异种移植用无指定病原体 医用供体猪:微生物学监测_第1页
异种移植用无指定病原体 医用供体猪:微生物学监测_第2页
异种移植用无指定病原体 医用供体猪:微生物学监测_第3页
异种移植用无指定病原体 医用供体猪:微生物学监测_第4页
异种移植用无指定病原体 医用供体猪:微生物学监测_第5页
已阅读5页,还剩23页未读 继续免费阅读

付费下载

下载本文档

版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领

文档简介

异种移植用无指定病原体医用供体猪:微生物

学监测

1范围

本部分规定了异种移植用无指定病原体(DesignedPathogenFree,DPF)医用供体猪微生物学等

级分类、检测要求、检测程序、检测方法、检测规则、结果判定、判XX论、样本保存等。

本部分适用于异种移植用DPF医用供体猪微生物学等级监测。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文

件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T14926.1实验动物沙门氏菌检验方法

GB/T14926.4实验动物皮肤病原真菌检测方法

GB/T14926.8实验动物支原体检测方法

GB/T14926.27实验动物小鼠腺病毒检验方法

GB/T14926.30实验动物兔轮状病毒检测方法

GB/T14926.46实验动物钩端螺旋体检测方法

GB/T14926.47实验动物志贺氏菌检测方法

GB/T14926.48实验动物结合分枝杆菌检测方法

GB/T14926.56实验动物狂犬病病毒检测方法

GB/T16551猪瘟诊断技术

GB/T17013包虫病诊断标准及处理原则

GB/T18090猪繁殖与呼吸综合征诊断方法

GB/T18448.1实验动物体外寄生虫检测方法

GB/T18448.2实验动物弓形虫检测方法

GB/T18448.6实验动物蠕虫检测方法

GB/T18638流行性乙型脑炎诊断技术

GB/T18641伪狂犬病诊断技术

GB/T18646动物化X氏菌病诊断技术

GB/T18647动物球虫病诊断技术

GB/T18935口蹄疫诊断技术

GB/T19200猪水泡病诊断技术

GB/T19915.1猪链球菌2型平板和试管凝集试验操作规程

GB/T19915.2猪链球菌2型分离鉴定操作规程

GB/T19915.3猪链球菌2型PCR定型检测技术

GB/T19915.7猪链球菌2型荧光PCR检测方法

GB/T2I674猪圆环病毒聚合酶链反应试验方法

GB/T22333日本乙型脑炎病毒反转录聚合酶链反应试验方法

GB/T22915口蹄疫病毒荧光RT-PCR检测方法

GB/T22917猪水泡病病毒荧光RT-PCR检测方法

GB/T27536猪流感病毒分离与鉴定方法

GB/T2I674猪圆环病毒聚合酶链反应试验方法

GB/T34757猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法

GB/T36871猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒和猪轮状病毒多重RT-PCR检测方法

NY/T537猪放线杆菌胸膜肺炎诊断技术

NY/T541动物疫病实验室检验采样方法

NY/T545猪痢疾诊断技术

NY/T546猪菱缩性鼻炎诊断技术

NY/T548猪传染性胃肠炎诊断技术

NY/T550动物和动物产品沙门氏菌检测方法

NY/T564猪巴氏杆菌病诊断技术

NY/T679猪繁殖和呼吸综合征免疫陋试验方法

SN/T0420出口猪肉旋毛虫检验方法消化法

SN/T1379.1猪瘟单克隆抗体酶联免疫吸附试验

SN/T1396弓形虫病间接血凝试验

SN/T1446.1猪传染性胃肠炎阻断能联免疫吸附试验

SN/T1699猪流行性腹泻检疫技术规范

SN/T1919猪细小病毒病红细胞凝集抑制试验操作规程

SN/T2708猪圆环病毒病检疫技术规范

SN/T3499新泡子虫病检疫技术规范

SN/T4235猪戊型肝炎检疫技术规范

SN/T5124猪Delta冠状病毒检疫技术规范

DB22/T3283猪血凝性脑脊髓炎病毒检测TaqMan荧光定量PCR法

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

异种移植用DPF医用供体猪medicalgradeDPFdonorpigforxenotransplantation

经人工饲养与培育,遗传背景明确或者来源清楚,12月龄体重宜不超过50kg,不携带世界卫生组

织(WorldHealthOrganization,WHO)指定供体动物应排除的潜在感染或条件致病和感染性人畜共患

疾病病原,必须利用生物安全屏障环境防止病原体感染,不得使用抗生素或疫苗,用于医用异种移植供

体、科学研究、教学、生产和质量控制鉴定以及其他科学实验的小型猪。

4微生物学等级

异种移植用DPF医用供体猪微生物学等级为医用供体无指定病原体级。

5检测要求

2

5.1临床观察

外观检查无异常。

5.2微生物检测项目

异种移植用DPF医用供体猪病原微生物检测项目见表1。

6检测程序

检测程序见图1。

图1异种移植用DPF医用供体猪检测程序

结合临床症状和实验室检查结果,需要进一步确证时,可取特定样本进行检测。

7检测方法

检测方法见表lo

表1异种移植用DPF医用供体猪病原微生物检测项目及检测方法(续)

