基因测序服务外包合同协议（2025版）

基因测序服务外包合同协议（2025版）合同编号：________________________甲方（委托方）：________________________统一社会信用代码/身份证号：________________________地址：________________________联系人：________________________联系电话：________________________电子邮箱：________________________乙方（服务方）：________________________统一社会信用代码：________________________资质编号：________________________（含《生物安全实验室证书》，若有）地址：________________________法定代表人/负责人：________________________联系人：________________________联系电话：________________________电子邮箱：________________________依据《中华人民共和国民法典》《中华人民共和国生物安全法》《人类遗传资源管理条例》《中华人民共和国个人信息保护法》等相关法律法规，甲乙双方本着平等自愿、诚实信用、公平公正的原则，就甲方委托乙方提供基因测序服务外包事宜，经友好协商，达成如下协议，以资共同信守。一、鉴于条款1.甲方拥有/合法控制本合同约定用于测序的样本，保证样本来源合法、符合伦理要求，若涉及人类遗传资源，已依法获得《人类遗传资源采集、保藏、利用、对外提供审批》或伦理委员会批件，不侵犯任何第三方合法权益。2.乙方具备开展基因测序服务所需的专业技术、合格设备及符合国家标准的生物安全实验室，拥有相应的服务资质，可按照本合同约定提供高质量的基因测序及数据分析服务，严格遵守2025年行业技术规范。3.双方均已充分知晓本合同项下服务的技术要求、风险及相关法律法规规定，自愿按照本合同条款履行各自权利与义务。二、服务内容与范围（一）测序服务具体要求1.测序类型：________________________（可选择：全基因组测序WGS、全外显子组测序WES、靶向测序Panel、单细胞测序scRNA-seq、长读长测序ONT/PacBio或多组学联合测序等）。2.测序平台：乙方采用2025年行业主流测序平台（如IlluminaNovaSeqXPlus、ONTPromethION3、PacBioRevio等），具体平台乙方需提前5个工作日书面通知甲方，未经甲方书面同意，不得擅自变更。3.技术参数（双方明确约定，可根据测序类型调整）：（1）测序深度：________________________（如WGS≥30×，肿瘤样本≥100×）；（2）数据质量：Q30值≥85%（长读长测序Q20≥90%）；（3）覆盖范围：________________________（如靶向测序覆盖目标区域≥99%，覆盖深度≥500×）；（4）其他技术要求：________________________。（二）样本相关约定1.样本类型与规格：甲方需按照乙方提供的《样本采集指南》，提供________________________（如2mlEDTA抗凝全血/50mg新鲜组织/200μl唾液样本），每个样本需标注清晰的样本编号、来源、采集时间等信息，确保样本可追溯。2.样本采集与运输：（1）甲方负责按照乙方标准化流程采集、处理样本，填写完整的《样本信息表》（含样本编号、来源、采集时间、相关临床信息或样本背景等），确保样本质量符合测序要求；（2）运输方式：采用________________________（干冰/冷链）运输，温度控制在-80℃以下，运输时间不超过24小时（偏远地区≤48小时），运输过程需符合生物安全相关规定，运费由________________________（甲方/乙方）承担；（3）甲方需在样本运输后及时通知乙方，提供运输单号及相关信息，便于乙方跟踪接收。3.