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文档简介
1非极性氨基酸(疏水氨基酸)8种:丙氨酸(Ala)缀氨酸(Vai)
亮氨酸(Leu)异亮氨酸(He)脯氨酸(Pro)苯丙氨酸(Phe)色氨
酸(Trp)蛋氨酸(Met)极性氨基酸(亲水氨基酸)
2极性不带电荷7种:甘氨酸(Gly)丝氨酸(Ser)苏氨酸(Thr)
半胱氨酸(Cys)酪氨酸(Tyr)天冬酰胺(Asn)谷氨酰胺(Gin)
3极性带正电(碱性氨基酸)3种:赖氨酸(Lys)精氨酸(Arg)
组氨酸(His)
4极性带负电(酸性氨基酸)2种:天冬氨酸(Asp)谷氨酸(Gki)
5脂肪族氨基酸:丙、缀、亮、异亮、蛋、天冬、谷、赖、精、
甘、丝、苏、半胱、天冬酰胺、谷氨酰胺
6芳香族氨基酸:苯丙氨酸、酪氨酸
7杂环族氨基酸:组氨酸、色氨酸
8杂环亚氨基酸:脯氨酸
9因为一个晶体中分子的有序排列一般只有在分子单元相同的
情况下才能形成,许多蛋白质都能结晶这一事实,强有力地证明,虽
然是非常大的蛋白质,也是有特定结构的不连续的化学实体。
10稳定一个特定蛋白质结构的最重要的作用力是非共价相互作
用。蛋白质行使功效常常伴有两种或更多结构形式的相互转变。
11蛋白质中原子的空间排列叫做蛋白质的构象。蛋白质的也许
构象包括任何无须破坏共价键而达成的结构状态。具备功效和折登构
象的任何一个蛋白质称为天然蛋白质。
12弱相互作用力是稳定蛋白质构象的重要作用力,因为它们数
目众多。自由能最低的蛋白质构象(即最稳定的构象)就是弱相互作
用力数目最多的一个构象。
13蛋白质中基团是协同形成氢键的,一个氢键的形成有利于具
他氢键的形成。
14蛋白质结构模式规则:疏水残基重要包埋在蛋白质内部,远
离水;蛋白质内氢键的数目达成最大值。肽键是刚性的平面。
15蛋白质是以氨基酸为基本单位组成的生物高分子,蛋白质分
子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构组成了蛋白质结构的多样
性。蛋白质具备一级、二级、三级、四级结构,蛋白质分子的结构决
定了它的功效。
一级结构:蛋白质多肽链中氨基酸的排列次序,以及二硫键的位
置。二级结构(a-螺旋、隹折叠):蛋白质分子局区域内,多肽链沿
一定方向盘绕和折叠的方式。三级结构:蛋白质的二级结构基础上借
助各种次级键卷波折叠成特定的球状分子结构的空间构象。四级结
构:多亚基蛋白质分子中各个具备三级结构的多肽链,以适当的方式
聚合所形成的蛋白质的三维结构。
16蛋白质中发觉的a-螺旋都是右手螺旋,a-螺旋是a角蛋白中
最重要的结构,它最佳地利用了内部的氢键。氨基酸序列影响a螺旋
稳定性。脯氨酸和甘氨酸残基的存在妨碍a-螺旋的形成。
17影响a-螺旋稳定性的原因:连续性的R基团带电的氨基酸残
基之间的静电排斥(或吸引):相邻的基团体积庞大;间隔三个或四
个残基的氨基酸侧链之间的相互作用;脯氨酸和甘氨酸残基的存在;
螺旋节段末端的氨基酸残基与a-螺旋固有的电偶极的相互作用。
180构象使多肽链折叠成片状结构。锯齿状的多肽链并排排列,
形成一系列的片层结构,这种排列叫。-折叠片。氢键在多肽链的相对
节段间形成。0转角在蛋白质中普遍存在。有紧凑折叠结构的球蛋白
中,在多肽钵转向处的转角或突环上的氨基酸残基数几乎占了1/3,
它们是连续出现的a-螺旋或隹构象的连接耍素。尤其普遍的是。-转
角,它连接反平行(3-折叠片的两个相邻节段的末端,这结构是一个包
括四个氨基酸残基的18()。的转角。甘氨酸和脯氨酸常常出目前。-转
角中,这是因为甘氨酸小而灵活,而脯氨酸的亚氨基氮形成的肽键轻
易呈弯曲构象,这种形式尤其有利于形成稳定的转角,不过,它们却
极少出目前a-螺旋中。常见二级结构都有经典的键角和氨基酸成份。
甘氨酸残基能够参加许多构象的形成。
19蛋白质中所有原子的整体三维排列方式称为蛋白质的三级结
构。二级结构则是指一级结构中相邻氨基酸残基的空间排列方式,三
级结构包括更大范围的氨基酸序列。
20蛋白质提成两组:纤维蛋白,多肽链排列成长绳状或片层状,