类型序号检测项目检测方法

3猪痢疾蛇样螺旋体Serpulina-hyodysenteriaeNY/T545

4牛型分枝杆菌Mycobacteriumbovis附录A

5结核分枝杆菌MycobacteriumtuberculosisGB/T14926.48

细胞内鸟型结核分枝杆菌复合物

6附录R

Mycobacteriumavium-intracelluarecomplex

7猪肺炎支原体MycoplasmahyopneiunoniaeGB/T14926.8

细菌类

8沙门氏菌SalmonellatyphiGB/T14926.1;NY/T550

Bacterium

9志贺氏菌ShigellaGB/T14926.47

10支气管败血波氏杆菌BordeteUabmnchisepticaNY/T546

11多杀巴氏杆菌PasteurellamultocidaNY/T546:NY/T564

12猪胸膜肺炎放线杆菌ActinohacilluspleumpneumoniaeNY/T537

GB/T19915.1-3;

13猪链球菌2型Streptococcussuistype2

GB/T19915.7

14皮肤病原真菌PathogenicdermalfungiGB/T14926.4

真菌类

15新型隐球菌Cryptococcusneoformans附录c

Fungi

16荚膜组织胞浆菌Histoplasmacapsulation附录D

17体外寄生虫氏tozoaGB/T18448.1

18猪蛔虫AscarissuumGB/T18448.6

19棘球绦虫Echinococcussp.GB/T17013

20等抱球虫属IsosporaspGB/T18647

寄生虫类

21猪兰氏类圆线虫Slrongyloidesransomi附录E

Parasites

22弓形虫ToxoplasmagondiiGB/T18448.2;SN/T1396

23旋毛虫TrichinellaspiralisSN/T(M20

24新彳包子虫NeosporaSN/T3499

25布氏姜片吸虫Fasciolopsisbuski附录F

26猪腺病毒Adenovirus(porcine)GB/T14926.27

27猪脑心肌炎病毒Encephalomyocarditisvirus附录G

28猪流感病毒porcineInfluenzavirusGB/T27536

29人流感病毒HumanInfluenzaviruses附录H

病毒类30猪巨细胞病毒Porcinecytomegalovirus附录I

Viruses

31疱疹病毒Porcinegaina-herpesvirus附录J

猪繁殖与呼吸综合征病毒

32GB/T18090:NY/T679

Porcinereproductiveandrespiratorysyndromevirus

33猪细小病毒ProcineparvovirusSN/T1919

34轮状病毒RotavirusGB/T14926.30

表1异种移植用DPF医用供体猪病原微生物检测项目及检测方法(续)

类型序号检测项目检测方法

35伪狂犬病病毒PseudorabiesvirusGB/T18641

36狂犬病病毒RabiesvirusGB/T14926.56

37口蹄疫病毒FootandmouthdiseasevirusGB/T18935:GB/T22915

38猪瘟病毒ClassicalswinefevervirusGB/T16551;SN/T1379.1

39日本乙型脑炎病毒JapanesesencephalitisvirusGB/T18638:GB/T22333

40猪圆环病毒

猪圆环病毒1型Porcinecircovirustype1GB/T21674:SN/T2708

猪圆环病毒2型Porcinecircovirustype2

41猪冠状病毒

猪传染性胃肠炎病毒GB/T36871;NY/T548;

PorcinetransmissiblegastroenteritisvirusSN/T1446.1

病毒类GB/T36871;GB/T34757:

猪流行性腹泻病由Porcineepidemicdiarrheavirus

VirusesSN/T1699

猪德尔塔冠状病毒PorcinedeltacoronavirusSN/T5124

猪急性腹泻综合征冠状病毒

附录K

Swineacutediarrheasyndromecoronavirus

猪呼吸道冠状病等PorcineRespirator),Coronavirus附录L

猪血凝性脑脊髓炎病毒

DB22/T3283

Porcinehemaggkitinatingencephalomyelitisvirus

42猪水泡病病毒SwinevesiculardiseasevirusGB/T19200:GB/T22917

猪内源性逆转录病毒C

43附录M

PorcineendogenousretrovirusC(PF.RV-C)