样本接收与处理：（1）乙方收到样本后3个工作日内完成验收，核对样本数量、状态及《样本信息表》完整性，验收合格后向甲方出具《样本接收确认单》；（2）若样本不合格（如样本破损、污染、数量不足、信息缺失等），乙方需书面通知甲方，说明不合格原因，甲方应在5个工作日内补寄合格样本，逾期未补寄视为甲方自动放弃本次服务，乙方不承担任何责任；（3）乙方对接收的合格样本进行妥善保管、处理，严格遵守生物安全管理规定，检测完成后，剩余样本按双方约定处理：________________________（如乙方按法规要求销毁/返还甲方，返还需甲方承担运输费用），样本保存期不少于7天。（三）数据产出与交付1.数据类型：（1）原始数据：FASTQ格式，确保数据完整、无篡改；（2）分析数据：参考基因组比对（BAM格式）、变异检测（VCF格式）、注释结果（采用ANNOVAR/VEP软件，遵循ACMG/AMP指南2025年修订版）；（3）报告内容：测序流程报告、数据质量报告、变异解读报告（含临床意义说明，标注FDA/NMPA批准适应症，若有）、技术说明等，报告需加盖乙方公章（或检测专用章），确保真实、准确、完整。2.交付方式：（1）电子数据及电子报告：通过乙方加密数据平台（符合《个人信息保护法》要求）交付，甲方凭专属账号密码下载，账号密码由乙方及时提供；（2）书面报告：______份，由乙方通过快递方式寄送至甲方合同约定地址，快递费由________________________（甲方/乙方）承担。3.交付时间：（1）基础分析及报告：样本验收合格后15个工作日内交付；（2）复杂分析（如结构变异、AI辅助解读等）：样本验收合格后25个工作日内交付，若需延期，乙方需提前3个工作日书面通知甲方，说明延期原因及预计交付时间，延期不得超过10个工作日；（3）若因甲方原因（如补寄样本、提供信息不及时等）导致交付延迟，交付时间相应顺延，乙方不承担违约责任。（四）服务周期本次服务周期自乙方收到合格样本及甲方支付的预付款之日起计算，至甲方确认验收合格之日止，最长不超过______个工作日（含复杂分析延期时间）。三、双方权利与义务（一）甲方权利与义务1.权利：（1）有权要求乙方按照本合同约定的技术标准、服务范围及交付时间提供服务；（2）有权对乙方交付的数据及报告进行审核，对数据质量、报告内容有异议的，可在收到交付物后10个工作日内书面通知乙方，逾期未提出异议视为认可；（3）有权要求乙方提供必要的技术支持，包括数据分析咨询、报告解读培训等；（4）有权对乙方的服务过程、实验室操作进行合理监督（需提前3个工作日书面通知乙方，遵守乙方实验室管理规定）。2.义务：（1）保证样本来源合法、真实、有效，不侵犯第三方权益（包括但不限于知识产权、隐私权等），若因样本问题导致乙方或第三方损失，由甲方承担全部赔偿责任；（2）按照本合同约定及时支付服务费用，配合乙方完成样本交接、信息核对等工作；（3）若涉及人类遗传资源，需及时向乙方提供相关审批文件或伦理批件，配合乙方完成相关备案工作；（4）不得擅自将乙方提供的技术流程、分析算法、数据模板等用于本合同约定之外的用途，不得泄露乙方的商业秘密及技术信息。（二）乙方权利与义务1.权利：（1）有权按照本合同约定收取服务费用，对甲方逾期支付的费用，有权要求甲方支付滞纳金；（2）有权拒绝接收不合格样本，有权要求甲方补寄合格样本，逾期未补寄的，有权终止服务并扣除已产生的费用；（3）有权要求甲方提供必要的样本背景信息、审批文件等，配合乙方完成测序及分析工作；（4）有权保留自身开发的定制化分析算法、工具的知识产权，有权在符合约定的前提下使用测序数据进行技术优化（不得泄露甲方及样本相关隐私信息）。2.义务：（1）严格按照本合同约定的技术标准、服务范围提供服务，采用2025年先进技术及合格设备，确保数据质量及报告准确性，对检测过程及结果的可追溯性负责；（2）严格遵守《生物安全法》《人类遗传资源管理条例》等相关法规，规范操作实验室，妥善处理样本及实验废弃物，杜绝生物安全事故；（3）严格保密甲方的商业秘密、样本信息、测序数据、报告内容等相关信息，采取必要的技术及管理措施，防止信息泄露、丢失或被未经授权访问（详见本合同第六条保密条款）；（4）配合甲方的数据复核工作，提供原始数据及分析流程，复验费用由________________________（甲方/乙方）承担（因乙方原因导致数据不合格的，复验费用由乙方承担）；（5）不得将本合同项下的服务转包、分包给第三方，如需委托第三方协助完成部分辅助工作（如快递、样本初步处理），需提前书面通知甲方，确保第三方符合相关资质并履行同等保密义务，乙方对第三方的行为承担全部责任；（6）及时向甲方反馈服务进展，若出现服务异常（如设备故障、样本异常等），需在24小时内通知甲方，协商解决方案。