一般重要由一个二级结构组成,组成给脊椎动物提供支持、定形和保
护作用的结构,a-角蛋白、胶原蛋白和丝心蛋白,纤维蛋白都不溶于
水,这种性质由蛋白质内部和表面的高浓度疏水氨基酸残基所赋予;
球蛋白,多肽链折叠成球形,一条肽链或多条肽链的不一样节段
相互折叠,一般包括几个类型二级结构,许多酶(细胞色素C、溶菌
酶、核糖核酸酶)和调整蛋白、运输蛋白、运动蛋白、免疫球蛋白等。
纤维蛋白适合于结构性功效,a■角蛋白中稳定四级结构的是二硫
键。胶原蛋白中超螺旋是向右手方向扭曲的,而每条a-链却是左手螺
旋。伴随年龄增加,胶原纤维共价交联累积,结缔组织的刚性和易脆
性不停增加。
胶原蛋白带来独特螺旋结构的甘氨酸-X-脯氨酸的重复结构。丝心
蛋白多肽链重要是供构象,其整个结构是由每个0-折叠片中多肽链
的所有肽键广泛参加形成的氢键和片层之间范德华力的最大化来稳
定的。
肌红蛋白是一条序列已知的由153个氨基酸残基组成的肽链和一
个铁原吓咻或血红素基团组成的。
21超二级结构也叫模体,或简单地称为折叠。
由几百个以上氨基酸残基组成的多肽链一般折置成两个或两个以上
稳定的球状单元,称为结构域。
22一系列的0-a-B环这么的排列使得P链排布形成一个桶状结
构,产生了一个尤其稳定、常见的模体,叫做a/[3桶。蛋白质模体
是蛋白质结构分类的基础。
23四类蛋白质结构:全a、全a/[3(a和[3节段分散或交替
出现)、a+B(a和0有某些程度的分离)。
24一级结构序列极具相同或/和在结构和功效上也体现出相同
的蛋白质,被以为属于同一个蛋白质家族。一个蛋白质家族一般存在
明显的强的进化关系。珠蛋白家族中有许多不一样的蛋白质,其结构
和序列都与肌红蛋白相同。
多亚基蛋白质也称多聚体。只有几个亚基的多聚体一般也叫寡聚
体。大多数多聚体有相同的亚基或由不一样的亚基组成的重复性的亚
组织,一般对称排列,此种多聚体蛋白中的重复结构单元,无论是单
个亚基还是一组亚基,都叫做原体。
血红蛋白有四条多肽链和四个血红素辅基,血红素辅基中的铁原
子处在二价状态,其蛋白质部分叫做珠蛋白。寡聚体有旋转对称和螺
旋对称。单个亚基能够绕着一个或多个旋转轴旋转从而与其他亚基重
叠。螺旋对称的蛋白质趋向于形成更具开放末端的结构。
所有蛋白质在核糖体上都是以线性排列的氨基酸残基开始出现
的。
蛋白质的结构己经进化到能在特定的细胞环境中行使其功效。
环境条件的变化会引起蛋白质结构或大或小的变化,三级结构变
化到一定程度,就会导致其功效的丧失,此即为变性。变性的状态并
不一定等同于蛋白质完全解折叠和构象的完全随机化。加热变性一氢
键;有机溶剂、尿素、去污剂重要是通过破坏组成球蛋白稳定核心的
疏水相互作用来起作用的;极端pH变化蛋白质的静电荷,导致静电
排斥和某些氢键的破坏。
氨基酸序列决定蛋白质的三级结构。有些蛋白质的变性是可逆
的,某些通过加热、极端pH或变性试剂变性的球蛋白,假如回到使
其天然构象保持稳定的条件下,能够恢复其天然构象和生物活性,这
个过程叫复性。
多肽链的迅速折叠是一个渐进的过程。由多肽链自发塌陷形成密
实状态引起的折叠,并由非极性残基之间的疏水相互作用介导,此“疏
水塌陷”产生的这种状态,也许有大量的二级结构,不过许多氨基酸
侧链并没有完全固定,这种塌陷状态被称为熔球。
并非所有蛋白质都是自发折叠,有的需要特异蛋白质的促进。分
子分子伴侣是与部分折叠或不正确折叠的多肽链相互作用的蛋白质。
它有利于纠正折叠途径或提供正确折叠发生的微环境。分子伴侣包括
两类型:第一是称为Hsp70的蛋白质家族第二是伴侣素。
许多蛋白质的折叠途径中都需要两个催化异构化反应的酶的参
加:蛋白二硫键异构酶(PDI),催化二硫键的变换或位置的变化,直
到天然构象的二硫键的形成。PDI的功效之一就是催化清除具备不宜
的二硫键的折叠中间物。肽脯氨酰顺反异构酶(PPI)催化脯氨酸肽
键的顺反异构体的相互转换,这在某些含有顺式构象的肽键的蛋白质
的折叠中是
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