻三次,然后在10,000g下离心10分
钟。按照病毒核酸试剂盒说明书进行病毒核酸提取。-80C保存备用。
K3.2根据猪急性腹泻综合征冠状病毒N基因序列设计引物:F:-GGTCCCTGTGACCGAAGTTTTAG:
R:-GCGTTCTGCGATAAAGCTTAAAACTATTA<)
K3.3参照一步法RT-PCR试剂盒说明书进行RT-PCR检测,扩增条件:50℃30分钟,94c3分钟,
%℃变性3()秒,35个循环,5£℃退火30秒,72℃延伸30秒,最后72℃5分钟。
K3.4根据所得曲线作数据分析。取部分PCR产物进行X脂糖凝胶电泳,检测产物的特异性。
K4结果判定
以电泳阴性对照为标准,根据电泳结果判断是否有阳性产物。
附录L
(规范性附录)
猪呼吸道冠状病毒(PRCV)巢式PCR检测
L1原理
巢式PCR是一种变异的聚合酶链反应(PCR),使用两对(而非一对)PCR引物扩增完整的片段。
第一对PCR引物扩增片段和普通PCR相似。第二对引物称为巢式引物,结合在第一次PCR产物内部,
使得第二次PCR扩增片断短于第一次犷增。巢式PCR的优点在于,如果第一次扩增产生了错误片断,
则第二次能在错误片段上进行引物配对并扩增的概率极低。因此,巢式PCR的扩增非常特异。
L2样品采集
L2.1样品类型
粪便或鼻拭子
L2.2样品采集/处理
粪便样本保存于-80C,鼻拭子样本进行冷冻处理后,快速转运至实验室,进行相关检冽。
L3.操作步骤
L3.1样本RNA提取:根据RNA提取试剂盒说明书对粪便或鼻拭子样本进行RNA提取。
L3.2引物的设计与合成:根据己报道的PERV核甘酸序列,引物FI:
-GGGTAAGTTGCTCATTAGAATAATGG,RI:-CTTCTTCAAAGCTAGGGACTG;巢式PCR弓I物F2:
-TTGTGGTYTTGGTYGTAATKCC,R2:-GGCTGTTTGGTAACTAATTTRCCAo
L3.3对照设计:阳性对照:菌株ISU-1(PRCV)用作;阴性对照:MEM-E或PRCV阴性粪便或鼻拭
N、°
L3.4第一次反应体系:将检测样品、阳性和阴性对照的5pLRNA、5^L10xPCR缓冲液、5pL25mM
MgCb、IpL10mMdNTPsx20URnasin.5UAMV逆转录酶、2.5UTaqDNA聚合酶和各0.5pL50Pm
的引物Fl和RI混合均匀。在42℃孵育90分钟,95c5分钟。
L3.5第一次反应条件:94℃,1分钟;60℃,1.5分钟;72℃.2.5分钟,30个循环,72℃,10分钟。
L3.6第二次反应体系:将PCR产物以1:10稀释并用作巢式PCR的模板。取1g稀稀产物与5也10xPCR
缓冲液、5pL25mMMgCk、IpL10mMdNTPs>2.5UTaqDNA聚合酶(美国威斯康星州普罗米加市
麦迪逊)和各0.5pL50Pm引物F2和R2混合。
L3.7第二次反应条件:94C,1分钟:62℃,1.5分钟;72℃,2.5分钟,30个循环,72℃,10分钟。
L3.8在用澳化乙锭染色的l.5%X脂糖凝胶上分析PCR产物。PRCV扩增产物的预测大小为193-253bp
22
K4.结果判定
以电泳阴性对照为标准,根据电泳结果判断是否有阳性产物。
附录M
(规范性附录)
猪内源性逆转录病毒C(PERV-C)PCR检测
Ml原理
依据已公布的猪内源性逆转录病毒env基因差异,分另ij设计PERV-A、PERV-B、PERV-C3种特异
性引物,优化反应条件,建立PCR检测方法。
M2样品采集
M2.1样品类型
血液样本
M2.2样品采集/处理
无菌条件卜.取上述样本2-3mL左右,置入洁净抗凝聚血管中,等量加入PBS液混匀,梯度离心分
离猪PBMC,-8()℃保存备用。
M3操作步骤
M3.1样本DNA提取和总RNA提取:去200ulPBMC悬液加入等体积细胞裂解液及20mg/mL蛋白酹
KIOul,消化,按照DNA/RNA提取试剂盒说明书进行DNA、RNA提取.
M3.2引物的设计与合成:根据已报道的PERV核甘酸序列,分别合成3对引物用于检测PERV-A、
PERV-B、PERV-C3种分型;(PERV-A:
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