44猪淋巴性疱疹病毒Porcinelymphotropicherpesvirus(PLHV)附录N

45戊型肝炎病毒HepatitisEvirus(HEV)SN/T4235-2015

新型冠状病毒SevereAcuteRespiratorySyndromeCoronavirus

46附录0

2(SARS-CoV-2)

8检测规则

8.1检测频率

每6个月至少检测一次。

8.2抽样

方式

选择6月龄以上的异种移植用DPF医用供体猪用于检测,随机抽样。

数量

根据异种移植用DPF医用供体猪群体大小,抽样数量见表2。

6

表2抽样数量

群体大小抽样数量

<50头不少于3头

50-100头不少于5头

100-500头不少于25头

>500头不少于5%

注:临床应用的猪需要进行100%抽样检查。

方法

.1按病毒、细菌、真菌、寄生虫检测要求联合采样。

.2采样方法按照NY/T541以及医学采样程序进行。

8.3样本标识要求

样本要求有明显标识,写明检品名称、品系、等级、数量、编号、栏舍及检测项目等内容,安全送

达实验室。

9结果判定

9.1合格判定

按各个微生物检测项目结果判定方法判定检测结果,抗体检测项目,血清抗体阴性为合格,抗原和

核酸检测项目,未见阳性为合格。

10判XX论

所有项目的检测结果均合格,判为符合DPF等级标准。否则,判为不符合DPF等级标准。

11样本保存

11.1样本资料、样本来源、动物编号、样本种类及编号,按医学病理资料档案管理规范保存。保存时

间为I年V

11.2检测样本应一式两份,其中一份应该保存于液氮罐中,保存器具应该标志清晰,符合病理标本保

存规范。

附录A

(规范性附录)

牛分枝杆菌PCR检测方法

A1原理

以牛分枝杆菌16SrRNA基因和IS6110基因为靶序列,建立双重PCR方法。

A2样品采集

A2.1样品类型

有明显的结节状、干酪样坏死组织的猪病变组织

A2.2样品采集用无菌剪刀剪取病料组织约0.5-lg,置无菌1.5mLEP管中;加入400pL的组织消化液

和蛋白酶K(终浓度为1mg/mL);55℃,水浴8h,其间间隔半小时颠倒EP管几次,以使病料组织与

消化液充分反应;8000rpm,离心5min,取上清液置另一无菌1.5mLEP管中;加入等体积的苯酚:氯

仿:异戊醇(25:24:1)液体,反复颠倒几次:12000rpm,离心10min,取上层液体于•无窗1.5mLEP

管中;重复抽提I次;加入等体积的异丙醇,充分混匀后,置-20℃30min;l20()0rpm,离心lOmin,

弃上清;沉淀用70%乙醇清洗,并置37℃,至乙醇挥发完全;加入30RLTE,并加入RNA酶,37℃,

放置40min;将所得液体作为模板,并置-20C保存。

A3操作步骤

A3.1引物的设计

参照MycobacteriumbovisAF2122^97[gi:31742509]基因序列设计出16SrRNA基因和IS6110基因引物。

引物序列如下:

16SrRNAPl5-CACATGCAAGTCGAACGGAAAGG-3'

16SrRNAP2:5,-GCCCGTATCGCCCGCACGCT-3,扩增片段大小约为584bp.>

IS6110Pl:5'-GGCTTGCCGGGTTTGA-3」S6110P2:5'-

TTTGTCACCGACGCCTACGCT-3,扩增片段大小约为309bp。

A3.2PCR反应

根据引物设计时,oligo6.0软件提供的建议Tm值,PCR反应体系为:原理模板2^L(1.75pg-l.75pg),

lOxPCRbuffer2.5gL,dNTPs2pL,IS6110引物各0.5pL(5pM),16SrRNA引物各1.5pL(15pM),蒸

储水14吐,Taq酶0.5pL(2.5U);体系总体积为25比。

PCR扩增的反应条件:95℃预变性lOmin,95℃变性30s,59.5℃退火30s,72℃延伸45s,30个循

环,最后延伸7min,4"C保存。

A3.3PCR扩增产物的鉴定

0.8%的X脂糖,电压I2OV,电泳12-I5min,在凝胶成像系统中检测。

8

A4结果判定按照设定的双重PCR反应体系和扩增条件,如果出现大小309bp的1S6110基因和约584bp

的I6SrRNA基因的目的片段说明PCR结果阳性。

附录B

(规范性附录)