四、费用及支付方式1.服务总费用：人民币________________________元（大写：________________________），该费用包含样本检测费、测序费、数据分析费、报告制作费及________________________（基础技术支持/复杂分析附加费），不包含________________________（如样本运输费、复验费、加急费等，明确列明）。2.费用构成（可选，可根据实际情况列明）：（1）样本处理费：________________________元/样本；（2）测序费：________________________元/基因组（如WGS）；（3）数据分析费：________________________元/例（含基础变异检测及注释）；（4）附加服务费：________________________元/项（如长读长测序、结构变异分析、加急服务等）。3.支付方式（双方约定，可选择分期支付或一次性支付）：（1）预付款：本合同生效后5个工作日内，甲方支付总费用的40%，即人民币________________________元（大写：________________________）；（2）中期款：乙方交付原始数据后5个工作日内，甲方支付总费用的40%，即人民币________________________元（大写：________________________）；（3）尾款：甲方完成验收并收到乙方开具的合法有效发票后5个工作日内，支付剩余20%的费用，即人民币________________________元（大写：________________________）。4.发票约定：乙方在收到甲方各期款项后3个工作日内，向甲方开具等额的________________________（增值税专用发票/普通发票），发票项目为________________________，发票信息需与甲方提供的信息一致，若发票开具错误，乙方需在3个工作日内重新开具。5.逾期付款约定：甲方逾期支付任何一期款项的，每逾期一日，需按应付未付款项的0.05%向乙方支付滞纳金；逾期超过30日的，乙方有权暂停服务，直至甲方付清款项及滞纳金，由此造成的服务延迟及损失由甲方承担；逾期超过60日的，乙方有权单方解除本合同，没收预付款，并要求甲方支付已完成服务的费用及滞纳金。6.乙方收款信息：开户名：________________________开户银行：________________________银行账号：________________________五、知识产权1.样本及测序数据所有权：（1）甲方提供的原始样本、样本相关信息及测序产生的原始数据（FASTQ、BAM格式）、分析过程数据归甲方所有，乙方仅可根据本合同约定，为完成服务之目的使用该等数据，不得用于其他用途；（2）乙方开发的定制化分析算法、工具、数据处理模板等知识产权归乙方所有，甲方享有在本合同约定服务范围内的免费使用权，不得擅自复制、转让、许可第三方使用。2.科研成果归属：（1）双方基于本次测序服务产生的科研成果（如论文、专利等），需协商确定归属及署名方式：共同发表的论文/申请的专利，需注明“数据由乙方提供”，甲方为第一作者/专利权人，乙方为第二作者/共同专利权人（具体按贡献协商）；（2）甲方独立利用本次测序数据发表科研成果的，需注明“测序服务由乙方完成”，若未注明导致乙方损失，甲方需承担赔偿责任。3.第三方知识产权：乙方保证本次服务所使用的技术、设备、软件等不侵犯任何第三方的知识产权，若因乙方原因导致第三方主张知识产权侵权，由乙方承担全部责任（包括但不限于赔偿费、诉讼费、律师费等），若因此给甲方造成损失，乙方需全额赔偿。