细胞内鸟型分枝杆菌PCR检测方法

BI以鸟型分枝杆菌特异性插入序列IS1245,设计一对特异性引物,用于检测和鉴定皮肤组织中鸟型

分枝杆菌。

B2样品采集

B2.1样品类型

猪皮肤组织

B2.2样品采集

无菌条件下取上述组织1g左右,置入1.5mL洁净EP管。

B3操作步骤

B3.1组织处理

将皮肤组织去脂、剪碎,用组织研磨器研磨后补加适量蒸储水,制成组织匀浆2mL,低速离心后

取上清液,2倍连续稀释后装于微量离心管中。

B3.2PCR扩增和检测

扩增插入序列IS1245:

弓I物1为5<GCCGCCGAAACGATCTAC-3'

引物2为5AGGTGGCGTCGAGGAAGAC-3'

5()RLPCR反应体系含lOxPCR缓冲液5pL,25mmol/LMgCI25|.iL,dNTPs200pmol/L,引物各

Ipmol/L,模板DNAIOpL,TaqDNA聚合酶lUo循环条件:94℃预变性5min,其后按94℃30s,65℃30s,

72c45s,扩增产物于1.5%X脂糖凝胶电泳,花青素染色,用紫外检测仪观察结果并摄影。

B4结果判定。

出现427bp扩增带为阳性,未见427bp扩增带为阴性。

附录c

(规范性附录)

新型隐球菌DNA实时荧光定量PCR检测

CI以新型隐球菌的ITS基因序列中一段高度保守序列为目的序列,设计出特异引物和探针,应用实

时荧光定量PCR技术进行检测,

C2样品采集

C2.1样品类型

猪肺部分泌物

C2.2样品采集

对送检的猪解剖后用棉拭子取下肺部的分泌物,用PBS洗脱棉拭子,洗下的液体经冻融二次,离

心取上清,加入双抗保存备用。

C3操作步骤

C3.1引物的设计

根据新型隐球菌的基因序列设计引物为:

FP:5,-TTACCTGTTGGACTTGGATTTGG-3,

RP:55-CATAGGCCCAGCGAAACTTATT-3,

C3.2DNA的提取

取气管分泌物上清加入SDS和蛋白随K,50℃水浴lh,每15分钟摇一次。用酚及酚氯仿抽提,

乙醉沉淀,用20ul无菌双蒸水溶解备用。在反应体系中加入5ul模板,总量为50uL。

C3.3目的基因的扩增

以50jxLPCR反应体系进行反应:lOxPCRBuffe以含15mmR/LMgCI2)5gL,dNTPmixture(1Ogmol/L)

IpL,TaqDNA聚合酶(5U/|iL)0.4RL、DNA模板2RL,上式游引物各3pL,加ddH2O至50pL,于

扩增仪扩增,循环条件:94℃Smin,94c30s、58℃Imin共40个循环。

C4结果判定

取5HLpcR产物于1.5%X脂糖(含10%GoldView)中,5V/cm电压电泳60-75min,紫外透视仪上

检测,荧光条带在124bp处即为阳性。

附录D

(规范性附录)

抗荚膜组织胞浆菌抗体ELISA检测方法

D1用中国药品生物制品检定所研制的荚膜组织胞浆菌蛋白提取物(purifiedproteinfromHistoplasma

capsulatum,P-HTPM)为抗原,建立检测猪血清中抗真菌英膜组织胞浆菌抗体的酶联免疫吸附试验。

D2样品采集

D2.1样品类型

猪血清

D2.2样品采集

无菌条件下用一次性注射器取耳静脉血3mL-5mL,置于试管中,分离血清,待检。

D3操作步骤

D3.1用1座孔的抗原包被酶标板,50/L/孔,37℃孵育2h。

D3.2弃去孔中液体,加入洗涤液(含0.05%Tween-20的0.01mol/LpH7.4PBS、PBST),300山孔,

洗涤3次,每次3min。

D3.3扣干。

D3.4加入封闭液(含5%犊牛血清的PBST),100pL/孔,37c封闭30min。

D3.5弃去封闭液,加入待检血清(稀释度为1:1000),100R孔,37℃作用30“山1。

D3.6洗涤3次(方法同前)。

D3.7扣干。

D3.8加入1:10000的酶标抗体(二抗)100山孔,37c作用45min。

D3.9洗涤3次。

D3.10扣干。

D3.ll加入底物TMB显色液,IOORL/孔,室温避光显色10-l5min。

D3.12每孔加入50nL2moi/LILSOj终止反应。

D3.13测定吸光度值,按照下列公式计算P/N值:P/N值二阳性对照孔OD均值/阴性对照孔OD均值。

D4结果判定

当被检样品的A值>0.135时,判定为阳性;当样品的A值在0.059-0.135之间时,判定为可疑;当

样品的A值<0.059时,判定为阴性。

12

附录E

(规范性附录)

猪兰氏类圆线虫病镜检法诊断

EI消化道蠕虫粪学检查。

E2样品采集

E2.I样品类型

猪粪便

E2.2样品采集

从猪舍地面及猪直肠分别采集猪的粪样。

E3操作步骤

E3.I饱和食盐水漂浮法检查

取粪样10g溶于饱和食盐水中,用玻璃棒搅拌均匀后用40目的金属筛反复过滤,除去大的粪渣,

将滤液置于大试管中,让液面突出于试管口,静止30min后蘸取液面制压片,在40倍显微镜下检查。

E3.2尼龙箍淘洗法检查

取粪样25g置于大烧杯中,用常水溶解并用玻璃棒充分搅拌均匀后,经金属筛反复过滤,除去大的

美渣,将滤液置入260目的尼龙筛内,用清水反复淘洗,直至淘洗液澄清透明位置,吸取尼龙筛内沉积

物制压片,在10倍和40倍显微镜下检查。

E4结果判定

E4.I饱和食盐水漂浮法

经饱和食盐水飘浮法对猪的粪便进行检查,从直肠采取的粪样中查到虫卵,椭圆形,无色透明,卵

克薄,大小为(42-53)pmx(24-32)gm,内有幼虫。鉴定为兰氏类圆线虫卵。

E4.2经尼龙筛淘洗法

对猪的粪便进行检查,从地面采集的粪样中查到虫体,虫体细小,呈乳白色,毛发状,镜下透明,

食道短,呈柱状,有两个食道球,虫体大小为(3.1-4.6)mmx(0.055-0.080)mm。鉴定为兰氏类圆线

旦的杆型幼虫。

附录F

(规范性附录)

布氏姜片吸虫镜检法诊断

FI消化道蠕虫粪学检查。

F2样品采集

F2.1样品类型

猪新鲜粪便

F2.2样品采集

从猪舍地面及猪直肠分别采集猪的粪样。

F3操作步骤

F3.1直接涂片法

先取2-3滴蒸偏水(或50%的甘油水)于载玻片上,再用火柴棒取新鲜的粪便混合均匀,去除污秽

后,用低倍镜检查。

F3.2沉淀法

取5J0g的粪便于烧杯中加20mL水,用筛过滤后,装入嘲心器然后倒上清液,再进行离心,反复

数次,取沉淀渣滴于玻片上,用低倍镜检查。

F4结果判定

采用以上两种方法对猪的粪便进行检查,从地面采集的粪样中查到虫体或虫卵,虫体肥厚、背腹扁

工、前端狭窄、后端钝圆,形似鲜姜之切片;虫卵长椭圆形、淡黄色、卵壳薄均匀、前端卵盖扁小不易

看出,长宽比约为130-145Nmx85-97pm,鉴定为布氏姜片吸虫阳性。

14

附录G

(规范性附录)

猪脑心肌炎病毒间接ELISA检测

G1由于2c蛋白为猪脑心肌炎病毒的非结构蛋白,参与病毒的复制,因此在病毒复制时才会产生该蛋

白并刺激机体产生抗体,通过重组2C蛋白为包被抗原建立检测猪脑心肌炎病毒抗体间接ELISA方法。

G2样品采集

G2.1样品类型

猪血清

G2.2样品采集

无菌条件下用一次性注射器取耳静脉血3mL-5mL,置「试管中,分离血清,待检。

G3操作步骤

G3.1将重组蛋白2C用包被液(0.05mol/L>pH9.6的碳酸盐缓冲液)稀释为适当浓度按IOOJIL/孔包被

解标板,37c孵育lh后4c过夜。

G3.2弃去孔中液体,加入洗涤液(含0.05%Tween-20的O.Qlmol/LpH7.4PBS、PBST),300匹/孔,

洗涤3次,每次3min.

G3.3扣干。

G3.4力口入封闭液(含5%犊牛血清的PBST),IOORL/孔,37c封闭lh。

G3.5弃去封闭液,加入待检血清(一抗),lOOpL/孔,37℃作用45min。

G3.6洗涤3次(方法同前)。

G3.7扣干。

G3.8加入适当稀糅的酶标抗体(二抗)lOOpL/孔,37℃作用45min.