六、保密条款1.保密信息范围：双方在签署及履行本合同过程中获知的对方的商业秘密、技术信息、样本信息、测序数据、报告内容、价格体系、客户名单、财务信息等所有未公开信息，均属于保密信息。2.保密义务：（1）双方均需对获知的对方保密信息严格保密，不得向任何第三方披露、泄露、转让或用于本合同约定之外的用途；（2）双方仅可向因履行本合同职责需要获知保密信息的员工、顾问等第三方披露，且需提前与该第三方签订保密协议，要求其履行同等严格的保密义务，对该第三方的泄密行为承担连带责任；（3）双方需采取不低于保护自身同类保密信息的谨慎程度，采取必要的技术及管理措施，防止保密信息泄露、丢失或被未经授权访问。3.保密例外：以下情况无需承担保密义务：（1）该保密信息已通过正当途径为公众所知；（2）该保密信息在披露前已为接收方合法持有；（3）接收方依据法律法规、有权司法/行政机关的要求披露；（4）为履行本合同之必要，且已履行保密告知义务的披露。4.保密期限：本保密义务不因本合同终止而失效，自本合同签订之日起至保密信息公开之日止，或自合同终止后5年止，以期限较长者为准。七、违约责任1.甲方违约责任：（1）甲方未按约定提供合格样本、相关信息或审批文件，导致服务延迟、无法开展或失败的，由甲方承担全部责任，已支付的预付款不予退还，若给乙方造成损失，甲方需全额赔偿；（2）甲方逾期支付服务费用的，按本合同第四条第5款约定支付滞纳金，逾期超过60日的，乙方有权解除合同并要求甲方承担违约责任；（3）甲方违反保密义务，泄露乙方保密信息，给乙方造成损失的，需全额赔偿乙方的直接及间接损失；（4）甲方擅自将乙方的技术、算法等用于本合同约定之外的用途，或擅自转让、许可第三方使用的，需向乙方支付合同总金额20%的违约金，并赔偿乙方因此造成的损失。2.乙方违约责任：（1）乙方未按约定的技术标准、服务范围提供服务，导致数据质量不合格、报告错误的，需在5个工作日内免费重新测序及分析，若重新服务后仍不合格，甲方有权解除合同，乙方需退还甲方已支付的全部费用，并向甲方支付合同总金额20%的违约金，若给甲方造成损失，乙方需全额赔偿；（2）乙方未按约定时间交付数据及报告的，每逾期一日，需按合同总金额的0.05%向甲方支付违约金，逾期超过10个工作日（除甲方原因及不可抗力外），甲方有权解除合同，乙方需退还已支付的全部费用，并赔偿甲方因此造成的损失；（3）乙方违反保密义务，泄露甲方样本信息、测序数据等保密信息，给甲方或第三方（如样本提供者）造成损失的，需全额赔偿全部损失，若构成犯罪，依法承担刑事责任；（4）乙方擅自将服务转包、分包给第三方，或擅自变更测序平台的，甲方有权解除合同，乙方需退还已支付的全部费用，并向甲方支付合同总金额20%的违约金；（5）乙方违反生物安全相关规定，导致生物安全事故的，需承担全部责任，赔偿甲方及第三方因此造成的损失。3.违约金约定：本合同约定的违约金不足以弥补一方实际损失的，受损方有权要求违约方赔偿不足部分。八、不可抗力1.本合同所称不可抗力，是指不能预见、不能避免并不能克服的客观情况，包括但不限于地震、洪水、台风等自然灾害，战争、政策调整、疫情等社会事件，以及设备故障（非乙方故意或重大过失导致）、电力中断等不可归责于双方的事件。2.发生不可抗力事件后，受影响一方需在24小时内通知对方，提供相关证明文件（如政府部门通知、灾害证明等），双方可根据不可抗力的影响，协商决定延期履行、部分履行或解除合同，互不承担违约责任，但应尽力减少不可抗力造成的损失。九、合同的变更、解除与终止1.本合同的任何变更，需经双方书面协商一致，并签订补充协议，补充协议与本合同具有同等法律效力。2.发生以下情况之一，守约方有权书面通知违约方解除本合同：（1）一方严重违反本合同约定，经守约方书面催告后30日内仍未纠正的；（2）甲方逾期支付费用超过60日的；（3）乙方未按约定提供服务，导致合同目的无法实现的；（4）一方破产、清算或丧失履行合同能力的。3.本合同终止后，双方需履行以下义务：（1）乙方需向甲方交付已完成的测序数据、报告等相关成果，退还甲方未使用的预付款（若有）；（2）双