G3.9洗涤3次。

G3.10扣干。

G3.ll加入底物TMB显色液,lOOpL/孔,室温避光显色1045min。

G3.12每孔加入5()gL2mol/LH2SO4终止反应。

G3.13测定OD450nm光吸收值,按照下列公式计算P/N值:P/N值=阳性对照孔OD均值/阴性对照

孔OD均值。

G4结果判定当被检样品的OD俏>0.27时,判定为阳性;当样品的OD值<0.27时,判定为阴性。

附录H

(规范性附录)

人流感病毒多重PCR检测

HI根据流感病毒HA基因和M基因设计引物,进行RT-PCR方法检测。

H2样品采集

H2.1样品类型

鼻咽拭子

H2.2样品采集标本采集后,冷冻12h内运送至实验室,24h内进行流感病毒分离培养和快速检测试验。

H3操作步骤

H3.1多重PCR引物设计分别设计扩增引物扩增

HA全基因片段:

H1F-5^agcaaaagcaggggaaaata-S'

HIR-5'-aacaagggtgtttttcctca-S'

H3F-5^agcaaaagcaggggataaltc-S'

H3R-5'-ctcaaaigcaaatgligcacc-3'

BF-5'-gggacatgaacaacaaagatgc-3'

BR-5,-tgtcagctattatggagctg-3,

Hl、H3和乙型扩增产物分别431bp、210bp和390bp。

H3.2病毒RNA提取

提取病毒RNA作为RT-PCR模板,用于反转录试验或置-20℃保存备用。

H3.3病毒逆转录

用试剂盒进行病毒RNA逆转录。

H3.4多重PCR反应体系25卜也,各反应物浓度lOxBuffcr2.'iL、MgCl2(25mM)2RLdNTP2pL、

Taq(5U/pL)0.4gL>H对引物(lOmM)各I.25RL、逆转录生成的cDNA4pL、力口水至lj25匹。反应程

序:94"C3min,30s、51℃lmin、68℃Imin共35个循环,68℃10min.

H3.5PCR产物的鉴定

取PCR产物5gL,加入上样孔后进行1%X脂糖凝胶电泳。

H4结果判断出现431bp、210bp或390bp条带,判定为阳性。

附录I

(规范性附录)

猪巨细胞病毒FQ-PCR检测

II原理

TaqMan探针法是高度特异的定量PCR技术,是利用Taq睡的外切核酸酶活性,切断探针,

产生荧光信号。由于探斜与模板是特异性结合,囚此从荧光佶号的强弱就可以判断模板数量。

12样品采集

12.1样品类型

病变组织

12.2样品采集

无菌条件下取上述组织1g左右,置入1.5mL洁净EP管。

13操作步骤

13.1总RNA提取1.5mL样品离心管中,加入ImLTrizol试剂,静置5min或马上-70C保存,12000rpm

离心15min,分相为三层,取上清液至新1.5mL管,加入200ul氯仿,振荡混匀30s,室温静置3・5min

分层,l2000rpm离心I5min,取上清液至新1.5mL管,中间层和红色下层4c保存,便于提取DNA和

蛋白,上清液加入约0.5mL的异丙醇(预冷),振荡混匀30s,室温下静置I5min,12000rpm离心lOmin,

弃上清,RNA沉淀管底,如沉淀不明显,则再离心数秒吸出上清,加入1mL75%乙醇(预冷),温和震

荡悬浮沉淀,8000rpm离心5min,弃上清,短暂快速离心(5s),弃上清,室温放置2min晾干,沉淀

加入15卜iLDEPC处理水,轻弹管壁溶解,少量样品55-60℃水浴孵育10J5min,测量OD260/280值后,

样品放置-70C保存。

13.2反转录

0.2mL离心管加入1匹总RNA,1迎随机引物oligo(dt),lOpiLDEPC处理水,混匀,瞬时离心

5s,7(TC水浴5min,迅速冰浴2min,瞬时离心,加入4匹5xBuffer,2pL0.1MDTT,2pLlOMmdNTPs,

混匀,温浴2min,加入IpL反转录酶,42c温育50min,70℃孵育lOmin灭活,-70℃冰箱保存。

13.3引物与TapMan探针的设计与合成

设计一对特异引物P1/P2和TapMan探针:

PI:5,-TGGCACTGATACTTGACAAGC-3,

P2:5,-CTCCCGTGAAGCCGTAAA-3,

TapMan探针:FAM-5'・CAGCTTGCCCTCAAGGTGACGTG-3'-TAMRA.

13.4标准曲线的建立

用含pGEMT/PCMV重组质粒的溶液作标准品,10倍稀释成1.0x101()-1.0x100拷贝/回,共II个

稀释度,以不同浓度的重组质粒为模板进行FQ-PCR敏感性试验。以起始模板数的对数为X轴,以

FQ-PCR循环次数Ct值为Y轴作回归曲线,建立PCMV检测的标准曲线。

13.5FQ-PCR反应条件

采用5pmol/L的引物浓度和2.5pmol/L的探针浓度对质粒标准品进行检测,双温循环及60c的退火

温度为最佳的循环条件。FQ-PCR反应总体积为25pL,其中lOxExTaqBuffer2.5gL(Mg2+浓度为

2.0mmol/L),dNTPs2pLExlaq0.25gL,上下游引物各0.5ul(lOpmol/L),探针0.25pL(lOpmol/L),

模板IRL,ddlhOI8.00PL,混合均匀,置荧光定量PCR仪上进行自动化扩增反应。反应程序为:94℃

预变性4min,94℃变性15s,60℃退火延伸40s,40个循环。荧光模式设为FAM/TAMRA双标记模式。

13.6根据所得曲线作数据分析。

13.7取部分PCR产物进行X脂糖凝胶电泳,检测产物的特异性。

14结果判定

以电泳阴性对照为标准,根据电泳结果判断是否有阳性产物。

附录J

(规范性附录)

疱疹病毒核酸检测

J1原理

选取一对猪疱疹病毒I型(PHV)将异性引物,通过减裂解法提取猪疱疹病毒DNA,后名在耐热DNA

聚合酶(Taq酶)作用下,配以SD-Buffer(内含Mg2+、Tris-HQ等)、四种核甘酸单体(dNTPs)等成

分,通过聚合酶链式反应体外扩增法对猪疱疹病毒进行体外扩增,产物经凝胶电泳,EB染色,紫外灯

观察,从而达到快速检测之目的。

J2标本采集

J2.1样本类型

血消或病毒液

J2.2样本采集

发病猪脑、淋巴结、扁桃体、肾和脾等组织标本:无菌条件下取上述组织1g左右,置入1.5mL洁

挣EP管,立即送检。血清:用一次性无菌注射器抽取受检猪耳静脉或者前腔静脉静脉血2-5mL,静置

斜放待血清析出,lOOOOrpm离心3min,可取上清立即用于测试;或吸取上部血清(约200pL)转入无

茵1.5mLEP管,保存待检。

J3操作步骤

J3.1引物设计

设计引物序列

PHV-F:5,-GGGACGCTCTGATTAAGGAAT-3,

PHV-R:5,-CTTGGTGATCAGCAGCAGCTTG-3,

J3.2DNA提取

血清或病毒液,常规市售DNA提取试剂盒提取DNA,取提取液进行PCR扩增。

J3.3PCR扩增

反应总体积为25pL,其中IOxBuffer2.5NL(Mg?+浓度为2.0mmol/L),dNTPs2pLExTaqO.25pL,

上下游引物各0.5/L(lOpmol/L),DNA模板IpL,ddH2O19.00gL,混合均匀,置荧光定量PCR仪上

进行自动化扩增反应。按照下列条件扩增:循环条件:95℃预变性3min,53c退火45s,72c延伸3min,

共35个循环。

J3.4电泳检测

(1)2%X脂糠凝胶配制:稀释50xTAE至IxTAE.称4gx脂糖放于500mL锥形瓶中,IxTAE200mL.

置入微波炉中加热溶解-再加入20RLEB充分混匀。在电泳槽内放好梳子,倒入X脂

糖凝胶,待凝固后使用。

(2)电泳检测:直接取PCR扩增产物15回,用加样枪点样于X脂凝胶孔中,以5V/cm电压,IxTAE

中电泳,紫外灯下观察结果。

K4检测结果判定:

阴性无带出现(引物带除外),阳性出现242bp扩增带。若被检样品出现242bp扩增带,即为猪疱

疹病毒阳性,否则为阴性。

23

附录K

(规范性附录)

猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV)RT-PCR检测

K1原理

依据该病毒的保守N基因设计特异性引物,优化反应条件,建立RT-PCR检测方法。

K2样品采集

K2.1样品类型

粪便

K2.2样品采集

标本采集后,在-80C下保存,运送至实验室,进行猪急性腹泻综合征冠状病毒核酸提取。

K3.操作步骤

K3.1在样品中加入磷酸盐缓冲液(PBS)(20%w/v),冷冻并解冻三次,然后在10,000g下离心10分

钟。按照病毒核酸试剂盒说明书进行病毒核酸提取。-80C保存备用。

K3.2根据猪急性腹泻综合征冠状病毒N基因序列设计引物:F:-GGTCCCTGTGACCGAAGTTTTAG:

R:-GCGTTCTGCGATAAAGCTTAAAACTATTA<)

K3.3参照一步法RT-PCR试剂盒说明书进行RT-PCR检测,扩增条件:50℃30分钟,94c3分钟,

%℃变性3()秒,35个循环,5£℃退火30秒,72℃延伸30秒,最后72℃5分钟。

K3.4根据所得曲线作数据分析。取部分PCR产物进行X脂糖凝胶电泳,检测产物的特异性。

K4结果判定

以电泳阴性对照为标准,根据电泳结果判断是否有阳性产物。

附录L

(规范性附录)

猪呼吸道冠状病毒(PRCV)巢式PCR检测

L1原理

巢式PCR是一种变异的聚合酶链反应(PCR),使用两对(而非一对)PCR引物扩增完整的片段。

第一对PCR引物扩增片段和普通PCR相似。第二对引物称为巢式引物,结合在第一次PCR产物内部,

使得第二次PCR扩增片断短于第一次犷增。巢式PCR的优点在于,如果第一次扩增产生了错误片断,

则第二次能在错误片段上进行引物配对并扩增的概率极低。因此,巢式PCR的扩增非常特异。

L2样品采集

L2.1样品类型

粪便或鼻拭子

L2.2样品采集/处理

粪便样本保存于-80C,鼻拭子样本进行冷冻处理后,快速转运至实验室,进行相关检冽。

L3.操作步骤

L3.1样本RNA提取:根据RNA提取试剂盒说明书对粪便或鼻拭子样本进行RNA提取。

L3.2引物的设计与合成:根据己报道的PERV核甘酸序列,引物FI:

-GGGTAAGTTGCTCATTAGAATAATGG,RI:-CTTCTTCAAAGCTAGGGACTG;巢式PCR弓I物F2:

-TTGTGGTYTTGGTYGTAATKCC,R2:-GGCTGTTTGGTAACTAATTTRCCAo

L3.3对照设计:阳性对照:菌株ISU-1(PRCV)用作;阴性对照:MEM-E或PRCV阴性粪便或鼻拭

N、°

L3.4第一次反应体系:将检测样品、阳性和阴性对照的5pLRNA、5^L10xPCR缓冲液、5pL25mM

MgCb、IpL10mMdNTPsx20URnasin.5UAMV逆转录酶、2.5UTaqDNA聚合酶和各0.5pL50Pm

的引物Fl和RI混合均匀。在42℃孵育90分钟,95c5分钟。

L3.5第一次反应条件:94℃,1分钟;60℃,1.5分钟;72℃.2.5分钟,30个循环,72℃,10分钟。

L3.6第二次反应体系:将PCR产物以1:10稀释并用作巢式PCR的模板。取1g稀稀产物与5也10xPCR

缓冲液、5pL25mMMgCk、IpL10mMdNTPs>2.5UTaqDNA聚合酶(美国威斯康星州普罗米加市

麦迪逊)和各0.5pL50Pm引物F2和R2混合。

L3.7第二次反应条件:94C,1分钟:62℃,1.5分钟;72℃,2.5分钟,30个循环,72℃,10分钟。

L3.8在用澳化乙锭染色的l.5%X脂糖凝胶上分析PCR产物。PRCV扩增产物的预测大小为193-253bp

22

K4.结果判定

以电泳阴性对照为标准,根据电泳结果判断是否有阳性产物。

附录M

(规范性附录)

猪内源性逆转录病毒C(PERV-C)PCR检测

Ml原理

依据已公布的猪内源性逆转录病毒env基因差异,分另ij设计PERV-A、PERV-B、PERV-C3种特异

性引物,优化反应条件,建立PCR检测方法。

M2样品采集

M2.1样品类型

血液样本

M2.2样品采集/处理

无菌条件卜.取上述样本2-3mL左右,置入洁净抗凝聚血管中,等量加入PBS液混匀,梯度离心分

离猪PBMC,-8()℃保存备用。

M3操作步骤

M3.1样本DNA提取和总RNA提取:去200ulPBMC悬液加入等体积细胞裂解液及20mg/mL蛋白酹

KIOul,消化,按照DNA/RNA提取试剂盒说明书进行DNA、RNA提取.

M3.2引物的设计与合成:根据已报道的PERV核甘酸序列,分别合成3对引物用于检测PERV-A、

PERV-B、PERV-C3种分型;(PERV-A:

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

评论

0/150

提交评论